RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000560957.1

AKAP13-223, Transcript of A-kinase anchoring protein 13, human

TSL 3

Gene AKAP13, Length 751 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
AKAP13-223	ENST00000560957		Q6YL49	198 aa		3.74	□□□□□ -1.81
AKAP13-223	ENST00000560957	HDGFL2	Q7Z4V5	671 aa	Predicted RBP	3.74	□□□□□ -1.81
AKAP13-223	ENST00000560957	SLC7A14	Q8TBB6	771 aa		3.74	□□□□□ -1.81
AKAP13-223	ENST00000560957	SCARB1	Q8WTV0	552 aa		3.74	□□□□□ -1.81
AKAP13-223	ENST00000560957	C16orf92	Q96LL3	132 aa		3.74	□□□□□ -1.81
AKAP13-223	ENST00000560957	RNPC3	Q96LT9	517 aa	Known RBP	3.74	□□□□□ -1.81
AKAP13-223	ENST00000560957	MNT	Q99583	582 aa		3.74	□□□□□ -1.81
AKAP13-223	ENST00000560957	OR10A5	Q9H207	317 aa		3.74	□□□□□ -1.81
AKAP13-223	ENST00000560957	SLK	Q9H2G2	1235 aa	Predicted RBP	3.74	□□□□□ -1.81
AKAP13-223	ENST00000560957	SLC6A15	Q9H2J7	730 aa		3.74	□□□□□ -1.81
AKAP13-223	ENST00000560957	SLC52A2	Q9HAB3	445 aa		3.74	□□□□□ -1.81
AKAP13-223	ENST00000560957	CYP4F11	Q9HBI6	524 aa		3.74	□□□□□ -1.81
AKAP13-223	ENST00000560957	CATSPERZ	Q9NTU4	200 aa		3.74	□□□□□ -1.81
AKAP13-223	ENST00000560957	SNTG2	Q9NY99	539 aa		3.74	□□□□□ -1.81
AKAP13-223	ENST00000560957	FRMD4B	Q9Y2L6	1034 aa		3.74	□□□□□ -1.81
AKAP13-223	ENST00000560957	PRAMEF25	A6NGN4	478 aa		3.73	□□□□□ -1.81
AKAP13-223	ENST00000560957	RASSF10	A6NK89	507 aa		3.73	□□□□□ -1.81
AKAP13-223	ENST00000560957	RASGRP1	O95267	797 aa		3.73	□□□□□ -1.81
AKAP13-223	ENST00000560957	CRY1	Q16526	586 aa		3.73	□□□□□ -1.81
AKAP13-223	ENST00000560957	NAIF1	Q69YI7	327 aa	Predicted RBP	3.73	□□□□□ -1.81
AKAP13-223	ENST00000560957	ZC3H7A	Q8IWR0	971 aa	Known RBP	3.73	□□□□□ -1.81
AKAP13-223	ENST00000560957	WDR48	Q8TAF3	677 aa		3.73	□□□□□ -1.81
AKAP13-223	ENST00000560957	STAG1	Q8WVM7	1258 aa		3.73	□□□□□ -1.81
AKAP13-223	ENST00000560957	SCLY	Q96I15	445 aa		3.73	□□□□□ -1.81
AKAP13-223	ENST00000560957	C8orf48	Q96LL4	319 aa		3.73	□□□□□ -1.81
AKAP13-223	ENST00000560957	DEPDC7	Q96QD5	511 aa		3.73	□□□□□ -1.81
AKAP13-223	ENST00000560957	CELF4	Q9BZC1	486 aa	Known RBP	3.73	□□□□□ -1.81
AKAP13-223	ENST00000560957	INSL6	Q9Y581	213 aa		3.73	□□□□□ -1.81
AKAP13-223	ENST00000560957	ARHGEF17	Q96PE2	2063 aa	Predicted RBP	3.72	□□□□□ -1.81
AKAP13-223	ENST00000560957	IKBKB	O14920	756 aa		3.72	□□□□□ -1.81
AKAP13-223	ENST00000560957	ZNF185	O15231	689 aa		3.72	□□□□□ -1.81
AKAP13-223	ENST00000560957	PEX14	O75381	377 aa		3.72	□□□□□ -1.81
AKAP13-223	ENST00000560957	MME	P08473	750 aa		3.72	□□□□□ -1.81
AKAP13-223	ENST00000560957	PDGFRB	P09619	1106 aa		3.72	□□□□□ -1.81
AKAP13-223	ENST00000560957	TYRP1	P17643	537 aa		3.72	□□□□□ -1.81
AKAP13-223	ENST00000560957	KCNA6	P17658	529 aa		3.72	□□□□□ -1.81
AKAP13-223	ENST00000560957	STAT3	P40763	770 aa		3.72	□□□□□ -1.81
AKAP13-223	ENST00000560957	DNM2	P50570	870 aa		3.72	□□□□□ -1.81
AKAP13-223	ENST00000560957	TBX4	P57082	545 aa		3.72	□□□□□ -1.81
AKAP13-223	ENST00000560957	ADAM8	P78325	824 aa		3.72	□□□□□ -1.81
AKAP13-223	ENST00000560957	HSP90AB4P	Q58FF6	505 aa		3.72	□□□□□ -1.81
AKAP13-223	ENST00000560957	FAM47C	Q5HY64	1035 aa		3.72	□□□□□ -1.81
AKAP13-223	ENST00000560957	ZC3H12B	Q5HYM0	836 aa	Known RBP	3.72	□□□□□ -1.81
AKAP13-223	ENST00000560957	CCSAP	Q6IQ19	270 aa	Predicted RBP	3.72	□□□□□ -1.81
AKAP13-223	ENST00000560957	ABHD17C	Q6PCB6	329 aa		3.72	□□□□□ -1.81
AKAP13-223	ENST00000560957	LRSAM1	Q6UWE0	723 aa		3.72	□□□□□ -1.81
AKAP13-223	ENST00000560957	OVCH1	Q7RTY7	1134 aa		3.72	□□□□□ -1.81
AKAP13-223	ENST00000560957	KIAA0907	Q7Z7F0	614 aa	Predicted RBP	3.72	□□□□□ -1.81
AKAP13-223	ENST00000560957	CISD2	Q8N5K1	135 aa	Known RBP	3.72	□□□□□ -1.81
AKAP13-223	ENST00000560957	ANKS1A	Q92625	1134 aa		3.72	□□□□□ -1.81
AKAP13-223	ENST00000560957	DLG3	Q92796	817 aa		3.72	□□□□□ -1.81
AKAP13-223	ENST00000560957	PMM1	Q92871	262 aa		3.72	□□□□□ -1.81
AKAP13-223	ENST00000560957	CCDC136	Q96JN2	1154 aa		3.72	□□□□□ -1.81
AKAP13-223	ENST00000560957	IPO9	Q96P70	1041 aa	Known RBP	3.72	□□□□□ -1.81
AKAP13-223	ENST00000560957	GPHA2	Q96T91	129 aa		3.72	□□□□□ -1.81
AKAP13-223	ENST00000560957	NDOR1	Q9UHB4	597 aa		3.72	□□□□□ -1.81
AKAP13-223	ENST00000560957	COQ6	Q9Y2Z9	468 aa		3.72	□□□□□ -1.81
AKAP13-223	ENST00000560957	SCD	O00767	359 aa		3.71	□□□□□ -1.82
AKAP13-223	ENST00000560957	GSTA4	O15217	222 aa		3.71	□□□□□ -1.82
AKAP13-223	ENST00000560957	KCNQ2	O43526	872 aa		3.71	□□□□□ -1.82
AKAP13-223	ENST00000560957	EFCAB14	O75071	495 aa		3.71	□□□□□ -1.82
AKAP13-223	ENST00000560957	APP	P05067	770 aa		3.71	□□□□□ -1.82
AKAP13-223	ENST00000560957	VIL1	P09327	827 aa	Known RBP	3.71	□□□□□ -1.82
AKAP13-223	ENST00000560957	ZFP36	P26651	326 aa	Known RBP	3.71	□□□□□ -1.82
AKAP13-223	ENST00000560957	SDHA	P31040	664 aa		3.71	□□□□□ -1.82
AKAP13-223	ENST00000560957	SESN2	P58004	480 aa	Predicted RBP	3.71	□□□□□ -1.82
AKAP13-223	ENST00000560957	ATP2C1	P98194	919 aa	Predicted RBP	3.71	□□□□□ -1.82
AKAP13-223	ENST00000560957	AMPD3	Q01432	767 aa		3.71	□□□□□ -1.82
AKAP13-223	ENST00000560957	ADAM15	Q13444	863 aa		3.71	□□□□□ -1.82
AKAP13-223	ENST00000560957	RALBP1	Q15311	655 aa		3.71	□□□□□ -1.82
AKAP13-223	ENST00000560957	TIGD2	Q4W5G0	525 aa		3.71	□□□□□ -1.82
AKAP13-223	ENST00000560957	PRR16	Q569H4	304 aa		3.71	□□□□□ -1.82
AKAP13-223	ENST00000560957	MFSD5	Q6N075	450 aa		3.71	□□□□□ -1.82
AKAP13-223	ENST00000560957	BCL6B	Q8N143	479 aa	Predicted RBP	3.71	□□□□□ -1.82
AKAP13-223	ENST00000560957	FAM98A	Q8NCA5	519 aa	Known RBP	3.71	□□□□□ -1.82
AKAP13-223	ENST00000560957	ATXN2L	Q8WWM7	1075 aa	Known RBP	3.71	□□□□□ -1.82
AKAP13-223	ENST00000560957	ASB15	Q8WXK1	588 aa		3.71	□□□□□ -1.82
AKAP13-223	ENST00000560957	SMG7	Q92540	1137 aa	Known RBP	3.71	□□□□□ -1.82
AKAP13-223	ENST00000560957	SLC7A6OS	Q96CW6	309 aa	Predicted RBP	3.71	□□□□□ -1.82
AKAP13-223	ENST00000560957	DNAJC7	Q99615	494 aa		3.71	□□□□□ -1.82
AKAP13-223	ENST00000560957	TRIM39	Q9HCM9	518 aa		3.71	□□□□□ -1.82
AKAP13-223	ENST00000560957	UCKL1	Q9NWZ5	548 aa		3.71	□□□□□ -1.82
AKAP13-223	ENST00000560957	B3GALT1	Q9Y5Z6	326 aa		3.71	□□□□□ -1.82
AKAP13-223	ENST00000560957	TCRBV16S1A1N1	A0A5B0	115 aa		3.7	□□□□□ -1.82
AKAP13-223	ENST00000560957	MYADML2	A6NDP7	307 aa		3.7	□□□□□ -1.82
AKAP13-223	ENST00000560957	PRC1	O43663	620 aa		3.7	□□□□□ -1.82
AKAP13-223	ENST00000560957	CREB3	O43889	395 aa		3.7	□□□□□ -1.82
AKAP13-223	ENST00000560957	CDC45	O75419	566 aa		3.7	□□□□□ -1.82
AKAP13-223	ENST00000560957	IPO13	O94829	963 aa	Known RBP	3.7	□□□□□ -1.82
AKAP13-223	ENST00000560957	C1R	P00736	705 aa		3.7	□□□□□ -1.82
AKAP13-223	ENST00000560957	ZBTB48	P10074	688 aa	Predicted RBP	3.7	□□□□□ -1.82
AKAP13-223	ENST00000560957	ZEB1	P37275	1124 aa	Predicted RBP	3.7	□□□□□ -1.82
AKAP13-223	ENST00000560957	USP14	P54578	494 aa		3.7	□□□□□ -1.82
AKAP13-223	ENST00000560957	ELL	P55199	621 aa	Predicted RBP	3.7	□□□□□ -1.82
AKAP13-223	ENST00000560957	FOXF2	Q12947	444 aa		3.7	□□□□□ -1.82
AKAP13-223	ENST00000560957	CATSPERE	Q5SY80	951 aa		3.7	□□□□□ -1.82
AKAP13-223	ENST00000560957	FKBP15	Q5T1M5	1219 aa		3.7	□□□□□ -1.82
AKAP13-223	ENST00000560957	KLHDC10	Q6PID8	442 aa		3.7	□□□□□ -1.82
AKAP13-223	ENST00000560957	BRAP	Q7Z569	592 aa		3.7	□□□□□ -1.82
AKAP13-223	ENST00000560957	FGD2	Q7Z6J4	655 aa		3.7	□□□□□ -1.82

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