RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000529998.5

UBASH3B-205, Transcript of ubiquitin associated and SH3 domain containing B, humanhuman

TSL 4

Gene UBASH3B, Length 698 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBASH3B-205ENST00000529998 MBTD1Q05BQ5 628 aa9.61□□□□□ -0.87
UBASH3B-205ENST00000529998 RAB30Q15771 203 aa9.61□□□□□ -0.87
UBASH3B-205ENST00000529998 RRAGBQ5VZM2 374 aa9.61□□□□□ -0.87
UBASH3B-205ENST00000529998 GPR153Q6NV75 609 aa9.61□□□□□ -0.87
UBASH3B-205ENST00000529998 SLC24A5Q71RS6 500 aa9.61□□□□□ -0.87
UBASH3B-205ENST00000529998 CATSPER4Q7RTX7 472 aa9.61□□□□□ -0.87
UBASH3B-205ENST00000529998 GPBP1Q86WP2 473 aa9.61□□□□□ -0.87
UBASH3B-205ENST00000529998 PDILTQ8N807 584 aa9.61□□□□□ -0.87
UBASH3B-205ENST00000529998 LEO1Q8WVC0 666 aaPredicted RBP9.61□□□□□ -0.87
UBASH3B-205ENST00000529998 LARP4BQ92615 738 aaKnown RBP9.61□□□□□ -0.87
UBASH3B-205ENST00000529998 KIFAP3Q92845 792 aa9.61□□□□□ -0.87
UBASH3B-205ENST00000529998 TIFAQ96CG3 184 aa9.61□□□□□ -0.87
UBASH3B-205ENST00000529998 SPATA32Q96LK8 384 aa9.61□□□□□ -0.87
UBASH3B-205ENST00000529998 RAD9AQ99638 391 aa9.61□□□□□ -0.87
UBASH3B-205ENST00000529998 NFKBIZQ9BYH8 718 aa9.61□□□□□ -0.87
UBASH3B-205ENST00000529998 TTYH1Q9H313 450 aaPredicted RBP9.61□□□□□ -0.87
UBASH3B-205ENST00000529998 CCDC39Q9UFE4 941 aa9.61□□□□□ -0.87
UBASH3B-205ENST00000529998 ATP6V1DQ9Y5K8 247 aa9.61□□□□□ -0.87
UBASH3B-205ENST00000529998 NLRC5Q86WI3 1866 aa9.61□□□□□ -0.87
UBASH3B-205ENST00000529998 ADGRA3Q8IWK6 1321 aa9.6□□□□□ -0.87
UBASH3B-205ENST00000529998 INO80B-WBP1J3KQ70 363 aa9.6□□□□□ -0.87
UBASH3B-205ENST00000529998 TSPAN1O60635 241 aa9.6□□□□□ -0.87
UBASH3B-205ENST00000529998 TXLNAP40222 546 aa9.6□□□□□ -0.87
UBASH3B-205ENST00000529998 NAMPTP43490 491 aa9.6□□□□□ -0.87
UBASH3B-205ENST00000529998 SARSP49591 514 aaKnown RBP9.6□□□□□ -0.87
UBASH3B-205ENST00000529998 PEX3P56589 373 aa9.6□□□□□ -0.87
UBASH3B-205ENST00000529998 GIT2Q14161 759 aa9.6□□□□□ -0.87
UBASH3B-205ENST00000529998 AMHR2Q16671 573 aa9.6□□□□□ -0.87
UBASH3B-205ENST00000529998 RESP18Q5W5W9 173 aa9.6□□□□□ -0.87
UBASH3B-205ENST00000529998 CDCA2Q69YH5 1023 aaPredicted RBP9.6□□□□□ -0.87
UBASH3B-205ENST00000529998 FAM43BQ6ZT52 329 aaPredicted RBP9.6□□□□□ -0.87
UBASH3B-205ENST00000529998 SPRED2Q7Z698 418 aa9.6□□□□□ -0.87
UBASH3B-205ENST00000529998 IFT74Q96LB3 600 aa9.6□□□□□ -0.87
UBASH3B-205ENST00000529998 FAM161BQ96MY7 647 aa9.6□□□□□ -0.87
UBASH3B-205ENST00000529998 KIFC3Q9BVG8 833 aa9.6□□□□□ -0.87
UBASH3B-205ENST00000529998 SEMA6BQ9H3T3 888 aa9.6□□□□□ -0.87
UBASH3B-205ENST00000529998 GDPD2Q9HCC8 539 aa9.6□□□□□ -0.87
UBASH3B-205ENST00000529998 CHST12Q9NRB3 414 aa9.6□□□□□ -0.87
UBASH3B-205ENST00000529998 C1orf112Q9NSG2 853 aa9.6□□□□□ -0.87
UBASH3B-205ENST00000529998 AGPAT5Q9NUQ2 364 aa9.6□□□□□ -0.87
UBASH3B-205ENST00000529998 KCND2Q9NZV8 630 aa9.6□□□□□ -0.87
UBASH3B-205ENST00000529998 STK17AQ9UEE5 414 aa9.6□□□□□ -0.87
UBASH3B-205ENST00000529998 PIN4Q9Y237 131 aaKnown RBP9.6□□□□□ -0.87
UBASH3B-205ENST00000529998 INSL6Q9Y581 213 aa9.6□□□□□ -0.87
UBASH3B-205ENST00000529998 KIAA1671Q9BY89 1806 aa9.6□□□□□ -0.87
UBASH3B-205ENST00000529998 CDH23Q9H251 3354 aa9.59□□□□□ -0.87
UBASH3B-205ENST00000529998 A0A0U1RQF3 1178 aa9.59□□□□□ -0.87
UBASH3B-205ENST00000529998 TTLL13PA6NNM8 815 aa9.59□□□□□ -0.87
UBASH3B-205ENST00000529998 CCDC169A6NNP5 214 aa9.59□□□□□ -0.87
UBASH3B-205ENST00000529998 B4GALT5O43286 388 aa9.59□□□□□ -0.87
UBASH3B-205ENST00000529998 DGKIO75912 1065 aa9.59□□□□□ -0.87
UBASH3B-205ENST00000529998 ERLIN2O94905 339 aa9.59□□□□□ -0.87
UBASH3B-205ENST00000529998 EDN1P05305 212 aa9.59□□□□□ -0.87
UBASH3B-205ENST00000529998 ATF7P17544 494 aaPredicted RBP9.59□□□□□ -0.87
UBASH3B-205ENST00000529998 ARF4P18085 180 aaPredicted RBP9.59□□□□□ -0.87
UBASH3B-205ENST00000529998 STAT6P42226 847 aa9.59□□□□□ -0.87
UBASH3B-205ENST00000529998 NPTX2P47972 431 aa9.59□□□□□ -0.87
UBASH3B-205ENST00000529998 GATMP50440 423 aa9.59□□□□□ -0.87
UBASH3B-205ENST00000529998 TAP1Q03518 808 aa9.59□□□□□ -0.87
UBASH3B-205ENST00000529998 PPP2R5AQ15172 486 aa9.59□□□□□ -0.87
UBASH3B-205ENST00000529998 E2F4Q16254 413 aa9.59□□□□□ -0.87
UBASH3B-205ENST00000529998 UBXN11Q5T124 520 aa9.59□□□□□ -0.87
UBASH3B-205ENST00000529998 ZNF697Q5TEC3 545 aa9.59□□□□□ -0.87
UBASH3B-205ENST00000529998 TWF2Q6IBS0 349 aaKnown RBP9.59□□□□□ -0.87
UBASH3B-205ENST00000529998 CCDC73Q6ZRK6 1079 aa9.59□□□□□ -0.87
UBASH3B-205ENST00000529998 CDR2LQ86X02 465 aaPredicted RBP9.59□□□□□ -0.87
UBASH3B-205ENST00000529998 ECHDC2Q86YB7 292 aa9.59□□□□□ -0.87
UBASH3B-205ENST00000529998 NPAS4Q8IUM7 802 aa9.59□□□□□ -0.87
UBASH3B-205ENST00000529998 DEFB123Q8N688 67 aa9.59□□□□□ -0.87
UBASH3B-205ENST00000529998 DEPTORQ8TB45 409 aa9.59□□□□□ -0.87
UBASH3B-205ENST00000529998 STAMQ92783 540 aa9.59□□□□□ -0.87
UBASH3B-205ENST00000529998 ZNF689Q96CS4 500 aaPredicted RBP9.59□□□□□ -0.87
UBASH3B-205ENST00000529998 CPB2Q96IY4 423 aa9.59□□□□□ -0.87
UBASH3B-205ENST00000529998 DRC1Q96MC2 740 aa9.59□□□□□ -0.87
UBASH3B-205ENST00000529998 YME1L1Q96TA2 773 aa9.59□□□□□ -0.87
UBASH3B-205ENST00000529998 REEP2Q9BRK0 252 aa9.59□□□□□ -0.87
UBASH3B-205ENST00000529998 NTPCRQ9BSD7 190 aaKnown RBP9.59□□□□□ -0.87
UBASH3B-205ENST00000529998 TIPINQ9BVW5 301 aa9.59□□□□□ -0.87
UBASH3B-205ENST00000529998 SCAND2PQ9GZW5 306 aaPredicted RBP9.59□□□□□ -0.87
UBASH3B-205ENST00000529998 CCDC113Q9H0I3 377 aa9.59□□□□□ -0.87
UBASH3B-205ENST00000529998 FZD8Q9H461 694 aa9.59□□□□□ -0.87
UBASH3B-205ENST00000529998 ZNF576Q9H609 170 aa9.59□□□□□ -0.87
UBASH3B-205ENST00000529998 SLC28A3Q9HAS3 691 aa9.59□□□□□ -0.87
UBASH3B-205ENST00000529998 RC3H2Q9HBD1 1191 aaKnown RBP9.59□□□□□ -0.87
UBASH3B-205ENST00000529998 TSHZ2Q9NRE2 1034 aa9.59□□□□□ -0.87
UBASH3B-205ENST00000529998 DACT1Q9NYF0 836 aa9.59□□□□□ -0.87
UBASH3B-205ENST00000529998 LRFN2Q9ULH4 789 aa9.59□□□□□ -0.87
UBASH3B-205ENST00000529998 USP20Q9Y2K6 914 aa9.59□□□□□ -0.87
UBASH3B-205ENST00000529998 RBM19Q9Y4C8 960 aaKnown RBP9.59□□□□□ -0.87
UBASH3B-205ENST00000529998 PCDHB7Q9Y5E2 793 aa9.59□□□□□ -0.87
UBASH3B-205ENST00000529998 TRANK1O15050 2925 aa9.59□□□□□ -0.87
UBASH3B-205ENST00000529998 RALGAPA2Q2PPJ7 1873 aa9.58□□□□□ -0.88
UBASH3B-205ENST00000529998 LINC01553A4QN01 128 aa9.58□□□□□ -0.88
UBASH3B-205ENST00000529998 MYMKA6NI61 221 aa9.58□□□□□ -0.88
UBASH3B-205ENST00000529998 SLC16A4O15374 487 aa9.58□□□□□ -0.88
UBASH3B-205ENST00000529998 POLR2DO15514 142 aaKnown RBP9.58□□□□□ -0.88
UBASH3B-205ENST00000529998 STAG3L1P0CL83 205 aa9.58□□□□□ -0.88
UBASH3B-205ENST00000529998 FGFR1P11362 822 aa9.58□□□□□ -0.88
UBASH3B-205ENST00000529998 PLS3P13797 630 aa9.58□□□□□ -0.88
UBASH3B-205ENST00000529998 LIG1P18858 919 aa9.58□□□□□ -0.88
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 20.6 ms