RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000530005.5

SLC43A3-217, Transcript of solute carrier family 43 member 3, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene SLC43A3, Length 1,434 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC43A3-217ENST00000530005 KCNK18Q7Z418 384 aa21.48■■□□□ 1.03
SLC43A3-217ENST00000530005 P2RX5Q93086 422 aa21.48■■□□□ 1.03
SLC43A3-217ENST00000530005 C11orf84Q9BUA3 381 aaPredicted RBP21.48■■□□□ 1.03
SLC43A3-217ENST00000530005 BHMT2Q9H2M3 363 aa21.48■■□□□ 1.03
SLC43A3-217ENST00000530005 CWH43Q9H720 699 aa21.48■■□□□ 1.03
SLC43A3-217ENST00000530005 MTMR6Q9Y217 621 aa21.48■■□□□ 1.03
SLC43A3-217ENST00000530005 VWA3AA6NCI4 1184 aa21.47■■□□□ 1.03
SLC43A3-217ENST00000530005 GRM6O15303 877 aa21.47■■□□□ 1.03
SLC43A3-217ENST00000530005 ZNF623O75123 536 aa21.47■■□□□ 1.03
SLC43A3-217ENST00000530005 MBTD1Q05BQ5 628 aa21.47■■□□□ 1.03
SLC43A3-217ENST00000530005 PCBP1Q15365 356 aaKnown RBP eCLIP21.47■■□□□ 1.03
SLC43A3-217ENST00000530005 UBXN11Q5T124 520 aa21.47■■□□□ 1.03
SLC43A3-217ENST00000530005 TWF2Q6IBS0 349 aaKnown RBP21.47■■□□□ 1.03
SLC43A3-217ENST00000530005 BSNDQ8WZ55 320 aa21.47■■□□□ 1.03
SLC43A3-217ENST00000530005 FAM105AQ9NUU6 356 aa21.47■■□□□ 1.03
SLC43A3-217ENST00000530005 TYW1Q9NV66 732 aaKnown RBP21.47■■□□□ 1.03
SLC43A3-217ENST00000530005 PLAGL2Q9UPG8 496 aa21.47■■□□□ 1.03
SLC43A3-217ENST00000530005 BRWD1Q9NSI6 2320 aa21.47■■□□□ 1.03
SLC43A3-217ENST00000530005 E9PMD0 336 aa21.46■■□□□ 1.03
SLC43A3-217ENST00000530005 HOXA2O43364 376 aa21.46■■□□□ 1.03
SLC43A3-217ENST00000530005 TSPAN1O60635 241 aa21.46■■□□□ 1.03
SLC43A3-217ENST00000530005 EYA4O95677 639 aa21.46■■□□□ 1.03
SLC43A3-217ENST00000530005 CAMK1Q14012 370 aa21.46■■□□□ 1.03
SLC43A3-217ENST00000530005 SF3A1Q15459 793 aaKnown RBP21.46■■□□□ 1.03
SLC43A3-217ENST00000530005 CDCA2Q69YH5 1023 aaPredicted RBP21.46■■□□□ 1.03
SLC43A3-217ENST00000530005 PNMA5Q96PV4 448 aa21.46■■□□□ 1.03
SLC43A3-217ENST00000530005 MEIS3P2A8K0S8 358 aa21.46■■□□□ 1.03
SLC43A3-217ENST00000530005 BMP15O95972 392 aa21.46■■□□□ 1.03
SLC43A3-217ENST00000530005 NAALADL2Q58DX5 795 aa21.46■■□□□ 1.03
SLC43A3-217ENST00000530005 RNF169Q8NCN4 708 aa21.46■■□□□ 1.03
SLC43A3-217ENST00000530005 INO80B-WBP1J3KQ70 363 aa21.45■■□□□ 1.02
SLC43A3-217ENST00000530005 ITGB1P05556 798 aa21.45■■□□□ 1.02
SLC43A3-217ENST00000530005 SKIP12755 728 aa21.45■■□□□ 1.02
SLC43A3-217ENST00000530005 RAB27AP51159 221 aa21.45■■□□□ 1.02
SLC43A3-217ENST00000530005 GRIN1Q05586 938 aa21.45■■□□□ 1.02
SLC43A3-217ENST00000530005 PTPAQ15257 358 aa21.45■■□□□ 1.02
SLC43A3-217ENST00000530005 PTPROQ16827 1216 aa21.45■■□□□ 1.02
SLC43A3-217ENST00000530005 FAM173BQ6P4H8 233 aa21.45■■□□□ 1.02
SLC43A3-217ENST00000530005 MRPL10Q7Z7H8 261 aaKnown RBP21.45■■□□□ 1.02
SLC43A3-217ENST00000530005 KLHL23Q8NBE8 558 aa21.45■■□□□ 1.02
SLC43A3-217ENST00000530005 SPPL3Q8TCT6 385 aa21.45■■□□□ 1.02
SLC43A3-217ENST00000530005 LPPQ93052 612 aa21.45■■□□□ 1.02
SLC43A3-217ENST00000530005 LMAN2LQ9H0V9 348 aa21.45■■□□□ 1.02
SLC43A3-217ENST00000530005 THEGQ9P2T0 379 aa21.45■■□□□ 1.02
SLC43A3-217ENST00000530005 DNM3Q9UQ16 869 aa21.45■■□□□ 1.02
SLC43A3-217ENST00000530005 PCDHB2Q9Y5E7 798 aa21.45■■□□□ 1.02
SLC43A3-217ENST00000530005 CLIC4Q9Y696 253 aa21.45■■□□□ 1.02
SLC43A3-217ENST00000530005 STX6O43752 255 aa21.44■■□□□ 1.02
SLC43A3-217ENST00000530005 ERLIN2O94905 339 aa21.44■■□□□ 1.02
SLC43A3-217ENST00000530005 DNAJB1P25685 340 aa21.44■■□□□ 1.02
SLC43A3-217ENST00000530005 AXLP30530 894 aa21.44■■□□□ 1.02
SLC43A3-217ENST00000530005 HSCBQ8IWL3 235 aa21.44■■□□□ 1.02
SLC43A3-217ENST00000530005 HELQQ8TDG4 1101 aa21.44■■□□□ 1.02
SLC43A3-217ENST00000530005 AK8Q96MA6 479 aa21.44■■□□□ 1.02
SLC43A3-217ENST00000530005 POLD4Q9HCU8 107 aa21.44■■□□□ 1.02
SLC43A3-217ENST00000530005 ALG13Q9NP73 1137 aaKnown RBP21.44■■□□□ 1.02
SLC43A3-217ENST00000530005 PLXNA4Q9HCM2 1894 aa21.43■■□□□ 1.02
SLC43A3-217ENST00000530005 LRRIQ4A6NIV6 560 aa21.43■■□□□ 1.02
SLC43A3-217ENST00000530005 B4GALT5O43286 388 aa21.43■■□□□ 1.02
SLC43A3-217ENST00000530005 ARF4P18085 180 aaPredicted RBP21.43■■□□□ 1.02
SLC43A3-217ENST00000530005 TMEM119Q4V9L6 283 aa21.43■■□□□ 1.02
SLC43A3-217ENST00000530005 PPP4R3CPQ6ZMV5 832 aa21.43■■□□□ 1.02
SLC43A3-217ENST00000530005 AGMOQ6ZNB7 445 aa21.43■■□□□ 1.02
SLC43A3-217ENST00000530005 C1orf186Q6ZWK4 172 aa21.43■■□□□ 1.02
SLC43A3-217ENST00000530005 ABI1Q8IZP0 508 aa21.43■■□□□ 1.02
SLC43A3-217ENST00000530005 DAW1Q8N136 415 aa21.43■■□□□ 1.02
SLC43A3-217ENST00000530005 LRRC43Q8N309 656 aa21.43■■□□□ 1.02
SLC43A3-217ENST00000530005 KCTD17Q8N5Z5 321 aa21.43■■□□□ 1.02
SLC43A3-217ENST00000530005 COLGALT1Q8NBJ5 622 aa21.43■■□□□ 1.02
SLC43A3-217ENST00000530005 CCDC51Q96ER9 411 aa21.43■■□□□ 1.02
SLC43A3-217ENST00000530005 CPB2Q96IY4 423 aa21.43■■□□□ 1.02
SLC43A3-217ENST00000530005 RUSC1Q9BVN2 902 aa21.43■■□□□ 1.02
SLC43A3-217ENST00000530005 FZD8Q9H461 694 aa21.43■■□□□ 1.02
SLC43A3-217ENST00000530005 NAMPTP43490 491 aa21.42■■□□□ 1.02
SLC43A3-217ENST00000530005 FAM187BQ17R55 369 aa21.42■■□□□ 1.02
SLC43A3-217ENST00000530005 LONRF3Q496Y0 759 aa21.42■■□□□ 1.02
SLC43A3-217ENST00000530005 TIGD5Q53EQ6 642 aa21.42■■□□□ 1.02
SLC43A3-217ENST00000530005 RINT1Q6NUQ1 792 aa21.42■■□□□ 1.02
SLC43A3-217ENST00000530005 SMG8Q8ND04 991 aaKnown RBP21.42■■□□□ 1.02
SLC43A3-217ENST00000530005 LRRC15Q8TF66 581 aa21.42■■□□□ 1.02
SLC43A3-217ENST00000530005 ATXN2LQ8WWM7 1075 aaKnown RBP21.42■■□□□ 1.02
SLC43A3-217ENST00000530005 RSPH1Q8WYR4 309 aa21.42■■□□□ 1.02
SLC43A3-217ENST00000530005 EIF2AQ9BY44 585 aaKnown RBP21.42■■□□□ 1.02
SLC43A3-217ENST00000530005 CCDC113Q9H0I3 377 aa21.42■■□□□ 1.02
SLC43A3-217ENST00000530005 SLC26A4O43511 780 aa21.41■■□□□ 1.02
SLC43A3-217ENST00000530005 OFD1O75665 1012 aa21.41■■□□□ 1.02
SLC43A3-217ENST00000530005 LAG3P18627 525 aa21.41■■□□□ 1.02
SLC43A3-217ENST00000530005 NCLP19338 710 aaKnown RBP21.41■■□□□ 1.02
SLC43A3-217ENST00000530005 MAPK7Q13164 816 aa21.41■■□□□ 1.02
SLC43A3-217ENST00000530005 COL19A1Q14993 1142 aa21.41■■□□□ 1.02
SLC43A3-217ENST00000530005 TCEAL5Q5H9L2 206 aa21.41■■□□□ 1.02
SLC43A3-217ENST00000530005 NOTUMQ6P988 496 aa21.41■■□□□ 1.02
SLC43A3-217ENST00000530005 CABP7Q86V35 215 aa21.41■■□□□ 1.02
SLC43A3-217ENST00000530005 KIFAP3Q92845 792 aa21.41■■□□□ 1.02
SLC43A3-217ENST00000530005 NT5C3AQ9H0P0 336 aa21.41■■□□□ 1.02
SLC43A3-217ENST00000530005 CSRNP2Q9H175 543 aa21.41■■□□□ 1.02
SLC43A3-217ENST00000530005 AAASQ9NRG9 546 aa21.41■■□□□ 1.02
SLC43A3-217ENST00000530005 PCDHB12Q9Y5F1 795 aa21.41■■□□□ 1.02
SLC43A3-217ENST00000530005 TTLL13PA6NNM8 815 aa21.4■■□□□ 1.02
SLC43A3-217ENST00000530005 LONP1P36776 959 aaKnown RBP21.4■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 15.4 ms