RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000622362.1

FAM200B-223, Transcript of family with sequence similarity 200 member B, human

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene FAM200B, Length 4,377 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
FAM200B-223	ENST00000622362	ARL4A	P40617	200 aa		12.48	□□□□□ -0.41
FAM200B-223	ENST00000622362	MRPS15	P82914	257 aa	Known RBP	12.48	□□□□□ -0.41
FAM200B-223	ENST00000622362	SKOR1	P84550	965 aa		12.48	□□□□□ -0.41
FAM200B-223	ENST00000622362	TSTA3	Q13630	321 aa	Predicted RBP	12.48	□□□□□ -0.41
FAM200B-223	ENST00000622362	CNGA3	Q16281	694 aa		12.48	□□□□□ -0.41
FAM200B-223	ENST00000622362	PPP6R3	Q5H9R7	873 aa	Predicted RBP	12.48	□□□□□ -0.41
FAM200B-223	ENST00000622362	HNRNPLL	Q8WVV9	542 aa	Known RBP	12.48	□□□□□ -0.41
FAM200B-223	ENST00000622362	TEKT4	Q8WW24	435 aa		12.48	□□□□□ -0.41
FAM200B-223	ENST00000622362	ADPGK	Q9BRR6	497 aa		12.48	□□□□□ -0.41
FAM200B-223	ENST00000622362	TMEM206	Q9H813	350 aa		12.48	□□□□□ -0.41
FAM200B-223	ENST00000622362	KIF9	Q9HAQ2	790 aa		12.48	□□□□□ -0.41
FAM200B-223	ENST00000622362	KMT5A	Q9NQR1	393 aa		12.48	□□□□□ -0.41
FAM200B-223	ENST00000622362	TMEM51	Q9NW97	253 aa		12.48	□□□□□ -0.41
FAM200B-223	ENST00000622362	STX18	Q9P2W9	335 aa	Known RBP	12.48	□□□□□ -0.41
FAM200B-223	ENST00000622362	ANGPTL3	Q9Y5C1	460 aa		12.48	□□□□□ -0.41
FAM200B-223	ENST00000622362	SNX5	Q9Y5X3	404 aa		12.48	□□□□□ -0.41
FAM200B-223	ENST00000622362	PRPSAP2	O60256	369 aa		12.48	□□□□□ -0.41
FAM200B-223	ENST00000622362	FTL	P02792	175 aa	Predicted RBP	12.48	□□□□□ -0.41
FAM200B-223	ENST00000622362	TMED10	P49755	219 aa	Known RBP	12.48	□□□□□ -0.41
FAM200B-223	ENST00000622362	PRPSAP1	Q14558	356 aa		12.48	□□□□□ -0.41
FAM200B-223	ENST00000622362	STRBP	Q96SI9	672 aa	Known RBP	12.48	□□□□□ -0.41
FAM200B-223	ENST00000622362	TRIM51	Q9BSJ1	452 aa		12.48	□□□□□ -0.41
FAM200B-223	ENST00000622362	ADD3	Q9UEY8	706 aa	Known RBP	12.48	□□□□□ -0.41
FAM200B-223	ENST00000622362	TCHH	Q07283	1943 aa		12.48	□□□□□ -0.41
FAM200B-223	ENST00000622362	PALM3	A6NDB9	673 aa	Predicted RBP	12.48	□□□□□ -0.41
FAM200B-223	ENST00000622362	IGF2BP3	O00425	579 aa	Known RBP eCLIP	12.48	□□□□□ -0.41
FAM200B-223	ENST00000622362	PHKG2	P15735	406 aa		12.48	□□□□□ -0.41
FAM200B-223	ENST00000622362	GCLM	P48507	274 aa		12.48	□□□□□ -0.41
FAM200B-223	ENST00000622362	NEK2	P51955	445 aa		12.48	□□□□□ -0.41
FAM200B-223	ENST00000622362	BTK	Q06187	659 aa		12.48	□□□□□ -0.41
FAM200B-223	ENST00000622362	MKRN3	Q13064	507 aa	Known RBP	12.48	□□□□□ -0.41
FAM200B-223	ENST00000622362	PDIA2	Q13087	525 aa	Known RBP	12.48	□□□□□ -0.41
FAM200B-223	ENST00000622362	GPS1	Q13098	491 aa		12.48	□□□□□ -0.41
FAM200B-223	ENST00000622362	PRKG1	Q13976	671 aa		12.48	□□□□□ -0.41
FAM200B-223	ENST00000622362	KIF19	Q2TAC6	998 aa		12.48	□□□□□ -0.41
FAM200B-223	ENST00000622362	HABP4	Q5JVS0	413 aa	Known RBP	12.48	□□□□□ -0.41
FAM200B-223	ENST00000622362	RARS2	Q5T160	578 aa	Known RBP	12.48	□□□□□ -0.41
FAM200B-223	ENST00000622362	OR6B2	Q6IFH4	312 aa		12.48	□□□□□ -0.41
FAM200B-223	ENST00000622362	KIAA0825	Q8IV33	1275 aa		12.48	□□□□□ -0.41
FAM200B-223	ENST00000622362	CCNYL1	Q8N7R7	359 aa		12.48	□□□□□ -0.41
FAM200B-223	ENST00000622362	FBXL13	Q8NEE6	735 aa		12.48	□□□□□ -0.41
FAM200B-223	ENST00000622362	C9orf72	Q96LT7	481 aa		12.48	□□□□□ -0.41
FAM200B-223	ENST00000622362	CPVL	Q9H3G5	476 aa		12.48	□□□□□ -0.41
FAM200B-223	ENST00000622362	EIF2AK3	Q9NZJ5	1116 aa	Known RBP	12.48	□□□□□ -0.41
FAM200B-223	ENST00000622362	L1RE1	Q9UN81	338 aa		12.48	□□□□□ -0.41
FAM200B-223	ENST00000622362	USP17L3	A6NCW0	530 aa		12.48	□□□□□ -0.41
FAM200B-223	ENST00000622362	USP17L4	A6NCW7	530 aa		12.48	□□□□□ -0.41
FAM200B-223	ENST00000622362	LPXN	O60711	386 aa		12.48	□□□□□ -0.41
FAM200B-223	ENST00000622362	SKAP2	O75563	359 aa	Predicted RBP	12.48	□□□□□ -0.41
FAM200B-223	ENST00000622362	USP17L8	P0C7I0	530 aa		12.48	□□□□□ -0.41
FAM200B-223	ENST00000622362	UBTFL6	P0CB48	400 aa	Predicted RBP	12.48	□□□□□ -0.41
FAM200B-223	ENST00000622362	CAV1	Q03135	178 aa		12.48	□□□□□ -0.41
FAM200B-223	ENST00000622362	MKRN4P	Q13434	485 aa	Predicted RBP	12.48	□□□□□ -0.41
FAM200B-223	ENST00000622362	CRYM	Q14894	314 aa		12.48	□□□□□ -0.41
FAM200B-223	ENST00000622362	SMAD1	Q15797	465 aa	Known RBP	12.48	□□□□□ -0.41
FAM200B-223	ENST00000622362	PTGIS	Q16647	500 aa		12.48	□□□□□ -0.41
FAM200B-223	ENST00000622362	CDO1	Q16878	200 aa		12.48	□□□□□ -0.41
FAM200B-223	ENST00000622362	TXNRD1	Q16881	649 aa		12.48	□□□□□ -0.41
FAM200B-223	ENST00000622362	ASPRV1	Q53RT3	343 aa		12.48	□□□□□ -0.41
FAM200B-223	ENST00000622362	MDH1B	Q5I0G3	518 aa		12.48	□□□□□ -0.41
FAM200B-223	ENST00000622362	USP17L1	Q7RTZ2	530 aa		12.48	□□□□□ -0.41
FAM200B-223	ENST00000622362	TBC1D10C	Q8IV04	446 aa		12.48	□□□□□ -0.41
FAM200B-223	ENST00000622362	AGR3	Q8TD06	166 aa		12.48	□□□□□ -0.41
FAM200B-223	ENST00000622362	DYNLL2	Q96FJ2	89 aa		12.48	□□□□□ -0.41
FAM200B-223	ENST00000622362	ATG3	Q9NT62	314 aa		12.48	□□□□□ -0.41
FAM200B-223	ENST00000622362	ZNF229	Q9UJW7	825 aa		12.48	□□□□□ -0.41
FAM200B-223	ENST00000622362	TBX22	Q9Y458	520 aa		12.48	□□□□□ -0.41
FAM200B-223	ENST00000622362	PPP1R12A	O14974	1030 aa	Predicted RBP	12.47	□□□□□ -0.41
FAM200B-223	ENST00000622362	SEC24D	O94855	1032 aa	Predicted RBP	12.47	□□□□□ -0.41
FAM200B-223	ENST00000622362	SYF2	O95926	243 aa	Known RBP	12.47	□□□□□ -0.41
FAM200B-223	ENST00000622362	AGT	P01019	485 aa		12.47	□□□□□ -0.41
FAM200B-223	ENST00000622362	SLC4A1	P02730	911 aa		12.47	□□□□□ -0.41
FAM200B-223	ENST00000622362	PRAME	P78395	509 aa		12.47	□□□□□ -0.41
FAM200B-223	ENST00000622362	HIC1	Q14526	733 aa		12.47	□□□□□ -0.41
FAM200B-223	ENST00000622362	AGGF1	Q8N302	714 aa	eCLIP	12.47	□□□□□ -0.41
FAM200B-223	ENST00000622362	TTC25	Q96NG3	672 aa		12.47	□□□□□ -0.41
FAM200B-223	ENST00000622362	NBPF3	Q9H094	633 aa		12.47	□□□□□ -0.41
FAM200B-223	ENST00000622362	IL25	Q9H293	177 aa		12.47	□□□□□ -0.41
FAM200B-223	ENST00000622362	CACYBP	Q9HB71	228 aa	Known RBP	12.47	□□□□□ -0.41
FAM200B-223	ENST00000622362	PIH1D3	Q9NQM4	214 aa	Known RBP	12.47	□□□□□ -0.41
FAM200B-223	ENST00000622362	NOD1	Q9Y239	953 aa		12.47	□□□□□ -0.41
FAM200B-223	ENST00000622362	ENO1	P06733	434 aa	Known RBP	12.47	□□□□□ -0.41
FAM200B-223	ENST00000622362	CTCF	P49711	727 aa	Predicted RBP	12.47	□□□□□ -0.41
FAM200B-223	ENST00000622362	THOC5	Q13769	683 aa	Known RBP	12.47	□□□□□ -0.41
FAM200B-223	ENST00000622362	TRIP10	Q15642	601 aa		12.47	□□□□□ -0.41
FAM200B-223	ENST00000622362	PROM2	Q8N271	834 aa		12.47	□□□□□ -0.41
FAM200B-223	ENST00000622362	MDM1	Q8TC05	714 aa		12.47	□□□□□ -0.41
FAM200B-223	ENST00000622362	PIGO	Q8TEQ8	1089 aa		12.47	□□□□□ -0.41
FAM200B-223	ENST00000622362	EXT2	Q93063	718 aa		12.47	□□□□□ -0.41
FAM200B-223	ENST00000622362	C11orf70	Q9BRQ4	267 aa		12.47	□□□□□ -0.41
FAM200B-223	ENST00000622362	ASCC2	Q9H1I8	757 aa	Predicted RBP	12.47	□□□□□ -0.41
FAM200B-223	ENST00000622362	IPO11	Q9UI26	975 aa	Known RBP	12.47	□□□□□ -0.41
FAM200B-223	ENST00000622362	TFR2	Q9UP52	801 aa		12.47	□□□□□ -0.41
FAM200B-223	ENST00000622362	ADAMTSL3	P82987	1691 aa		12.47	□□□□□ -0.41
FAM200B-223	ENST00000622362	USP42	Q9H9J4	1324 aa	Known RBP	12.47	□□□□□ -0.41
FAM200B-223	ENST00000622362	INO80B-WBP1	J3KQ70	363 aa		12.47	□□□□□ -0.41
FAM200B-223	ENST00000622362	PFDN6	O15212	129 aa		12.47	□□□□□ -0.41
FAM200B-223	ENST00000622362	PYGB	P11216	843 aa		12.47	□□□□□ -0.41
FAM200B-223	ENST00000622362	KPNA2	P52292	529 aa	Known RBP	12.47	□□□□□ -0.41
FAM200B-223	ENST00000622362	DRAP1	Q14919	205 aa	Predicted RBP	12.47	□□□□□ -0.41

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