RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000592759.5

POP4-213, Transcript of POP4 homolog, ribonuclease P/MRP subunit, human

TSL 4

Gene POP4, Length 550 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
POP4-213	ENST00000592759	FNDC1	Q4ZHG4	1894 aa	Predicted RBP	13.86	□□□□□ -0.19
POP4-213	ENST00000592759	FRMD3	A2A2Y4	597 aa		13.85	□□□□□ -0.19
POP4-213	ENST00000592759	TTLL13P	A6NNM8	815 aa		13.85	□□□□□ -0.19
POP4-213	ENST00000592759	SLFN14	P0C7P3	912 aa		13.85	□□□□□ -0.19
POP4-213	ENST00000592759	LIG1	P18858	919 aa		13.85	□□□□□ -0.19
POP4-213	ENST00000592759	CASP1	P29466	404 aa		13.85	□□□□□ -0.19
POP4-213	ENST00000592759	SYK	P43405	635 aa		13.85	□□□□□ -0.19
POP4-213	ENST00000592759	NAMPT	P43490	491 aa		13.85	□□□□□ -0.19
POP4-213	ENST00000592759	NPTX2	P47972	431 aa		13.85	□□□□□ -0.19
POP4-213	ENST00000592759	VASP	P50552	380 aa	Predicted RBP	13.85	□□□□□ -0.19
POP4-213	ENST00000592759	PEX3	P56589	373 aa		13.85	□□□□□ -0.19
POP4-213	ENST00000592759	CNNM4	Q6P4Q7	775 aa		13.85	□□□□□ -0.19
POP4-213	ENST00000592759	LIN28B	Q6ZN17	250 aa	Known RBP eCLIP	13.85	□□□□□ -0.19
POP4-213	ENST00000592759	DYM	Q7RTS9	669 aa		13.85	□□□□□ -0.19
POP4-213	ENST00000592759	TAS1R3	Q7RTX0	852 aa		13.85	□□□□□ -0.19
POP4-213	ENST00000592759	SRGAP1	Q7Z6B7	1085 aa		13.85	□□□□□ -0.19
POP4-213	ENST00000592759	C7orf25	Q9BPX7	421 aa		13.85	□□□□□ -0.19
POP4-213	ENST00000592759	NTPCR	Q9BSD7	190 aa	Known RBP	13.85	□□□□□ -0.19
POP4-213	ENST00000592759	TNMD	Q9H2S6	317 aa		13.85	□□□□□ -0.19
POP4-213	ENST00000592759	FZD8	Q9H461	694 aa		13.85	□□□□□ -0.19
POP4-213	ENST00000592759	CUEDC2	Q9H467	287 aa		13.85	□□□□□ -0.19
POP4-213	ENST00000592759	ODF2L	Q9ULJ1	636 aa		13.85	□□□□□ -0.19
POP4-213	ENST00000592759	LRRIQ4	A6NIV6	560 aa		13.84	□□□□□ -0.19
POP4-213	ENST00000592759	ENPP3	O14638	875 aa		13.84	□□□□□ -0.19
POP4-213	ENST00000592759	PLS3	P13797	630 aa		13.84	□□□□□ -0.19
POP4-213	ENST00000592759	HOXA11	P31270	313 aa	Predicted RBP	13.84	□□□□□ -0.19
POP4-213	ENST00000592759	PHKA2	P46019	1235 aa		13.84	□□□□□ -0.19
POP4-213	ENST00000592759	WDR5	P61964	334 aa	Known RBP	13.84	□□□□□ -0.19
POP4-213	ENST00000592759	DEFB103A	P81534	67 aa		13.84	□□□□□ -0.19
POP4-213	ENST00000592759	PAK2	Q13177	524 aa		13.84	□□□□□ -0.19
POP4-213	ENST00000592759	TFDP1	Q14186	410 aa		13.84	□□□□□ -0.19
POP4-213	ENST00000592759	FAM109B	Q6ICB4	259 aa	Predicted RBP	13.84	□□□□□ -0.19
POP4-213	ENST00000592759	CRIPAK	Q8N1N5	446 aa		13.84	□□□□□ -0.19
POP4-213	ENST00000592759	SPIRE2	Q8WWL2	714 aa		13.84	□□□□□ -0.19
POP4-213	ENST00000592759	APBB2	Q92870	758 aa		13.84	□□□□□ -0.19
POP4-213	ENST00000592759	PAGE5	Q96GU1	130 aa		13.84	□□□□□ -0.19
POP4-213	ENST00000592759	DRC1	Q96MC2	740 aa		13.84	□□□□□ -0.19
POP4-213	ENST00000592759	TRIM9	Q9C026	710 aa		13.84	□□□□□ -0.19
POP4-213	ENST00000592759	ARHGAP28	Q9P2N2	729 aa		13.84	□□□□□ -0.19
POP4-213	ENST00000592759	USP20	Q9Y2K6	914 aa		13.84	□□□□□ -0.19
POP4-213	ENST00000592759	KIAA1671	Q9BY89	1806 aa		13.83	□□□□□ -0.2
POP4-213	ENST00000592759	ABHD14A-ACY1	A0A1B0GW23	586 aa		13.83	□□□□□ -0.2
POP4-213	ENST00000592759	GPR182	O15218	404 aa		13.83	□□□□□ -0.2
POP4-213	ENST00000592759	SLC16A4	O15374	487 aa		13.83	□□□□□ -0.2
POP4-213	ENST00000592759	B4GALT5	O43286	388 aa		13.83	□□□□□ -0.2
POP4-213	ENST00000592759	KLRC4	O43908	158 aa		13.83	□□□□□ -0.2
POP4-213	ENST00000592759	TSPAN1	O60635	241 aa		13.83	□□□□□ -0.2
POP4-213	ENST00000592759	BAIAP3	O94812	1187 aa		13.83	□□□□□ -0.2
POP4-213	ENST00000592759	ZNF202	O95125	648 aa		13.83	□□□□□ -0.2
POP4-213	ENST00000592759	NCKAP1L	P55160	1127 aa		13.83	□□□□□ -0.2
POP4-213	ENST00000592759	EHHADH	Q08426	723 aa		13.83	□□□□□ -0.2
POP4-213	ENST00000592759	NFX1	Q12986	1120 aa	Known RBP	13.83	□□□□□ -0.2
POP4-213	ENST00000592759	CUL4B	Q13620	913 aa		13.83	□□□□□ -0.2
POP4-213	ENST00000592759	IKBKE	Q14164	716 aa		13.83	□□□□□ -0.2
POP4-213	ENST00000592759	UBXN11	Q5T124	520 aa		13.83	□□□□□ -0.2
POP4-213	ENST00000592759	KRBA2	Q6ZNG9	492 aa		13.83	□□□□□ -0.2
POP4-213	ENST00000592759	TMCO2	Q7Z6W1	182 aa	Predicted RBP	13.83	□□□□□ -0.2
POP4-213	ENST00000592759	TDH	Q8IZJ6	230 aa		13.83	□□□□□ -0.2
POP4-213	ENST00000592759	TMEM161B	Q8NDZ6	487 aa		13.83	□□□□□ -0.2
POP4-213	ENST00000592759	KCNN1	Q92952	543 aa		13.83	□□□□□ -0.2
POP4-213	ENST00000592759	SCLT1	Q96NL6	688 aa		13.83	□□□□□ -0.2
POP4-213	ENST00000592759	FGFBP2	Q9BYJ0	223 aa		13.83	□□□□□ -0.2
POP4-213	ENST00000592759	TSPYL2	Q9H2G4	693 aa	Predicted RBP	13.83	□□□□□ -0.2
POP4-213	ENST00000592759	BLZF1	Q9H2G9	400 aa		13.83	□□□□□ -0.2
POP4-213	ENST00000592759	C17orf75	Q9HAS0	396 aa		13.83	□□□□□ -0.2
POP4-213	ENST00000592759	MAGEF1	Q9HAY2	307 aa		13.83	□□□□□ -0.2
POP4-213	ENST00000592759	USP25	Q9UHP3	1055 aa		13.83	□□□□□ -0.2
POP4-213	ENST00000592759	GRXCR1	A8MXD5	290 aa		13.82	□□□□□ -0.2
POP4-213	ENST00000592759		C9IYK1	514 aa		13.82	□□□□□ -0.2
POP4-213	ENST00000592759	PRPF40A	O75400	957 aa	Known RBP	13.82	□□□□□ -0.2
POP4-213	ENST00000592759	NR1I2	O75469	434 aa		13.82	□□□□□ -0.2
POP4-213	ENST00000592759	AFM	P43652	599 aa		13.82	□□□□□ -0.2
POP4-213	ENST00000592759	FAM189B	P81408	668 aa		13.82	□□□□□ -0.2
POP4-213	ENST00000592759	PPP2R5A	Q15172	486 aa		13.82	□□□□□ -0.2
POP4-213	ENST00000592759	FAM187B	Q17R55	369 aa		13.82	□□□□□ -0.2
POP4-213	ENST00000592759	NT5DC1	Q5TFE4	455 aa		13.82	□□□□□ -0.2
POP4-213	ENST00000592759	CATSPER4	Q7RTX7	472 aa		13.82	□□□□□ -0.2
POP4-213	ENST00000592759	SFR1	Q86XK3	245 aa		13.82	□□□□□ -0.2
POP4-213	ENST00000592759	IFT74	Q96LB3	600 aa		13.82	□□□□□ -0.2
POP4-213	ENST00000592759	RNPC3	Q96LT9	517 aa	Known RBP	13.82	□□□□□ -0.2
POP4-213	ENST00000592759	PYM1	Q9BRP8	204 aa	Known RBP	13.82	□□□□□ -0.2
POP4-213	ENST00000592759	STRA6	Q9BX79	667 aa		13.82	□□□□□ -0.2
POP4-213	ENST00000592759	INO80B	Q9C086	356 aa	Predicted RBP	13.82	□□□□□ -0.2
POP4-213	ENST00000592759	PARVG	Q9HBI0	331 aa		13.82	□□□□□ -0.2
POP4-213	ENST00000592759	RGS18	Q9NS28	235 aa		13.82	□□□□□ -0.2
POP4-213	ENST00000592759	LMBRD1	Q9NUN5	540 aa		13.82	□□□□□ -0.2
POP4-213	ENST00000592759	AGPAT5	Q9NUQ2	364 aa		13.82	□□□□□ -0.2
POP4-213	ENST00000592759	NLRC5	Q86WI3	1866 aa		13.81	□□□□□ -0.2
POP4-213	ENST00000592759	CCDC169	A6NNP5	214 aa		13.81	□□□□□ -0.2
POP4-213	ENST00000592759	INO80B-WBP1	J3KQ70	363 aa		13.81	□□□□□ -0.2
POP4-213	ENST00000592759	PPP1R37	O75864	691 aa		13.81	□□□□□ -0.2
POP4-213	ENST00000592759	FAM13A	O94988	1023 aa		13.81	□□□□□ -0.2
POP4-213	ENST00000592759	KRT18	P05783	430 aa	Known RBP	13.81	□□□□□ -0.2
POP4-213	ENST00000592759	MAPT	P10636	758 aa	Known RBP	13.81	□□□□□ -0.2
POP4-213	ENST00000592759	ACTN1	P12814	892 aa		13.81	□□□□□ -0.2
POP4-213	ENST00000592759	ARF4	P18085	180 aa	Predicted RBP	13.81	□□□□□ -0.2
POP4-213	ENST00000592759	SFPQ	P23246	707 aa	Known RBP eCLIP	13.81	□□□□□ -0.2
POP4-213	ENST00000592759	NMT1	P30419	496 aa	Known RBP	13.81	□□□□□ -0.2
POP4-213	ENST00000592759	FAM160A1	Q05DH4	1040 aa		13.81	□□□□□ -0.2
POP4-213	ENST00000592759	DMP1	Q13316	513 aa	Predicted RBP	13.81	□□□□□ -0.2

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