RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000627568.2

TCF4-259, Transcript of transcription factor 4, human

TSL 5

Gene TCF4, Length 806 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TCF4-259	ENST00000627568	PER2	O15055	1255 aa		28.62	■■■□□ 2.17
TCF4-259	ENST00000627568	GLP2R	O95838	553 aa		28.62	■■■□□ 2.17
TCF4-259	ENST00000627568	SRGAP2B	P0DMP2	458 aa		28.62	■■■□□ 2.17
TCF4-259	ENST00000627568	ALDH7A1	P49419	539 aa	Known RBP	28.62	■■■□□ 2.17
TCF4-259	ENST00000627568	SRGAP1	Q7Z6B7	1085 aa		28.62	■■■□□ 2.17
TCF4-259	ENST00000627568	SMRP1	Q8NCR6	262 aa		28.62	■■■□□ 2.17
TCF4-259	ENST00000627568	CCDC43	Q96MW1	224 aa	Known RBP	28.62	■■■□□ 2.17
TCF4-259	ENST00000627568	MTR	Q99707	1265 aa		28.62	■■■□□ 2.17
TCF4-259	ENST00000627568	EIF2AK1	Q9BQI3	630 aa	Known RBP	28.62	■■■□□ 2.17
TCF4-259	ENST00000627568	LRFN3	Q9BTN0	628 aa		28.62	■■■□□ 2.17
TCF4-259	ENST00000627568	TTC12	Q9H892	705 aa	Predicted RBP	28.62	■■■□□ 2.17
TCF4-259	ENST00000627568	NGRN	Q9NPE2	291 aa	Known RBP	28.62	■■■□□ 2.17
TCF4-259	ENST00000627568	FAM105A	Q9NUU6	356 aa		28.62	■■■□□ 2.17
TCF4-259	ENST00000627568	CLEC1B	Q9P126	229 aa		28.62	■■■□□ 2.17
TCF4-259	ENST00000627568	BARX2	Q9UMQ3	279 aa	Predicted RBP	28.62	■■■□□ 2.17
TCF4-259	ENST00000627568	ASAP2	O43150	1006 aa		28.61	■■■□□ 2.17
TCF4-259	ENST00000627568	EYA4	O95677	639 aa		28.61	■■■□□ 2.17
TCF4-259	ENST00000627568	SRGAP2C	P0DJJ0	459 aa		28.61	■■■□□ 2.17
TCF4-259	ENST00000627568	LAMTOR4	Q0VGL1	99 aa		28.61	■■■□□ 2.17
TCF4-259	ENST00000627568	COASY	Q13057	564 aa		28.61	■■■□□ 2.17
TCF4-259	ENST00000627568	DUSP6	Q16828	381 aa		28.61	■■■□□ 2.17
TCF4-259	ENST00000627568	GLB1L	Q6UWU2	654 aa		28.61	■■■□□ 2.17
TCF4-259	ENST00000627568	AGPAT5	Q9NUQ2	364 aa		28.61	■■■□□ 2.17
TCF4-259	ENST00000627568	CARNS1	A5YM72	827 aa		28.6	■■■□□ 2.17
TCF4-259	ENST00000627568	C19orf67	A6NJJ6	358 aa		28.6	■■■□□ 2.17
TCF4-259	ENST00000627568	GPR37L1	O60883	481 aa		28.6	■■■□□ 2.17
TCF4-259	ENST00000627568	SLITRK3	O94933	977 aa		28.6	■■■□□ 2.17
TCF4-259	ENST00000627568	TMC7	Q7Z402	723 aa		28.6	■■■□□ 2.17
TCF4-259	ENST00000627568	PGBD4	Q96DM1	585 aa		28.6	■■■□□ 2.17
TCF4-259	ENST00000627568	FAM86C2P	A6NEL3	165 aa		28.59	■■■□□ 2.17
TCF4-259	ENST00000627568	TXK	P42681	527 aa		28.59	■■■□□ 2.17
TCF4-259	ENST00000627568	ST3GAL1	Q11201	340 aa		28.59	■■■□□ 2.17
TCF4-259	ENST00000627568	LONRF3	Q496Y0	759 aa		28.59	■■■□□ 2.17
TCF4-259	ENST00000627568	FERMT3	Q86UX7	667 aa		28.59	■■■□□ 2.17
TCF4-259	ENST00000627568	CCDC83	Q8IWF9	413 aa		28.59	■■■□□ 2.17
TCF4-259	ENST00000627568	SLC39A11	Q8N1S5	342 aa		28.59	■■■□□ 2.17
TCF4-259	ENST00000627568	RNF149	Q8NC42	400 aa		28.59	■■■□□ 2.17
TCF4-259	ENST00000627568	LPP	Q93052	612 aa		28.59	■■■□□ 2.17
TCF4-259	ENST00000627568	RAPGEFL1	Q9UHV5	662 aa		28.59	■■■□□ 2.17
TCF4-259	ENST00000627568	INPP5F	Q9Y2H2	1132 aa		28.59	■■■□□ 2.17
TCF4-259	ENST00000627568	DCX	O43602	365 aa		28.58	■■■□□ 2.17
TCF4-259	ENST00000627568	ZNF623	O75123	536 aa		28.58	■■■□□ 2.17
TCF4-259	ENST00000627568	ZC3H11A	O75152	810 aa	Known RBP eCLIP	28.58	■■■□□ 2.17
TCF4-259	ENST00000627568	BCAR1	P56945	870 aa		28.58	■■■□□ 2.17
TCF4-259	ENST00000627568	MXD4	Q14582	209 aa	Predicted RBP	28.58	■■■□□ 2.17
TCF4-259	ENST00000627568	BMS1	Q14692	1282 aa	Known RBP	28.58	■■■□□ 2.17
TCF4-259	ENST00000627568	TMEM169	Q96HH4	297 aa		28.58	■■■□□ 2.17
TCF4-259	ENST00000627568	C8orf76	Q96K31	380 aa		28.58	■■■□□ 2.17
TCF4-259	ENST00000627568	ZBTB39	O15060	712 aa		28.57	■■■□□ 2.16
TCF4-259	ENST00000627568	ERLIN2	O94905	339 aa		28.57	■■■□□ 2.16
TCF4-259	ENST00000627568	LYPLA2	O95372	231 aa		28.57	■■■□□ 2.16
TCF4-259	ENST00000627568	GUCY1B3	Q02153	619 aa		28.57	■■■□□ 2.16
TCF4-259	ENST00000627568	RNASEL	Q05823	741 aa	Known RBP	28.57	■■■□□ 2.16
TCF4-259	ENST00000627568	NOMO2	Q5JPE7	1267 aa		28.57	■■■□□ 2.16
TCF4-259	ENST00000627568	HSD17B14	Q9BPX1	270 aa		28.57	■■■□□ 2.16
TCF4-259	ENST00000627568	LLPH	Q9BRT6	129 aa	Known RBP	28.57	■■■□□ 2.16
TCF4-259	ENST00000627568	ANKEF1	Q9NU02	776 aa		28.57	■■■□□ 2.16
TCF4-259	ENST00000627568	HCN4	Q9Y3Q4	1203 aa		28.57	■■■□□ 2.16
TCF4-259	ENST00000627568	PCDHB2	Q9Y5E7	798 aa		28.57	■■■□□ 2.16
TCF4-259	ENST00000627568	WNT7A	O00755	349 aa		28.56	■■■□□ 2.16
TCF4-259	ENST00000627568	ATP2B1	P20020	1258 aa		28.56	■■■□□ 2.16
TCF4-259	ENST00000627568	TFDP1	Q14186	410 aa		28.56	■■■□□ 2.16
TCF4-259	ENST00000627568	SMC1A	Q14683	1233 aa	Known RBP	28.56	■■■□□ 2.16
TCF4-259	ENST00000627568	URGCP	Q8TCY9	931 aa		28.56	■■■□□ 2.16
TCF4-259	ENST00000627568	MTMR9	Q96QG7	549 aa		28.56	■■■□□ 2.16
TCF4-259	ENST00000627568	MINDY3	Q9H8M7	445 aa		28.56	■■■□□ 2.16
TCF4-259	ENST00000627568	C11orf16	Q9NQ32	467 aa		28.56	■■■□□ 2.16
TCF4-259	ENST00000627568	USP15	Q9Y4E8	981 aa	Predicted RBP	28.56	■■■□□ 2.16
TCF4-259	ENST00000627568	HIDE1	A8MVS5	230 aa		28.55	■■■□□ 2.16
TCF4-259	ENST00000627568	NT5C1B-RDH14	C9J2C7	533 aa		28.55	■■■□□ 2.16
TCF4-259	ENST00000627568	DGAT1	O75907	488 aa		28.55	■■■□□ 2.16
TCF4-259	ENST00000627568	MCM7	P33993	719 aa		28.55	■■■□□ 2.16
TCF4-259	ENST00000627568	CA8	P35219	290 aa		28.55	■■■□□ 2.16
TCF4-259	ENST00000627568	RBM10	P98175	930 aa	Known RBP	28.55	■■■□□ 2.16
TCF4-259	ENST00000627568	VN1R2	Q8NFZ6	395 aa		28.55	■■■□□ 2.16
TCF4-259	ENST00000627568	ZSCAN31	Q96LW9	406 aa	Predicted RBP	28.55	■■■□□ 2.16
TCF4-259	ENST00000627568	XPNPEP1	Q9NQW7	623 aa		28.55	■■■□□ 2.16
TCF4-259	ENST00000627568	TBC1D13	Q9NVG8	400 aa		28.55	■■■□□ 2.16
TCF4-259	ENST00000627568	C5orf42	Q9H799	3197 aa		28.54	■■■□□ 2.16
TCF4-259	ENST00000627568	POTEM	A6NI47	508 aa		28.54	■■■□□ 2.16
TCF4-259	ENST00000627568	HMGN5	P82970	282 aa	Known RBP	28.54	■■■□□ 2.16
TCF4-259	ENST00000627568	NCBP1	Q09161	790 aa	Known RBP	28.54	■■■□□ 2.16
TCF4-259	ENST00000627568	GNL2	Q13823	731 aa	Known RBP	28.54	■■■□□ 2.16
TCF4-259	ENST00000627568	PCBP1	Q15365	356 aa	Known RBP eCLIP	28.54	■■■□□ 2.16
TCF4-259	ENST00000627568	CNTNAP2	Q9UHC6	1331 aa		28.53	■■■□□ 2.16
TCF4-259	ENST00000627568	MEIS3P2	A8K0S8	358 aa		28.53	■■■□□ 2.16
TCF4-259	ENST00000627568	OFD1	O75665	1012 aa		28.53	■■■□□ 2.16
TCF4-259	ENST00000627568	LLGL2	Q6P1M3	1020 aa		28.53	■■■□□ 2.16
TCF4-259	ENST00000627568	FAM184A	Q8NB25	1140 aa		28.53	■■■□□ 2.16
TCF4-259	ENST00000627568	GBP3	Q9H0R5	595 aa		28.53	■■■□□ 2.16
TCF4-259	ENST00000627568	RSAD1	Q9HA92	442 aa		28.53	■■■□□ 2.16
TCF4-259	ENST00000627568	SH2B1	Q9NRF2	756 aa	Predicted RBP	28.53	■■■□□ 2.16
TCF4-259	ENST00000627568	PRR33	A8MZF0	331 aa		28.52	■■■□□ 2.16
TCF4-259	ENST00000627568	AXL	P30530	894 aa		28.52	■■■□□ 2.16
TCF4-259	ENST00000627568	HOXA11	P31270	313 aa	Predicted RBP	28.52	■■■□□ 2.16
TCF4-259	ENST00000627568	TEC	P42680	631 aa		28.52	■■■□□ 2.16
TCF4-259	ENST00000627568	RARRES1	P49788	294 aa		28.52	■■■□□ 2.16
TCF4-259	ENST00000627568	TMEM184A	Q6ZMB5	413 aa		28.52	■■■□□ 2.16
TCF4-259	ENST00000627568	TMEM60	Q9H2L4	133 aa		28.52	■■■□□ 2.16
TCF4-259	ENST00000627568	FOXP1	Q9H334	677 aa	Predicted RBP	28.52	■■■□□ 2.16

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