RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000553628.1

AC009396.1-201, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene AC009396.1, Length 1,079 nt, Biotype antisense RNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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AC009396.1-201ENST00000553628 OPHN1O60890 802 aa7.26□□□□□ -1.25
AC009396.1-201ENST00000553628 CNOT4O95628 575 aaKnown RBP7.26□□□□□ -1.25
AC009396.1-201ENST00000553628 MANFP55145 182 aaKnown RBP7.26□□□□□ -1.25
AC009396.1-201ENST00000553628 TBR1Q16650 682 aa7.26□□□□□ -1.25
AC009396.1-201ENST00000553628 DGKDQ16760 1214 aa7.26□□□□□ -1.25
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