RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000589669.1

CCDC130-211, Transcript of coiled-coil domain containing 130, humanhuman

TSL 2

Gene CCDC130, Length 701 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC130-211ENST00000589669 TNFRSF25Q93038 417 aa14.8□□□□□ -0.04
CCDC130-211ENST00000589669 SAMD11Q96NU1 681 aa14.8□□□□□ -0.04
CCDC130-211ENST00000589669 YME1L1Q96TA2 773 aa14.8□□□□□ -0.04
CCDC130-211ENST00000589669 NIFKQ9BYG3 293 aaKnown RBP14.8□□□□□ -0.04
CCDC130-211ENST00000589669 KCNMB3Q9NPA1 279 aa14.8□□□□□ -0.04
CCDC130-211ENST00000589669 DOLKQ9UPQ8 538 aa14.8□□□□□ -0.04
CCDC130-211ENST00000589669 CHMP2AO43633 222 aa14.79□□□□□ -0.04
CCDC130-211ENST00000589669 SLC37A4O43826 429 aa14.79□□□□□ -0.04
CCDC130-211ENST00000589669 REV3LO60673 3130 aa14.79□□□□□ -0.04
CCDC130-211ENST00000589669 GPR32O75388 356 aa14.79□□□□□ -0.04
CCDC130-211ENST00000589669 STBD1O95210 358 aa14.79□□□□□ -0.04
CCDC130-211ENST00000589669 TMOD1P28289 359 aa14.79□□□□□ -0.04
CCDC130-211ENST00000589669 KRT2P35908 639 aa14.79□□□□□ -0.04
CCDC130-211ENST00000589669 TARBP2Q15633 366 aaKnown RBP14.79□□□□□ -0.04
CCDC130-211ENST00000589669 UGCGQ16739 394 aa14.79□□□□□ -0.04
CCDC130-211ENST00000589669 ODR4Q5SWX8 454 aa14.79□□□□□ -0.04
CCDC130-211ENST00000589669 EFCAB12Q6NXP0 572 aa14.79□□□□□ -0.04
CCDC130-211ENST00000589669 TRMT1LQ7Z2T5 733 aaKnown RBP14.79□□□□□ -0.04
CCDC130-211ENST00000589669 METTL13Q8N6R0 699 aa14.79□□□□□ -0.04
CCDC130-211ENST00000589669 LINC01465Q8N7H1 131 aa14.79□□□□□ -0.04
CCDC130-211ENST00000589669 ZNF689Q96CS4 500 aaPredicted RBP14.79□□□□□ -0.04
CCDC130-211ENST00000589669 KIF2CQ99661 725 aa14.79□□□□□ -0.04
CCDC130-211ENST00000589669 PCDHB11Q9Y5F2 797 aa14.79□□□□□ -0.04
CCDC130-211ENST00000589669 GPR182O15218 404 aa14.78□□□□□ -0.04
CCDC130-211ENST00000589669 CCNT1O60563 726 aaKnown RBP14.78□□□□□ -0.04
CCDC130-211ENST00000589669 MMP1P03956 469 aa14.78□□□□□ -0.04
CCDC130-211ENST00000589669 PRKCEQ02156 737 aa14.78□□□□□ -0.04
CCDC130-211ENST00000589669 PAK2Q13177 524 aa14.78□□□□□ -0.04
CCDC130-211ENST00000589669 PPP2R5CQ13362 524 aa14.78□□□□□ -0.04
CCDC130-211ENST00000589669 XKR3Q5GH77 459 aa14.78□□□□□ -0.04
CCDC130-211ENST00000589669 EARS2Q5JPH6 523 aaKnown RBP14.78□□□□□ -0.04
CCDC130-211ENST00000589669 HAS1Q92839 578 aa14.78□□□□□ -0.04
CCDC130-211ENST00000589669 ZSCAN31Q96LW9 406 aaPredicted RBP14.78□□□□□ -0.04
CCDC130-211ENST00000589669 CEP89Q96ST8 783 aa14.78□□□□□ -0.04
CCDC130-211ENST00000589669 LLPHQ9BRT6 129 aaKnown RBP14.78□□□□□ -0.04
CCDC130-211ENST00000589669 C17orf80Q9BSJ5 609 aa14.78□□□□□ -0.04
CCDC130-211ENST00000589669 TMX1Q9H3N1 280 aa14.78□□□□□ -0.04
CCDC130-211ENST00000589669 BRMS1Q9HCU9 246 aa14.78□□□□□ -0.04
CCDC130-211ENST00000589669 PRDM6Q9NQX0 595 aa14.78□□□□□ -0.04
CCDC130-211ENST00000589669 NOC2LQ9Y3T9 749 aaKnown RBP14.78□□□□□ -0.04
CCDC130-211ENST00000589669 GBF1Q92538 1859 aa14.78□□□□□ -0.04
CCDC130-211ENST00000589669 BTBD18B2RXH4 712 aa14.77□□□□□ -0.05
CCDC130-211ENST00000589669 JAK2O60674 1132 aa14.77□□□□□ -0.05
CCDC130-211ENST00000589669 RPS6KA5O75582 802 aa14.77□□□□□ -0.05
CCDC130-211ENST00000589669 DGKIO75912 1065 aa14.77□□□□□ -0.05
CCDC130-211ENST00000589669 RBM25P49756 843 aaKnown RBP14.77□□□□□ -0.05
CCDC130-211ENST00000589669 PSMC5P62195 406 aa14.77□□□□□ -0.05
CCDC130-211ENST00000589669 CDC42EP1Q00587 391 aa14.77□□□□□ -0.05
CCDC130-211ENST00000589669 DHX9Q08211 1270 aaKnown RBP14.77□□□□□ -0.05
CCDC130-211ENST00000589669 ST3GAL1Q11201 340 aa14.77□□□□□ -0.05
CCDC130-211ENST00000589669 KIZQ2M2Z5 673 aa14.77□□□□□ -0.05
CCDC130-211ENST00000589669 MAP7D1Q3KQU3 841 aa14.77□□□□□ -0.05
CCDC130-211ENST00000589669 EPC2Q52LR7 807 aa14.77□□□□□ -0.05
CCDC130-211ENST00000589669 TMEM192Q8IY95 271 aa14.77□□□□□ -0.05
CCDC130-211ENST00000589669 DEPDC4Q8N2C3 294 aa14.77□□□□□ -0.05
CCDC130-211ENST00000589669 TMEM40Q8WWA1 233 aa14.77□□□□□ -0.05
CCDC130-211ENST00000589669 LINC01599Q8WXQ3 324 aa14.77□□□□□ -0.05
CCDC130-211ENST00000589669 COL25A1Q9BXS0 654 aaPredicted RBP14.77□□□□□ -0.05
CCDC130-211ENST00000589669 ADAMTS10Q9H324 1103 aa14.77□□□□□ -0.05
CCDC130-211ENST00000589669 RC3H2Q9HBD1 1191 aaKnown RBP14.77□□□□□ -0.05
CCDC130-211ENST00000589669 ERVK-5Q9HDB9 667 aa14.77□□□□□ -0.05
CCDC130-211ENST00000589669 TMPRSS4Q9NRS4 437 aa14.77□□□□□ -0.05
CCDC130-211ENST00000589669 VAV3Q9UKW4 847 aa14.77□□□□□ -0.05
CCDC130-211ENST00000589669 MTUS1Q9ULD2 1270 aa14.77□□□□□ -0.05
CCDC130-211ENST00000589669 ST3GAL5Q9UNP4 418 aa14.77□□□□□ -0.05
CCDC130-211ENST00000589669 GINS2Q9Y248 185 aa14.77□□□□□ -0.05
CCDC130-211ENST00000589669 IGKV6-21A0A0C4DH24 114 aa14.76□□□□□ -0.05
CCDC130-211ENST00000589669 H3BNC9 293 aa14.76□□□□□ -0.05
CCDC130-211ENST00000589669 EML1O00423 815 aa14.76□□□□□ -0.05
CCDC130-211ENST00000589669 BAG4O95429 457 aaKnown RBP14.76□□□□□ -0.05
CCDC130-211ENST00000589669 VTNP04004 478 aa14.76□□□□□ -0.05
CCDC130-211ENST00000589669 RB1P06400 928 aa14.76□□□□□ -0.05
CCDC130-211ENST00000589669 P4HBP07237 508 aaKnown RBP14.76□□□□□ -0.05
CCDC130-211ENST00000589669 STAG3L1P0CL83 205 aa14.76□□□□□ -0.05
CCDC130-211ENST00000589669 RFX1P22670 979 aa14.76□□□□□ -0.05
CCDC130-211ENST00000589669 QARSP47897 775 aaKnown RBP14.76□□□□□ -0.05
CCDC130-211ENST00000589669 NLRP11P59045 1033 aaKnown RBP14.76□□□□□ -0.05
CCDC130-211ENST00000589669 FAM189BP81408 668 aa14.76□□□□□ -0.05
CCDC130-211ENST00000589669 MRPS5P82675 430 aaKnown RBP14.76□□□□□ -0.05
CCDC130-211ENST00000589669 NFX1Q12986 1120 aaKnown RBP14.76□□□□□ -0.05
CCDC130-211ENST00000589669 TRIM29Q14134 588 aa14.76□□□□□ -0.05
CCDC130-211ENST00000589669 TMEM266Q2M3C6 531 aa14.76□□□□□ -0.05
CCDC130-211ENST00000589669 PPP1R26Q5T8A7 1209 aaPredicted RBP14.76□□□□□ -0.05
CCDC130-211ENST00000589669 KRT40Q6A162 431 aa14.76□□□□□ -0.05
CCDC130-211ENST00000589669 NPAS4Q8IUM7 802 aa14.76□□□□□ -0.05
CCDC130-211ENST00000589669 SLFN12Q8IYM2 578 aa14.76□□□□□ -0.05
CCDC130-211ENST00000589669 FIBCD1Q8N539 461 aa14.76□□□□□ -0.05
CCDC130-211ENST00000589669 CLP1Q92989 425 aaKnown RBP14.76□□□□□ -0.05
CCDC130-211ENST00000589669 ASB2Q96Q27 587 aa14.76□□□□□ -0.05
CCDC130-211ENST00000589669 MAP7D2Q96T17 732 aa14.76□□□□□ -0.05
CCDC130-211ENST00000589669 RGS18Q9NS28 235 aa14.76□□□□□ -0.05
CCDC130-211ENST00000589669 THEGQ9P2T0 379 aa14.76□□□□□ -0.05
CCDC130-211ENST00000589669 PRRC2BQ5JSZ5 2229 aaKnown RBP14.76□□□□□ -0.05
CCDC130-211ENST00000589669 PTPRSQ13332 1948 aa14.75□□□□□ -0.05
CCDC130-211ENST00000589669 C5orf67F2Z3F1 127 aa14.75□□□□□ -0.05
CCDC130-211ENST00000589669 DKC1O60832 514 aaKnown RBP eCLIP14.75□□□□□ -0.05
CCDC130-211ENST00000589669 LINC00271P0C7V0 271 aa14.75□□□□□ -0.05
CCDC130-211ENST00000589669 EIF4BP23588 611 aaKnown RBP14.75□□□□□ -0.05
CCDC130-211ENST00000589669 BMPR1AP36894 532 aa14.75□□□□□ -0.05
CCDC130-211ENST00000589669 CLCN3P51790 818 aa14.75□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 16.8 ms