RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000548823.1

CTDSP2-204, Transcript of CTD small phosphatase 2, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene CTDSP2, Length 1,368 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDSP2-204ENST00000548823 ZBTB33Q86T24 672 aa22.18■■□□□ 1.14
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CTDSP2-204ENST00000548823 MBOAT7Q96N66 472 aa22.18■■□□□ 1.14
CTDSP2-204ENST00000548823 TLE6Q9H808 572 aa22.18■■□□□ 1.14
CTDSP2-204ENST00000548823 DISC1Q9NRI5 854 aa22.18■■□□□ 1.14
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CTDSP2-204ENST00000548823 ATP8B4Q8TF62 1192 aa22.17■■□□□ 1.14
CTDSP2-204ENST00000548823 MRFAP1L1Q96HT8 127 aa22.17■■□□□ 1.14
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CTDSP2-204ENST00000548823 SLC26A4O43511 780 aa22.16■■□□□ 1.14
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CTDSP2-204ENST00000548823 RAB34Q9BZG1 259 aa22.16■■□□□ 1.14
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CTDSP2-204ENST00000548823 TMEM105Q8N8V8 129 aa22.15■■□□□ 1.14
CTDSP2-204ENST00000548823 GVINP1Q7Z2Y8 2422 aa22.14■■□□□ 1.14
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CTDSP2-204ENST00000548823 ERCC5P28715 1186 aaPredicted RBP22.14■■□□□ 1.14
CTDSP2-204ENST00000548823 ARHGAP4P98171 946 aa22.14■■□□□ 1.14
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CTDSP2-204ENST00000548823 RRAGBQ5VZM2 374 aa22.14■■□□□ 1.14
CTDSP2-204ENST00000548823 FRMD5Q7Z6J6 570 aa22.14■■□□□ 1.14
CTDSP2-204ENST00000548823 CABP7Q86V35 215 aa22.14■■□□□ 1.14
CTDSP2-204ENST00000548823 UBALD2Q8IYN6 164 aa22.14■■□□□ 1.14
CTDSP2-204ENST00000548823 CRIPAKQ8N1N5 446 aa22.14■■□□□ 1.14
CTDSP2-204ENST00000548823 LMBR1Q8WVP7 490 aa22.14■■□□□ 1.14
CTDSP2-204ENST00000548823 CDCA3Q99618 268 aaPredicted RBP22.14■■□□□ 1.14
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CTDSP2-204ENST00000548823 NRCAMQ92823 1304 aa22.13■■□□□ 1.13
CTDSP2-204ENST00000548823 PER2O15055 1255 aa22.12■■□□□ 1.13
CTDSP2-204ENST00000548823 SLC37A4O43826 429 aa22.12■■□□□ 1.13
CTDSP2-204ENST00000548823 SREBF1P36956 1147 aa22.12■■□□□ 1.13
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CTDSP2-204ENST00000548823 S1PR5Q9H228 398 aa22.12■■□□□ 1.13
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CTDSP2-204ENST00000548823 ISM2Q6H9L7 571 aa22.12■■□□□ 1.13
CTDSP2-204ENST00000548823 TSHZ1Q6ZSZ6 1077 aa22.12■■□□□ 1.13
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CTDSP2-204ENST00000548823 NPAS4Q8IUM7 802 aa22.12■■□□□ 1.13
CTDSP2-204ENST00000548823 SAMD3Q8N6K7 520 aa22.12■■□□□ 1.13
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CTDSP2-204ENST00000548823 GTPBP4Q9BZE4 634 aaKnown RBP22.12■■□□□ 1.13
CTDSP2-204ENST00000548823 SORCS3Q9UPU3 1222 aa22.12■■□□□ 1.13
CTDSP2-204ENST00000548823 SRGAP2BP0DMP2 458 aa22.11■■□□□ 1.13
CTDSP2-204ENST00000548823 TECP42680 631 aa22.11■■□□□ 1.13
CTDSP2-204ENST00000548823 TXKP42681 527 aa22.11■■□□□ 1.13
CTDSP2-204ENST00000548823 PAN2Q504Q3 1202 aaKnown RBP22.11■■□□□ 1.13
CTDSP2-204ENST00000548823 ASTLQ6HA08 431 aaPredicted RBP22.11■■□□□ 1.13
CTDSP2-204ENST00000548823 METTL7BQ6UX53 244 aa22.11■■□□□ 1.13
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