RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000609525.1

CSNK2A1-208, Transcript of casein kinase 2 alpha 1, human

TSL 5

Gene CSNK2A1, Length 581 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CSNK2A1-208	ENST00000609525	GCDH	Q92947	438 aa	Predicted RBP	6.08	□□□□□ -1.44
CSNK2A1-208	ENST00000609525	CDK11A	Q9UQ88	783 aa	Predicted RBP	6.08	□□□□□ -1.44
CSNK2A1-208	ENST00000609525	MIA2	Q96PC5	1412 aa		6.08	□□□□□ -1.44
CSNK2A1-208	ENST00000609525	ZNF142	P52746	1687 aa	Predicted RBP	6.07	□□□□□ -1.44
CSNK2A1-208	ENST00000609525	CTTNBP2	Q8WZ74	1663 aa		6.07	□□□□□ -1.44
CSNK2A1-208	ENST00000609525	RAPGEF6	Q8TEU7	1601 aa		6.07	□□□□□ -1.44
CSNK2A1-208	ENST00000609525	XDH	P47989	1333 aa		6.07	□□□□□ -1.44
CSNK2A1-208	ENST00000609525	VWDE	Q8N2E2	1590 aa		6.07	□□□□□ -1.44
CSNK2A1-208	ENST00000609525	DIP2C	Q9Y2E4	1556 aa		6.07	□□□□□ -1.44
CSNK2A1-208	ENST00000609525	RANGAP1	P46060	587 aa	Predicted RBP	6.07	□□□□□ -1.44
CSNK2A1-208	ENST00000609525	GABRE	P78334	506 aa		6.07	□□□□□ -1.44
CSNK2A1-208	ENST00000609525	EFCAB2	Q5VUJ9	269 aa		6.07	□□□□□ -1.44
CSNK2A1-208	ENST00000609525	NOSTRIN	Q8IVI9	506 aa		6.07	□□□□□ -1.44
CSNK2A1-208	ENST00000609525	SYNE4	Q8N205	404 aa		6.07	□□□□□ -1.44
CSNK2A1-208	ENST00000609525	CISD2	Q8N5K1	135 aa	Known RBP	6.07	□□□□□ -1.44
CSNK2A1-208	ENST00000609525	GPR150	Q8NGU9	434 aa		6.07	□□□□□ -1.44
CSNK2A1-208	ENST00000609525	GFM2	Q969S9	779 aa	Known RBP	6.07	□□□□□ -1.44
CSNK2A1-208	ENST00000609525	SAE1	Q9UBE0	346 aa	Predicted RBP	6.07	□□□□□ -1.44
CSNK2A1-208	ENST00000609525	RBM8A	Q9Y5S9	174 aa	Known RBP	6.07	□□□□□ -1.44
CSNK2A1-208	ENST00000609525	AGL	P35573	1532 aa		6.06	□□□□□ -1.44
CSNK2A1-208	ENST00000609525	POLR1A	O95602	1720 aa	Predicted RBP	6.06	□□□□□ -1.44
CSNK2A1-208	ENST00000609525	GOLGA6L22	H0YM25	854 aa		6.06	□□□□□ -1.44
CSNK2A1-208	ENST00000609525	CRTAM	O95727	393 aa		6.06	□□□□□ -1.44
CSNK2A1-208	ENST00000609525	LMNA	P02545	664 aa	Known RBP	6.06	□□□□□ -1.44
CSNK2A1-208	ENST00000609525	C6orf222	P0C671	652 aa	Predicted RBP	6.06	□□□□□ -1.44
CSNK2A1-208	ENST00000609525	ATXN1	P54253	815 aa	Known RBP	6.06	□□□□□ -1.44
CSNK2A1-208	ENST00000609525	BPIFB4	P59827	614 aa		6.06	□□□□□ -1.44
CSNK2A1-208	ENST00000609525	MRPS21	P82921	87 aa	Known RBP	6.06	□□□□□ -1.44
CSNK2A1-208	ENST00000609525	FAM50A	Q14320	339 aa	Known RBP	6.06	□□□□□ -1.44
CSNK2A1-208	ENST00000609525	CSRP2	Q16527	193 aa		6.06	□□□□□ -1.44
CSNK2A1-208	ENST00000609525	RABL3	Q5HYI8	236 aa		6.06	□□□□□ -1.44
CSNK2A1-208	ENST00000609525	FAM209A	Q5JX71	171 aa		6.06	□□□□□ -1.44
CSNK2A1-208	ENST00000609525	ZNF276	Q8N554	614 aa		6.06	□□□□□ -1.44
CSNK2A1-208	ENST00000609525	ANKRD53	Q8N9V6	530 aa		6.06	□□□□□ -1.44
CSNK2A1-208	ENST00000609525	LENG9	Q96B70	501 aa		6.06	□□□□□ -1.44
CSNK2A1-208	ENST00000609525	GPHA2	Q96T91	129 aa		6.06	□□□□□ -1.44
CSNK2A1-208	ENST00000609525	TINF2	Q9BSI4	451 aa		6.06	□□□□□ -1.44
CSNK2A1-208	ENST00000609525	RIOX1	Q9H6W3	641 aa		6.06	□□□□□ -1.44
CSNK2A1-208	ENST00000609525	PACSIN3	Q9UKS6	424 aa		6.06	□□□□□ -1.44
CSNK2A1-208	ENST00000609525	NEURL4	Q96JN8	1562 aa		6.06	□□□□□ -1.44
CSNK2A1-208	ENST00000609525	ROCK1	Q13464	1354 aa		6.06	□□□□□ -1.44
CSNK2A1-208	ENST00000609525	MTUS2	Q5JR59	1369 aa		6.06	□□□□□ -1.44
CSNK2A1-208	ENST00000609525	ZNF518A	Q6AHZ1	1483 aa		6.05	□□□□□ -1.44
CSNK2A1-208	ENST00000609525	UBE2QL1	A1L167	161 aa		6.05	□□□□□ -1.44
CSNK2A1-208	ENST00000609525	APP	P05067	770 aa		6.05	□□□□□ -1.44
CSNK2A1-208	ENST00000609525	YY1	P25490	414 aa		6.05	□□□□□ -1.44
CSNK2A1-208	ENST00000609525	RAB33A	Q14088	237 aa		6.05	□□□□□ -1.44
CSNK2A1-208	ENST00000609525	TMEM132B	Q14DG7	1078 aa		6.05	□□□□□ -1.44
CSNK2A1-208	ENST00000609525	TM4SF20	Q53R12	229 aa		6.05	□□□□□ -1.44
CSNK2A1-208	ENST00000609525	SPATC1	Q76KD6	591 aa		6.05	□□□□□ -1.44
CSNK2A1-208	ENST00000609525	VRK3	Q8IV63	474 aa		6.05	□□□□□ -1.44
CSNK2A1-208	ENST00000609525	ERCC4	Q92889	916 aa	Predicted RBP	6.05	□□□□□ -1.44
CSNK2A1-208	ENST00000609525	NAF1	Q96HR8	494 aa	Known RBP	6.05	□□□□□ -1.44
CSNK2A1-208	ENST00000609525	TCF25	Q9BQ70	676 aa		6.05	□□□□□ -1.44
CSNK2A1-208	ENST00000609525	TRIM55	Q9BYV6	548 aa		6.05	□□□□□ -1.44
CSNK2A1-208	ENST00000609525	PTGFRN	Q9P2B2	879 aa		6.05	□□□□□ -1.44
CSNK2A1-208	ENST00000609525	ZNHIT2	Q9UHR6	403 aa		6.05	□□□□□ -1.44
CSNK2A1-208	ENST00000609525	DENND2A	Q9ULE3	1009 aa		6.05	□□□□□ -1.44
CSNK2A1-208	ENST00000609525	ABCA6	Q8N139	1617 aa		6.05	□□□□□ -1.44
CSNK2A1-208	ENST00000609525	SRCAP	Q6ZRS2	3230 aa		6.05	□□□□□ -1.44
CSNK2A1-208	ENST00000609525	NPHP4	O75161	1426 aa	Predicted RBP	6.05	□□□□□ -1.44
CSNK2A1-208	ENST00000609525	MYOM3	Q5VTT5	1437 aa		6.05	□□□□□ -1.44
CSNK2A1-208	ENST00000609525	CLTC	Q00610	1675 aa	Known RBP	6.04	□□□□□ -1.44
CSNK2A1-208	ENST00000609525	DNMT1	P26358	1616 aa	Known RBP	6.04	□□□□□ -1.44
CSNK2A1-208	ENST00000609525	C2orf78	A6NCI8	922 aa		6.04	□□□□□ -1.44
CSNK2A1-208	ENST00000609525	RASSF10	A6NK89	507 aa		6.04	□□□□□ -1.44
CSNK2A1-208	ENST00000609525	GOLGA6L6	A8MZA4	724 aa		6.04	□□□□□ -1.44
CSNK2A1-208	ENST00000609525	ADCY3	O60266	1144 aa		6.04	□□□□□ -1.44
CSNK2A1-208	ENST00000609525	SDHA	P31040	664 aa		6.04	□□□□□ -1.44
CSNK2A1-208	ENST00000609525	TCIRG1	Q13488	830 aa		6.04	□□□□□ -1.44
CSNK2A1-208	ENST00000609525	PTPA	Q15257	358 aa		6.04	□□□□□ -1.44
CSNK2A1-208	ENST00000609525	LY6G5C	Q5SRR4	150 aa		6.04	□□□□□ -1.44
CSNK2A1-208	ENST00000609525	MNT	Q99583	582 aa		6.04	□□□□□ -1.44
CSNK2A1-208	ENST00000609525	IL23A	Q9NPF7	189 aa		6.04	□□□□□ -1.44
CSNK2A1-208	ENST00000609525	TRPS1	Q9UHF7	1281 aa		6.04	□□□□□ -1.44
CSNK2A1-208	ENST00000609525	MAGEL2	Q9UJ55	1249 aa		6.04	□□□□□ -1.44
CSNK2A1-208	ENST00000609525	B3GALT1	Q9Y5Z6	326 aa		6.04	□□□□□ -1.44
CSNK2A1-208	ENST00000609525	PLCH2	O75038	1416 aa		6.04	□□□□□ -1.44
CSNK2A1-208	ENST00000609525	KTN1	Q86UP2	1357 aa	Known RBP	6.04	□□□□□ -1.44
CSNK2A1-208	ENST00000609525	MROH2A	A6NES4	1674 aa		6.04	□□□□□ -1.44
CSNK2A1-208	ENST00000609525	A2ML1	A8K2U0	1454 aa		6.03	□□□□□ -1.44
CSNK2A1-208	ENST00000609525	NUP153	P49790	1475 aa	Known RBP	6.03	□□□□□ -1.44
CSNK2A1-208	ENST00000609525	RERE	Q9P2R6	1566 aa		6.03	□□□□□ -1.44
CSNK2A1-208	ENST00000609525	NAIP	Q13075	1403 aa		6.03	□□□□□ -1.44
CSNK2A1-208	ENST00000609525	KLRG2	A4D1S0	409 aa	Predicted RBP	6.03	□□□□□ -1.44
CSNK2A1-208	ENST00000609525	MFAP3L	O75121	409 aa		6.03	□□□□□ -1.44
CSNK2A1-208	ENST00000609525	RABGGTB	P53611	331 aa		6.03	□□□□□ -1.44
CSNK2A1-208	ENST00000609525	FKBP15	Q5T1M5	1219 aa		6.03	□□□□□ -1.44
CSNK2A1-208	ENST00000609525	LRCH2	Q5VUJ6	765 aa		6.03	□□□□□ -1.44
CSNK2A1-208	ENST00000609525	FOXB2	Q5VYV0	432 aa		6.03	□□□□□ -1.44
CSNK2A1-208	ENST00000609525	MFSD5	Q6N075	450 aa		6.03	□□□□□ -1.44
CSNK2A1-208	ENST00000609525	GGT6	Q6P531	493 aa		6.03	□□□□□ -1.44
CSNK2A1-208	ENST00000609525	RHOU	Q7L0Q8	258 aa		6.03	□□□□□ -1.44
CSNK2A1-208	ENST00000609525	ZBTB38	Q8NAP3	1195 aa	Predicted RBP	6.03	□□□□□ -1.44
CSNK2A1-208	ENST00000609525	PROKR1	Q8TCW9	393 aa		6.03	□□□□□ -1.44
CSNK2A1-208	ENST00000609525	DLG3	Q92796	817 aa		6.03	□□□□□ -1.44
CSNK2A1-208	ENST00000609525	PGBD4	Q96DM1	585 aa		6.03	□□□□□ -1.44
CSNK2A1-208	ENST00000609525	ZNF764	Q96H86	408 aa	Predicted RBP	6.03	□□□□□ -1.44
CSNK2A1-208	ENST00000609525	RCAN3	Q9UKA8	241 aa		6.03	□□□□□ -1.44
CSNK2A1-208	ENST00000609525	FZD1	Q9UP38	647 aa		6.03	□□□□□ -1.44

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 18.3 ms