RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000566515.5

CCNDBP1-208, Transcript of cyclin D1 binding protein 1, humanhuman

TSL 5

Gene CCNDBP1, Length 1,634 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNDBP1-208ENST00000566515 DEPTORQ8TB45 409 aa23.16■■□□□ 1.3
CCNDBP1-208ENST00000566515 NFKBIZQ9BYH8 718 aa23.16■■□□□ 1.3
CCNDBP1-208ENST00000566515 RGS18Q9NS28 235 aa23.16■■□□□ 1.3
CCNDBP1-208ENST00000566515 ADGRA3Q8IWK6 1321 aa23.16■■□□□ 1.3
CCNDBP1-208ENST00000566515 A0A1B0GVL5 298 aa23.15■■□□□ 1.3
CCNDBP1-208ENST00000566515 ZSCAN20P17040 1043 aaPredicted RBP23.15■■□□□ 1.3
CCNDBP1-208ENST00000566515 CMA1P23946 247 aa23.15■■□□□ 1.3
CCNDBP1-208ENST00000566515 GIT2Q14161 759 aa23.15■■□□□ 1.3
CCNDBP1-208ENST00000566515 CDCA2Q69YH5 1023 aaPredicted RBP23.15■■□□□ 1.3
CCNDBP1-208ENST00000566515 IQUBQ8NA54 791 aa23.15■■□□□ 1.3
CCNDBP1-208ENST00000566515 TOP1MTQ969P6 601 aa23.15■■□□□ 1.3
CCNDBP1-208ENST00000566515 ZBED2Q9BTP6 218 aa23.15■■□□□ 1.3
CCNDBP1-208ENST00000566515 PBX4Q9BYU1 374 aa23.15■■□□□ 1.3
CCNDBP1-208ENST00000566515 KCNH3Q9ULD8 1083 aa23.15■■□□□ 1.3
CCNDBP1-208ENST00000566515 PIN4Q9Y237 131 aaKnown RBP23.15■■□□□ 1.3
CCNDBP1-208ENST00000566515 CCDC169A6NNP5 214 aa23.15■■□□□ 1.3
CCNDBP1-208ENST00000566515 MYOGP15173 224 aa23.15■■□□□ 1.3
CCNDBP1-208ENST00000566515 NPTX2P47972 431 aa23.15■■□□□ 1.3
CCNDBP1-208ENST00000566515 DMP1Q13316 513 aaPredicted RBP23.15■■□□□ 1.3
CCNDBP1-208ENST00000566515 DYMQ7RTS9 669 aa23.15■■□□□ 1.3
CCNDBP1-208ENST00000566515 ZBTB8OSQ8IWT0 167 aa23.15■■□□□ 1.3
CCNDBP1-208ENST00000566515 STAMQ92783 540 aa23.15■■□□□ 1.3
CCNDBP1-208ENST00000566515 MYMKA6NI61 221 aa23.14■■□□□ 1.29
CCNDBP1-208ENST00000566515 ERLIN2O94905 339 aa23.14■■□□□ 1.29
CCNDBP1-208ENST00000566515 GJB5O95377 273 aa23.14■■□□□ 1.29
CCNDBP1-208ENST00000566515 PFKFB1P16118 471 aa23.14■■□□□ 1.29
CCNDBP1-208ENST00000566515 C2orf40Q9H1Z8 148 aa23.14■■□□□ 1.29
CCNDBP1-208ENST00000566515 AGPAT5Q9NUQ2 364 aa23.14■■□□□ 1.29
CCNDBP1-208ENST00000566515 ODF2LQ9ULJ1 636 aa23.14■■□□□ 1.29
CCNDBP1-208ENST00000566515 C9IYK1 514 aa23.13■■□□□ 1.29
CCNDBP1-208ENST00000566515 TSPAN1O60635 241 aa23.13■■□□□ 1.29
CCNDBP1-208ENST00000566515 PLS3P13797 630 aa23.13■■□□□ 1.29
CCNDBP1-208ENST00000566515 LIG1P18858 919 aa23.13■■□□□ 1.29
CCNDBP1-208ENST00000566515 HOXA11P31270 313 aaPredicted RBP23.13■■□□□ 1.29
CCNDBP1-208ENST00000566515 FXR1P51114 621 aaKnown RBP eCLIP23.13■■□□□ 1.29
CCNDBP1-208ENST00000566515 AMHR2Q16671 573 aa23.13■■□□□ 1.29
CCNDBP1-208ENST00000566515 FAM43BQ6ZT52 329 aaPredicted RBP23.13■■□□□ 1.29
CCNDBP1-208ENST00000566515 SLC24A5Q71RS6 500 aa23.13■■□□□ 1.29
CCNDBP1-208ENST00000566515 DDX12PQ92771 950 aa23.13■■□□□ 1.29
CCNDBP1-208ENST00000566515 CPB2Q96IY4 423 aa23.13■■□□□ 1.29
CCNDBP1-208ENST00000566515 ZHX3Q9H4I2 956 aa23.13■■□□□ 1.29
CCNDBP1-208ENST00000566515 C17orf75Q9HAS0 396 aa23.13■■□□□ 1.29
CCNDBP1-208ENST00000566515 KMT5AQ9NQR1 393 aa23.13■■□□□ 1.29
CCNDBP1-208ENST00000566515 CHST12Q9NRB3 414 aa23.13■■□□□ 1.29
CCNDBP1-208ENST00000566515 C1orf112Q9NSG2 853 aa23.13■■□□□ 1.29
CCNDBP1-208ENST00000566515 YBX2Q9Y2T7 364 aaKnown RBP23.13■■□□□ 1.29
CCNDBP1-208ENST00000566515 B4GALT5O43286 388 aa23.12■■□□□ 1.29
CCNDBP1-208ENST00000566515 TLL1O43897 1013 aa23.12■■□□□ 1.29
CCNDBP1-208ENST00000566515 FAM13AO94988 1023 aa23.12■■□□□ 1.29
CCNDBP1-208ENST00000566515 DNAJB2P25686 324 aa23.12■■□□□ 1.29
CCNDBP1-208ENST00000566515 SARSP49591 514 aaKnown RBP23.12■■□□□ 1.29
CCNDBP1-208ENST00000566515 TWF2Q6IBS0 349 aaKnown RBP23.12■■□□□ 1.29
CCNDBP1-208ENST00000566515 CUEDC2Q9H467 287 aa23.12■■□□□ 1.29
CCNDBP1-208ENST00000566515 SZT2Q5T011 3432 aa23.12■■□□□ 1.29
CCNDBP1-208ENST00000566515 A0A1W2PQ27 194 aa23.11■■□□□ 1.29
CCNDBP1-208ENST00000566515 A0A1W2PQ64 194 aa23.11■■□□□ 1.29
CCNDBP1-208ENST00000566515 A0A1W2PQD8 194 aa23.11■■□□□ 1.29
CCNDBP1-208ENST00000566515 SLC16A4O15374 487 aa23.11■■□□□ 1.29
CCNDBP1-208ENST00000566515 MYCT1Q8N699 235 aa23.11■■□□□ 1.29
CCNDBP1-208ENST00000566515 FSIP1Q8NA03 581 aa23.11■■□□□ 1.29
CCNDBP1-208ENST00000566515 CCDC113Q9H0I3 377 aa23.11■■□□□ 1.29
CCNDBP1-208ENST00000566515 FZD8Q9H461 694 aa23.11■■□□□ 1.29
CCNDBP1-208ENST00000566515 KBTBD4Q9NVX7 518 aa23.11■■□□□ 1.29
CCNDBP1-208ENST00000566515 DACT1Q9NYF0 836 aa23.11■■□□□ 1.29
CCNDBP1-208ENST00000566515 MSRAQ9UJ68 235 aa23.11■■□□□ 1.29
CCNDBP1-208ENST00000566515 HPSEQ9Y251 543 aa23.11■■□□□ 1.29
CCNDBP1-208ENST00000566515 USP20Q9Y2K6 914 aa23.11■■□□□ 1.29
CCNDBP1-208ENST00000566515 PCDHA11Q9Y5I1 949 aa23.11■■□□□ 1.29
CCNDBP1-208ENST00000566515 TBCAO75347 108 aaKnown RBP23.11■■□□□ 1.29
CCNDBP1-208ENST00000566515 ARF4P18085 180 aaPredicted RBP23.11■■□□□ 1.29
CCNDBP1-208ENST00000566515 NDUFA8P51970 172 aa23.11■■□□□ 1.29
CCNDBP1-208ENST00000566515 ZNF131P52739 623 aa23.11■■□□□ 1.29
CCNDBP1-208ENST00000566515 EFNA5P52803 228 aa23.11■■□□□ 1.29
CCNDBP1-208ENST00000566515 FAM189BP81408 668 aa23.11■■□□□ 1.29
CCNDBP1-208ENST00000566515 PCBP1Q15365 356 aaKnown RBP eCLIP23.11■■□□□ 1.29
CCNDBP1-208ENST00000566515 RAB30Q15771 203 aa23.11■■□□□ 1.29
CCNDBP1-208ENST00000566515 MAPK6Q16659 721 aa23.11■■□□□ 1.29
CCNDBP1-208ENST00000566515 NPAS4Q8IUM7 802 aa23.11■■□□□ 1.29
CCNDBP1-208ENST00000566515 CRIPAKQ8N1N5 446 aa23.11■■□□□ 1.29
CCNDBP1-208ENST00000566515 DNAJC19Q96DA6 116 aa23.11■■□□□ 1.29
CCNDBP1-208ENST00000566515 NTPCRQ9BSD7 190 aaKnown RBP23.11■■□□□ 1.29
CCNDBP1-208ENST00000566515 GOLPH3LQ9H4A5 285 aa23.11■■□□□ 1.29
CCNDBP1-208ENST00000566515 PARVGQ9HBI0 331 aa23.11■■□□□ 1.29
CCNDBP1-208ENST00000566515 PRMT7Q9NVM4 692 aaPredicted RBP23.11■■□□□ 1.29
CCNDBP1-208ENST00000566515 LARSQ9P2J5 1176 aaKnown RBP23.11■■□□□ 1.29
CCNDBP1-208ENST00000566515 TTLL13PA6NNM8 815 aa23.1■■□□□ 1.29
CCNDBP1-208ENST00000566515 K7ERI5 159 aa23.1■■□□□ 1.29
CCNDBP1-208ENST00000566515 EDN1P05305 212 aa23.1■■□□□ 1.29
CCNDBP1-208ENST00000566515 PRKCBP05771 671 aa23.1■■□□□ 1.29
CCNDBP1-208ENST00000566515 NCBP1Q09161 790 aaKnown RBP23.1■■□□□ 1.29
CCNDBP1-208ENST00000566515 SPIRE2Q8WWL2 714 aa23.1■■□□□ 1.29
CCNDBP1-208ENST00000566515 MRPS27Q92552 414 aaKnown RBP23.1■■□□□ 1.29
CCNDBP1-208ENST00000566515 RAD9AQ99638 391 aa23.1■■□□□ 1.29
CCNDBP1-208ENST00000566515 TNMDQ9H2S6 317 aa23.1■■□□□ 1.29
CCNDBP1-208ENST00000566515 NKX2-4Q9H2Z4 354 aa23.1■■□□□ 1.29
CCNDBP1-208ENST00000566515 ARHGAP28Q9P2N2 729 aa23.1■■□□□ 1.29
CCNDBP1-208ENST00000566515 SERTAD1Q9UHV2 236 aa23.1■■□□□ 1.29
CCNDBP1-208ENST00000566515 LRFN2Q9ULH4 789 aa23.1■■□□□ 1.29
CCNDBP1-208ENST00000566515 PCDHB7Q9Y5E2 793 aa23.1■■□□□ 1.29
CCNDBP1-208ENST00000566515 CHD9Q3L8U1 2897 aa23.09■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 73.1 ms