RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000549306.1

HECTD4-210, Transcript of HECT domain E3 ubiquitin protein ligase 4, humanhuman

TSL 2

Gene HECTD4, Length 543 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HECTD4-210ENST00000549306 USP14P54578 494 aa6.54□□□□□ -1.36
HECTD4-210ENST00000549306 BRAPQ7Z569 592 aa6.54□□□□□ -1.36
HECTD4-210ENST00000549306 NME9Q86XW9 330 aa6.54□□□□□ -1.36
HECTD4-210ENST00000549306 CPPED1Q9BRF8 314 aaPredicted RBP6.54□□□□□ -1.36
HECTD4-210ENST00000549306 HAPLN2Q9GZV7 340 aa6.54□□□□□ -1.36
HECTD4-210ENST00000549306 EPC1Q9H2F5 836 aa6.54□□□□□ -1.36
HECTD4-210ENST00000549306 PCIF1Q9H4Z3 704 aa6.54□□□□□ -1.36
HECTD4-210ENST00000549306 DVL2O14641 736 aa6.53□□□□□ -1.36
HECTD4-210ENST00000549306 MAFGO15525 162 aa6.53□□□□□ -1.36
HECTD4-210ENST00000549306 MTSS1O43312 755 aa6.53□□□□□ -1.36
HECTD4-210ENST00000549306 HOXA3O43365 443 aaPredicted RBP6.53□□□□□ -1.36
HECTD4-210ENST00000549306 ZNF37AP17032 561 aaPredicted RBP6.53□□□□□ -1.36
HECTD4-210ENST00000549306 FGD2Q7Z6J4 655 aa6.53□□□□□ -1.36
HECTD4-210ENST00000549306 SUPT20HQ8NEM7 779 aa6.53□□□□□ -1.36
HECTD4-210ENST00000549306 MYEOVQ96EZ4 313 aa6.53□□□□□ -1.36
HECTD4-210ENST00000549306 KCNH6Q9H252 994 aa6.53□□□□□ -1.36
HECTD4-210ENST00000549306 ZNF768Q9H5H4 540 aaKnown RBP6.53□□□□□ -1.36
HECTD4-210ENST00000549306 CENPVL1A0A0U1RR11 272 aa6.52□□□□□ -1.37
HECTD4-210ENST00000549306 KCNQ2O43526 872 aa6.52□□□□□ -1.37
HECTD4-210ENST00000549306 ZFP36P26651 326 aaKnown RBP6.52□□□□□ -1.37
HECTD4-210ENST00000549306 MECP2P51608 486 aaKnown RBP6.52□□□□□ -1.37
HECTD4-210ENST00000549306 MAN2A1Q16706 1144 aa6.52□□□□□ -1.37
HECTD4-210ENST00000549306 FAM214AQ32MH5 1076 aa6.52□□□□□ -1.37
HECTD4-210ENST00000549306 COLEC12Q5KU26 742 aa6.52□□□□□ -1.37
HECTD4-210ENST00000549306 DDX53Q86TM3 631 aaKnown RBP6.52□□□□□ -1.37
HECTD4-210ENST00000549306 UIMC1Q96RL1 719 aa6.52□□□□□ -1.37
HECTD4-210ENST00000549306 SLC46A2Q9BY10 475 aa6.52□□□□□ -1.37
HECTD4-210ENST00000549306 MRPL4Q9BYD3 311 aaKnown RBP6.52□□□□□ -1.37
HECTD4-210ENST00000549306 OSBPL6Q9BZF3 934 aa6.52□□□□□ -1.37
HECTD4-210ENST00000549306 CCDC163A0A0D9SF12 145 aa6.51□□□□□ -1.37
HECTD4-210ENST00000549306 M0R2C6 588 aa6.51□□□□□ -1.37
HECTD4-210ENST00000549306 FSBPO95073 299 aa6.51□□□□□ -1.37
HECTD4-210ENST00000549306 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP6.51□□□□□ -1.37
HECTD4-210ENST00000549306 METTL24Q5JXM2 366 aa6.51□□□□□ -1.37
HECTD4-210ENST00000549306 IQSEC1Q6DN90 963 aa6.51□□□□□ -1.37
HECTD4-210ENST00000549306 Q6YL49 198 aa6.51□□□□□ -1.37
HECTD4-210ENST00000549306 SERHL2Q9H4I8 314 aa6.51□□□□□ -1.37
HECTD4-210ENST00000549306 AHRRA9YTQ3 701 aa6.5□□□□□ -1.37
HECTD4-210ENST00000549306 NRP1O14786 923 aa6.5□□□□□ -1.37
HECTD4-210ENST00000549306 CLK3P49761 638 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
HECTD4-210ENST00000549306 ADCY2Q08462 1091 aa6.5□□□□□ -1.37
HECTD4-210ENST00000549306 MYBPC3Q14896 1274 aa6.5□□□□□ -1.37
HECTD4-210ENST00000549306 EPHA7Q15375 998 aa6.5□□□□□ -1.37
HECTD4-210ENST00000549306 ZNF174Q15697 407 aa6.5□□□□□ -1.37
HECTD4-210ENST00000549306 FAM83AQ86UY5 434 aa6.5□□□□□ -1.37
HECTD4-210ENST00000549306 LCORLQ8N3X6 602 aa6.5□□□□□ -1.37
HECTD4-210ENST00000549306 GLB1L3Q8NCI6 653 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
HECTD4-210ENST00000549306 PDCD2LQ9BRP1 358 aa6.5□□□□□ -1.37
HECTD4-210ENST00000549306 WDR11Q9BZH6 1224 aa6.5□□□□□ -1.37
HECTD4-210ENST00000549306 ANKFY1Q9P2R3 1169 aa6.5□□□□□ -1.37
HECTD4-210ENST00000549306 TNPO3Q9Y5L0 923 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
HECTD4-210ENST00000549306 COX11Q9Y6N1 276 aa6.5□□□□□ -1.37
HECTD4-210ENST00000549306 A0A0A6YYJ9 748 aa6.49□□□□□ -1.37
HECTD4-210ENST00000549306 A0A0A6YYK5 440 aaPredicted RBP6.49□□□□□ -1.37
HECTD4-210ENST00000549306 H7C1D1 291 aa6.49□□□□□ -1.37
HECTD4-210ENST00000549306 LPXNO60711 386 aa6.49□□□□□ -1.37
HECTD4-210ENST00000549306 PTTG1IPP53801 180 aa6.49□□□□□ -1.37
HECTD4-210ENST00000549306 VPS72Q15906 364 aa6.49□□□□□ -1.37
HECTD4-210ENST00000549306 TIGD7Q6NT04 549 aaPredicted RBP6.49□□□□□ -1.37
HECTD4-210ENST00000549306 RD3Q7Z3Z2 195 aa6.49□□□□□ -1.37
HECTD4-210ENST00000549306 GLCCI1Q86VQ1 547 aa6.49□□□□□ -1.37
HECTD4-210ENST00000549306 KIAA1958Q8N8K9 716 aa6.49□□□□□ -1.37
HECTD4-210ENST00000549306 CHST14Q8NCH0 376 aa6.49□□□□□ -1.37
HECTD4-210ENST00000549306 NDC1Q9BTX1 674 aa6.49□□□□□ -1.37
HECTD4-210ENST00000549306 PITHD1Q9GZP4 211 aaPredicted RBP6.49□□□□□ -1.37
HECTD4-210ENST00000549306 MTG2Q9H4K7 406 aa6.49□□□□□ -1.37
HECTD4-210ENST00000549306 TRIM39Q9HCM9 518 aa6.49□□□□□ -1.37
HECTD4-210ENST00000549306 ING3Q9NXR8 418 aa6.49□□□□□ -1.37
HECTD4-210ENST00000549306 SAMD15Q9P1V8 674 aa6.49□□□□□ -1.37
HECTD4-210ENST00000549306 HDAC5Q9UQL6 1122 aa6.49□□□□□ -1.37
HECTD4-210ENST00000549306 PTPDC1A2A3K4 754 aa6.48□□□□□ -1.37
HECTD4-210ENST00000549306 B4E1Z4 1266 aa6.48□□□□□ -1.37
HECTD4-210ENST00000549306 DNAJC6O75061 913 aa6.48□□□□□ -1.37
HECTD4-210ENST00000549306 APOL3O95236 402 aa6.48□□□□□ -1.37
HECTD4-210ENST00000549306 CDK4P11802 303 aa6.48□□□□□ -1.37
HECTD4-210ENST00000549306 PTX3P26022 381 aaPredicted RBP6.48□□□□□ -1.37
HECTD4-210ENST00000549306 AVPR1BP47901 424 aa6.48□□□□□ -1.37
HECTD4-210ENST00000549306 FAM189BP81408 668 aa6.48□□□□□ -1.37
HECTD4-210ENST00000549306 ADCY1Q08828 1119 aa6.48□□□□□ -1.37
HECTD4-210ENST00000549306 LRP10Q7Z4F1 713 aa6.48□□□□□ -1.37
HECTD4-210ENST00000549306 ZSWIM2Q8NEG5 633 aa6.48□□□□□ -1.37
HECTD4-210ENST00000549306 OR52N2Q8NGI0 321 aa6.48□□□□□ -1.37
HECTD4-210ENST00000549306 OR5M3Q8NGP4 307 aa6.48□□□□□ -1.37
HECTD4-210ENST00000549306 TRPM5Q9NZQ8 1165 aa6.48□□□□□ -1.37
HECTD4-210ENST00000549306 WDR3Q9UNX4 943 aaKnown RBP eCLIP6.48□□□□□ -1.37
HECTD4-210ENST00000549306 TMEM200CA6NKL6 621 aa6.47□□□□□ -1.37
HECTD4-210ENST00000549306 RNASET2O00584 256 aaKnown RBP6.47□□□□□ -1.37
HECTD4-210ENST00000549306 APOBEC3AP31941 199 aaPredicted RBP6.47□□□□□ -1.37
HECTD4-210ENST00000549306 KRTAP10-11P60412 298 aa6.47□□□□□ -1.37
HECTD4-210ENST00000549306 ZCCHC8Q6NZY4 707 aaKnown RBP6.47□□□□□ -1.37
HECTD4-210ENST00000549306 KANSL1Q7Z3B3 1105 aa6.47□□□□□ -1.37
HECTD4-210ENST00000549306 ARHGEF19Q8IW93 802 aa6.47□□□□□ -1.37
HECTD4-210ENST00000549306 DEPDC7Q96QD5 511 aa6.47□□□□□ -1.37
HECTD4-210ENST00000549306 DCLRE1CQ96SD1 692 aaKnown RBP6.47□□□□□ -1.37
HECTD4-210ENST00000549306 NOL10Q9BSC4 688 aaKnown RBP6.47□□□□□ -1.37
HECTD4-210ENST00000549306 CPEB1Q9BZB8 566 aaKnown RBP6.47□□□□□ -1.37
HECTD4-210ENST00000549306 ENKD1Q9H0I2 346 aa6.47□□□□□ -1.37
HECTD4-210ENST00000549306 CABP5Q9NP86 173 aa6.47□□□□□ -1.37
HECTD4-210ENST00000549306 FAM221BA6H8Z2 402 aa6.46□□□□□ -1.38
HECTD4-210ENST00000549306 GLRX3O76003 335 aaKnown RBP6.46□□□□□ -1.38
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22 ms