RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000527265.1

CLNS1A-208, Transcript of chloride nucleotide-sensitive channel 1A, human

TSL 2

Gene CLNS1A, Length 620 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CLNS1A-208	ENST00000527265	VAV1	P15498	845 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CLNS1A-208	ENST00000527265	BMP8B	P34820	402 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CLNS1A-208	ENST00000527265	LIMS1	P48059	325 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CLNS1A-208	ENST00000527265	FXR1	P51114	621 aa	Known RBP eCLIP	4.57	□□□□□ -1.68
CLNS1A-208	ENST00000527265	NCKAP1L	P55160	1127 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CLNS1A-208	ENST00000527265	RTP1	P59025	263 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CLNS1A-208	ENST00000527265	TNFAIP2	Q03169	654 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CLNS1A-208	ENST00000527265	BTK	Q06187	659 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CLNS1A-208	ENST00000527265	PDE1C	Q14123	709 aa	Predicted RBP	4.57	□□□□□ -1.68
CLNS1A-208	ENST00000527265	TARBP2	Q15633	366 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
CLNS1A-208	ENST00000527265	ALDH1L2	Q3SY69	923 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CLNS1A-208	ENST00000527265	MZT2B	Q6NZ67	158 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CLNS1A-208	ENST00000527265	FAM180B	Q6P0A1	224 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CLNS1A-208	ENST00000527265	GALNT18	Q6P9A2	607 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CLNS1A-208	ENST00000527265	LIPI	Q6XZB0	460 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CLNS1A-208	ENST00000527265	GRAMD1C	Q8IYS0	662 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CLNS1A-208	ENST00000527265	EFHB	Q8N7U6	833 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CLNS1A-208	ENST00000527265	NSUN6	Q8TEA1	469 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
CLNS1A-208	ENST00000527265	JADE3	Q92613	823 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CLNS1A-208	ENST00000527265	TRIM63	Q969Q1	353 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CLNS1A-208	ENST00000527265	PHF20	Q9BVI0	1012 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CLNS1A-208	ENST00000527265	LRRC27	Q9C0I9	530 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CLNS1A-208	ENST00000527265	OSBPL5	Q9H0X9	879 aa	Predicted RBP	4.57	□□□□□ -1.68
CLNS1A-208	ENST00000527265	MYLK2	Q9H1R3	596 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CLNS1A-208	ENST00000527265	VPS11	Q9H270	941 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CLNS1A-208	ENST00000527265	BHMT2	Q9H2M3	363 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CLNS1A-208	ENST00000527265	IFT122	Q9HBG6	1241 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CLNS1A-208	ENST00000527265	AGO4	Q9HCK5	861 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
CLNS1A-208	ENST00000527265	OXSM	Q9NWU1	459 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CLNS1A-208	ENST00000527265	GPRC5B	Q9NZH0	403 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CLNS1A-208	ENST00000527265	KLHL14	Q9P2G3	628 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CLNS1A-208	ENST00000527265	CDC23	Q9UJX2	597 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CLNS1A-208	ENST00000527265	C2orf71	A6NGG8	1288 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CLNS1A-208	ENST00000527265	NUDT19	A8MXV4	375 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CLNS1A-208	ENST00000527265	AURKA	O14965	403 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CLNS1A-208	ENST00000527265	TUSC2	O75896	110 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CLNS1A-208	ENST00000527265	ZNF205	O95201	554 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CLNS1A-208	ENST00000527265	TBC1D8	O95759	1140 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CLNS1A-208	ENST00000527265	EFEMP2	O95967	443 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CLNS1A-208	ENST00000527265	SRGAP2C	P0DJJ0	459 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CLNS1A-208	ENST00000527265	IFNGR1	P15260	489 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CLNS1A-208	ENST00000527265	PPM1A	P35813	382 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CLNS1A-208	ENST00000527265	ACVRL1	P37023	503 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CLNS1A-208	ENST00000527265	PCBP3	P57721	371 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
CLNS1A-208	ENST00000527265	NUCB1	Q02818	461 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CLNS1A-208	ENST00000527265	SCRN1	Q12765	414 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CLNS1A-208	ENST00000527265	MIER2	Q8N344	545 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CLNS1A-208	ENST00000527265	TTC30B	Q8N4P2	665 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CLNS1A-208	ENST00000527265	USHBP1	Q8N6Y0	703 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CLNS1A-208	ENST00000527265	LINC00116	Q8NCU8	138 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CLNS1A-208	ENST00000527265	KREMEN2	Q8NCW0	462 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CLNS1A-208	ENST00000527265	GIMAP8	Q8ND71	665 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
CLNS1A-208	ENST00000527265	LMBR1	Q8WVP7	490 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CLNS1A-208	ENST00000527265	KIAA1191	Q96A73	305 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CLNS1A-208	ENST00000527265	TMEM169	Q96HH4	297 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CLNS1A-208	ENST00000527265	FCRL3	Q96P31	734 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
CLNS1A-208	ENST00000527265	MAP3K14	Q99558	947 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CLNS1A-208	ENST00000527265	ZFYVE21	Q9BQ24	234 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CLNS1A-208	ENST00000527265	SLC12A9	Q9BXP2	914 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CLNS1A-208	ENST00000527265	FOXP3	Q9BZS1	431 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CLNS1A-208	ENST00000527265	TMEM60	Q9H2L4	133 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CLNS1A-208	ENST00000527265	MS4A5	Q9H3V2	200 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CLNS1A-208	ENST00000527265	RASSF1	Q9NS23	344 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CLNS1A-208	ENST00000527265	GJD2	Q9UKL4	321 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CLNS1A-208	ENST00000527265	TCFL5	Q9UL49	500 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CLNS1A-208	ENST00000527265	ZNF281	Q9Y2X9	895 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CLNS1A-208	ENST00000527265	CTDP1	Q9Y5B0	961 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
CLNS1A-208	ENST00000527265	GOLGA8A	A7E2F4	631 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CLNS1A-208	ENST00000527265	GOLGA8B	A8MQT2	603 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CLNS1A-208	ENST00000527265	FKTN	O75072	461 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CLNS1A-208	ENST00000527265	MBD4	O95243	580 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CLNS1A-208	ENST00000527265	THBD	P07204	575 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CLNS1A-208	ENST00000527265	POU2F2	P09086	479 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CLNS1A-208	ENST00000527265	MSL3P1	P0C860	447 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CLNS1A-208	ENST00000527265	CAPN3	P20807	821 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CLNS1A-208	ENST00000527265	ABCB4	P21439	1286 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CLNS1A-208	ENST00000527265	C5AR1	P21730	350 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CLNS1A-208	ENST00000527265	GRK2	P25098	689 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CLNS1A-208	ENST00000527265	PEX2	P28328	305 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CLNS1A-208	ENST00000527265	NOP2	P46087	812 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
CLNS1A-208	ENST00000527265	PRIM2	P49643	509 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CLNS1A-208	ENST00000527265	ADK	P55263	362 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
CLNS1A-208	ENST00000527265	GPR85	P60893	370 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CLNS1A-208	ENST00000527265	PPFIA1	Q13136	1202 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CLNS1A-208	ENST00000527265	TERF2	Q15554	542 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CLNS1A-208	ENST00000527265	DGKK	Q5KSL6	1271 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CLNS1A-208	ENST00000527265	INTS11	Q5TA45	600 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
CLNS1A-208	ENST00000527265	ZKSCAN2	Q63HK3	967 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CLNS1A-208	ENST00000527265	DARS2	Q6PI48	645 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
CLNS1A-208	ENST00000527265	ZC3H14	Q6PJT7	736 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
CLNS1A-208	ENST00000527265	OVCH1	Q7RTY7	1134 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CLNS1A-208	ENST00000527265	DENND1C	Q8IV53	801 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CLNS1A-208	ENST00000527265	PPIL6	Q8IXY8	311 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CLNS1A-208	ENST00000527265	KIAA0319L	Q8IZA0	1049 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CLNS1A-208	ENST00000527265	KRT78	Q8N1N4	520 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CLNS1A-208	ENST00000527265	CAMKK1	Q8N5S9	505 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CLNS1A-208	ENST00000527265	PCDH19	Q8TAB3	1148 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CLNS1A-208	ENST00000527265	PUM2	Q8TB72	1066 aa	Known RBP eCLIP	4.55	□□□□□ -1.68
CLNS1A-208	ENST00000527265	SH3RF3	Q8TEJ3	882 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
CLNS1A-208	ENST00000527265	COPS5	Q92905	334 aa		4.55	□□□□□ -1.68

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