RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000566882.5

CCNDBP1-210, Transcript of cyclin D1 binding protein 1, humanhuman

TSL 2

Gene CCNDBP1, Length 2,746 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNDBP1-210ENST00000566882 PRKCEQ02156 737 aa11.07□□□□□ -0.64
CCNDBP1-210ENST00000566882 DRAP1Q14919 205 aaPredicted RBP11.07□□□□□ -0.64
CCNDBP1-210ENST00000566882 SH3D19Q5HYK7 790 aa11.07□□□□□ -0.64
CCNDBP1-210ENST00000566882 ZNF746Q6NUN9 644 aaPredicted RBP11.07□□□□□ -0.64
CCNDBP1-210ENST00000566882 STXBP4Q6ZWJ1 553 aa11.07□□□□□ -0.64
CCNDBP1-210ENST00000566882 EHBP1Q8NDI1 1231 aa11.07□□□□□ -0.64
CCNDBP1-210ENST00000566882 TRIM58Q8NG06 486 aa11.07□□□□□ -0.64
CCNDBP1-210ENST00000566882 LNX1Q8TBB1 728 aaPredicted RBP11.07□□□□□ -0.64
CCNDBP1-210ENST00000566882 MKNK1Q9BUB5 465 aa11.07□□□□□ -0.64
CCNDBP1-210ENST00000566882 NUCKS1Q9H1E3 243 aaKnown RBP11.07□□□□□ -0.64
CCNDBP1-210ENST00000566882 ACP6Q9NPH0 428 aa11.07□□□□□ -0.64
CCNDBP1-210ENST00000566882 ADARB2Q9NS39 739 aaKnown RBP11.07□□□□□ -0.64
CCNDBP1-210ENST00000566882 DENND3A2RUS2 1198 aa11.06□□□□□ -0.64
CCNDBP1-210ENST00000566882 SOWAHBA6NEL2 793 aa11.06□□□□□ -0.64
CCNDBP1-210ENST00000566882 F8VZ95 297 aa11.06□□□□□ -0.64
CCNDBP1-210ENST00000566882 EVI5O60447 810 aa11.06□□□□□ -0.64
CCNDBP1-210ENST00000566882 MATR3P43243 847 aaKnown RBP eCLIP11.06□□□□□ -0.64
CCNDBP1-210ENST00000566882 NCKAP1LP55160 1127 aa11.06□□□□□ -0.64
CCNDBP1-210ENST00000566882 NAB2Q15742 525 aa11.06□□□□□ -0.64
CCNDBP1-210ENST00000566882 MTERF2Q49AM1 385 aa11.06□□□□□ -0.64
CCNDBP1-210ENST00000566882 TMEM63BQ5T3F8 832 aa11.06□□□□□ -0.64
CCNDBP1-210ENST00000566882 ABHD15Q6UXT9 468 aa11.06□□□□□ -0.64
CCNDBP1-210ENST00000566882 LBX2Q6XYB7 198 aa11.06□□□□□ -0.64
CCNDBP1-210ENST00000566882 SULF1Q8IWU6 871 aa11.06□□□□□ -0.64
CCNDBP1-210ENST00000566882 GSPT2Q8IYD1 628 aaKnown RBP11.06□□□□□ -0.64
CCNDBP1-210ENST00000566882 SAMD3Q8N6K7 520 aa11.06□□□□□ -0.64
CCNDBP1-210ENST00000566882 MSANTD4Q8NCY6 345 aa11.06□□□□□ -0.64
CCNDBP1-210ENST00000566882 HDAC7Q8WUI4 952 aa11.06□□□□□ -0.64
CCNDBP1-210ENST00000566882 DCPSQ96C86 337 aaKnown RBP11.06□□□□□ -0.64
CCNDBP1-210ENST00000566882 OSBPL9Q96SU4 736 aa11.06□□□□□ -0.64
CCNDBP1-210ENST00000566882 TXNRD2Q9NNW7 524 aa11.06□□□□□ -0.64
CCNDBP1-210ENST00000566882 ABCB6Q9NP58 842 aa11.06□□□□□ -0.64
CCNDBP1-210ENST00000566882 NAGPAQ9UK23 515 aa11.06□□□□□ -0.64
CCNDBP1-210ENST00000566882 JRKLQ9Y4A0 524 aa11.06□□□□□ -0.64
CCNDBP1-210ENST00000566882 PPP2R3BQ9Y5P8 575 aa11.06□□□□□ -0.64
CCNDBP1-210ENST00000566882 MYH9P35579 1960 aaKnown RBP11.06□□□□□ -0.64
CCNDBP1-210ENST00000566882 PGK2P07205 417 aa11.06□□□□□ -0.64
CCNDBP1-210ENST00000566882 VAMP7P51809 220 aa11.06□□□□□ -0.64
CCNDBP1-210ENST00000566882 RNASE9P60153 205 aaKnown RBP11.06□□□□□ -0.64
CCNDBP1-210ENST00000566882 GABPB1Q06547 395 aaPredicted RBP11.06□□□□□ -0.64
CCNDBP1-210ENST00000566882 LONRF2Q1L5Z9 754 aa11.06□□□□□ -0.64
CCNDBP1-210ENST00000566882 C9orf131Q5VYM1 1079 aa11.06□□□□□ -0.64
CCNDBP1-210ENST00000566882 TAS1R3Q7RTX0 852 aa11.06□□□□□ -0.64
CCNDBP1-210ENST00000566882 NCAPG2Q86XI2 1143 aa11.06□□□□□ -0.64
CCNDBP1-210ENST00000566882 SLC9A9Q8IVB4 645 aa11.06□□□□□ -0.64
CCNDBP1-210ENST00000566882 GLYCTKQ8IVS8 523 aa11.06□□□□□ -0.64
CCNDBP1-210ENST00000566882 CAGE1Q8TC20 777 aa11.06□□□□□ -0.64
CCNDBP1-210ENST00000566882 CCDC127Q96BQ5 260 aa11.06□□□□□ -0.64
CCNDBP1-210ENST00000566882 FUT8Q9BYC5 575 aa11.06□□□□□ -0.64
CCNDBP1-210ENST00000566882 PLEKHA4Q9H4M7 779 aa11.06□□□□□ -0.64
CCNDBP1-210ENST00000566882 SPON1Q9HCB6 807 aa11.06□□□□□ -0.64
CCNDBP1-210ENST00000566882 ANKEF1Q9NU02 776 aa11.06□□□□□ -0.64
CCNDBP1-210ENST00000566882 TAS2R14Q9NYV8 317 aa11.06□□□□□ -0.64
CCNDBP1-210ENST00000566882 TBX20Q9UMR3 447 aa11.06□□□□□ -0.64
CCNDBP1-210ENST00000566882 ANO9A1A5B4 782 aa11.05□□□□□ -0.64
CCNDBP1-210ENST00000566882 GRID2IPA4D2P6 1211 aa11.05□□□□□ -0.64
CCNDBP1-210ENST00000566882 FOXN3O00409 490 aaPredicted RBP11.05□□□□□ -0.64
CCNDBP1-210ENST00000566882 PPP1R12BO60237 982 aaPredicted RBP11.05□□□□□ -0.64
CCNDBP1-210ENST00000566882 TUBB2AQ13885 445 aa11.05□□□□□ -0.64
CCNDBP1-210ENST00000566882 Q3C1V9 767 aa11.05□□□□□ -0.64
CCNDBP1-210ENST00000566882 U2AF1L4Q8WU68 220 aaKnown RBP11.05□□□□□ -0.64
CCNDBP1-210ENST00000566882 TMEM143Q96AN5 459 aa11.05□□□□□ -0.64
CCNDBP1-210ENST00000566882 NOX5Q96PH1 765 aa11.05□□□□□ -0.64
CCNDBP1-210ENST00000566882 SENP7Q9BQF6 1050 aa11.05□□□□□ -0.64
CCNDBP1-210ENST00000566882 TUBB2BQ9BVA1 445 aa11.05□□□□□ -0.64
CCNDBP1-210ENST00000566882 ARFGAP3Q9NP61 516 aa11.05□□□□□ -0.64
CCNDBP1-210ENST00000566882 LOC285556D6RIA3 1793 aa11.05□□□□□ -0.64
CCNDBP1-210ENST00000566882 GTPBP10A4D1E9 387 aaKnown RBP11.05□□□□□ -0.64
CCNDBP1-210ENST00000566882 H3BQF6 201 aa11.05□□□□□ -0.64
CCNDBP1-210ENST00000566882 CNMDO75829 334 aa11.05□□□□□ -0.64
CCNDBP1-210ENST00000566882 CALCAP01258 141 aa11.05□□□□□ -0.64
CCNDBP1-210ENST00000566882 OAS2P29728 719 aaKnown RBP11.05□□□□□ -0.64
CCNDBP1-210ENST00000566882 CNGA1P29973 690 aa11.05□□□□□ -0.64
CCNDBP1-210ENST00000566882 ALKBH5Q6P6C2 394 aaKnown RBP11.05□□□□□ -0.64
CCNDBP1-210ENST00000566882 XXYLT1Q8NBI6 393 aa11.05□□□□□ -0.64
CCNDBP1-210ENST00000566882 SLC20A1Q8WUM9 679 aa11.05□□□□□ -0.64
CCNDBP1-210ENST00000566882 SEMA4DQ92854 862 aa11.05□□□□□ -0.64
CCNDBP1-210ENST00000566882 GDAP1L1Q96MZ0 367 aa11.05□□□□□ -0.64
CCNDBP1-210ENST00000566882 SYT17Q9BSW7 474 aa11.05□□□□□ -0.64
CCNDBP1-210ENST00000566882 TMEM206Q9H813 350 aa11.05□□□□□ -0.64
CCNDBP1-210ENST00000566882 KMT5AQ9NQR1 393 aa11.05□□□□□ -0.64
CCNDBP1-210ENST00000566882 PDLIM7Q9NR12 457 aa11.05□□□□□ -0.64
CCNDBP1-210ENST00000566882 CSADQ9Y600 493 aa11.05□□□□□ -0.64
CCNDBP1-210ENST00000566882 SYNGAP1Q96PV0 1343 aa11.04□□□□□ -0.64
CCNDBP1-210ENST00000566882 DNAH12Q6ZR08 3092 aa11.04□□□□□ -0.64
CCNDBP1-210ENST00000566882 N4BP1O75113 896 aaKnown RBP11.04□□□□□ -0.64
CCNDBP1-210ENST00000566882 PSAPP07602 524 aa11.04□□□□□ -0.64
CCNDBP1-210ENST00000566882 MYBL2P10244 700 aa11.04□□□□□ -0.64
CCNDBP1-210ENST00000566882 SOX5P35711 763 aa11.04□□□□□ -0.64
CCNDBP1-210ENST00000566882 PRKCIP41743 596 aa11.04□□□□□ -0.64
CCNDBP1-210ENST00000566882 ALDH5A1P51649 535 aaPredicted RBP11.04□□□□□ -0.64
CCNDBP1-210ENST00000566882 WNT7BP56706 349 aa11.04□□□□□ -0.64
CCNDBP1-210ENST00000566882 MAP2K1Q02750 393 aaPredicted RBP11.04□□□□□ -0.64
CCNDBP1-210ENST00000566882 TTLL12Q14166 644 aaPredicted RBP11.04□□□□□ -0.64
CCNDBP1-210ENST00000566882 XRRA1Q6P2D8 792 aa11.04□□□□□ -0.64
CCNDBP1-210ENST00000566882 ASCC2Q9H1I8 757 aaPredicted RBP11.04□□□□□ -0.64
CCNDBP1-210ENST00000566882 UBE2TQ9NPD8 197 aaPredicted RBP11.04□□□□□ -0.64
CCNDBP1-210ENST00000566882 CYP26B1Q9NR63 512 aa11.04□□□□□ -0.64
CCNDBP1-210ENST00000566882 APEX2Q9UBZ4 518 aa11.04□□□□□ -0.64
CCNDBP1-210ENST00000566882 RAB21Q9UL25 225 aa11.04□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21.5 ms