RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000577409.1

CNDP2-204, Transcript of carnosine dipeptidase 2, humanhuman

TSL 2

Gene CNDP2, Length 422 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNDP2-204ENST00000577409 A0A0U1RQF3 1178 aa23.17■■□□□ 1.3
CNDP2-204ENST00000577409 SLC26A4O43511 780 aa23.17■■□□□ 1.3
CNDP2-204ENST00000577409 STAG3L1P0CL83 205 aa23.17■■□□□ 1.3
CNDP2-204ENST00000577409 FGFR1P11362 822 aa23.17■■□□□ 1.3
CNDP2-204ENST00000577409 PLCG1P19174 1290 aa23.17■■□□□ 1.3
CNDP2-204ENST00000577409 MAPK7Q13164 816 aa23.17■■□□□ 1.3
CNDP2-204ENST00000577409 STK38Q15208 465 aa23.17■■□□□ 1.3
CNDP2-204ENST00000577409 CDCA2Q69YH5 1023 aaPredicted RBP23.17■■□□□ 1.3
CNDP2-204ENST00000577409 ZNF598Q86UK7 904 aaKnown RBP23.17■■□□□ 1.3
CNDP2-204ENST00000577409 KRI1Q8N9T8 703 aaKnown RBP23.17■■□□□ 1.3
CNDP2-204ENST00000577409 CDK5RAP3Q96JB5 506 aa23.17■■□□□ 1.3
CNDP2-204ENST00000577409 TGS1Q96RS0 853 aaKnown RBP23.17■■□□□ 1.3
CNDP2-204ENST00000577409 KIFC3Q9BVG8 833 aa23.17■■□□□ 1.3
CNDP2-204ENST00000577409 NFKBIZQ9BYH8 718 aa23.17■■□□□ 1.3
CNDP2-204ENST00000577409 TMEM161AQ9NX61 479 aa23.17■■□□□ 1.3
CNDP2-204ENST00000577409 LRFN2Q9ULH4 789 aa23.17■■□□□ 1.3
CNDP2-204ENST00000577409 TRANK1O15050 2925 aa23.16■■□□□ 1.3
CNDP2-204ENST00000577409 LRRIQ4A6NIV6 560 aa23.16■■□□□ 1.3
CNDP2-204ENST00000577409 INO80B-WBP1J3KQ70 363 aa23.16■■□□□ 1.3
CNDP2-204ENST00000577409 TSPAN1O60635 241 aa23.16■■□□□ 1.3
CNDP2-204ENST00000577409 SSBP05455 408 aaKnown RBP eCLIP23.16■■□□□ 1.3
CNDP2-204ENST00000577409 BECN1Q14457 450 aa23.16■■□□□ 1.3
CNDP2-204ENST00000577409 PAN2Q504Q3 1202 aaKnown RBP23.16■■□□□ 1.3
CNDP2-204ENST00000577409 ARSHQ5FYA8 562 aa23.16■■□□□ 1.3
CNDP2-204ENST00000577409 UBXN11Q5T124 520 aa23.16■■□□□ 1.3
CNDP2-204ENST00000577409 KCTD17Q8N5Z5 321 aa23.16■■□□□ 1.3
CNDP2-204ENST00000577409 ELAC1Q9H777 363 aaKnown RBP23.16■■□□□ 1.3
CNDP2-204ENST00000577409 NPHP3-ACAD11A0A0J9YXS1 232 aa23.15■■□□□ 1.3
CNDP2-204ENST00000577409 SPTLC2O15270 562 aa23.15■■□□□ 1.3
CNDP2-204ENST00000577409 B4GALT5O43286 388 aa23.15■■□□□ 1.3
CNDP2-204ENST00000577409 LPXNO60711 386 aa23.15■■□□□ 1.3
CNDP2-204ENST00000577409 HIP1RO75146 1068 aa23.15■■□□□ 1.3
CNDP2-204ENST00000577409 DNM1Q05193 864 aaKnown RBP23.15■■□□□ 1.3
CNDP2-204ENST00000577409 BTG3Q14201 252 aaPredicted RBP23.15■■□□□ 1.3
CNDP2-204ENST00000577409 TWF2Q6IBS0 349 aaKnown RBP23.15■■□□□ 1.3
CNDP2-204ENST00000577409 FIBCD1Q8N539 461 aa23.15■■□□□ 1.3
CNDP2-204ENST00000577409 CALML4Q96GE6 196 aa23.15■■□□□ 1.3
CNDP2-204ENST00000577409 TRAIPQ9BWF2 469 aa23.15■■□□□ 1.3
CNDP2-204ENST00000577409 DACT1Q9NYF0 836 aa23.15■■□□□ 1.3
CNDP2-204ENST00000577409 MRPL42Q9Y6G3 142 aaKnown RBP23.15■■□□□ 1.3
CNDP2-204ENST00000577409 TTLL13PA6NNM8 815 aa23.14■■□□□ 1.29
CNDP2-204ENST00000577409 MEIS3P2A8K0S8 358 aa23.14■■□□□ 1.29
CNDP2-204ENST00000577409 SFI1A8K8P3 1242 aa23.14■■□□□ 1.29
CNDP2-204ENST00000577409 YEATS4O95619 227 aa23.14■■□□□ 1.29
CNDP2-204ENST00000577409 FOSL2P15408 326 aa23.14■■□□□ 1.29
CNDP2-204ENST00000577409 RAD51AP2Q09MP3 1159 aa23.14■■□□□ 1.29
CNDP2-204ENST00000577409 CMTR2Q8IYT2 770 aaKnown RBP23.14■■□□□ 1.29
CNDP2-204ENST00000577409 RNF169Q8NCN4 708 aa23.14■■□□□ 1.29
CNDP2-204ENST00000577409 RAD54LQ92698 747 aa23.14■■□□□ 1.29
CNDP2-204ENST00000577409 KIFAP3Q92845 792 aa23.14■■□□□ 1.29
CNDP2-204ENST00000577409 CPB2Q96IY4 423 aa23.14■■□□□ 1.29
CNDP2-204ENST00000577409 HCSTQ9UBK5 93 aa23.14■■□□□ 1.29
CNDP2-204ENST00000577409 USP20Q9Y2K6 914 aa23.14■■□□□ 1.29
CNDP2-204ENST00000577409 A0A087X0B3 334 aa23.13■■□□□ 1.29
CNDP2-204ENST00000577409 TBKBP1A7MCY6 615 aa23.13■■□□□ 1.29
CNDP2-204ENST00000577409 EDN1P05305 212 aa23.13■■□□□ 1.29
CNDP2-204ENST00000577409 ARF4P18085 180 aaPredicted RBP23.13■■□□□ 1.29
CNDP2-204ENST00000577409 GUCY2CP25092 1073 aa23.13■■□□□ 1.29
CNDP2-204ENST00000577409 NAMPTP43490 491 aa23.13■■□□□ 1.29
CNDP2-204ENST00000577409 MCM6Q14566 821 aa23.13■■□□□ 1.29
CNDP2-204ENST00000577409 LONRF3Q496Y0 759 aa23.13■■□□□ 1.29
CNDP2-204ENST00000577409 EPC2Q52LR7 807 aa23.13■■□□□ 1.29
CNDP2-204ENST00000577409 CLLU1OSQ5K130 101 aa23.13■■□□□ 1.29
CNDP2-204ENST00000577409 TMEM192Q8IY95 271 aa23.13■■□□□ 1.29
CNDP2-204ENST00000577409 GDPD5Q8WTR4 605 aa23.13■■□□□ 1.29
CNDP2-204ENST00000577409 CLP1Q92989 425 aaKnown RBP23.13■■□□□ 1.29
CNDP2-204ENST00000577409 LPPQ93052 612 aa23.13■■□□□ 1.29
CNDP2-204ENST00000577409 CASD1Q96PB1 797 aa23.13■■□□□ 1.29
CNDP2-204ENST00000577409 CCDC113Q9H0I3 377 aa23.13■■□□□ 1.29
CNDP2-204ENST00000577409 FZD8Q9H461 694 aa23.13■■□□□ 1.29
CNDP2-204ENST00000577409 FAM105AQ9NUU6 356 aa23.13■■□□□ 1.29
CNDP2-204ENST00000577409 PRUNE2Q8WUY3 3088 aa23.13■■□□□ 1.29
CNDP2-204ENST00000577409 PPP6R2O75170 966 aa23.12■■□□□ 1.29
CNDP2-204ENST00000577409 ERLIN2O94905 339 aa23.12■■□□□ 1.29
CNDP2-204ENST00000577409 CACNB1Q02641 598 aaPredicted RBP23.12■■□□□ 1.29
CNDP2-204ENST00000577409 DHX8Q14562 1220 aaKnown RBP23.12■■□□□ 1.29
CNDP2-204ENST00000577409 NAALADL2Q58DX5 795 aa23.12■■□□□ 1.29
CNDP2-204ENST00000577409 CDR2LQ86X02 465 aaPredicted RBP23.12■■□□□ 1.29
CNDP2-204ENST00000577409 RASSF8Q8NHQ8 419 aa23.12■■□□□ 1.29
CNDP2-204ENST00000577409 EIF2AQ9BY44 585 aaKnown RBP23.12■■□□□ 1.29
CNDP2-204ENST00000577409 PCDHB2Q9Y5E7 798 aa23.12■■□□□ 1.29
CNDP2-204ENST00000577409 ZNF623O75123 536 aa23.11■■□□□ 1.29
CNDP2-204ENST00000577409 EOMESO95936 686 aa23.11■■□□□ 1.29
CNDP2-204ENST00000577409 NPTX2P47972 431 aa23.11■■□□□ 1.29
CNDP2-204ENST00000577409 PEX3P56589 373 aa23.11■■□□□ 1.29
CNDP2-204ENST00000577409 PCBP1Q15365 356 aaKnown RBP eCLIP23.11■■□□□ 1.29
CNDP2-204ENST00000577409 AXDND1Q5T1B0 1012 aaPredicted RBP23.11■■□□□ 1.29
CNDP2-204ENST00000577409 PPP4R3CPQ6ZMV5 832 aa23.11■■□□□ 1.29
CNDP2-204ENST00000577409 LRRC55Q6ZSA7 311 aa23.11■■□□□ 1.29
CNDP2-204ENST00000577409 GPBP1Q86WP2 473 aa23.11■■□□□ 1.29
CNDP2-204ENST00000577409 DEPTORQ8TB45 409 aa23.11■■□□□ 1.29
CNDP2-204ENST00000577409 IFT74Q96LB3 600 aa23.11■■□□□ 1.29
CNDP2-204ENST00000577409 PANK2Q9BZ23 570 aa23.11■■□□□ 1.29
CNDP2-204ENST00000577409 SPTBN5Q9NRC6 3674 aaKnown RBP23.11■■□□□ 1.29
CNDP2-204ENST00000577409 IGFBP4P22692 258 aa23.1■■□□□ 1.29
CNDP2-204ENST00000577409 DDIT3P35638 169 aa23.1■■□□□ 1.29
CNDP2-204ENST00000577409 BMPR1AP36894 532 aa23.1■■□□□ 1.29
CNDP2-204ENST00000577409 PPP2R5AQ15172 486 aa23.1■■□□□ 1.29
CNDP2-204ENST00000577409 SHC4Q6S5L8 630 aa23.1■■□□□ 1.29
CNDP2-204ENST00000577409 MRPL10Q7Z7H8 261 aaKnown RBP23.1■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 17.3 ms