RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000606476.1

LINC00993-204, long intergenic non-protein coding RNA 993, human

TSL 5 BASIC

Gene LINC00993, Length 500 nt, Biotype processed transcript.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
LINC00993-204	ENST00000606476	PCYT2	Q99447	389 aa		4.97	□□□□□ -1.61
LINC00993-204	ENST00000606476	IFIH1	Q9BYX4	1025 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
LINC00993-204	ENST00000606476	OSBPL7	Q9BZF2	842 aa		4.97	□□□□□ -1.61
LINC00993-204	ENST00000606476	TM6SF1	Q9BZW5	370 aa		4.97	□□□□□ -1.61
LINC00993-204	ENST00000606476	PRDM6	Q9NQX0	595 aa		4.97	□□□□□ -1.61
LINC00993-204	ENST00000606476	GJB4	Q9NTQ9	266 aa		4.97	□□□□□ -1.61
LINC00993-204	ENST00000606476	ORC3	Q9UBD5	711 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
LINC00993-204	ENST00000606476	GABBR1	Q9UBS5	961 aa		4.97	□□□□□ -1.61
LINC00993-204	ENST00000606476	PCDHA4	Q9UN74	947 aa		4.97	□□□□□ -1.61
LINC00993-204	ENST00000606476	CDY2A	Q9Y6F7	541 aa		4.97	□□□□□ -1.61
LINC00993-204	ENST00000606476	NFASC	O94856	1347 aa		4.97	□□□□□ -1.61
LINC00993-204	ENST00000606476	NID2	Q14112	1375 aa		4.96	□□□□□ -1.62
LINC00993-204	ENST00000606476	IGLV3-22	A0A075B6J6	115 aa		4.96	□□□□□ -1.62
LINC00993-204	ENST00000606476	EPOP	A6NHQ4	379 aa		4.96	□□□□□ -1.62
LINC00993-204	ENST00000606476	RRN3P2	A6NIE6	340 aa		4.96	□□□□□ -1.62
LINC00993-204	ENST00000606476	WDR64	B1ANS9	1081 aa		4.96	□□□□□ -1.62
LINC00993-204	ENST00000606476		B8ZZF3	427 aa		4.96	□□□□□ -1.62
LINC00993-204	ENST00000606476	MSH4	O15457	936 aa		4.96	□□□□□ -1.62
LINC00993-204	ENST00000606476	CCNT1	O60563	726 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
LINC00993-204	ENST00000606476	JAK2	O60674	1132 aa		4.96	□□□□□ -1.62
LINC00993-204	ENST00000606476	PFKFB2	O60825	505 aa		4.96	□□□□□ -1.62
LINC00993-204	ENST00000606476	EFCAB14	O75071	495 aa		4.96	□□□□□ -1.62
LINC00993-204	ENST00000606476	PARN	O95453	639 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
LINC00993-204	ENST00000606476	F12	P00748	615 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
LINC00993-204	ENST00000606476	CHRNA1	P02708	482 aa		4.96	□□□□□ -1.62
LINC00993-204	ENST00000606476	CXCL10	P02778	98 aa		4.96	□□□□□ -1.62
LINC00993-204	ENST00000606476	VTN	P04004	478 aa		4.96	□□□□□ -1.62
LINC00993-204	ENST00000606476	KLRC1	P26715	233 aa		4.96	□□□□□ -1.62
LINC00993-204	ENST00000606476	CD52	P31358	61 aa		4.96	□□□□□ -1.62
LINC00993-204	ENST00000606476	MRPS6	P82932	125 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
LINC00993-204	ENST00000606476	GUCY1B3	Q02153	619 aa		4.96	□□□□□ -1.62
LINC00993-204	ENST00000606476	PRKCE	Q02156	737 aa		4.96	□□□□□ -1.62
LINC00993-204	ENST00000606476	TAP1	Q03518	808 aa		4.96	□□□□□ -1.62
LINC00993-204	ENST00000606476	PAK2	Q13177	524 aa		4.96	□□□□□ -1.62
LINC00993-204	ENST00000606476	GNL2	Q13823	731 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
LINC00993-204	ENST00000606476	ANKRD1	Q15327	319 aa		4.96	□□□□□ -1.62
LINC00993-204	ENST00000606476	PAN2	Q504Q3	1202 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
LINC00993-204	ENST00000606476	MARCH8	Q5T0T0	291 aa		4.96	□□□□□ -1.62
LINC00993-204	ENST00000606476	IER5	Q5VY09	327 aa		4.96	□□□□□ -1.62
LINC00993-204	ENST00000606476	MCTP2	Q6DN12	878 aa		4.96	□□□□□ -1.62
LINC00993-204	ENST00000606476	MTHFD1L	Q6UB35	978 aa		4.96	□□□□□ -1.62
LINC00993-204	ENST00000606476	PLPPR4	Q7Z2D5	763 aa		4.96	□□□□□ -1.62
LINC00993-204	ENST00000606476	MIER3	Q7Z3K6	550 aa		4.96	□□□□□ -1.62
LINC00993-204	ENST00000606476	KRT25	Q7Z3Z0	450 aa		4.96	□□□□□ -1.62
LINC00993-204	ENST00000606476	CCDC83	Q8IWF9	413 aa		4.96	□□□□□ -1.62
LINC00993-204	ENST00000606476	LRRC71	Q8N4P6	559 aa		4.96	□□□□□ -1.62
LINC00993-204	ENST00000606476	PHOSPHO2	Q8TCD6	241 aa		4.96	□□□□□ -1.62
LINC00993-204	ENST00000606476	ATP8B4	Q8TF62	1192 aa		4.96	□□□□□ -1.62
LINC00993-204	ENST00000606476	WASF1	Q92558	559 aa		4.96	□□□□□ -1.62
LINC00993-204	ENST00000606476	RAD9A	Q99638	391 aa		4.96	□□□□□ -1.62
LINC00993-204	ENST00000606476	SH2D3A	Q9BRG2	576 aa		4.96	□□□□□ -1.62
LINC00993-204	ENST00000606476	SSBP4	Q9BWG4	385 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
LINC00993-204	ENST00000606476	TEKT3	Q9BXF9	490 aa		4.96	□□□□□ -1.62
LINC00993-204	ENST00000606476	AGXT2	Q9BYV1	514 aa		4.96	□□□□□ -1.62
LINC00993-204	ENST00000606476	SUGCT	Q9HAC7	445 aa		4.96	□□□□□ -1.62
LINC00993-204	ENST00000606476	BRMS1	Q9HCU9	246 aa		4.96	□□□□□ -1.62
LINC00993-204	ENST00000606476	SH3GLB2	Q9NR46	395 aa		4.96	□□□□□ -1.62
LINC00993-204	ENST00000606476	DISC1	Q9NRI5	854 aa		4.96	□□□□□ -1.62
LINC00993-204	ENST00000606476	TBC1D22B	Q9NU19	505 aa		4.96	□□□□□ -1.62
LINC00993-204	ENST00000606476	DDX25	Q9UHL0	483 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
LINC00993-204	ENST00000606476	LRFN2	Q9ULH4	789 aa		4.96	□□□□□ -1.62
LINC00993-204	ENST00000606476	AKT3	Q9Y243	479 aa		4.96	□□□□□ -1.62
LINC00993-204	ENST00000606476	PCDHA10	Q9Y5I2	948 aa		4.96	□□□□□ -1.62
LINC00993-204	ENST00000606476	TRPV2	Q9Y5S1	764 aa		4.96	□□□□□ -1.62
LINC00993-204	ENST00000606476	TTC28	Q96AY4	2481 aa		4.96	□□□□□ -1.62
LINC00993-204	ENST00000606476	SCN5A	Q14524	2016 aa		4.96	□□□□□ -1.62
LINC00993-204	ENST00000606476	KIAA1217	Q5T5P2	1943 aa		4.95	□□□□□ -1.62
LINC00993-204	ENST00000606476	DENND3	A2RUS2	1198 aa		4.95	□□□□□ -1.62
LINC00993-204	ENST00000606476	MBLAC1	A4D2B0	266 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
LINC00993-204	ENST00000606476	LINC01553	A4QN01	128 aa		4.95	□□□□□ -1.62
LINC00993-204	ENST00000606476	TMEM150B	A6NC51	233 aa		4.95	□□□□□ -1.62
LINC00993-204	ENST00000606476	DHX15	O43143	795 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
LINC00993-204	ENST00000606476	EPB41L2	O43491	1005 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
LINC00993-204	ENST00000606476	SLC37A4	O43826	429 aa		4.95	□□□□□ -1.62
LINC00993-204	ENST00000606476	HBP1	O60381	514 aa		4.95	□□□□□ -1.62
LINC00993-204	ENST00000606476	EIF5B	O60841	1220 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
LINC00993-204	ENST00000606476	CAND2	O75155	1236 aa		4.95	□□□□□ -1.62
LINC00993-204	ENST00000606476	GJB5	O95377	273 aa		4.95	□□□□□ -1.62
LINC00993-204	ENST00000606476	CTDNEP1	O95476	244 aa		4.95	□□□□□ -1.62
LINC00993-204	ENST00000606476	CYP3A4	P08684	503 aa		4.95	□□□□□ -1.62
LINC00993-204	ENST00000606476	ARAF	P10398	606 aa		4.95	□□□□□ -1.62
LINC00993-204	ENST00000606476	HOXC8	P31273	242 aa		4.95	□□□□□ -1.62
LINC00993-204	ENST00000606476	CTNNB1	P35222	781 aa		4.95	□□□□□ -1.62
LINC00993-204	ENST00000606476	KRT2	P35908	639 aa		4.95	□□□□□ -1.62
LINC00993-204	ENST00000606476	CLCN3	P51790	818 aa		4.95	□□□□□ -1.62
LINC00993-204	ENST00000606476	EVC	P57679	992 aa		4.95	□□□□□ -1.62
LINC00993-204	ENST00000606476	ANAPC15	P60006	121 aa		4.95	□□□□□ -1.62
LINC00993-204	ENST00000606476	NRG1	Q02297	640 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
LINC00993-204	ENST00000606476	RBL2	Q08999	1139 aa		4.95	□□□□□ -1.62
LINC00993-204	ENST00000606476	GRB10	Q13322	594 aa		4.95	□□□□□ -1.62
LINC00993-204	ENST00000606476	LPIN1	Q14693	890 aa		4.95	□□□□□ -1.62
LINC00993-204	ENST00000606476	UGCG	Q16739	394 aa		4.95	□□□□□ -1.62
LINC00993-204	ENST00000606476	ME3	Q16798	604 aa		4.95	□□□□□ -1.62
LINC00993-204	ENST00000606476	KIZ	Q2M2Z5	673 aa		4.95	□□□□□ -1.62
LINC00993-204	ENST00000606476	MTERF2	Q49AM1	385 aa		4.95	□□□□□ -1.62
LINC00993-204	ENST00000606476	PLEKHG4	Q58EX7	1191 aa		4.95	□□□□□ -1.62
LINC00993-204	ENST00000606476	ZNF484	Q5JVG2	852 aa		4.95	□□□□□ -1.62
LINC00993-204	ENST00000606476	FBXO47	Q5MNV8	452 aa		4.95	□□□□□ -1.62
LINC00993-204	ENST00000606476	SPOUT1	Q5T280	376 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
LINC00993-204	ENST00000606476	NCAPH2	Q6IBW4	605 aa		4.95	□□□□□ -1.62

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 38.7 ms