RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000555562.1

FOXN3-AS1-201, FOXN3 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene FOXN3-AS1, Length 1,077 nt, Biotype antisense RNA.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 PTPN21Q16825 1174 aa21.74■■□□□ 1.07
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 TWF2Q6IBS0 349 aaKnown RBP21.74■■□□□ 1.07
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 CES5AQ6NT32 575 aa21.74■■□□□ 1.07
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 ANO5Q75V66 913 aa21.74■■□□□ 1.07
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 KRT25Q7Z3Z0 450 aa21.74■■□□□ 1.07
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 RHPN2Q8IUC4 686 aa21.74■■□□□ 1.07
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 ZSCAN31Q96LW9 406 aaPredicted RBP21.74■■□□□ 1.07
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 NECTIN4Q96NY8 510 aa21.74■■□□□ 1.07
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 SH2D3AQ9BRG2 576 aa21.74■■□□□ 1.07
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 BRMS1Q9HCU9 246 aa21.74■■□□□ 1.07
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 NT5C1B-RDH14C9J2C7 533 aa21.73■■□□□ 1.07
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 DKC1O60832 514 aaKnown RBP eCLIP21.73■■□□□ 1.07
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 CLASP2O75122 1294 aaKnown RBP21.73■■□□□ 1.07
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 TRIM29Q14134 588 aa21.73■■□□□ 1.07
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 GLB1LQ6UWU2 654 aa21.73■■□□□ 1.07
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 NECAB1Q8N987 351 aa21.73■■□□□ 1.07
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 FAM20AQ96MK3 541 aa21.73■■□□□ 1.07
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 ADAM7Q9H2U9 754 aa21.73■■□□□ 1.07
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 PIN4Q9Y237 131 aaKnown RBP21.73■■□□□ 1.07
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 NR2E1Q9Y466 385 aa21.73■■□□□ 1.07
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 QARSP47897 775 aaKnown RBP21.72■■□□□ 1.07
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 RAB27AP51159 221 aa21.72■■□□□ 1.07
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 POLGP54098 1239 aaPredicted RBP21.72■■□□□ 1.07
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 INF2Q27J81 1249 aa21.72■■□□□ 1.07
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 IER5LQ5T953 404 aa21.72■■□□□ 1.07
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 CATSPER4Q7RTX7 472 aa21.72■■□□□ 1.07
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 EXOC8Q8IYI6 725 aa21.72■■□□□ 1.07
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 VPS52Q8N1B4 723 aa21.72■■□□□ 1.07
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 ASIC4Q96FT7 647 aa21.72■■□□□ 1.07
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 AIFM3Q96NN9 605 aa21.72■■□□□ 1.07
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 CYP26B1Q9NR63 512 aa21.72■■□□□ 1.07
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 FAM105AQ9NUU6 356 aa21.72■■□□□ 1.07
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 CCDC194A0A1B0GVG4 234 aa21.71■■□□□ 1.07
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 EML1O00423 815 aa21.71■■□□□ 1.07
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 ST18O60284 1047 aa21.71■■□□□ 1.07
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 ZC3H11AO75152 810 aaKnown RBP eCLIP21.71■■□□□ 1.07
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 CD2BP2O95400 341 aaKnown RBP21.71■■□□□ 1.07
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 PTPN5P54829 565 aa21.71■■□□□ 1.07
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 PPP2R5CQ13362 524 aa21.71■■□□□ 1.07
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 GIT2Q14161 759 aa21.71■■□□□ 1.07
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 LETM2Q2VYF4 491 aa21.71■■□□□ 1.07
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 NOMO2Q5JPE7 1267 aa21.71■■□□□ 1.07
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 DDX53Q86TM3 631 aaKnown RBP21.71■■□□□ 1.07
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 KSR1Q8IVT5 923 aa21.71■■□□□ 1.07
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 TMEM87AQ8NBN3 555 aa21.71■■□□□ 1.07
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 PRSS33Q8NF86 280 aa21.71■■□□□ 1.07
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 LPPQ93052 612 aa21.71■■□□□ 1.07
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 PGBD4Q96DM1 585 aa21.71■■□□□ 1.07
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 IGSF21Q96ID5 467 aa21.71■■□□□ 1.07
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 NLRP4Q96MN2 994 aa21.71■■□□□ 1.07
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 SH2B1Q9NRF2 756 aaPredicted RBP21.71■■□□□ 1.07
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 PPME1Q9Y570 386 aa21.71■■□□□ 1.07
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 IRAK3Q9Y616 596 aa21.71■■□□□ 1.07
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 SLC37A4O43826 429 aa21.7■■□□□ 1.06
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 OFD1O75665 1012 aa21.7■■□□□ 1.06
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 GALTP07902 379 aa21.7■■□□□ 1.06
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 CA8P35219 290 aa21.7■■□□□ 1.06
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 MTHFRP42898 656 aa21.7■■□□□ 1.06
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 PPP4R3AQ6IN85 833 aa21.7■■□□□ 1.06
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 ZBTB33Q86T24 672 aa21.7■■□□□ 1.06
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 SLC7A3Q8WY07 619 aa21.7■■□□□ 1.06
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 ZBP1Q9H171 429 aa21.7■■□□□ 1.06
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 NRDE2Q9H7Z3 1164 aa21.7■■□□□ 1.06
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 IFT122Q9HBG6 1241 aa21.7■■□□□ 1.06
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 KCNMB3Q9NPA1 279 aa21.7■■□□□ 1.06
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 TBC1D13Q9NVG8 400 aa21.7■■□□□ 1.06
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 VAV3Q9UKW4 847 aa21.7■■□□□ 1.06
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 KCNJ14Q9UNX9 436 aa21.7■■□□□ 1.06
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 ZDBF2Q9HCK1 2354 aa21.69■■□□□ 1.06
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 P4HBP07237 508 aaKnown RBP21.69■■□□□ 1.06
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 CTSAP10619 480 aa21.69■■□□□ 1.06
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 FDPSP14324 419 aaKnown RBP21.69■■□□□ 1.06
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 GCFC2P16383 781 aaKnown RBP21.69■■□□□ 1.06
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 RNASELQ05823 741 aaKnown RBP21.69■■□□□ 1.06
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 LONRF3Q496Y0 759 aa21.69■■□□□ 1.06
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 PLA2G4FQ68DD2 849 aa21.69■■□□□ 1.06
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 NEK8Q86SG6 692 aa21.69■■□□□ 1.06
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 TMEM173Q86WV6 379 aaPredicted RBP21.69■■□□□ 1.06
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 NSUN7Q8NE18 718 aaKnown RBP21.69■■□□□ 1.06
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 CEP170P1Q96L14 293 aa21.69■■□□□ 1.06
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 RIPOR3Q96MK2 946 aa21.69■■□□□ 1.06
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 NAP1L4Q99733 375 aaKnown RBP21.69■■□□□ 1.06
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 PHF20Q9BVI0 1012 aa21.69■■□□□ 1.06
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 TSHZ2Q9NRE2 1034 aa21.69■■□□□ 1.06
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 DZANK1Q9NVP4 752 aa21.69■■□□□ 1.06
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 INPP5FQ9Y2H2 1132 aa21.69■■□□□ 1.06
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 COL4A3BPQ9Y5P4 624 aa21.69■■□□□ 1.06
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 ZC3H11BA0A1B0GUI2 810 aaPredicted RBP21.68■■□□□ 1.06
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 TBX3O15119 743 aa21.68■■□□□ 1.06
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 NPEPPSP55786 919 aa21.68■■□□□ 1.06
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 SRGAP1Q7Z6B7 1085 aa21.68■■□□□ 1.06
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 PRPF31Q8WWY3 499 aaKnown RBP21.68■■□□□ 1.06
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 LLPHQ9BRT6 129 aaKnown RBP21.68■■□□□ 1.06
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 POMKQ9H5K3 350 aa21.68■■□□□ 1.06
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 DHX33Q9H6R0 707 aaKnown RBP21.68■■□□□ 1.06
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 AGPAT5Q9NUQ2 364 aa21.68■■□□□ 1.06
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 STK39Q9UEW8 545 aa21.68■■□□□ 1.06
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 PCDHB2Q9Y5E7 798 aa21.68■■□□□ 1.06
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 MEIS3P2A8K0S8 358 aa21.67■■□□□ 1.06
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 SP100P23497 879 aaPredicted RBP21.67■■□□□ 1.06
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