RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000541576.5

THBS3-210, Transcript of thrombospondin 3, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene THBS3, Length 3,200 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
THBS3-210ENST00000541576 PPP2R5AQ15172 486 aa9.5□□□□□ -0.89
THBS3-210ENST00000541576 DGKDQ16760 1214 aa9.5□□□□□ -0.89
THBS3-210ENST00000541576 FKBP15Q5T1M5 1219 aa9.5□□□□□ -0.89
THBS3-210ENST00000541576 LRRN4CLQ8ND94 238 aa9.5□□□□□ -0.89
THBS3-210ENST00000541576 ASAP3Q8TDY4 903 aa9.5□□□□□ -0.89
THBS3-210ENST00000541576 JPH2Q9BR39 696 aaPredicted RBP9.5□□□□□ -0.89
THBS3-210ENST00000541576 NDST4Q9H3R1 872 aa9.5□□□□□ -0.89
THBS3-210ENST00000541576 RNPEPQ9H4A4 650 aa9.5□□□□□ -0.89
THBS3-210ENST00000541576 TBX20Q9UMR3 447 aa9.5□□□□□ -0.89
THBS3-210ENST00000541576 GNEQ9Y223 722 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
THBS3-210ENST00000541576 CTIFO43310 598 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
THBS3-210ENST00000541576 GAS2O43903 313 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
THBS3-210ENST00000541576 AKAP3O75969 853 aa9.5□□□□□ -0.89
THBS3-210ENST00000541576 GYPCP04921 128 aa9.5□□□□□ -0.89
THBS3-210ENST00000541576 EPB41P11171 864 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
THBS3-210ENST00000541576 GLRA2P23416 452 aa9.5□□□□□ -0.89
THBS3-210ENST00000541576 ABCD1P33897 745 aa9.5□□□□□ -0.89
THBS3-210ENST00000541576 CASP4P49662 377 aa9.5□□□□□ -0.89
THBS3-210ENST00000541576 FLT3LGP49771 235 aa9.5□□□□□ -0.89
THBS3-210ENST00000541576 KLK7P49862 253 aa9.5□□□□□ -0.89
THBS3-210ENST00000541576 FXR1P51114 621 aaKnown RBP eCLIP9.5□□□□□ -0.89
THBS3-210ENST00000541576 HNRNPH2P55795 449 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
THBS3-210ENST00000541576 TAF3Q5VWG9 929 aa9.5□□□□□ -0.89
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THBS3-210ENST00000541576 MAP4K3Q8IVH8 894 aa9.5□□□□□ -0.89
THBS3-210ENST00000541576 C10orf67Q8IYJ2 551 aa9.5□□□□□ -0.89
THBS3-210ENST00000541576 C16orf70Q9BSU1 422 aa9.5□□□□□ -0.89
THBS3-210ENST00000541576 SUGCTQ9HAC7 445 aa9.5□□□□□ -0.89
THBS3-210ENST00000541576 ARHGAP28Q9P2N2 729 aa9.5□□□□□ -0.89
THBS3-210ENST00000541576 ARMCX3Q9UH62 379 aaPredicted RBP9.5□□□□□ -0.89
THBS3-210ENST00000541576 UCHL5Q9Y5K5 329 aaKnown RBP eCLIP9.5□□□□□ -0.89
THBS3-210ENST00000541576 ADGRA3Q8IWK6 1321 aa9.5□□□□□ -0.89
THBS3-210ENST00000541576 H3BRB1 525 aa9.5□□□□□ -0.89
THBS3-210ENST00000541576 TRPA1O75762 1119 aa9.5□□□□□ -0.89
THBS3-210ENST00000541576 MAP2K2P36507 400 aa9.5□□□□□ -0.89
THBS3-210ENST00000541576 NAMPTP43490 491 aa9.5□□□□□ -0.89
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THBS3-210ENST00000541576 TRIM59Q8IWR1 403 aa9.5□□□□□ -0.89
THBS3-210ENST00000541576 CCDC155Q8N6L0 562 aa9.5□□□□□ -0.89
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THBS3-210ENST00000541576 GABRQQ9UN88 632 aa9.5□□□□□ -0.89
THBS3-210ENST00000541576 UTP18Q9Y5J1 556 aaKnown RBP eCLIP9.5□□□□□ -0.89
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THBS3-210ENST00000541576 IGKV6-21A0A0C4DH24 114 aa9.49□□□□□ -0.89
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THBS3-210ENST00000541576 ZNF397Q8NF99 534 aaPredicted RBP9.48□□□□□ -0.89
THBS3-210ENST00000541576 TMEM174Q8WUU8 243 aa9.48□□□□□ -0.89
THBS3-210ENST00000541576 TRIB2Q92519 343 aa9.48□□□□□ -0.89
THBS3-210ENST00000541576 AP5M1Q9H0R1 490 aa9.48□□□□□ -0.89
THBS3-210ENST00000541576 Q9Y3F1 56 aa9.48□□□□□ -0.89
THBS3-210ENST00000541576 TTC26A0AVF1 554 aa9.48□□□□□ -0.89
THBS3-210ENST00000541576 SEC31AO94979 1220 aaKnown RBP9.48□□□□□ -0.89
THBS3-210ENST00000541576 CNGA1P29973 690 aa9.48□□□□□ -0.89
THBS3-210ENST00000541576 PPP2R3AQ06190 1150 aa9.48□□□□□ -0.89
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