RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000515753.1

HERC4-215, Transcript of HECT and RLD domain containing E3 ubiquitin protein ligase 4, human

TSL 2

Gene HERC4, Length 589 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
HERC4-215	ENST00000515753	TTC38	Q5R3I4	469 aa		4.62	□□□□□ -1.67
HERC4-215	ENST00000515753	GAREM2	Q75VX8	874 aa		4.62	□□□□□ -1.67
HERC4-215	ENST00000515753	KANSL1	Q7Z3B3	1105 aa		4.62	□□□□□ -1.67
HERC4-215	ENST00000515753	PHYKPL	Q8IUZ5	450 aa		4.62	□□□□□ -1.67
HERC4-215	ENST00000515753	RABGGTA	Q92696	567 aa		4.62	□□□□□ -1.67
HERC4-215	ENST00000515753	MPHOSPH9	Q99550	1183 aa		4.62	□□□□□ -1.67
HERC4-215	ENST00000515753	PITHD1	Q9GZP4	211 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
HERC4-215	ENST00000515753	NRDE2	Q9H7Z3	1164 aa		4.62	□□□□□ -1.67
HERC4-215	ENST00000515753	XPO5	Q9HAV4	1204 aa	Known RBP eCLIP	4.62	□□□□□ -1.67
HERC4-215	ENST00000515753	PRKAB1	Q9Y478	270 aa		4.62	□□□□□ -1.67
HERC4-215	ENST00000515753	RBM8A	Q9Y5S9	174 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
HERC4-215	ENST00000515753	C2orf78	A6NCI8	922 aa		4.61	□□□□□ -1.67
HERC4-215	ENST00000515753	FOXN1	O15353	648 aa		4.61	□□□□□ -1.67
HERC4-215	ENST00000515753	TGM5	O43548	720 aa		4.61	□□□□□ -1.67
HERC4-215	ENST00000515753	MYCLP1	P12525	358 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
HERC4-215	ENST00000515753	SLC9A1	P19634	815 aa		4.61	□□□□□ -1.67
HERC4-215	ENST00000515753	BMP5	P22003	454 aa		4.61	□□□□□ -1.67
HERC4-215	ENST00000515753	ADCYAP1R1	P41586	468 aa		4.61	□□□□□ -1.67
HERC4-215	ENST00000515753	SCNN1B	P51168	640 aa		4.61	□□□□□ -1.67
HERC4-215	ENST00000515753	ADCY7	P51828	1080 aa		4.61	□□□□□ -1.67
HERC4-215	ENST00000515753	BCAR1	P56945	870 aa		4.61	□□□□□ -1.67
HERC4-215	ENST00000515753	COL10A1	Q03692	680 aa		4.61	□□□□□ -1.67
HERC4-215	ENST00000515753	MYBPC3	Q14896	1274 aa		4.61	□□□□□ -1.67
HERC4-215	ENST00000515753	EGFLAM	Q63HQ2	1017 aa		4.61	□□□□□ -1.67
HERC4-215	ENST00000515753	LAIR1	Q6GTX8	287 aa		4.61	□□□□□ -1.67
HERC4-215	ENST00000515753	SLFN12L	Q6IEE8	588 aa		4.61	□□□□□ -1.67
HERC4-215	ENST00000515753	DPY19L2P1	Q6NXN4	242 aa		4.61	□□□□□ -1.67
HERC4-215	ENST00000515753	PASD1	Q8IV76	773 aa		4.61	□□□□□ -1.67
HERC4-215	ENST00000515753	ANKRD35	Q8N283	1001 aa		4.61	□□□□□ -1.67
HERC4-215	ENST00000515753	ANKRD53	Q8N9V6	530 aa		4.61	□□□□□ -1.67
HERC4-215	ENST00000515753	OR5AN1	Q8NGI8	311 aa		4.61	□□□□□ -1.67
HERC4-215	ENST00000515753	CHTF18	Q8WVB6	975 aa		4.61	□□□□□ -1.67
HERC4-215	ENST00000515753	LPP	Q93052	612 aa		4.61	□□□□□ -1.67
HERC4-215	ENST00000515753	PUS7	Q96PZ0	661 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
HERC4-215	ENST00000515753	GPHA2	Q96T91	129 aa		4.61	□□□□□ -1.67
HERC4-215	ENST00000515753	PRRX2	Q99811	253 aa		4.61	□□□□□ -1.67
HERC4-215	ENST00000515753	IFT57	Q9NWB7	429 aa		4.61	□□□□□ -1.67
HERC4-215	ENST00000515753	KCMF1	Q9P0J7	381 aa		4.61	□□□□□ -1.67
HERC4-215	ENST00000515753	TNFRSF18	Q9Y5U5	241 aa		4.61	□□□□□ -1.67
HERC4-215	ENST00000515753	CLSTN1	O94985	981 aa		4.6	□□□□□ -1.67
HERC4-215	ENST00000515753	SOX5	P35711	763 aa		4.6	□□□□□ -1.67
HERC4-215	ENST00000515753	KPNA1	P52294	538 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
HERC4-215	ENST00000515753	SESN2	P58004	480 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
HERC4-215	ENST00000515753	ANTXR2	P58335	489 aa		4.6	□□□□□ -1.67
HERC4-215	ENST00000515753	SLC6A3	Q01959	620 aa		4.6	□□□□□ -1.67
HERC4-215	ENST00000515753	ELAVL1	Q15717	326 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
HERC4-215	ENST00000515753	KLHDC10	Q6PID8	442 aa		4.6	□□□□□ -1.67
HERC4-215	ENST00000515753	KRT26	Q7Z3Y9	468 aa		4.6	□□□□□ -1.67
HERC4-215	ENST00000515753	BMP8A	Q7Z5Y6	402 aa		4.6	□□□□□ -1.67
HERC4-215	ENST00000515753	GSPT2	Q8IYD1	628 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
HERC4-215	ENST00000515753	NXPE1	Q8N323	547 aa		4.6	□□□□□ -1.67
HERC4-215	ENST00000515753	C7orf31	Q8N865	590 aa		4.6	□□□□□ -1.67
HERC4-215	ENST00000515753	ZNF610	Q8N9Z0	462 aa		4.6	□□□□□ -1.67
HERC4-215	ENST00000515753	GPR150	Q8NGU9	434 aa		4.6	□□□□□ -1.67
HERC4-215	ENST00000515753	MIEF2	Q96C03	454 aa		4.6	□□□□□ -1.67
HERC4-215	ENST00000515753	PGBD4	Q96DM1	585 aa		4.6	□□□□□ -1.67
HERC4-215	ENST00000515753	CAAP1	Q9H8G2	361 aa		4.6	□□□□□ -1.67
HERC4-215	ENST00000515753	TOMM22	Q9NS69	142 aa		4.6	□□□□□ -1.67
HERC4-215	ENST00000515753	THG1L	Q9NWX6	298 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
HERC4-215	ENST00000515753	H2AFY2	Q9P0M6	372 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
HERC4-215	ENST00000515753	APOBEC2	Q9Y235	224 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
HERC4-215	ENST00000515753	UBE2QL1	A1L167	161 aa		4.59	□□□□□ -1.67
HERC4-215	ENST00000515753	GOLGA8B	A8MQT2	603 aa		4.59	□□□□□ -1.67
HERC4-215	ENST00000515753	MAFG	O15525	162 aa		4.59	□□□□□ -1.67
HERC4-215	ENST00000515753	ZEB2	O60315	1214 aa		4.59	□□□□□ -1.67
HERC4-215	ENST00000515753	FKBP9	O95302	570 aa		4.59	□□□□□ -1.67
HERC4-215	ENST00000515753	MASP1	P48740	699 aa		4.59	□□□□□ -1.67
HERC4-215	ENST00000515753	MAN2A2	P49641	1150 aa		4.59	□□□□□ -1.67
HERC4-215	ENST00000515753	RGS3	P49796	1198 aa		4.59	□□□□□ -1.67
HERC4-215	ENST00000515753	BPIFB4	P59827	614 aa		4.59	□□□□□ -1.67
HERC4-215	ENST00000515753	TOB2	Q14106	344 aa	Predicted RBP	4.59	□□□□□ -1.67
HERC4-215	ENST00000515753	SART3	Q15020	963 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
HERC4-215	ENST00000515753	TERF2	Q15554	542 aa		4.59	□□□□□ -1.67
HERC4-215	ENST00000515753	KIAA1841	Q6NSI8	718 aa		4.59	□□□□□ -1.67
HERC4-215	ENST00000515753	FAM111B	Q6SJ93	734 aa		4.59	□□□□□ -1.67
HERC4-215	ENST00000515753	FKBP9P1	Q75LS8	142 aa		4.59	□□□□□ -1.67
HERC4-215	ENST00000515753	AFAP1L2	Q8N4X5	818 aa		4.59	□□□□□ -1.67
HERC4-215	ENST00000515753	RPGR	Q92834	1020 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
HERC4-215	ENST00000515753	GCDH	Q92947	438 aa	Predicted RBP	4.59	□□□□□ -1.67
HERC4-215	ENST00000515753	NKD2	Q969F2	451 aa	Predicted RBP	4.59	□□□□□ -1.67
HERC4-215	ENST00000515753	GPR87	Q9BY21	358 aa		4.59	□□□□□ -1.67
HERC4-215	ENST00000515753	WNT8A	Q9H1J5	351 aa		4.59	□□□□□ -1.67
HERC4-215	ENST00000515753	SLC6A15	Q9H2J7	730 aa		4.59	□□□□□ -1.67
HERC4-215	ENST00000515753	EMC7	Q9NPA0	242 aa		4.59	□□□□□ -1.67
HERC4-215	ENST00000515753	SAE1	Q9UBE0	346 aa	Predicted RBP	4.59	□□□□□ -1.67
HERC4-215	ENST00000515753	DENND2A	Q9ULE3	1009 aa		4.59	□□□□□ -1.67
HERC4-215	ENST00000515753	XDH	P47989	1333 aa		4.58	□□□□□ -1.68
HERC4-215	ENST00000515753		A0A0A6YYJ9	748 aa		4.58	□□□□□ -1.68
HERC4-215	ENST00000515753	TMEM191C	A6NGB0	347 aa		4.58	□□□□□ -1.68
HERC4-215	ENST00000515753	H2AFY	O75367	372 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
HERC4-215	ENST00000515753	PEX11B	O96011	259 aa		4.58	□□□□□ -1.68
HERC4-215	ENST00000515753	LSP1	P33241	339 aa		4.58	□□□□□ -1.68
HERC4-215	ENST00000515753	TCIRG1	Q13488	830 aa		4.58	□□□□□ -1.68
HERC4-215	ENST00000515753	DGKD	Q16760	1214 aa		4.58	□□□□□ -1.68
HERC4-215	ENST00000515753	PRAMEF9	Q5VWM5	478 aa		4.58	□□□□□ -1.68
HERC4-215	ENST00000515753	TIGD7	Q6NT04	549 aa	Predicted RBP	4.58	□□□□□ -1.68
HERC4-215	ENST00000515753	MRGPRE	Q86SM8	312 aa		4.58	□□□□□ -1.68
HERC4-215	ENST00000515753	C11orf74	Q86VG3	221 aa		4.58	□□□□□ -1.68
HERC4-215	ENST00000515753	VRK3	Q8IV63	474 aa		4.58	□□□□□ -1.68
HERC4-215	ENST00000515753	ELOA2	Q8IYF1	753 aa	Predicted RBP	4.58	□□□□□ -1.68

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