RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000533069.1

PKP3-209, Transcript of plakophilin 3, humanhuman

TSL 2

Gene PKP3, Length 590 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKP3-209ENST00000533069 IFNLR1Q8IU57 520 aaPredicted RBP18.5■□□□□ 0.55
PKP3-209ENST00000533069 IGSF22Q8N9C0 903 aa18.5■□□□□ 0.55
PKP3-209ENST00000533069 CASD1Q96PB1 797 aa18.5■□□□□ 0.55
PKP3-209ENST00000533069 NFKBIZQ9BYH8 718 aa18.5■□□□□ 0.55
PKP3-209ENST00000533069 ALG13Q9NP73 1137 aaKnown RBP18.5■□□□□ 0.55
PKP3-209ENST00000533069 FAM105AQ9NUU6 356 aa18.5■□□□□ 0.55
PKP3-209ENST00000533069 ARHGEF35A5YM69 484 aa18.49■□□□□ 0.55
PKP3-209ENST00000533069 ZNF623O75123 536 aa18.49■□□□□ 0.55
PKP3-209ENST00000533069 ERLIN2O94905 339 aa18.49■□□□□ 0.55
PKP3-209ENST00000533069 ATF7P17544 494 aaPredicted RBP18.49■□□□□ 0.55
PKP3-209ENST00000533069 PDCP20941 246 aa18.49■□□□□ 0.55
PKP3-209ENST00000533069 CCT6AP40227 531 aaKnown RBP18.49■□□□□ 0.55
PKP3-209ENST00000533069 UBE3AQ05086 875 aa18.49■□□□□ 0.55
PKP3-209ENST00000533069 CAPSQ13938 189 aa18.49■□□□□ 0.55
PKP3-209ENST00000533069 TCEAL5Q5H9L2 206 aa18.49■□□□□ 0.55
PKP3-209ENST00000533069 CLLU1OSQ5K130 101 aa18.49■□□□□ 0.55
PKP3-209ENST00000533069 DTHD1Q6ZMT9 781 aa18.49■□□□□ 0.55
PKP3-209ENST00000533069 SPPL3Q8TCT6 385 aa18.49■□□□□ 0.55
PKP3-209ENST00000533069 PPP2R3CQ969Q6 453 aa18.49■□□□□ 0.55
PKP3-209ENST00000533069 POLR3FQ9H1D9 316 aaPredicted RBP18.49■□□□□ 0.55
PKP3-209ENST00000533069 CWH43Q9H720 699 aa18.49■□□□□ 0.55
PKP3-209ENST00000533069 UBE2ZQ9H832 354 aaPredicted RBP18.49■□□□□ 0.55
PKP3-209ENST00000533069 MINDY3Q9H8M7 445 aa18.49■□□□□ 0.55
PKP3-209ENST00000533069 XIRP2A4UGR9 3374 aa18.49■□□□□ 0.55
PKP3-209ENST00000533069 NLRC5Q86WI3 1866 aa18.48■□□□□ 0.55
PKP3-209ENST00000533069 PPAN-P2RY11A0A0B4J1V8 794 aaPredicted RBP18.48■□□□□ 0.55
PKP3-209ENST00000533069 GLRA2P23416 452 aa18.48■□□□□ 0.55
PKP3-209ENST00000533069 AXLP30530 894 aa18.48■□□□□ 0.55
PKP3-209ENST00000533069 PPM1AP35813 382 aa18.48■□□□□ 0.55
PKP3-209ENST00000533069 NCBP1Q09161 790 aaKnown RBP18.48■□□□□ 0.55
PKP3-209ENST00000533069 COL19A1Q14993 1142 aa18.48■□□□□ 0.55
PKP3-209ENST00000533069 PADI6Q6TGC4 694 aa18.48■□□□□ 0.55
PKP3-209ENST00000533069 COLGALT1Q8NBJ5 622 aa18.48■□□□□ 0.55
PKP3-209ENST00000533069 HELQQ8TDG4 1101 aa18.48■□□□□ 0.55
PKP3-209ENST00000533069 ASAP3Q8TDY4 903 aa18.48■□□□□ 0.55
PKP3-209ENST00000533069 PGBD4Q96DM1 585 aa18.48■□□□□ 0.55
PKP3-209ENST00000533069 CCDC51Q96ER9 411 aa18.48■□□□□ 0.55
PKP3-209ENST00000533069 CIZ1Q9ULV3 898 aaPredicted RBP18.48■□□□□ 0.55
PKP3-209ENST00000533069 ARID2Q68CP9 1835 aa18.48■□□□□ 0.55
PKP3-209ENST00000533069 A0A087WWV3 80 aa18.47■□□□□ 0.55
PKP3-209ENST00000533069 CARNS1A5YM72 827 aa18.47■□□□□ 0.55
PKP3-209ENST00000533069 INO80B-WBP1J3KQ70 363 aa18.47■□□□□ 0.55
PKP3-209ENST00000533069 FGF18O76093 207 aa18.47■□□□□ 0.55
PKP3-209ENST00000533069 HOXA11P31270 313 aaPredicted RBP18.47■□□□□ 0.55
PKP3-209ENST00000533069 ATP2C1P98194 919 aaPredicted RBP18.47■□□□□ 0.55
PKP3-209ENST00000533069 CAMK1Q14012 370 aa18.47■□□□□ 0.55
PKP3-209ENST00000533069 KRT79Q5XKE5 535 aa18.47■□□□□ 0.55
PKP3-209ENST00000533069 GLB1LQ6UWU2 654 aa18.47■□□□□ 0.55
PKP3-209ENST00000533069 THNSL1Q8IYQ7 743 aa18.47■□□□□ 0.55
PKP3-209ENST00000533069 ADAMTS19Q8TE59 1207 aa18.47■□□□□ 0.55
PKP3-209ENST00000533069 SNX29Q8TEQ0 813 aa18.47■□□□□ 0.55
PKP3-209ENST00000533069 POF1BQ8WVV4 589 aa18.47■□□□□ 0.55
PKP3-209ENST00000533069 PABPC5Q96DU9 382 aaKnown RBP18.47■□□□□ 0.55
PKP3-209ENST00000533069 ZNF558Q96NG5 402 aa18.47■□□□□ 0.55
PKP3-209ENST00000533069 PCDHB2Q9Y5E7 798 aa18.47■□□□□ 0.55
PKP3-209ENST00000533069 CUL9Q8IWT3 2517 aa18.47■□□□□ 0.55
PKP3-209ENST00000533069 VCANP13611 3396 aa18.47■□□□□ 0.55
PKP3-209ENST00000533069 TSPAN1O60635 241 aa18.46■□□□□ 0.55
PKP3-209ENST00000533069 BMP1P13497 986 aa18.46■□□□□ 0.55
PKP3-209ENST00000533069 CYP11B2P19099 503 aa18.46■□□□□ 0.55
PKP3-209ENST00000533069 PLCB3Q01970 1234 aa18.46■□□□□ 0.55
PKP3-209ENST00000533069 MBTD1Q05BQ5 628 aa18.46■□□□□ 0.55
PKP3-209ENST00000533069 NOTUMQ6P988 496 aa18.46■□□□□ 0.55
PKP3-209ENST00000533069 LRRC55Q6ZSA7 311 aa18.46■□□□□ 0.55
PKP3-209ENST00000533069 BRAPQ7Z569 592 aa18.46■□□□□ 0.55
PKP3-209ENST00000533069 CNNM3Q8NE01 707 aa18.46■□□□□ 0.55
PKP3-209ENST00000533069 HCSTQ9UBK5 93 aa18.46■□□□□ 0.55
PKP3-209ENST00000533069 KIAA1024Q9UPX6 916 aa18.46■□□□□ 0.55
PKP3-209ENST00000533069 LZTS1Q9Y250 596 aa18.46■□□□□ 0.55
PKP3-209ENST00000533069 SPTBN5Q9NRC6 3674 aaKnown RBP18.46■□□□□ 0.55
PKP3-209ENST00000533069 CNTNAP2Q9UHC6 1331 aa18.46■□□□□ 0.55
PKP3-209ENST00000533069 KCNA5P22460 613 aa18.45■□□□□ 0.54
PKP3-209ENST00000533069 DNAJB1P25685 340 aa18.45■□□□□ 0.54
PKP3-209ENST00000533069 KCNQ1P51787 676 aa18.45■□□□□ 0.54
PKP3-209ENST00000533069 LEXMQ3ZCV2 418 aa18.45■□□□□ 0.54
PKP3-209ENST00000533069 ARL6IP4Q66PJ3 421 aaKnown RBP18.45■□□□□ 0.54
PKP3-209ENST00000533069 PDE12Q6L8Q7 609 aaKnown RBP18.45■□□□□ 0.54
PKP3-209ENST00000533069 KCNT2Q6UVM3 1135 aa18.45■□□□□ 0.54
PKP3-209ENST00000533069 MRPL10Q7Z7H8 261 aaKnown RBP18.45■□□□□ 0.54
PKP3-209ENST00000533069 C2orf40Q9H1Z8 148 aa18.45■□□□□ 0.54
PKP3-209ENST00000533069 GPRC5CQ9NQ84 441 aa18.45■□□□□ 0.54
PKP3-209ENST00000533069 DDX19AQ9NUU7 478 aaKnown RBP18.45■□□□□ 0.54
PKP3-209ENST00000533069 LRRIQ4A6NIV6 560 aa18.44■□□□□ 0.54
PKP3-209ENST00000533069 BMP15O95972 392 aa18.44■□□□□ 0.54
PKP3-209ENST00000533069 IL17AQ16552 155 aa18.44■□□□□ 0.54
PKP3-209ENST00000533069 ECM1Q16610 540 aa18.44■□□□□ 0.54
PKP3-209ENST00000533069 AMHR2Q16671 573 aa18.44■□□□□ 0.54
PKP3-209ENST00000533069 PUS10Q3MIT2 529 aaKnown RBP18.44■□□□□ 0.54
PKP3-209ENST00000533069 NOMO2Q5JPE7 1267 aa18.44■□□□□ 0.54
PKP3-209ENST00000533069 UBXN11Q5T124 520 aa18.44■□□□□ 0.54
PKP3-209ENST00000533069 CDCA2Q69YH5 1023 aaPredicted RBP18.44■□□□□ 0.54
PKP3-209ENST00000533069 MAEAQ7L5Y9 396 aa18.44■□□□□ 0.54
PKP3-209ENST00000533069 ZBTB8OSQ8IWT0 167 aa18.44■□□□□ 0.54
PKP3-209ENST00000533069 KCTD17Q8N5Z5 321 aa18.44■□□□□ 0.54
PKP3-209ENST00000533069 URGCPQ8TCY9 931 aa18.44■□□□□ 0.54
PKP3-209ENST00000533069 MRPS27Q92552 414 aaKnown RBP18.44■□□□□ 0.54
PKP3-209ENST00000533069 LPPQ93052 612 aa18.44■□□□□ 0.54
PKP3-209ENST00000533069 PRIMPOLQ96LW4 560 aa18.44■□□□□ 0.54
PKP3-209ENST00000533069 UHRF1Q96T88 793 aaPredicted RBP18.44■□□□□ 0.54
PKP3-209ENST00000533069 BHMT2Q9H2M3 363 aa18.44■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 17.7 ms