RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000531461.5

ACER3-211, Transcript of alkaline ceramidase 3, humanhuman

TSL 2

Gene ACER3, Length 1,292 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACER3-211ENST00000531461 AGPAT5Q9NUQ2 364 aa26.88■■□□□ 1.89
ACER3-211ENST00000531461 TPCN1Q9ULQ1 816 aa26.88■■□□□ 1.89
ACER3-211ENST00000531461 COL4A3BPQ9Y5P4 624 aa26.88■■□□□ 1.89
ACER3-211ENST00000531461 HCFC2Q9Y5Z7 792 aa26.88■■□□□ 1.89
ACER3-211ENST00000531461 TMEM221A6NGB7 291 aa26.87■■□□□ 1.89
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ACER3-211ENST00000531461 POLGP54098 1239 aaPredicted RBP26.87■■□□□ 1.89
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ACER3-211ENST00000531461 LLGL2Q6P1M3 1020 aa26.87■■□□□ 1.89
ACER3-211ENST00000531461 CEP170P1Q96L14 293 aa26.87■■□□□ 1.89
ACER3-211ENST00000531461 ZBP1Q9H171 429 aa26.87■■□□□ 1.89
ACER3-211ENST00000531461 TBC1D13Q9NVG8 400 aa26.87■■□□□ 1.89
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ACER3-211ENST00000531461 PIK3AP1Q6ZUJ8 805 aa26.86■■□□□ 1.89
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ACER3-211ENST00000531461 IGSF21Q96ID5 467 aa26.86■■□□□ 1.89
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ACER3-211ENST00000531461 SIGLEC14Q08ET2 396 aa26.85■■□□□ 1.89
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ACER3-211ENST00000531461 OXER1Q8TDS5 423 aa26.85■■□□□ 1.89
ACER3-211ENST00000531461 PSPC1Q8WXF1 523 aaKnown RBP26.85■■□□□ 1.89
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ACER3-211ENST00000531461 PBXIP1Q96AQ6 731 aa26.85■■□□□ 1.89
ACER3-211ENST00000531461 NECTIN4Q96NY8 510 aa26.85■■□□□ 1.89
ACER3-211ENST00000531461 LXNQ9BS40 222 aa26.85■■□□□ 1.89
ACER3-211ENST00000531461 ADAM7Q9H2U9 754 aa26.85■■□□□ 1.89
ACER3-211ENST00000531461 STK39Q9UEW8 545 aa26.85■■□□□ 1.89
ACER3-211ENST00000531461 ZDBF2Q9HCK1 2354 aa26.84■■□□□ 1.89
ACER3-211ENST00000531461 MEIS3P2A8K0S8 358 aa26.84■■□□□ 1.89
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ACER3-211ENST00000531461 CTDNEP1O95476 244 aa26.84■■□□□ 1.89
ACER3-211ENST00000531461 GALTP07902 379 aa26.84■■□□□ 1.89
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ACER3-211ENST00000531461 PTPN21Q16825 1174 aa26.83■■□□□ 1.89
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ACER3-211ENST00000531461 ZSWIM4Q9H7M6 989 aa26.83■■□□□ 1.89
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ACER3-211ENST00000531461 HOXA11P31270 313 aaPredicted RBP26.82■■□□□ 1.88
ACER3-211ENST00000531461 LAMTOR4Q0VGL1 99 aa26.82■■□□□ 1.88
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ACER3-211ENST00000531461 AGMOQ6ZNB7 445 aa26.82■■□□□ 1.88
ACER3-211ENST00000531461 POTEDQ86YR6 584 aa26.82■■□□□ 1.88
ACER3-211ENST00000531461 TMEM143Q96AN5 459 aa26.82■■□□□ 1.88
ACER3-211ENST00000531461 ASIC4Q96FT7 647 aa26.82■■□□□ 1.88
ACER3-211ENST00000531461 PRRX2Q99811 253 aa26.82■■□□□ 1.88
ACER3-211ENST00000531461 APOL5Q9BWW9 433 aa26.82■■□□□ 1.88
ACER3-211ENST00000531461 MINDY3Q9H8M7 445 aa26.82■■□□□ 1.88
ACER3-211ENST00000531461 DZANK1Q9NVP4 752 aa26.82■■□□□ 1.88
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ACER3-211ENST00000531461 CNTNAP2Q9UHC6 1331 aa26.82■■□□□ 1.88
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ACER3-211ENST00000531461 KANSL3Q9P2N6 904 aa26.81■■□□□ 1.88
ACER3-211ENST00000531461 INPP5FQ9Y2H2 1132 aa26.81■■□□□ 1.88
ACER3-211ENST00000531461 ZC3H11BA0A1B0GUI2 810 aaPredicted RBP26.8■■□□□ 1.88
ACER3-211ENST00000531461 MARCH6O60337 910 aa26.8■■□□□ 1.88
ACER3-211ENST00000531461 SRGAP2CP0DJJ0 459 aa26.8■■□□□ 1.88
ACER3-211ENST00000531461 FDPSP14324 419 aaKnown RBP26.8■■□□□ 1.88
ACER3-211ENST00000531461 MTHFRP42898 656 aa26.8■■□□□ 1.88
ACER3-211ENST00000531461 LONRF3Q496Y0 759 aa26.8■■□□□ 1.88
ACER3-211ENST00000531461 SUGP1Q8IWZ8 645 aaKnown RBP26.8■■□□□ 1.88
ACER3-211ENST00000531461 FBXL6Q8N531 539 aa26.8■■□□□ 1.88
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