RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000623052.1

C9orf170-201, Transcript of chromosome 9 open reading frame 170, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene C9orf170, Length 3,239 nt, Biotype lincRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf170-201ENST00000623052 MUTP22033 750 aa14.47□□□□□ -0.09
C9orf170-201ENST00000623052 CTNNA1P35221 906 aaKnown RBP14.47□□□□□ -0.09
C9orf170-201ENST00000623052 PTENP60484 403 aa14.47□□□□□ -0.09
C9orf170-201ENST00000623052 HS2ST1Q7LGA3 356 aa14.47□□□□□ -0.09
C9orf170-201ENST00000623052 CPNE8Q86YQ8 564 aa14.47□□□□□ -0.09
C9orf170-201ENST00000623052 ZDHHC18Q9NUE0 388 aa14.47□□□□□ -0.09
C9orf170-201ENST00000623052 TMOD4Q9NZQ9 345 aa14.47□□□□□ -0.09
C9orf170-201ENST00000623052 EMSYQ7Z589 1322 aa14.47□□□□□ -0.09
C9orf170-201ENST00000623052 RPTORQ8N122 1335 aa14.47□□□□□ -0.09
C9orf170-201ENST00000623052 RGPD3A6NKT7 1758 aaPredicted RBP14.47□□□□□ -0.09
C9orf170-201ENST00000623052 RGPD4Q7Z3J3 1758 aa14.47□□□□□ -0.09
C9orf170-201ENST00000623052 PPP1R12BO60237 982 aaPredicted RBP14.47□□□□□ -0.09
C9orf170-201ENST00000623052 HPDP32754 393 aaPredicted RBP14.47□□□□□ -0.09
C9orf170-201ENST00000623052 EPC2Q52LR7 807 aa14.47□□□□□ -0.09
C9orf170-201ENST00000623052 LDHDQ86WU2 507 aa14.47□□□□□ -0.09
C9orf170-201ENST00000623052 ZNF473Q8WTR7 871 aaKnown RBP14.47□□□□□ -0.09
C9orf170-201ENST00000623052 KRT35Q92764 455 aa14.47□□□□□ -0.09
C9orf170-201ENST00000623052 AGBL1Q96MI9 1066 aa14.47□□□□□ -0.09
C9orf170-201ENST00000623052 SH2D3AQ9BRG2 576 aa14.47□□□□□ -0.09
C9orf170-201ENST00000623052 TEKT3Q9BXF9 490 aa14.47□□□□□ -0.09
C9orf170-201ENST00000623052 WDR11Q9BZH6 1224 aa14.47□□□□□ -0.09
C9orf170-201ENST00000623052 GOPCQ9HD26 462 aa14.47□□□□□ -0.09
C9orf170-201ENST00000623052 K7ENM7 598 aa14.46□□□□□ -0.09
C9orf170-201ENST00000623052 EXOC3O60645 756 aa14.46□□□□□ -0.09
C9orf170-201ENST00000623052 LIG3P49916 1009 aa14.46□□□□□ -0.09
C9orf170-201ENST00000623052 SAMD1Q6SPF0 538 aaPredicted RBP14.46□□□□□ -0.09
C9orf170-201ENST00000623052 PADI6Q6TGC4 694 aa14.46□□□□□ -0.09
C9orf170-201ENST00000623052 MYCBPAPQ8TBZ2 947 aa14.46□□□□□ -0.09
C9orf170-201ENST00000623052 PPM1EQ8WY54 764 aa14.46□□□□□ -0.09
C9orf170-201ENST00000623052 CTNNBL1Q8WYA6 563 aaPredicted RBP14.46□□□□□ -0.09
C9orf170-201ENST00000623052 PCDHB18PQ96TA0 734 aa14.46□□□□□ -0.09
C9orf170-201ENST00000623052 AGPAT1Q99943 283 aa14.46□□□□□ -0.09
C9orf170-201ENST00000623052 MXRA8Q9BRK3 442 aa14.46□□□□□ -0.09
C9orf170-201ENST00000623052 PAGR1Q9BTK6 254 aa14.46□□□□□ -0.09
C9orf170-201ENST00000623052 VCPKMTQ9H867 229 aa14.46□□□□□ -0.09
C9orf170-201ENST00000623052 A0A087WUV0 522 aaPredicted RBP14.46□□□□□ -0.09
C9orf170-201ENST00000623052 HSD17B4P51659 736 aa14.46□□□□□ -0.09
C9orf170-201ENST00000623052 SETQ01105 290 aaPredicted RBP14.46□□□□□ -0.09
C9orf170-201ENST00000623052 GLG1Q92896 1179 aa14.46□□□□□ -0.09
C9orf170-201ENST00000623052 TRIM31Q9BZY9 425 aa14.46□□□□□ -0.09
C9orf170-201ENST00000623052 ACP6Q9NPH0 428 aa14.46□□□□□ -0.09
C9orf170-201ENST00000623052 ZNF70Q9UC06 446 aaPredicted RBP14.46□□□□□ -0.09
C9orf170-201ENST00000623052 WDR81Q562E7 1941 aa14.45□□□□□ -0.1
C9orf170-201ENST00000623052 ARHGEF35A5YM69 484 aa14.45□□□□□ -0.1
C9orf170-201ENST00000623052 ANKRD62A6NC57 917 aa14.45□□□□□ -0.1
C9orf170-201ENST00000623052 DUPD1Q68J44 220 aa14.45□□□□□ -0.1
C9orf170-201ENST00000623052 ZNF746Q6NUN9 644 aaPredicted RBP14.45□□□□□ -0.1
C9orf170-201ENST00000623052 UBLCP1Q8WVY7 318 aaPredicted RBP14.45□□□□□ -0.1
C9orf170-201ENST00000623052 CARD9Q9H257 536 aa14.45□□□□□ -0.1
C9orf170-201ENST00000623052 H0YIN7 160 aa14.45□□□□□ -0.1
C9orf170-201ENST00000623052 NFIBO00712 420 aa14.45□□□□□ -0.1
C9orf170-201ENST00000623052 MYZAPP0CAP1 466 aa14.45□□□□□ -0.1
C9orf170-201ENST00000623052 CHRNB2P17787 502 aa14.45□□□□□ -0.1
C9orf170-201ENST00000623052 UGCGQ16739 394 aa14.45□□□□□ -0.1
C9orf170-201ENST00000623052 TTC31Q49AM3 519 aaPredicted RBP14.45□□□□□ -0.1
C9orf170-201ENST00000623052 ZDHHC24Q6UX98 284 aa14.45□□□□□ -0.1
C9orf170-201ENST00000623052 NLRP14Q86W24 1093 aa14.45□□□□□ -0.1
C9orf170-201ENST00000623052 LRRC45Q96CN5 670 aa14.45□□□□□ -0.1
C9orf170-201ENST00000623052 CENPHQ9H3R5 247 aa14.45□□□□□ -0.1
C9orf170-201ENST00000623052 UBE2TQ9NPD8 197 aaPredicted RBP14.45□□□□□ -0.1
C9orf170-201ENST00000623052 KCNH7Q9NS40 1196 aa14.45□□□□□ -0.1
C9orf170-201ENST00000623052 SEPT11Q9NVA2 429 aaKnown RBP14.45□□□□□ -0.1
C9orf170-201ENST00000623052 ZHX2Q9Y6X8 837 aa14.45□□□□□ -0.1
C9orf170-201ENST00000623052 ATXN2Q99700 1313 aaKnown RBP14.45□□□□□ -0.1
C9orf170-201ENST00000623052 TMOD1P28289 359 aa14.45□□□□□ -0.1
C9orf170-201ENST00000623052 GCLMP48507 274 aa14.45□□□□□ -0.1
C9orf170-201ENST00000623052 TBC1D10BQ4KMP7 808 aaPredicted RBP14.45□□□□□ -0.1
C9orf170-201ENST00000623052 CHADLQ6NUI6 762 aa14.45□□□□□ -0.1
C9orf170-201ENST00000623052 CLEC4DQ8WXI8 215 aa14.45□□□□□ -0.1
C9orf170-201ENST00000623052 CCT8L2Q96SF2 557 aa14.45□□□□□ -0.1
C9orf170-201ENST00000623052 TMEM39BQ9GZU3 492 aa14.45□□□□□ -0.1
C9orf170-201ENST00000623052 DEFB129Q9H1M3 183 aa14.45□□□□□ -0.1
C9orf170-201ENST00000623052 MRPL11Q9Y3B7 192 aaKnown RBP14.45□□□□□ -0.1
C9orf170-201ENST00000623052 ATMINO43313 823 aaPredicted RBP14.44□□□□□ -0.1
C9orf170-201ENST00000623052 PPFIA2O75334 1257 aa14.44□□□□□ -0.1
C9orf170-201ENST00000623052 ADRB2P07550 413 aa14.44□□□□□ -0.1
C9orf170-201ENST00000623052 TNFAIP3P21580 790 aa14.44□□□□□ -0.1
C9orf170-201ENST00000623052 INPP5BP32019 993 aa14.44□□□□□ -0.1
C9orf170-201ENST00000623052 HADHBP55084 474 aaKnown RBP14.44□□□□□ -0.1
C9orf170-201ENST00000623052 DHX9Q08211 1270 aaKnown RBP14.44□□□□□ -0.1
C9orf170-201ENST00000623052 MIGA2Q7L4E1 593 aa14.44□□□□□ -0.1
C9orf170-201ENST00000623052 TMEM174Q8WUU8 243 aa14.44□□□□□ -0.1
C9orf170-201ENST00000623052 BBXQ8WY36 941 aaPredicted RBP14.44□□□□□ -0.1
C9orf170-201ENST00000623052 UTP3Q9NQZ2 479 aaKnown RBP eCLIP14.44□□□□□ -0.1
C9orf170-201ENST00000623052 NOCTQ9UK39 431 aaKnown RBP14.44□□□□□ -0.1
C9orf170-201ENST00000623052 A6NNZ2 444 aa14.44□□□□□ -0.1
C9orf170-201ENST00000623052 PLA2G6O60733 806 aa14.44□□□□□ -0.1
C9orf170-201ENST00000623052 SHBGP04278 402 aa14.44□□□□□ -0.1
C9orf170-201ENST00000623052 PTGER2P43116 358 aa14.44□□□□□ -0.1
C9orf170-201ENST00000623052 PTGIRP43119 386 aa14.44□□□□□ -0.1
C9orf170-201ENST00000623052 PRPF4BQ13523 1007 aaKnown RBP14.44□□□□□ -0.1
C9orf170-201ENST00000623052 DGKZQ13574 1117 aa14.44□□□□□ -0.1
C9orf170-201ENST00000623052 TUBB8Q3ZCM7 444 aa14.44□□□□□ -0.1
C9orf170-201ENST00000623052 TTC27Q6P3X3 843 aa14.44□□□□□ -0.1
C9orf170-201ENST00000623052 TEX2Q8IWB9 1127 aa14.44□□□□□ -0.1
C9orf170-201ENST00000623052 SYCP3Q8IZU3 236 aa14.44□□□□□ -0.1
C9orf170-201ENST00000623052 FAM151AQ8WW52 585 aa14.44□□□□□ -0.1
C9orf170-201ENST00000623052 C18orf8Q96DM3 657 aa14.44□□□□□ -0.1
C9orf170-201ENST00000623052 GMLQ99445 158 aa14.44□□□□□ -0.1
C9orf170-201ENST00000623052 RIT2Q99578 217 aa14.44□□□□□ -0.1
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.5 ms