RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000542019.1

TM7SF3-210, Transcript of transmembrane 7 superfamily member 3, humanhuman

TSL 3

Gene TM7SF3, Length 737 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM7SF3-210ENST00000542019 FAM105AQ9NUU6 356 aa27.58■■■□□ 2.01
TM7SF3-210ENST00000542019 TYW1Q9NV66 732 aaKnown RBP27.58■■■□□ 2.01
TM7SF3-210ENST00000542019 RWDD3Q9Y3V2 267 aa27.58■■■□□ 2.01
TM7SF3-210ENST00000542019 TSPAN1O60635 241 aa27.57■■■□□ 2
TM7SF3-210ENST00000542019 CSPG5O95196 566 aa27.57■■■□□ 2
TM7SF3-210ENST00000542019 RB1P06400 928 aa27.57■■■□□ 2
TM7SF3-210ENST00000542019 AMHR2Q16671 573 aa27.57■■■□□ 2
TM7SF3-210ENST00000542019 UBXN11Q5T124 520 aa27.57■■■□□ 2
TM7SF3-210ENST00000542019 ARL6IP4Q66PJ3 421 aaKnown RBP27.57■■■□□ 2
TM7SF3-210ENST00000542019 HSCBQ8IWL3 235 aa27.57■■■□□ 2
TM7SF3-210ENST00000542019 HELQQ8TDG4 1101 aa27.57■■■□□ 2
TM7SF3-210ENST00000542019 MRPL38Q96DV4 380 aaKnown RBP27.57■■■□□ 2
TM7SF3-210ENST00000542019 PLIN2Q99541 437 aa27.57■■■□□ 2
TM7SF3-210ENST00000542019 C11orf84Q9BUA3 381 aaPredicted RBP27.57■■■□□ 2
TM7SF3-210ENST00000542019 TMEM117Q9H0C3 514 aa27.57■■■□□ 2
TM7SF3-210ENST00000542019 CWH43Q9H720 699 aa27.57■■■□□ 2
TM7SF3-210ENST00000542019 ALG13Q9NP73 1137 aaKnown RBP27.57■■■□□ 2
TM7SF3-210ENST00000542019 RNF216Q9NWF9 866 aaPredicted RBP27.57■■■□□ 2
TM7SF3-210ENST00000542019 CLIC4Q9Y696 253 aa27.57■■■□□ 2
TM7SF3-210ENST00000542019 STK24Q9Y6E0 443 aa27.57■■■□□ 2
TM7SF3-210ENST00000542019 SPTBN5Q9NRC6 3674 aaKnown RBP27.56■■■□□ 2
TM7SF3-210ENST00000542019 INO80B-WBP1J3KQ70 363 aa27.56■■■□□ 2
TM7SF3-210ENST00000542019 POU5F1BQ06416 359 aa27.56■■■□□ 2
TM7SF3-210ENST00000542019 SKIV2LQ15477 1246 aaKnown RBP27.56■■■□□ 2
TM7SF3-210ENST00000542019 ZRSR1Q15695 479 aaKnown RBP27.56■■■□□ 2
TM7SF3-210ENST00000542019 KLHL23Q8NBE8 558 aa27.56■■■□□ 2
TM7SF3-210ENST00000542019 CPB2Q96IY4 423 aa27.56■■■□□ 2
TM7SF3-210ENST00000542019 LRRIQ4A6NIV6 560 aa27.55■■■□□ 2
TM7SF3-210ENST00000542019 B4GALT5O43286 388 aa27.55■■■□□ 2
TM7SF3-210ENST00000542019 EYA4O95677 639 aa27.55■■■□□ 2
TM7SF3-210ENST00000542019 EOMESO95936 686 aa27.55■■■□□ 2
TM7SF3-210ENST00000542019 ITGB1P05556 798 aa27.55■■■□□ 2
TM7SF3-210ENST00000542019 PLVAPQ9BX97 442 aa27.55■■■□□ 2
TM7SF3-210ENST00000542019 PLAGL2Q9UPG8 496 aa27.55■■■□□ 2
TM7SF3-210ENST00000542019 STX6O43752 255 aa27.54■■■□□ 2
TM7SF3-210ENST00000542019 ERLIN2O94905 339 aa27.54■■■□□ 2
TM7SF3-210ENST00000542019 DNAJB1P25685 340 aa27.54■■■□□ 2
TM7SF3-210ENST00000542019 CAMK1Q14012 370 aa27.54■■■□□ 2
TM7SF3-210ENST00000542019 PTPAQ15257 358 aa27.54■■■□□ 2
TM7SF3-210ENST00000542019 HYIQ5T013 277 aa27.54■■■□□ 2
TM7SF3-210ENST00000542019 SPOUT1Q5T280 376 aaKnown RBP27.54■■■□□ 2
TM7SF3-210ENST00000542019 RUSC1Q9BVN2 902 aa27.54■■■□□ 2
TM7SF3-210ENST00000542019 NFKBIZQ9BYH8 718 aa27.54■■■□□ 2
TM7SF3-210ENST00000542019 THEGQ9P2T0 379 aa27.54■■■□□ 2
TM7SF3-210ENST00000542019 DNM3Q9UQ16 869 aa27.54■■■□□ 2
TM7SF3-210ENST00000542019 PCDHB2Q9Y5E7 798 aa27.54■■■□□ 2
TM7SF3-210ENST00000542019 PLXNA4Q9HCM2 1894 aa27.53■■■□□ 2
TM7SF3-210ENST00000542019 HOXA2O43364 376 aa27.53■■■□□ 2
TM7SF3-210ENST00000542019 PBX3P40426 434 aa27.53■■■□□ 2
TM7SF3-210ENST00000542019 PTPROQ16827 1216 aa27.53■■■□□ 2
TM7SF3-210ENST00000542019 CDCA2Q69YH5 1023 aaPredicted RBP27.53■■■□□ 2
TM7SF3-210ENST00000542019 ABI1Q8IZP0 508 aa27.53■■■□□ 2
TM7SF3-210ENST00000542019 COLGALT1Q8NBJ5 622 aa27.53■■■□□ 2
TM7SF3-210ENST00000542019 LRRC15Q8TF66 581 aa27.53■■■□□ 2
TM7SF3-210ENST00000542019 P2RX5Q93086 422 aa27.53■■■□□ 2
TM7SF3-210ENST00000542019 EIF2AQ9BY44 585 aaKnown RBP27.53■■■□□ 2
TM7SF3-210ENST00000542019 XIRP2A4UGR9 3374 aa27.52■■■□□ 2
TM7SF3-210ENST00000542019 ZNF623O75123 536 aa27.52■■■□□ 2
TM7SF3-210ENST00000542019 ARF4P18085 180 aaPredicted RBP27.52■■■□□ 2
TM7SF3-210ENST00000542019 TFF2Q03403 129 aa27.52■■■□□ 2
TM7SF3-210ENST00000542019 CDR2LQ86X02 465 aaPredicted RBP27.52■■■□□ 2
TM7SF3-210ENST00000542019 LRRC43Q8N309 656 aa27.52■■■□□ 2
TM7SF3-210ENST00000542019 SPPL3Q8TCT6 385 aa27.52■■■□□ 2
TM7SF3-210ENST00000542019 KIFC3Q9BVG8 833 aa27.52■■■□□ 2
TM7SF3-210ENST00000542019 TTLL13PA6NNM8 815 aa27.51■■□□□ 1.99
TM7SF3-210ENST00000542019 EDN1P05305 212 aa27.51■■□□□ 1.99
TM7SF3-210ENST00000542019 RAB27AP51159 221 aa27.51■■□□□ 1.99
TM7SF3-210ENST00000542019 TMEM119Q4V9L6 283 aa27.51■■□□□ 1.99
TM7SF3-210ENST00000542019 AGMOQ6ZNB7 445 aa27.51■■□□□ 1.99
TM7SF3-210ENST00000542019 CABP7Q86V35 215 aa27.51■■□□□ 1.99
TM7SF3-210ENST00000542019 DAW1Q8N136 415 aa27.51■■□□□ 1.99
TM7SF3-210ENST00000542019 SMG8Q8ND04 991 aaKnown RBP27.51■■□□□ 1.99
TM7SF3-210ENST00000542019 USP20Q9Y2K6 914 aa27.51■■□□□ 1.99
TM7SF3-210ENST00000542019 BMP15O95972 392 aa27.5■■□□□ 1.99
TM7SF3-210ENST00000542019 SKIP12755 728 aa27.5■■□□□ 1.99
TM7SF3-210ENST00000542019 AFF1P51825 1210 aaKnown RBP27.5■■□□□ 1.99
TM7SF3-210ENST00000542019 CEBPZQ03701 1054 aaKnown RBP27.5■■□□□ 1.99
TM7SF3-210ENST00000542019 TCEAL5Q5H9L2 206 aa27.5■■□□□ 1.99
TM7SF3-210ENST00000542019 RINT1Q6NUQ1 792 aa27.5■■□□□ 1.99
TM7SF3-210ENST00000542019 MRPL10Q7Z7H8 261 aaKnown RBP27.5■■□□□ 1.99
TM7SF3-210ENST00000542019 SPRYD3Q8NCJ5 442 aa27.5■■□□□ 1.99
TM7SF3-210ENST00000542019 OFD1O75665 1012 aa27.49■■□□□ 1.99
TM7SF3-210ENST00000542019 MARCKSP29966 332 aaPredicted RBP27.49■■□□□ 1.99
TM7SF3-210ENST00000542019 IRS1P35568 1242 aa27.49■■□□□ 1.99
TM7SF3-210ENST00000542019 NAMPTP43490 491 aa27.49■■□□□ 1.99
TM7SF3-210ENST00000542019 MAPK7Q13164 816 aa27.49■■□□□ 1.99
TM7SF3-210ENST00000542019 PCBP1Q15365 356 aaKnown RBP eCLIP27.49■■□□□ 1.99
TM7SF3-210ENST00000542019 NAALADL2Q58DX5 795 aa27.49■■□□□ 1.99
TM7SF3-210ENST00000542019 NOTUMQ6P988 496 aa27.49■■□□□ 1.99
TM7SF3-210ENST00000542019 C1orf186Q6ZWK4 172 aa27.49■■□□□ 1.99
TM7SF3-210ENST00000542019 POF1BQ8WVV4 589 aa27.49■■□□□ 1.99
TM7SF3-210ENST00000542019 AK8Q96MA6 479 aa27.49■■□□□ 1.99
TM7SF3-210ENST00000542019 USP28Q96RU2 1077 aa27.49■■□□□ 1.99
TM7SF3-210ENST00000542019 LMAN2LQ9H0V9 348 aa27.49■■□□□ 1.99
TM7SF3-210ENST00000542019 INPP5FQ9Y2H2 1132 aa27.49■■□□□ 1.99
TM7SF3-210ENST00000542019 HES2Q9Y543 173 aa27.49■■□□□ 1.99
TM7SF3-210ENST00000542019 PCDHB12Q9Y5F1 795 aa27.49■■□□□ 1.99
TM7SF3-210ENST00000542019 PCDHGC5Q9Y5F6 944 aa27.49■■□□□ 1.99
TM7SF3-210ENST00000542019 HIP1RO75146 1068 aa27.48■■□□□ 1.99
TM7SF3-210ENST00000542019 LAG3P18627 525 aa27.48■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 34.8 ms