RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000553732.1

TGFB3-AS1-201, TGFB3 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 4 BASIC

Gene TGFB3-AS1, Length 580 nt, Biotype lincRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TGFB3-AS1-201ENST00000553732 TMOD1P28289 359 aa8.75□□□□□ -1.01
TGFB3-AS1-201ENST00000553732 KIF5BP33176 963 aa8.75□□□□□ -1.01
TGFB3-AS1-201ENST00000553732 NRLP54845 237 aa8.75□□□□□ -1.01
TGFB3-AS1-201ENST00000553732 PFKPQ01813 784 aa8.75□□□□□ -1.01
TGFB3-AS1-201ENST00000553732 SIM2Q14190 667 aaPredicted RBP8.75□□□□□ -1.01
TGFB3-AS1-201ENST00000553732 CSRP2Q16527 193 aa8.75□□□□□ -1.01
TGFB3-AS1-201ENST00000553732 UBE2SQ16763 222 aa8.75□□□□□ -1.01
TGFB3-AS1-201ENST00000553732 C20orf194Q5TEA3 1177 aa8.75□□□□□ -1.01
TGFB3-AS1-201ENST00000553732 ANKRD45Q5TZF3 282 aa8.75□□□□□ -1.01
TGFB3-AS1-201ENST00000553732 EFCAB12Q6NXP0 572 aa8.75□□□□□ -1.01
TGFB3-AS1-201ENST00000553732 CYB5R4Q7L1T6 521 aa8.75□□□□□ -1.01
TGFB3-AS1-201ENST00000553732 NELL1Q92832 810 aa8.75□□□□□ -1.01
TGFB3-AS1-201ENST00000553732 FGF14Q92915 247 aa8.75□□□□□ -1.01
TGFB3-AS1-201ENST00000553732 RRP36Q96EU6 259 aaKnown RBP8.75□□□□□ -1.01
TGFB3-AS1-201ENST00000553732 NELL2Q99435 816 aa8.75□□□□□ -1.01
TGFB3-AS1-201ENST00000553732 MXRA8Q9BRK3 442 aa8.75□□□□□ -1.01
TGFB3-AS1-201ENST00000553732 DDX23Q9BUQ8 820 aaKnown RBP8.75□□□□□ -1.01
TGFB3-AS1-201ENST00000553732 VN1R3Q9BXE9 311 aa8.75□□□□□ -1.01
TGFB3-AS1-201ENST00000553732 FAM126AQ9BYI3 521 aaPredicted RBP8.75□□□□□ -1.01
TGFB3-AS1-201ENST00000553732 NT5C3AQ9H0P0 336 aa8.75□□□□□ -1.01
TGFB3-AS1-201ENST00000553732 CNNM2Q9H8M5 875 aa8.75□□□□□ -1.01
TGFB3-AS1-201ENST00000553732 FAM217BQ9NTX9 383 aaPredicted RBP8.75□□□□□ -1.01
TGFB3-AS1-201ENST00000553732 TBC1D13Q9NVG8 400 aa8.75□□□□□ -1.01
TGFB3-AS1-201ENST00000553732 SEC63Q9UGP8 760 aaKnown RBP8.75□□□□□ -1.01
TGFB3-AS1-201ENST00000553732 SSX2IPQ9Y2D8 614 aa8.75□□□□□ -1.01
TGFB3-AS1-201ENST00000553732 NFASCO94856 1347 aa8.75□□□□□ -1.01
TGFB3-AS1-201ENST00000553732 FANCMQ8IYD8 2048 aa8.75□□□□□ -1.01
TGFB3-AS1-201ENST00000553732 COL1A2P08123 1366 aa8.74□□□□□ -1.01
TGFB3-AS1-201ENST00000553732 ERICH2A1L162 156 aa8.74□□□□□ -1.01
TGFB3-AS1-201ENST00000553732 C1QTNF9BB2RNN3 333 aa8.74□□□□□ -1.01
TGFB3-AS1-201ENST00000553732 ZBTB42B2RXF5 422 aa8.74□□□□□ -1.01
TGFB3-AS1-201ENST00000553732 MAGEB2O15479 319 aa8.74□□□□□ -1.01
TGFB3-AS1-201ENST00000553732 TEX28O15482 410 aa8.74□□□□□ -1.01
TGFB3-AS1-201ENST00000553732 LRP3O75074 770 aa8.74□□□□□ -1.01
TGFB3-AS1-201ENST00000553732 OFD1O75665 1012 aa8.74□□□□□ -1.01
TGFB3-AS1-201ENST00000553732 ATG7O95352 703 aa8.74□□□□□ -1.01
TGFB3-AS1-201ENST00000553732 C22orf31O95567 290 aa8.74□□□□□ -1.01
TGFB3-AS1-201ENST00000553732 C1QTNF9P0C862 333 aa8.74□□□□□ -1.01
TGFB3-AS1-201ENST00000553732 TARSP26639 723 aaKnown RBP8.74□□□□□ -1.01
TGFB3-AS1-201ENST00000553732 ZNF76P36508 570 aa8.74□□□□□ -1.01
TGFB3-AS1-201ENST00000553732 PHKA2P46019 1235 aa8.74□□□□□ -1.01
TGFB3-AS1-201ENST00000553732 SHC2P98077 582 aa8.74□□□□□ -1.01
TGFB3-AS1-201ENST00000553732 MTAPQ13126 283 aa8.74□□□□□ -1.01
TGFB3-AS1-201ENST00000553732 ITGB3BPQ13352 177 aaPredicted RBP8.74□□□□□ -1.01
TGFB3-AS1-201ENST00000553732 TWF2Q6IBS0 349 aaKnown RBP8.74□□□□□ -1.01
TGFB3-AS1-201ENST00000553732 MIS18BP1Q6P0N0 1132 aa8.74□□□□□ -1.01
TGFB3-AS1-201ENST00000553732 ABHD15Q6UXT9 468 aa8.74□□□□□ -1.01
TGFB3-AS1-201ENST00000553732 RSPO2Q6UXX9 243 aaPredicted RBP8.74□□□□□ -1.01
TGFB3-AS1-201ENST00000553732 TAS1R1Q7RTX1 841 aa8.74□□□□□ -1.01
TGFB3-AS1-201ENST00000553732 CATIPQ7Z7H3 387 aa8.74□□□□□ -1.01
TGFB3-AS1-201ENST00000553732 ZNF280BQ86YH2 543 aa8.74□□□□□ -1.01
TGFB3-AS1-201ENST00000553732 LRRC71Q8N4P6 559 aa8.74□□□□□ -1.01
TGFB3-AS1-201ENST00000553732 NLRP7Q8WX94 980 aa8.74□□□□□ -1.01
TGFB3-AS1-201ENST00000553732 ZNF707Q96C28 371 aaPredicted RBP8.74□□□□□ -1.01
TGFB3-AS1-201ENST00000553732 RPS6KC1Q96S38 1066 aa8.74□□□□□ -1.01
TGFB3-AS1-201ENST00000553732 ADAMTS10Q9H324 1103 aa8.74□□□□□ -1.01
TGFB3-AS1-201ENST00000553732 STK39Q9UEW8 545 aa8.74□□□□□ -1.01
TGFB3-AS1-201ENST00000553732 FAM208BQ5VWN6 2430 aa8.74□□□□□ -1.01
TGFB3-AS1-201ENST00000553732 IGKV6D-21A0A0A0MT36 114 aa8.73□□□□□ -1.01
TGFB3-AS1-201ENST00000553732 CCNE2O96020 404 aa8.73□□□□□ -1.01
TGFB3-AS1-201ENST00000553732 SKIP12755 728 aa8.73□□□□□ -1.01
TGFB3-AS1-201ENST00000553732 DARSP14868 501 aaKnown RBP8.73□□□□□ -1.01
TGFB3-AS1-201ENST00000553732 SDSP20132 328 aa8.73□□□□□ -1.01
TGFB3-AS1-201ENST00000553732 ATP4AP20648 1035 aa8.73□□□□□ -1.01
TGFB3-AS1-201ENST00000553732 PDE1AP54750 535 aa8.73□□□□□ -1.01
TGFB3-AS1-201ENST00000553732 TROAPQ12815 778 aa8.73□□□□□ -1.01
TGFB3-AS1-201ENST00000553732 TRDNQ13061 729 aa8.73□□□□□ -1.01
TGFB3-AS1-201ENST00000553732 PPP2R5DQ14738 602 aa8.73□□□□□ -1.01
TGFB3-AS1-201ENST00000553732 AASDHQ4L235 1098 aaPredicted RBP8.73□□□□□ -1.01
TGFB3-AS1-201ENST00000553732 LRSAM1Q6UWE0 723 aa8.73□□□□□ -1.01
TGFB3-AS1-201ENST00000553732 CWC27Q6UX04 472 aaKnown RBP8.73□□□□□ -1.01
TGFB3-AS1-201ENST00000553732 UNQ6494/PRO21346Q6UXR6 183 aa8.73□□□□□ -1.01
TGFB3-AS1-201ENST00000553732 ZNF852Q6ZMS4 543 aa8.73□□□□□ -1.01
TGFB3-AS1-201ENST00000553732 TPRG1Q6ZUI0 275 aa8.73□□□□□ -1.01
TGFB3-AS1-201ENST00000553732 ARHGAP30Q7Z6I6 1101 aaPredicted RBP8.73□□□□□ -1.01
TGFB3-AS1-201ENST00000553732 GLYCTKQ8IVS8 523 aa8.73□□□□□ -1.01
TGFB3-AS1-201ENST00000553732 CCDC60Q8IWA6 550 aaPredicted RBP8.73□□□□□ -1.01
TGFB3-AS1-201ENST00000553732 URGCPQ8TCY9 931 aa8.73□□□□□ -1.01
TGFB3-AS1-201ENST00000553732 CLDN23Q96B33 292 aa8.73□□□□□ -1.01
TGFB3-AS1-201ENST00000553732 RHOBTB2Q9BYZ6 727 aa8.73□□□□□ -1.01
TGFB3-AS1-201ENST00000553732 PRKD2Q9BZL6 878 aa8.73□□□□□ -1.01
TGFB3-AS1-201ENST00000553732 PLEKHA4Q9H4M7 779 aa8.73□□□□□ -1.01
TGFB3-AS1-201ENST00000553732 SENP2Q9HC62 589 aa8.73□□□□□ -1.01
TGFB3-AS1-201ENST00000553732 AGO4Q9HCK5 861 aaKnown RBP8.73□□□□□ -1.01
TGFB3-AS1-201ENST00000553732 CHST12Q9NRB3 414 aa8.73□□□□□ -1.01
TGFB3-AS1-201ENST00000553732 CEP131Q9UPN4 1083 aa8.73□□□□□ -1.01
TGFB3-AS1-201ENST00000553732 MRPS17Q9Y2R5 130 aaKnown RBP8.73□□□□□ -1.01
TGFB3-AS1-201ENST00000553732 ZFP37Q9Y6Q3 630 aaPredicted RBP8.73□□□□□ -1.01
TGFB3-AS1-201ENST00000553732 BAZ2BQ9UIF8 2168 aaKnown RBP8.73□□□□□ -1.01
TGFB3-AS1-201ENST00000553732 MEIS3P2A8K0S8 358 aa8.72□□□□□ -1.01
TGFB3-AS1-201ENST00000553732 NRP1O14786 923 aa8.72□□□□□ -1.01
TGFB3-AS1-201ENST00000553732 FOXD2O60548 495 aaPredicted RBP8.72□□□□□ -1.01
TGFB3-AS1-201ENST00000553732 DDHD2O94830 711 aa8.72□□□□□ -1.01
TGFB3-AS1-201ENST00000553732 SOD2P04179 222 aa8.72□□□□□ -1.01
TGFB3-AS1-201ENST00000553732 RPS9P46781 194 aaKnown RBP8.72□□□□□ -1.01
TGFB3-AS1-201ENST00000553732 OR1G1P47890 313 aa8.72□□□□□ -1.01
TGFB3-AS1-201ENST00000553732 GPC3P51654 580 aa8.72□□□□□ -1.01
TGFB3-AS1-201ENST00000553732 ADCY1Q08828 1119 aa8.72□□□□□ -1.01
TGFB3-AS1-201ENST00000553732 ERICH6BQ5W0A0 696 aa8.72□□□□□ -1.01
TGFB3-AS1-201ENST00000553732 MTSS1LQ765P7 747 aa8.72□□□□□ -1.01
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32.7 ms