RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000585084.5

GPS1-225, Transcript of G protein pathway suppressor 1, human

TSL 3

Gene GPS1, Length 997 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
GPS1-225	ENST00000585084	RAB27A	P51159	221 aa		31.83	■■■□□ 2.69
GPS1-225	ENST00000585084	CALCRL	Q16602	461 aa		31.83	■■■□□ 2.69
GPS1-225	ENST00000585084	DUSP6	Q16828	381 aa		31.83	■■■□□ 2.69
GPS1-225	ENST00000585084	TPH2	Q8IWU9	490 aa		31.83	■■■□□ 2.69
GPS1-225	ENST00000585084	TCP11	Q8WWU5	503 aa		31.83	■■■□□ 2.69
GPS1-225	ENST00000585084	NGRN	Q9NPE2	291 aa	Known RBP	31.83	■■■□□ 2.69
GPS1-225	ENST00000585084	BMP2K	Q9NSY1	1161 aa	Predicted RBP	31.83	■■■□□ 2.69
GPS1-225	ENST00000585084	SRGAP2C	P0DJJ0	459 aa		31.82	■■■□□ 2.68
GPS1-225	ENST00000585084	ALDH7A1	P49419	539 aa	Known RBP	31.82	■■■□□ 2.68
GPS1-225	ENST00000585084	SMRP1	Q8NCR6	262 aa		31.82	■■■□□ 2.68
GPS1-225	ENST00000585084	C11orf16	Q9NQ32	467 aa		31.82	■■■□□ 2.68
GPS1-225	ENST00000585084	FAM105A	Q9NUU6	356 aa		31.82	■■■□□ 2.68
GPS1-225	ENST00000585084	DCX	O43602	365 aa		31.81	■■■□□ 2.68
GPS1-225	ENST00000585084	SEC24B	O95487	1268 aa		31.81	■■■□□ 2.68
GPS1-225	ENST00000585084	SRGAP2B	P0DMP2	458 aa		31.81	■■■□□ 2.68
GPS1-225	ENST00000585084	LAMTOR4	Q0VGL1	99 aa		31.81	■■■□□ 2.68
GPS1-225	ENST00000585084	EMC2	Q15006	297 aa		31.81	■■■□□ 2.68
GPS1-225	ENST00000585084	TMC7	Q7Z402	723 aa		31.81	■■■□□ 2.68
GPS1-225	ENST00000585084	SRGAP1	Q7Z6B7	1085 aa		31.81	■■■□□ 2.68
GPS1-225	ENST00000585084	ASAP2	O43150	1006 aa		31.8	■■■□□ 2.68
GPS1-225	ENST00000585084	SLITRK3	O94933	977 aa		31.8	■■■□□ 2.68
GPS1-225	ENST00000585084	LONRF3	Q496Y0	759 aa		31.8	■■■□□ 2.68
GPS1-225	ENST00000585084	GLB1L	Q6UWU2	654 aa		31.8	■■■□□ 2.68
GPS1-225	ENST00000585084	SLC39A11	Q8N1S5	342 aa		31.8	■■■□□ 2.68
GPS1-225	ENST00000585084	LPP	Q93052	612 aa		31.8	■■■□□ 2.68
GPS1-225	ENST00000585084	EIF2AK1	Q9BQI3	630 aa	Known RBP	31.8	■■■□□ 2.68
GPS1-225	ENST00000585084	TTC12	Q9H892	705 aa	Predicted RBP	31.8	■■■□□ 2.68
GPS1-225	ENST00000585084	ZBTB39	O15060	712 aa		31.79	■■■□□ 2.68
GPS1-225	ENST00000585084	NEMF	O60524	1076 aa		31.79	■■■□□ 2.68
GPS1-225	ENST00000585084	ZNF623	O75123	536 aa		31.79	■■■□□ 2.68
GPS1-225	ENST00000585084	PGBD4	Q96DM1	585 aa		31.79	■■■□□ 2.68
GPS1-225	ENST00000585084	MTR	Q99707	1265 aa		31.79	■■■□□ 2.68
GPS1-225	ENST00000585084	AGPAT5	Q9NUQ2	364 aa		31.79	■■■□□ 2.68
GPS1-225	ENST00000585084	HCN4	Q9Y3Q4	1203 aa		31.79	■■■□□ 2.68
GPS1-225	ENST00000585084	CARNS1	A5YM72	827 aa		31.78	■■■□□ 2.68
GPS1-225	ENST00000585084	TXK	P42681	527 aa		31.78	■■■□□ 2.68
GPS1-225	ENST00000585084	BCAR1	P56945	870 aa		31.78	■■■□□ 2.68
GPS1-225	ENST00000585084	RBM10	P98175	930 aa	Known RBP	31.78	■■■□□ 2.68
GPS1-225	ENST00000585084	BMS1	Q14692	1282 aa	Known RBP	31.78	■■■□□ 2.68
GPS1-225	ENST00000585084	SAFB	Q15424	915 aa	Known RBP eCLIP	31.78	■■■□□ 2.68
GPS1-225	ENST00000585084	FERMT3	Q86UX7	667 aa		31.78	■■■□□ 2.68
GPS1-225	ENST00000585084	TMEM169	Q96HH4	297 aa		31.78	■■■□□ 2.68
GPS1-225	ENST00000585084	LIMCH1	Q9UPQ0	1083 aa		31.78	■■■□□ 2.68
GPS1-225	ENST00000585084	INPP5F	Q9Y2H2	1132 aa		31.78	■■■□□ 2.68
GPS1-225	ENST00000585084	HIDE1	A8MVS5	230 aa		31.77	■■■□□ 2.68
GPS1-225	ENST00000585084	NT5C1B-RDH14	C9J2C7	533 aa		31.77	■■■□□ 2.68
GPS1-225	ENST00000585084	ZC3H11A	O75152	810 aa	Known RBP eCLIP	31.77	■■■□□ 2.68
GPS1-225	ENST00000585084	NOMO2	Q5JPE7	1267 aa		31.77	■■■□□ 2.68
GPS1-225	ENST00000585084	RNF149	Q8NC42	400 aa		31.77	■■■□□ 2.68
GPS1-225	ENST00000585084	VN1R2	Q8NFZ6	395 aa		31.77	■■■□□ 2.68
GPS1-225	ENST00000585084	CCDC43	Q96MW1	224 aa	Known RBP	31.77	■■■□□ 2.68
GPS1-225	ENST00000585084	HSD17B14	Q9BPX1	270 aa		31.77	■■■□□ 2.68
GPS1-225	ENST00000585084	USP15	Q9Y4E8	981 aa	Predicted RBP	31.77	■■■□□ 2.68
GPS1-225	ENST00000585084	PCDHB2	Q9Y5E7	798 aa		31.77	■■■□□ 2.68
GPS1-225	ENST00000585084	PRR33	A8MZF0	331 aa		31.76	■■■□□ 2.67
GPS1-225	ENST00000585084	RNASEL	Q05823	741 aa	Known RBP	31.76	■■■□□ 2.67
GPS1-225	ENST00000585084	SMC1A	Q14683	1233 aa	Known RBP	31.76	■■■□□ 2.67
GPS1-225	ENST00000585084	MINDY3	Q9H8M7	445 aa		31.76	■■■□□ 2.67
GPS1-225	ENST00000585084	LYPLA2	O95372	231 aa		31.75	■■■□□ 2.67
GPS1-225	ENST00000585084	ST3GAL1	Q11201	340 aa		31.75	■■■□□ 2.67
GPS1-225	ENST00000585084	MXD4	Q14582	209 aa	Predicted RBP	31.75	■■■□□ 2.67
GPS1-225	ENST00000585084	TMEM184A	Q6ZMB5	413 aa		31.75	■■■□□ 2.67
GPS1-225	ENST00000585084	ANKEF1	Q9NU02	776 aa		31.75	■■■□□ 2.67
GPS1-225	ENST00000585084	TBC1D13	Q9NVG8	400 aa		31.75	■■■□□ 2.67
GPS1-225	ENST00000585084	OFD1	O75665	1012 aa		31.74	■■■□□ 2.67
GPS1-225	ENST00000585084	ERLIN2	O94905	339 aa		31.74	■■■□□ 2.67
GPS1-225	ENST00000585084	ATP2B1	P20020	1258 aa		31.74	■■■□□ 2.67
GPS1-225	ENST00000585084	CA8	P35219	290 aa		31.74	■■■□□ 2.67
GPS1-225	ENST00000585084	TEC	P42680	631 aa		31.74	■■■□□ 2.67
GPS1-225	ENST00000585084	LLGL2	Q6P1M3	1020 aa		31.74	■■■□□ 2.67
GPS1-225	ENST00000585084	CCDC83	Q8IWF9	413 aa		31.74	■■■□□ 2.67
GPS1-225	ENST00000585084	MTMR9	Q96QG7	549 aa		31.74	■■■□□ 2.67
GPS1-225	ENST00000585084	ARID2	Q68CP9	1835 aa		31.73	■■■□□ 2.67
GPS1-225	ENST00000585084	MEIS3P2	A8K0S8	358 aa		31.73	■■■□□ 2.67
GPS1-225	ENST00000585084	WNT7A	O00755	349 aa		31.73	■■■□□ 2.67
GPS1-225	ENST00000585084	GUCY1B3	Q02153	619 aa		31.73	■■■□□ 2.67
GPS1-225	ENST00000585084	TFDP1	Q14186	410 aa		31.73	■■■□□ 2.67
GPS1-225	ENST00000585084	RNF135	Q8IUD6	432 aa		31.73	■■■□□ 2.67
GPS1-225	ENST00000585084	MRPL43	Q8N983	215 aa	Known RBP	31.73	■■■□□ 2.67
GPS1-225	ENST00000585084	URGCP	Q8TCY9	931 aa		31.73	■■■□□ 2.67
GPS1-225	ENST00000585084	C8orf76	Q96K31	380 aa		31.73	■■■□□ 2.67
GPS1-225	ENST00000585084	NRDE2	Q9H7Z3	1164 aa		31.73	■■■□□ 2.67
GPS1-225	ENST00000585084	XPNPEP1	Q9NQW7	623 aa		31.73	■■■□□ 2.67
GPS1-225	ENST00000585084	DGAT1	O75907	488 aa		31.72	■■■□□ 2.67
GPS1-225	ENST00000585084	HOXA11	P31270	313 aa	Predicted RBP	31.72	■■■□□ 2.67
GPS1-225	ENST00000585084	MCM7	P33993	719 aa		31.72	■■■□□ 2.67
GPS1-225	ENST00000585084	KCNC3	Q14003	757 aa		31.72	■■■□□ 2.67
GPS1-225	ENST00000585084	PCBP1	Q15365	356 aa	Known RBP eCLIP	31.72	■■■□□ 2.67
GPS1-225	ENST00000585084	ANKRD54	Q6NXT1	300 aa		31.72	■■■□□ 2.67
GPS1-225	ENST00000585084	MRPL10	Q7Z7H8	261 aa	Known RBP	31.72	■■■□□ 2.67
GPS1-225	ENST00000585084	LLPH	Q9BRT6	129 aa	Known RBP	31.72	■■■□□ 2.67
GPS1-225	ENST00000585084	PHF7	Q9BWX1	381 aa	Predicted RBP	31.72	■■■□□ 2.67
GPS1-225	ENST00000585084	GBP3	Q9H0R5	595 aa		31.72	■■■□□ 2.67
GPS1-225	ENST00000585084	C2orf71	A6NGG8	1288 aa		31.71	■■■□□ 2.67
GPS1-225	ENST00000585084	NCBP1	Q09161	790 aa	Known RBP	31.71	■■■□□ 2.67
GPS1-225	ENST00000585084	AGMO	Q6ZNB7	445 aa		31.71	■■■□□ 2.67
GPS1-225	ENST00000585084	VPS52	Q8N1B4	723 aa		31.71	■■■□□ 2.67
GPS1-225	ENST00000585084	TMEM87A	Q8NBN3	555 aa		31.71	■■■□□ 2.67
GPS1-225	ENST00000585084	RSAD1	Q9HA92	442 aa		31.71	■■■□□ 2.67
GPS1-225	ENST00000585084	MUTYH	Q9UIF7	546 aa		31.71	■■■□□ 2.67

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22.3 ms