RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000577760.1

RPL23-208, Transcript of ribosomal protein L23, human

Gene RPL23, Length 3,081 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RPL23-208	ENST00000577760	KDM3A	Q9Y4C1	1321 aa		11.76	□□□□□ -0.53
RPL23-208	ENST00000577760	RIPK2	O43353	540 aa		11.75	□□□□□ -0.53
RPL23-208	ENST00000577760	SUN1	O94901	812 aa		11.75	□□□□□ -0.53
RPL23-208	ENST00000577760	AGT	P01019	485 aa		11.75	□□□□□ -0.53
RPL23-208	ENST00000577760	SLC12A3	P55017	1021 aa		11.75	□□□□□ -0.53
RPL23-208	ENST00000577760	ADCY2	Q08462	1091 aa		11.75	□□□□□ -0.53
RPL23-208	ENST00000577760	CBWD6	Q4V339	395 aa		11.75	□□□□□ -0.53
RPL23-208	ENST00000577760	CBWD3	Q5JTY5	395 aa		11.75	□□□□□ -0.53
RPL23-208	ENST00000577760	CBWD5	Q5RIA9	395 aa		11.75	□□□□□ -0.53
RPL23-208	ENST00000577760	MYCT1	Q8N699	235 aa		11.75	□□□□□ -0.53
RPL23-208	ENST00000577760	FITM2	Q8N6M3	262 aa		11.75	□□□□□ -0.53
RPL23-208	ENST00000577760	SETDB2	Q96T68	719 aa		11.75	□□□□□ -0.53
RPL23-208	ENST00000577760	MYH14	Q7Z406	1995 aa	Known RBP	11.75	□□□□□ -0.53
RPL23-208	ENST00000577760	FAM196B	A6NMK8	535 aa		11.75	□□□□□ -0.53
RPL23-208	ENST00000577760	BHMG1	C9JSJ3	638 aa	Predicted RBP	11.75	□□□□□ -0.53
RPL23-208	ENST00000577760	PDHA1	P08559	390 aa		11.75	□□□□□ -0.53
RPL23-208	ENST00000577760	NUDT17	P0C025	328 aa		11.75	□□□□□ -0.53
RPL23-208	ENST00000577760	DLAT	P10515	647 aa	Known RBP	11.75	□□□□□ -0.53
RPL23-208	ENST00000577760	COPS2	P61201	443 aa		11.75	□□□□□ -0.53
RPL23-208	ENST00000577760	BIRC2	Q13490	618 aa		11.75	□□□□□ -0.53
RPL23-208	ENST00000577760	SEPT2	Q15019	361 aa		11.75	□□□□□ -0.53
RPL23-208	ENST00000577760	TAF11	Q15544	211 aa		11.75	□□□□□ -0.53
RPL23-208	ENST00000577760	SEC14L1	Q92503	715 aa		11.75	□□□□□ -0.53
RPL23-208	ENST00000577760	TMEM237	Q96Q45	408 aa		11.75	□□□□□ -0.53
RPL23-208	ENST00000577760	RTFDC1	Q9BY42	306 aa	Predicted RBP	11.75	□□□□□ -0.53
RPL23-208	ENST00000577760	ETNK1	Q9HBU6	452 aa		11.75	□□□□□ -0.53
RPL23-208	ENST00000577760	ASTN1	O14525	1302 aa		11.75	□□□□□ -0.53
RPL23-208	ENST00000577760	SNED1	Q8TER0	1413 aa		11.75	□□□□□ -0.53
RPL23-208	ENST00000577760	PNMA6F	A0A0J9YX94	578 aa		11.75	□□□□□ -0.53
RPL23-208	ENST00000577760	ESYT2	A0FGR8	921 aa		11.75	□□□□□ -0.53
RPL23-208	ENST00000577760	FOXN3	O00409	490 aa	Predicted RBP	11.75	□□□□□ -0.53
RPL23-208	ENST00000577760	PPP1R12A	O14974	1030 aa	Predicted RBP	11.75	□□□□□ -0.53
RPL23-208	ENST00000577760	SPOP	O43791	374 aa		11.75	□□□□□ -0.53
RPL23-208	ENST00000577760	FTL	P02792	175 aa	Predicted RBP	11.75	□□□□□ -0.53
RPL23-208	ENST00000577760	LDHC	P07864	332 aa		11.75	□□□□□ -0.53
RPL23-208	ENST00000577760	MSH2	P43246	934 aa		11.75	□□□□□ -0.53
RPL23-208	ENST00000577760	IK	Q13123	557 aa	Predicted RBP	11.75	□□□□□ -0.53
RPL23-208	ENST00000577760	DDB1	Q16531	1140 aa		11.75	□□□□□ -0.53
RPL23-208	ENST00000577760	KYNU	Q16719	465 aa		11.75	□□□□□ -0.53
RPL23-208	ENST00000577760	CAPN12	Q6ZSI9	719 aa		11.75	□□□□□ -0.53
RPL23-208	ENST00000577760	TAOK1	Q7L7X3	1001 aa		11.75	□□□□□ -0.53
RPL23-208	ENST00000577760	CYP2W1	Q8TAV3	490 aa		11.75	□□□□□ -0.53
RPL23-208	ENST00000577760	ZNF622	Q969S3	477 aa	Known RBP eCLIP	11.75	□□□□□ -0.53
RPL23-208	ENST00000577760	L3MBTL3	Q96JM7	780 aa	Predicted RBP	11.75	□□□□□ -0.53
RPL23-208	ENST00000577760	NAP1L3	Q99457	506 aa	Predicted RBP	11.75	□□□□□ -0.53
RPL23-208	ENST00000577760	CDC42EP4	Q9H3Q1	356 aa	Known RBP	11.75	□□□□□ -0.53
RPL23-208	ENST00000577760	MTMR4	Q9NYA4	1195 aa		11.75	□□□□□ -0.53
RPL23-208	ENST00000577760	ASIC3	Q9UHC3	531 aa		11.75	□□□□□ -0.53
RPL23-208	ENST00000577760	PFAS	O15067	1338 aa		11.75	□□□□□ -0.53
RPL23-208	ENST00000577760	NHSL1	Q5SYE7	1610 aa		11.74	□□□□□ -0.53
RPL23-208	ENST00000577760	CFAP73	A6NFT4	308 aa		11.74	□□□□□ -0.53
RPL23-208	ENST00000577760	GSTA1	P08263	222 aa		11.74	□□□□□ -0.53
RPL23-208	ENST00000577760	PYGM	P11217	842 aa		11.74	□□□□□ -0.53
RPL23-208	ENST00000577760	LMNB1	P20700	586 aa		11.74	□□□□□ -0.53
RPL23-208	ENST00000577760	COMT	P21964	271 aa		11.74	□□□□□ -0.53
RPL23-208	ENST00000577760	RPL13	P26373	211 aa	Known RBP	11.74	□□□□□ -0.53
RPL23-208	ENST00000577760	STX2	P32856	288 aa		11.74	□□□□□ -0.53
RPL23-208	ENST00000577760	JAM2	P57087	298 aa		11.74	□□□□□ -0.53
RPL23-208	ENST00000577760	GSTO1	P78417	241 aa		11.74	□□□□□ -0.53
RPL23-208	ENST00000577760	LACTB	P83111	547 aa	Predicted RBP	11.74	□□□□□ -0.53
RPL23-208	ENST00000577760	PPAT	Q06203	517 aa		11.74	□□□□□ -0.53
RPL23-208	ENST00000577760	CALCOCO2	Q13137	446 aa		11.74	□□□□□ -0.53
RPL23-208	ENST00000577760	SEL1L2	Q5TEA6	688 aa		11.74	□□□□□ -0.53
RPL23-208	ENST00000577760	PRUNE1	Q86TP1	453 aa		11.74	□□□□□ -0.53
RPL23-208	ENST00000577760	SRRM1	Q8IYB3	904 aa	Known RBP	11.74	□□□□□ -0.53
RPL23-208	ENST00000577760	CARD9	Q9H257	536 aa		11.74	□□□□□ -0.53
RPL23-208	ENST00000577760	PCIF1	Q9H4Z3	704 aa		11.74	□□□□□ -0.53
RPL23-208	ENST00000577760	HOMER3	Q9NSC5	361 aa		11.74	□□□□□ -0.53
RPL23-208	ENST00000577760	PCDHA1	Q9Y5I3	950 aa		11.74	□□□□□ -0.53
RPL23-208	ENST00000577760	KIAA1551	Q9HCM1	1747 aa		11.74	□□□□□ -0.53
RPL23-208	ENST00000577760	PHF2	O75151	1096 aa		11.74	□□□□□ -0.53
RPL23-208	ENST00000577760	TMEM253	P0C7T8	217 aa		11.74	□□□□□ -0.53
RPL23-208	ENST00000577760	BRAF	P15056	766 aa		11.74	□□□□□ -0.53
RPL23-208	ENST00000577760	VCAM1	P19320	739 aa		11.74	□□□□□ -0.53
RPL23-208	ENST00000577760	CHKA	P35790	457 aa		11.74	□□□□□ -0.53
RPL23-208	ENST00000577760	PTGIR	P43119	386 aa		11.74	□□□□□ -0.53
RPL23-208	ENST00000577760	ATP11A	P98196	1134 aa		11.74	□□□□□ -0.53
RPL23-208	ENST00000577760	MPP2	Q14168	576 aa		11.74	□□□□□ -0.53
RPL23-208	ENST00000577760	SHROOM1	Q2M3G4	852 aa	Predicted RBP	11.74	□□□□□ -0.53
RPL23-208	ENST00000577760	ANKRD20A2	Q5SQ80	823 aa		11.74	□□□□□ -0.53
RPL23-208	ENST00000577760	HP1BP3	Q5SSJ5	553 aa	Predicted RBP	11.74	□□□□□ -0.53
RPL23-208	ENST00000577760	ANKRD20A1	Q5TYW2	823 aa		11.74	□□□□□ -0.53
RPL23-208	ENST00000577760	ANKRD20A3	Q5VUR7	823 aa		11.74	□□□□□ -0.53
RPL23-208	ENST00000577760	ZNF449	Q6P9G9	518 aa		11.74	□□□□□ -0.53
RPL23-208	ENST00000577760	SPATA21	Q7Z572	469 aa		11.74	□□□□□ -0.53
RPL23-208	ENST00000577760	ATG4A	Q8WYN0	398 aa		11.74	□□□□□ -0.53
RPL23-208	ENST00000577760	TGS1	Q96RS0	853 aa	Known RBP	11.74	□□□□□ -0.53
RPL23-208	ENST00000577760	CRAMP1	Q96RY5	1269 aa		11.74	□□□□□ -0.53
RPL23-208	ENST00000577760	FAM187A	A6NFU0	413 aa		11.73	□□□□□ -0.53
RPL23-208	ENST00000577760	HOXA13	P31271	388 aa	Predicted RBP	11.73	□□□□□ -0.53
RPL23-208	ENST00000577760	SESN3	P58005	492 aa		11.73	□□□□□ -0.53
RPL23-208	ENST00000577760	ZNF268	Q14587	947 aa	Predicted RBP	11.73	□□□□□ -0.53
RPL23-208	ENST00000577760	MFSD14B	Q5SR56	506 aa		11.73	□□□□□ -0.53
RPL23-208	ENST00000577760	THEMIS2	Q5TEJ8	643 aa		11.73	□□□□□ -0.53
RPL23-208	ENST00000577760	PPP4R3CP	Q6ZMV5	832 aa		11.73	□□□□□ -0.53
RPL23-208	ENST00000577760	COL23A1	Q86Y22	540 aa	Predicted RBP	11.73	□□□□□ -0.53
RPL23-208	ENST00000577760	TPH2	Q8IWU9	490 aa		11.73	□□□□□ -0.53
RPL23-208	ENST00000577760	PARD3B	Q8TEW8	1205 aa		11.73	□□□□□ -0.53
RPL23-208	ENST00000577760	ANO3	Q9BYT9	981 aa		11.73	□□□□□ -0.53
RPL23-208	ENST00000577760	TYW1	Q9NV66	732 aa	Known RBP	11.73	□□□□□ -0.53

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