RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000539589.5

PACSIN3-211, Transcript of protein kinase C and casein kinase substrate in neurons 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene PACSIN3, Length 2,009 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PACSIN3-211ENST00000539589 ENC1O14682 589 aa22.11■■□□□ 1.13
PACSIN3-211ENST00000539589 TACC1O75410 805 aa22.11■■□□□ 1.13
PACSIN3-211ENST00000539589 ATP1A1P05023 1023 aaKnown RBP22.11■■□□□ 1.13
PACSIN3-211ENST00000539589 SLC9A1P19634 815 aa22.11■■□□□ 1.13
PACSIN3-211ENST00000539589 PRKCEQ02156 737 aa22.11■■□□□ 1.13
PACSIN3-211ENST00000539589 GFPT1Q06210 699 aaPredicted RBP22.11■■□□□ 1.13
PACSIN3-211ENST00000539589 ASIC2Q16515 512 aa22.11■■□□□ 1.13
PACSIN3-211ENST00000539589 KLHDC7AQ5VTJ3 777 aa22.11■■□□□ 1.13
PACSIN3-211ENST00000539589 IFNL1Q8IU54 200 aa22.11■■□□□ 1.13
PACSIN3-211ENST00000539589 GPIHBP1Q8IV16 184 aa22.11■■□□□ 1.13
PACSIN3-211ENST00000539589 KSR1Q8IVT5 923 aa22.11■■□□□ 1.13
PACSIN3-211ENST00000539589 SYCP3Q8IZU3 236 aa22.11■■□□□ 1.13
PACSIN3-211ENST00000539589 TIPINQ9BVW5 301 aa22.11■■□□□ 1.13
PACSIN3-211ENST00000539589 MAFBQ9Y5Q3 323 aaPredicted RBP22.11■■□□□ 1.13
PACSIN3-211ENST00000539589 IVNS1ABPQ9Y6Y0 642 aa22.11■■□□□ 1.13
PACSIN3-211ENST00000539589 PJA2O43164 708 aa22.11■■□□□ 1.13
PACSIN3-211ENST00000539589 PPP1R37O75864 691 aa22.11■■□□□ 1.13
PACSIN3-211ENST00000539589 UCHL3P15374 230 aa22.11■■□□□ 1.13
PACSIN3-211ENST00000539589 TAF1CQ15572 869 aaPredicted RBP22.11■■□□□ 1.13
PACSIN3-211ENST00000539589 TMCO3Q6UWJ1 677 aa22.11■■□□□ 1.13
PACSIN3-211ENST00000539589 METTL7BQ6UX53 244 aa22.11■■□□□ 1.13
PACSIN3-211ENST00000539589 PLEKHH3Q7Z736 793 aa22.11■■□□□ 1.13
PACSIN3-211ENST00000539589 COPS5Q92905 334 aa22.11■■□□□ 1.13
PACSIN3-211ENST00000539589 DMAC2Q9NW81 257 aa22.11■■□□□ 1.13
PACSIN3-211ENST00000539589 SPDYE4A6NLX3 237 aa22.1■■□□□ 1.13
PACSIN3-211ENST00000539589 ECM2O94769 699 aaPredicted RBP22.1■■□□□ 1.13
PACSIN3-211ENST00000539589 ACTN1P12814 892 aa22.1■■□□□ 1.13
PACSIN3-211ENST00000539589 KLHL30Q0D2K2 578 aa22.1■■□□□ 1.13
PACSIN3-211ENST00000539589 DPY19L2P1Q6NXN4 242 aa22.1■■□□□ 1.13
PACSIN3-211ENST00000539589 EPC1Q9H2F5 836 aa22.1■■□□□ 1.13
PACSIN3-211ENST00000539589 IKZF4Q9H2S9 585 aa22.1■■□□□ 1.13
PACSIN3-211ENST00000539589 ZCCHC17Q9NP64 241 aaKnown RBP22.1■■□□□ 1.13
PACSIN3-211ENST00000539589 GPRC5CQ9NQ84 441 aa22.1■■□□□ 1.13
PACSIN3-211ENST00000539589 FBXL5Q9UKA1 691 aa22.1■■□□□ 1.13
PACSIN3-211ENST00000539589 ZNF236Q9UL36 1845 aa22.1■■□□□ 1.13
PACSIN3-211ENST00000539589 K7ENM7 598 aa22.09■■□□□ 1.13
PACSIN3-211ENST00000539589 SPAG5Q96R06 1193 aa22.09■■□□□ 1.13
PACSIN3-211ENST00000539589 PARD6BQ9BYG5 372 aa22.09■■□□□ 1.13
PACSIN3-211ENST00000539589 KATNBL1Q9H079 304 aa22.09■■□□□ 1.13
PACSIN3-211ENST00000539589 ZNF302Q9NR11 478 aa22.09■■□□□ 1.13
PACSIN3-211ENST00000539589 ZNF446Q9NWS9 450 aa22.09■■□□□ 1.13
PACSIN3-211ENST00000539589 HDAC6Q9UBN7 1215 aa22.09■■□□□ 1.13
PACSIN3-211ENST00000539589 PLS3P13797 630 aa22.09■■□□□ 1.13
PACSIN3-211ENST00000539589 ZSCAN20P17040 1043 aaPredicted RBP22.09■■□□□ 1.13
PACSIN3-211ENST00000539589 MAPK4P31152 587 aa22.09■■□□□ 1.13
PACSIN3-211ENST00000539589 CYP2J2P51589 502 aa22.09■■□□□ 1.13
PACSIN3-211ENST00000539589 MYBPC2Q14324 1141 aa22.09■■□□□ 1.13
PACSIN3-211ENST00000539589 CELF3Q5SZQ8 465 aaKnown RBP22.09■■□□□ 1.13
PACSIN3-211ENST00000539589 TAPT1Q6NXT6 567 aa22.09■■□□□ 1.13
PACSIN3-211ENST00000539589 KCNV1Q6PIU1 500 aa22.09■■□□□ 1.13
PACSIN3-211ENST00000539589 SLC9A9Q8IVB4 645 aa22.09■■□□□ 1.13
PACSIN3-211ENST00000539589 SMC1BQ8NDV3 1235 aa22.09■■□□□ 1.13
PACSIN3-211ENST00000539589 TMEM206Q9H813 350 aa22.09■■□□□ 1.13
PACSIN3-211ENST00000539589 MLXIPQ9HAP2 919 aa22.09■■□□□ 1.13
PACSIN3-211ENST00000539589 JRKLQ9Y4A0 524 aa22.09■■□□□ 1.13
PACSIN3-211ENST00000539589 DKC1O60832 514 aaKnown RBP eCLIP22.08■■□□□ 1.13
PACSIN3-211ENST00000539589 TFRCP02786 760 aaKnown RBP22.08■■□□□ 1.13
PACSIN3-211ENST00000539589 ARID5AQ03989 594 aa22.08■■□□□ 1.13
PACSIN3-211ENST00000539589 HSDL1Q3SXM5 330 aa22.08■■□□□ 1.13
PACSIN3-211ENST00000539589 C17orf99Q6UX52 265 aa22.08■■□□□ 1.13
PACSIN3-211ENST00000539589 OTUD6AQ7L8S5 288 aa22.08■■□□□ 1.13
PACSIN3-211ENST00000539589 ZNF467Q7Z7K2 595 aaPredicted RBP22.08■■□□□ 1.13
PACSIN3-211ENST00000539589 NPLOC4Q8TAT6 608 aa22.08■■□□□ 1.13
PACSIN3-211ENST00000539589 CEP170P1Q96L14 293 aa22.08■■□□□ 1.13
PACSIN3-211ENST00000539589 DRC1Q96MC2 740 aa22.08■■□□□ 1.13
PACSIN3-211ENST00000539589 ALS2CR12Q96Q35 445 aa22.08■■□□□ 1.13
PACSIN3-211ENST00000539589 PDLIM7Q9NR12 457 aa22.08■■□□□ 1.13
PACSIN3-211ENST00000539589 GCNT4Q9P109 453 aa22.08■■□□□ 1.13
PACSIN3-211ENST00000539589 SEPT9Q9UHD8 586 aaPredicted RBP22.08■■□□□ 1.13
PACSIN3-211ENST00000539589 ABT1Q9ULW3 272 aaKnown RBP22.08■■□□□ 1.13
PACSIN3-211ENST00000539589 BZW2Q9Y6E2 419 aaKnown RBP22.08■■□□□ 1.13
PACSIN3-211ENST00000539589 SNAI1O95863 264 aaPredicted RBP22.07■■□□□ 1.12
PACSIN3-211ENST00000539589 SLC18A3Q16572 532 aa22.07■■□□□ 1.12
PACSIN3-211ENST00000539589 MAMDC4Q6UXC1 1216 aa22.07■■□□□ 1.12
PACSIN3-211ENST00000539589 MAML3Q96JK9 1138 aa22.07■■□□□ 1.12
PACSIN3-211ENST00000539589 TXNP10599 105 aaKnown RBP22.07■■□□□ 1.12
PACSIN3-211ENST00000539589 TCF7P36402 384 aaPredicted RBP22.07■■□□□ 1.12
PACSIN3-211ENST00000539589 SOX10P56693 466 aa22.07■■□□□ 1.12
PACSIN3-211ENST00000539589 CBX1P83916 185 aa22.07■■□□□ 1.12
PACSIN3-211ENST00000539589 BMS1Q14692 1282 aaKnown RBP22.07■■□□□ 1.12
PACSIN3-211ENST00000539589 PPP2R5AQ15172 486 aa22.07■■□□□ 1.12
PACSIN3-211ENST00000539589 XKR3Q5GH77 459 aa22.07■■□□□ 1.12
PACSIN3-211ENST00000539589 DPP9Q86TI2 863 aa22.07■■□□□ 1.12
PACSIN3-211ENST00000539589 RNF10Q8N5U6 811 aaKnown RBP22.07■■□□□ 1.12
PACSIN3-211ENST00000539589 SEPT1Q8WYJ6 367 aa22.07■■□□□ 1.12
PACSIN3-211ENST00000539589 ACCSQ96QU6 501 aa22.07■■□□□ 1.12
PACSIN3-211ENST00000539589 GPR20Q99678 358 aa22.07■■□□□ 1.12
PACSIN3-211ENST00000539589 CYP26B1Q9NR63 512 aa22.07■■□□□ 1.12
PACSIN3-211ENST00000539589 CDKN2AIPQ9NXV6 580 aaPredicted RBP22.07■■□□□ 1.12
PACSIN3-211ENST00000539589 DIS3Q9Y2L1 958 aaKnown RBP22.07■■□□□ 1.12
PACSIN3-211ENST00000539589 FHOD1Q9Y613 1164 aa22.07■■□□□ 1.12
PACSIN3-211ENST00000539589 EXOC3O60645 756 aa22.06■■□□□ 1.12
PACSIN3-211ENST00000539589 INHBEP58166 350 aa22.06■■□□□ 1.12
PACSIN3-211ENST00000539589 CCDC102AQ96A19 550 aa22.06■■□□□ 1.12
PACSIN3-211ENST00000539589 HNRNPUL1Q9BUJ2 856 aaKnown RBP eCLIP22.06■■□□□ 1.12
PACSIN3-211ENST00000539589 XPNPEP1Q9NQW7 623 aa22.06■■□□□ 1.12
PACSIN3-211ENST00000539589 TMEM88BA6NKF7 163 aa22.06■■□□□ 1.12
PACSIN3-211ENST00000539589 MOCS3O95396 460 aa22.06■■□□□ 1.12
PACSIN3-211ENST00000539589 CKAP4Q07065 602 aaKnown RBP22.06■■□□□ 1.12
PACSIN3-211ENST00000539589 GJC2Q5T442 439 aaPredicted RBP22.06■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21.9 ms