RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000545882.5

CNN3-207, Transcript of calponin 3, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene CNN3, Length 1,902 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNN3-207ENST00000545882 AADACL2Q6P093 401 aa16.55■□□□□ 0.24
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CNN3-207ENST00000545882 SLC20A1Q8WUM9 679 aa16.55■□□□□ 0.24
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CNN3-207ENST00000545882 BCCIPQ9P287 314 aaKnown RBP eCLIP16.55■□□□□ 0.24
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CNN3-207ENST00000545882 IFT88Q13099 833 aa16.53■□□□□ 0.24
CNN3-207ENST00000545882 KRT71Q3SY84 523 aa16.53■□□□□ 0.24
CNN3-207ENST00000545882 CEP55Q53EZ4 464 aa16.53■□□□□ 0.24
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CNN3-207ENST00000545882 CCDC174Q6PII3 467 aa16.53■□□□□ 0.24
CNN3-207ENST00000545882 ZDHHC24Q6UX98 284 aa16.53■□□□□ 0.24
CNN3-207ENST00000545882 FMO2Q99518 471 aa16.53■□□□□ 0.24
CNN3-207ENST00000545882 RAB17Q9H0T7 212 aa16.53■□□□□ 0.24
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CNN3-207ENST00000545882 KCND2Q9NZV8 630 aa16.53■□□□□ 0.24
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CNN3-207ENST00000545882 H0YIN7 160 aa16.52■□□□□ 0.23
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CNN3-207ENST00000545882 CCDC172P0C7W6 258 aa16.52■□□□□ 0.23
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CNN3-207ENST00000545882 C1orf220Q5T0J3 134 aa16.52■□□□□ 0.23
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CNN3-207ENST00000545882 SEPT11Q9NVA2 429 aaKnown RBP16.52■□□□□ 0.23
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CNN3-207ENST00000545882 ZSWIM2Q8NEG5 633 aa16.51■□□□□ 0.23
CNN3-207ENST00000545882 PLEKHO2Q8TD55 490 aa16.51■□□□□ 0.23
CNN3-207ENST00000545882 RNF25Q96BH1 459 aaPredicted RBP16.51■□□□□ 0.23
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CNN3-207ENST00000545882 PCIF1Q9H4Z3 704 aa16.51■□□□□ 0.23
CNN3-207ENST00000545882 GRHL1Q9NZI5 618 aa16.51■□□□□ 0.23
CNN3-207ENST00000545882 TMX2Q9Y320 296 aa16.51■□□□□ 0.23
CNN3-207ENST00000545882 FTLP02792 175 aaPredicted RBP16.5■□□□□ 0.23
CNN3-207ENST00000545882 NUDT17P0C025 328 aa16.5■□□□□ 0.23
CNN3-207ENST00000545882 RFX1P22670 979 aa16.5■□□□□ 0.23
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