RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000590509.5

PTPRS-208, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type S, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRS, Length 893 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRS-208ENST00000590509 KLRC2P26717 231 aa18.09■□□□□ 0.49
PTPRS-208ENST00000590509 PRR16Q569H4 304 aa18.09■□□□□ 0.49
PTPRS-208ENST00000590509 AGMOQ6ZNB7 445 aa18.09■□□□□ 0.49
PTPRS-208ENST00000590509 MAML2Q8IZL2 1156 aaPredicted RBP18.09■□□□□ 0.49
PTPRS-208ENST00000590509 SLC44A3Q8N4M1 653 aa18.09■□□□□ 0.49
PTPRS-208ENST00000590509 GPR152Q8TDT2 470 aa18.09■□□□□ 0.49
PTPRS-208ENST00000590509 SCLT1Q96NL6 688 aa18.09■□□□□ 0.49
PTPRS-208ENST00000590509 CNTNAP3BQ96NU0 1288 aa18.09■□□□□ 0.49
PTPRS-208ENST00000590509 CNTNAP3Q9BZ76 1288 aa18.09■□□□□ 0.49
PTPRS-208ENST00000590509 TBC1D17Q9HA65 648 aa18.09■□□□□ 0.49
PTPRS-208ENST00000590509 FAM105AQ9NUU6 356 aa18.09■□□□□ 0.49
PTPRS-208ENST00000590509 CEP131Q9UPN4 1083 aa18.09■□□□□ 0.49
PTPRS-208ENST00000590509 C2CD2LO14523 706 aa18.08■□□□□ 0.48
PTPRS-208ENST00000590509 SP9P0CG40 484 aa18.08■□□□□ 0.48
PTPRS-208ENST00000590509 RTN1Q16799 776 aa18.08■□□□□ 0.48
PTPRS-208ENST00000590509 SMAP1Q8IYB5 467 aaPredicted RBP18.08■□□□□ 0.48
PTPRS-208ENST00000590509 TMEM87AQ8NBN3 555 aa18.08■□□□□ 0.48
PTPRS-208ENST00000590509 MAN1C1Q9NR34 630 aa18.08■□□□□ 0.48
PTPRS-208ENST00000590509 TBC1D22BQ9NU19 505 aa18.08■□□□□ 0.48
PTPRS-208ENST00000590509 MARCH5Q9NX47 278 aa18.08■□□□□ 0.48
PTPRS-208ENST00000590509 WNT16Q9UBV4 365 aa18.08■□□□□ 0.48
PTPRS-208ENST00000590509 SAMM50Q9Y512 469 aa18.08■□□□□ 0.48
PTPRS-208ENST00000590509 CACNA1IQ9P0X4 2223 aa18.08■□□□□ 0.48
PTPRS-208ENST00000590509 NCOR2Q9Y618 2525 aa18.08■□□□□ 0.48
PTPRS-208ENST00000590509 CHMP2AO43633 222 aa18.07■□□□□ 0.48
PTPRS-208ENST00000590509 SPATA31D3P0C874 917 aa18.07■□□□□ 0.48
PTPRS-208ENST00000590509 TMOD1P28289 359 aa18.07■□□□□ 0.48
PTPRS-208ENST00000590509 AAMPQ13685 434 aa18.07■□□□□ 0.48
PTPRS-208ENST00000590509 TWF2Q6IBS0 349 aaKnown RBP18.07■□□□□ 0.48
PTPRS-208ENST00000590509 SPATA31D4Q6ZUB0 917 aa18.07■□□□□ 0.48
PTPRS-208ENST00000590509 ZNF707Q96C28 371 aaPredicted RBP18.07■□□□□ 0.48
PTPRS-208ENST00000590509 RPP25Q9BUL9 199 aaKnown RBP18.07■□□□□ 0.48
PTPRS-208ENST00000590509 TRAIPQ9BWF2 469 aa18.07■□□□□ 0.48
PTPRS-208ENST00000590509 FOXQ1Q9C009 403 aa18.07■□□□□ 0.48
PTPRS-208ENST00000590509 UNC45AQ9H3U1 944 aa18.07■□□□□ 0.48
PTPRS-208ENST00000590509 DISC1Q9NRI5 854 aa18.07■□□□□ 0.48
PTPRS-208ENST00000590509 DACT1Q9NYF0 836 aa18.07■□□□□ 0.48
PTPRS-208ENST00000590509 DLL3Q9NYJ7 618 aa18.07■□□□□ 0.48
PTPRS-208ENST00000590509 IGSF9Q9P2J2 1179 aa18.07■□□□□ 0.48
PTPRS-208ENST00000590509 PIN4Q9Y237 131 aaKnown RBP18.07■□□□□ 0.48
PTPRS-208ENST00000590509 IGKV6-21A0A0C4DH24 114 aa18.06■□□□□ 0.48
PTPRS-208ENST00000590509 CCDC195A0A1B0GUA6 201 aa18.06■□□□□ 0.48
PTPRS-208ENST00000590509 MSH4O15457 936 aa18.06■□□□□ 0.48
PTPRS-208ENST00000590509 GBP2P32456 591 aaPredicted RBP18.06■□□□□ 0.48
PTPRS-208ENST00000590509 ADD1P35611 737 aaKnown RBP18.06■□□□□ 0.48
PTPRS-208ENST00000590509 EXOSC10Q01780 885 aaKnown RBP18.06■□□□□ 0.48
PTPRS-208ENST00000590509 GIT2Q14161 759 aa18.06■□□□□ 0.48
PTPRS-208ENST00000590509 MTERF2Q49AM1 385 aa18.06■□□□□ 0.48
PTPRS-208ENST00000590509 C15orf39Q6ZRI6 1047 aa18.06■□□□□ 0.48
PTPRS-208ENST00000590509 PPFIBP1Q86W92 1011 aa18.06■□□□□ 0.48
PTPRS-208ENST00000590509 SUMF1Q8NBK3 374 aa18.06■□□□□ 0.48
PTPRS-208ENST00000590509 FAM167AQ96KS9 214 aa18.06■□□□□ 0.48
PTPRS-208ENST00000590509 WDR6Q9NNW5 1121 aaKnown RBP18.06■□□□□ 0.48
PTPRS-208ENST00000590509 CEP250Q9BV73 2442 aa18.06■□□□□ 0.48
PTPRS-208ENST00000590509 GPR179Q6PRD1 2367 aa18.05■□□□□ 0.48
PTPRS-208ENST00000590509 SPDYE4A6NLX3 237 aa18.05■□□□□ 0.48
PTPRS-208ENST00000590509 NRP1O14786 923 aa18.05■□□□□ 0.48
PTPRS-208ENST00000590509 EFEMP2O95967 443 aa18.05■□□□□ 0.48
PTPRS-208ENST00000590509 CIITAP33076 1130 aa18.05■□□□□ 0.48
PTPRS-208ENST00000590509 TBC1D8BQ0IIM8 1120 aa18.05■□□□□ 0.48
PTPRS-208ENST00000590509 BMS1Q14692 1282 aaKnown RBP18.05■□□□□ 0.48
PTPRS-208ENST00000590509 ADCK5Q3MIX3 580 aa18.05■□□□□ 0.48
PTPRS-208ENST00000590509 GLB1LQ6UWU2 654 aa18.05■□□□□ 0.48
PTPRS-208ENST00000590509 B3GALT6Q96L58 329 aa18.05■□□□□ 0.48
PTPRS-208ENST00000590509 GCOM2Q9BZD3 368 aaPredicted RBP18.05■□□□□ 0.48
PTPRS-208ENST00000590509 CHST12Q9NRB3 414 aa18.05■□□□□ 0.48
PTPRS-208ENST00000590509 NRBP2Q9NSY0 501 aa18.05■□□□□ 0.48
PTPRS-208ENST00000590509 RBM28Q9NW13 759 aaKnown RBP18.05■□□□□ 0.48
PTPRS-208ENST00000590509 CLUHO75153 1309 aa18.04■□□□□ 0.48
PTPRS-208ENST00000590509 GOLGA8AA7E2F4 631 aa18.04■□□□□ 0.48
PTPRS-208ENST00000590509 GOLGA8BA8MQT2 603 aa18.04■□□□□ 0.48
PTPRS-208ENST00000590509 WDR64B1ANS9 1081 aa18.04■□□□□ 0.48
PTPRS-208ENST00000590509 INPPL1O15357 1258 aa18.04■□□□□ 0.48
PTPRS-208ENST00000590509 TEX28O15482 410 aa18.04■□□□□ 0.48
PTPRS-208ENST00000590509 ZBTB43O43298 467 aa18.04■□□□□ 0.48
PTPRS-208ENST00000590509 ZNF623O75123 536 aa18.04■□□□□ 0.48
PTPRS-208ENST00000590509 POMCP01189 267 aa18.04■□□□□ 0.48
PTPRS-208ENST00000590509 SETQ01105 290 aaPredicted RBP18.04■□□□□ 0.48
PTPRS-208ENST00000590509 RNASELQ05823 741 aaKnown RBP18.04■□□□□ 0.48
PTPRS-208ENST00000590509 PUM1Q14671 1186 aaKnown RBP eCLIP18.04■□□□□ 0.48
PTPRS-208ENST00000590509 PFKFB3Q16875 520 aaPredicted RBP18.04■□□□□ 0.48
PTPRS-208ENST00000590509 RSPO4Q2I0M5 234 aaPredicted RBP18.04■□□□□ 0.48
PTPRS-208ENST00000590509 UBXN11Q5T124 520 aa18.04■□□□□ 0.48
PTPRS-208ENST00000590509 CMASQ8NFW8 434 aaPredicted RBP18.04■□□□□ 0.48
PTPRS-208ENST00000590509 ZMYND12Q9H0C1 365 aa18.04■□□□□ 0.48
PTPRS-208ENST00000590509 MINDY3Q9H8M7 445 aa18.04■□□□□ 0.48
PTPRS-208ENST00000590509 MIOSQ9NXC5 875 aa18.04■□□□□ 0.48
PTPRS-208ENST00000590509 EPS15L1Q9UBC2 864 aa18.04■□□□□ 0.48
PTPRS-208ENST00000590509 ZFHX4Q86UP3 3567 aa18.04■□□□□ 0.48
PTPRS-208ENST00000590509 CACNA1BQ00975 2339 aa18.04■□□□□ 0.48
PTPRS-208ENST00000590509 SRFP11831 508 aa18.03■□□□□ 0.48
PTPRS-208ENST00000590509 AK2P54819 239 aa18.03■□□□□ 0.48
PTPRS-208ENST00000590509 RHPN2Q8IUC4 686 aa18.03■□□□□ 0.48
PTPRS-208ENST00000590509 C1orf210Q8IVY1 113 aa18.03■□□□□ 0.48
PTPRS-208ENST00000590509 RNF168Q8IYW5 571 aaPredicted RBP18.03■□□□□ 0.48
PTPRS-208ENST00000590509 RASEFQ8IZ41 740 aa18.03■□□□□ 0.48
PTPRS-208ENST00000590509 ZNF579Q8NAF0 562 aaKnown RBP18.03■□□□□ 0.48
PTPRS-208ENST00000590509 HINFPQ9BQA5 517 aa18.03■□□□□ 0.48
PTPRS-208ENST00000590509 ESYT1Q9BSJ8 1104 aa18.03■□□□□ 0.48
PTPRS-208ENST00000590509 EMILIN2Q9BXX0 1053 aa18.03■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32.4 ms