RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000624770.1

CR392000.1-201, humanhuman

BASIC

Gene CR392000.1, Length 1,228 nt, Biotype TEC.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CR392000.1-201ENST00000624770 FBXO2Q9UK22 296 aaPredicted RBP21.5■■□□□ 1.03
CR392000.1-201ENST00000624770 SRPRBQ9Y5M8 271 aaKnown RBP21.5■■□□□ 1.03
CR392000.1-201ENST00000624770 LIG1P18858 919 aa21.49■■□□□ 1.03
CR392000.1-201ENST00000624770 CTNNB1P35222 781 aa21.49■■□□□ 1.03
CR392000.1-201ENST00000624770 DHX8Q14562 1220 aaKnown RBP21.49■■□□□ 1.03
CR392000.1-201ENST00000624770 SLC39A14Q15043 492 aa21.49■■□□□ 1.03
CR392000.1-201ENST00000624770 KARSQ15046 597 aaKnown RBP21.49■■□□□ 1.03
CR392000.1-201ENST00000624770 CCDC85BQ15834 202 aaPredicted RBP21.49■■□□□ 1.03
CR392000.1-201ENST00000624770 TMEM119Q4V9L6 283 aa21.49■■□□□ 1.03
CR392000.1-201ENST00000624770 SPOUT1Q5T280 376 aaKnown RBP21.49■■□□□ 1.03
CR392000.1-201ENST00000624770 RINT1Q6NUQ1 792 aa21.49■■□□□ 1.03
CR392000.1-201ENST00000624770 ZBTB8OSQ8IWT0 167 aa21.49■■□□□ 1.03
CR392000.1-201ENST00000624770 DEPTORQ8TB45 409 aa21.49■■□□□ 1.03
CR392000.1-201ENST00000624770 BSNDQ8WZ55 320 aa21.49■■□□□ 1.03
CR392000.1-201ENST00000624770 CPB2Q96IY4 423 aa21.49■■□□□ 1.03
CR392000.1-201ENST00000624770 RUSC1Q9BVN2 902 aa21.49■■□□□ 1.03
CR392000.1-201ENST00000624770 MRPL42Q9Y6G3 142 aaKnown RBP21.49■■□□□ 1.03
CR392000.1-201ENST00000624770 GTPBP6O43824 516 aaPredicted RBP21.48■■□□□ 1.03
CR392000.1-201ENST00000624770 HIP1RO75146 1068 aa21.48■■□□□ 1.03
CR392000.1-201ENST00000624770 PLA2G4BP0C869 781 aa21.48■■□□□ 1.03
CR392000.1-201ENST00000624770 MBTD1Q05BQ5 628 aa21.48■■□□□ 1.03
CR392000.1-201ENST00000624770 RAD51AP2Q09MP3 1159 aa21.48■■□□□ 1.03
CR392000.1-201ENST00000624770 IFNLR1Q8IU57 520 aaPredicted RBP21.48■■□□□ 1.03
CR392000.1-201ENST00000624770 ABI1Q8IZP0 508 aa21.48■■□□□ 1.03
CR392000.1-201ENST00000624770 KIFAP3Q92845 792 aa21.48■■□□□ 1.03
CR392000.1-201ENST00000624770 EPSTI1Q96J88 318 aa21.48■■□□□ 1.03
CR392000.1-201ENST00000624770 SAMD11Q96NU1 681 aa21.48■■□□□ 1.03
CR392000.1-201ENST00000624770 FAM105AQ9NUU6 356 aa21.48■■□□□ 1.03
CR392000.1-201ENST00000624770 SLC26A4O43511 780 aa21.47■■□□□ 1.03
CR392000.1-201ENST00000624770 TSPAN1O60635 241 aa21.47■■□□□ 1.03
CR392000.1-201ENST00000624770 EOMESO95936 686 aa21.47■■□□□ 1.03
CR392000.1-201ENST00000624770 SKIP12755 728 aa21.47■■□□□ 1.03
CR392000.1-201ENST00000624770 PLCG1P19174 1290 aa21.47■■□□□ 1.03
CR392000.1-201ENST00000624770 HOXA11P31270 313 aaPredicted RBP21.47■■□□□ 1.03
CR392000.1-201ENST00000624770 BMPR1AP36894 532 aa21.47■■□□□ 1.03
CR392000.1-201ENST00000624770 PPP2R5AQ15172 486 aa21.47■■□□□ 1.03
CR392000.1-201ENST00000624770 C1orf186Q6ZWK4 172 aa21.47■■□□□ 1.03
CR392000.1-201ENST00000624770 USP49Q70CQ1 688 aa21.47■■□□□ 1.03
CR392000.1-201ENST00000624770 KCTD17Q8N5Z5 321 aa21.47■■□□□ 1.03
CR392000.1-201ENST00000624770 SYT2Q8N9I0 419 aaPredicted RBP21.47■■□□□ 1.03
CR392000.1-201ENST00000624770 KRI1Q8N9T8 703 aaKnown RBP21.47■■□□□ 1.03
CR392000.1-201ENST00000624770 LPPQ93052 612 aa21.47■■□□□ 1.03
CR392000.1-201ENST00000624770 NFKBIZQ9BYH8 718 aa21.47■■□□□ 1.03
CR392000.1-201ENST00000624770 CHD9Q3L8U1 2897 aa21.47■■□□□ 1.03
CR392000.1-201ENST00000624770 CCDC169A6NNP5 214 aa21.46■■□□□ 1.03
CR392000.1-201ENST00000624770 SFI1A8K8P3 1242 aa21.46■■□□□ 1.03
CR392000.1-201ENST00000624770 B4GALT5O43286 388 aa21.46■■□□□ 1.03
CR392000.1-201ENST00000624770 HOXA2O43364 376 aa21.46■■□□□ 1.03
CR392000.1-201ENST00000624770 AXLP30530 894 aa21.46■■□□□ 1.03
CR392000.1-201ENST00000624770 NAMPTP43490 491 aa21.46■■□□□ 1.03
CR392000.1-201ENST00000624770 NASPP49321 788 aaPredicted RBP21.46■■□□□ 1.03
CR392000.1-201ENST00000624770 GPM6BQ13491 265 aa21.46■■□□□ 1.03
CR392000.1-201ENST00000624770 PCBP1Q15365 356 aaKnown RBP eCLIP21.46■■□□□ 1.03
CR392000.1-201ENST00000624770 TMEM132AQ24JP5 1023 aa21.46■■□□□ 1.03
CR392000.1-201ENST00000624770 NOTUMQ6P988 496 aa21.46■■□□□ 1.03
CR392000.1-201ENST00000624770 LINC00301Q8NCQ3 95 aa21.46■■□□□ 1.03
CR392000.1-201ENST00000624770 HELQQ8TDG4 1101 aa21.46■■□□□ 1.03
CR392000.1-201ENST00000624770 SYMPKQ92797 1274 aaKnown RBP21.46■■□□□ 1.03
CR392000.1-201ENST00000624770 CASD1Q96PB1 797 aa21.46■■□□□ 1.03
CR392000.1-201ENST00000624770 KIFC3Q9BVG8 833 aa21.46■■□□□ 1.03
CR392000.1-201ENST00000624770 CCSER1Q9C0I3 900 aa21.46■■□□□ 1.03
CR392000.1-201ENST00000624770 TMEM117Q9H0C3 514 aa21.46■■□□□ 1.03
CR392000.1-201ENST00000624770 C2orf40Q9H1Z8 148 aa21.46■■□□□ 1.03
CR392000.1-201ENST00000624770 RNF19AQ9NV58 838 aa21.46■■□□□ 1.03
CR392000.1-201ENST00000624770 CCDC39Q9UFE4 941 aa21.46■■□□□ 1.03
CR392000.1-201ENST00000624770 RWDD3Q9Y3V2 267 aa21.46■■□□□ 1.03
CR392000.1-201ENST00000624770 PCDHB2Q9Y5E7 798 aa21.46■■□□□ 1.03
CR392000.1-201ENST00000624770 NPHP3-ACAD11A0A0J9YXS1 232 aa21.45■■□□□ 1.02
CR392000.1-201ENST00000624770 SPTLC2O15270 562 aa21.45■■□□□ 1.02
CR392000.1-201ENST00000624770 LPXNO60711 386 aa21.45■■□□□ 1.02
CR392000.1-201ENST00000624770 ATF7P17544 494 aaPredicted RBP21.45■■□□□ 1.02
CR392000.1-201ENST00000624770 TXLNAP40222 546 aa21.45■■□□□ 1.02
CR392000.1-201ENST00000624770 RAB27AP51159 221 aa21.45■■□□□ 1.02
CR392000.1-201ENST00000624770 SLC12A3P55017 1021 aa21.45■■□□□ 1.02
CR392000.1-201ENST00000624770 PEX3P56589 373 aa21.45■■□□□ 1.02
CR392000.1-201ENST00000624770 MCM6Q14566 821 aa21.45■■□□□ 1.02
CR392000.1-201ENST00000624770 ZNF598Q86UK7 904 aaKnown RBP21.45■■□□□ 1.02
CR392000.1-201ENST00000624770 CLP1Q92989 425 aaKnown RBP21.45■■□□□ 1.02
CR392000.1-201ENST00000624770 TRAIPQ9BWF2 469 aa21.45■■□□□ 1.02
CR392000.1-201ENST00000624770 TYW1Q9NV66 732 aaKnown RBP21.45■■□□□ 1.02
CR392000.1-201ENST00000624770 PRMT7Q9NVM4 692 aaPredicted RBP21.45■■□□□ 1.02
CR392000.1-201ENST00000624770 MTCH2Q9Y6C9 303 aa21.45■■□□□ 1.02
CR392000.1-201ENST00000624770 LINC00271P0C7V0 271 aa21.44■■□□□ 1.02
CR392000.1-201ENST00000624770 ARF4P18085 180 aaPredicted RBP21.44■■□□□ 1.02
CR392000.1-201ENST00000624770 CACNB1Q02641 598 aaPredicted RBP21.44■■□□□ 1.02
CR392000.1-201ENST00000624770 AMHR2Q16671 573 aa21.44■■□□□ 1.02
CR392000.1-201ENST00000624770 CLLU1OSQ5K130 101 aa21.44■■□□□ 1.02
CR392000.1-201ENST00000624770 UBXN11Q5T124 520 aa21.44■■□□□ 1.02
CR392000.1-201ENST00000624770 CDCA2Q69YH5 1023 aaPredicted RBP21.44■■□□□ 1.02
CR392000.1-201ENST00000624770 GPBP1Q86WP2 473 aa21.44■■□□□ 1.02
CR392000.1-201ENST00000624770 CDR2LQ86X02 465 aaPredicted RBP21.44■■□□□ 1.02
CR392000.1-201ENST00000624770 PGBD4Q96DM1 585 aa21.44■■□□□ 1.02
CR392000.1-201ENST00000624770 DRC1Q96MC2 740 aa21.44■■□□□ 1.02
CR392000.1-201ENST00000624770 EIF2AQ9BY44 585 aaKnown RBP21.44■■□□□ 1.02
CR392000.1-201ENST00000624770 PANK2Q9BZ23 570 aa21.44■■□□□ 1.02
CR392000.1-201ENST00000624770 HCSTQ9UBK5 93 aa21.44■■□□□ 1.02
CR392000.1-201ENST00000624770 MEIS3P2A8K0S8 358 aa21.43■■□□□ 1.02
CR392000.1-201ENST00000624770 H3BNC9 293 aa21.43■■□□□ 1.02
CR392000.1-201ENST00000624770 CSPG5O95196 566 aa21.43■■□□□ 1.02
CR392000.1-201ENST00000624770 PRKCBP05771 671 aa21.43■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 66.5 ms