RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000515746.5

ATXN3-212, Transcript of ataxin 3, human

TSL 5

Gene ATXN3, Length 619 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ATXN3-212	ENST00000515746	JAG2	Q9Y219	1238 aa		5.41	□□□□□ -1.54
ATXN3-212	ENST00000515746	TRAF3IP3	Q9Y228	551 aa		5.41	□□□□□ -1.54
ATXN3-212	ENST00000515746	LEMD3	Q9Y2U8	911 aa		5.41	□□□□□ -1.54
ATXN3-212	ENST00000515746	GAK	O14976	1311 aa		5.41	□□□□□ -1.54
ATXN3-212	ENST00000515746	PITPNM2	Q9BZ72	1349 aa		5.41	□□□□□ -1.54
ATXN3-212	ENST00000515746	KDM3A	Q9Y4C1	1321 aa		5.41	□□□□□ -1.54
ATXN3-212	ENST00000515746	PNMA6F	A0A0J9YX94	578 aa		5.4	□□□□□ -1.54
ATXN3-212	ENST00000515746	GTPBP10	A4D1E9	387 aa	Known RBP	5.4	□□□□□ -1.54
ATXN3-212	ENST00000515746	GOLGA6L10	A6NI86	522 aa		5.4	□□□□□ -1.54
ATXN3-212	ENST00000515746		E7EVH7	732 aa		5.4	□□□□□ -1.54
ATXN3-212	ENST00000515746	KRIT1	O00522	736 aa		5.4	□□□□□ -1.54
ATXN3-212	ENST00000515746	CETN3	O15182	167 aa		5.4	□□□□□ -1.54
ATXN3-212	ENST00000515746	DDX3Y	O15523	660 aa	Known RBP	5.4	□□□□□ -1.54
ATXN3-212	ENST00000515746	DAPK3	O43293	454 aa		5.4	□□□□□ -1.54
ATXN3-212	ENST00000515746	PPIP5K2	O43314	1243 aa		5.4	□□□□□ -1.54
ATXN3-212	ENST00000515746	DNAJC8	O75937	253 aa	Predicted RBP	5.4	□□□□□ -1.54
ATXN3-212	ENST00000515746	GNRH1	P01148	92 aa		5.4	□□□□□ -1.54
ATXN3-212	ENST00000515746	AFP	P02771	609 aa	Known RBP	5.4	□□□□□ -1.54
ATXN3-212	ENST00000515746	ADH1A	P07327	375 aa		5.4	□□□□□ -1.54
ATXN3-212	ENST00000515746	NUDT17	P0C025	328 aa		5.4	□□□□□ -1.54
ATXN3-212	ENST00000515746	H2AFZ	P0C0S5	128 aa		5.4	□□□□□ -1.54
ATXN3-212	ENST00000515746	ALAS1	P13196	640 aa		5.4	□□□□□ -1.54
ATXN3-212	ENST00000515746	UCHL3	P15374	230 aa		5.4	□□□□□ -1.54
ATXN3-212	ENST00000515746	SLC9A1	P19634	815 aa		5.4	□□□□□ -1.54
ATXN3-212	ENST00000515746	TMOD1	P28289	359 aa		5.4	□□□□□ -1.54
ATXN3-212	ENST00000515746	HPD	P32754	393 aa	Predicted RBP	5.4	□□□□□ -1.54
ATXN3-212	ENST00000515746	CTNNA1	P35221	906 aa	Known RBP	5.4	□□□□□ -1.54
ATXN3-212	ENST00000515746	DNA2	P51530	1060 aa		5.4	□□□□□ -1.54
ATXN3-212	ENST00000515746	CASP5	P51878	434 aa		5.4	□□□□□ -1.54
ATXN3-212	ENST00000515746	RNASE9	P60153	205 aa	Known RBP	5.4	□□□□□ -1.54
ATXN3-212	ENST00000515746	PTEN	P60484	403 aa		5.4	□□□□□ -1.54
ATXN3-212	ENST00000515746	PPAT	Q06203	517 aa		5.4	□□□□□ -1.54
ATXN3-212	ENST00000515746	KLRC3	Q07444	240 aa		5.4	□□□□□ -1.54
ATXN3-212	ENST00000515746	SPIRE1	Q08AE8	756 aa		5.4	□□□□□ -1.54
ATXN3-212	ENST00000515746	ZNF543	Q08ER8	600 aa		5.4	□□□□□ -1.54
ATXN3-212	ENST00000515746	ADAM9	Q13443	819 aa		5.4	□□□□□ -1.54
ATXN3-212	ENST00000515746	ELOA	Q14241	798 aa	Known RBP	5.4	□□□□□ -1.54
ATXN3-212	ENST00000515746	TCEAL1	Q15170	157 aa		5.4	□□□□□ -1.54
ATXN3-212	ENST00000515746	UBE2S	Q16763	222 aa		5.4	□□□□□ -1.54
ATXN3-212	ENST00000515746	CTC1	Q2NKJ3	1217 aa		5.4	□□□□□ -1.54
ATXN3-212	ENST00000515746	ERMARD	Q5T6L9	678 aa		5.4	□□□□□ -1.54
ATXN3-212	ENST00000515746	DUPD1	Q68J44	220 aa		5.4	□□□□□ -1.54
ATXN3-212	ENST00000515746	ALKBH5	Q6P6C2	394 aa	Known RBP	5.4	□□□□□ -1.54
ATXN3-212	ENST00000515746	TLDC1	Q6P9B6	456 aa		5.4	□□□□□ -1.54
ATXN3-212	ENST00000515746	ZDHHC24	Q6UX98	284 aa		5.4	□□□□□ -1.54
ATXN3-212	ENST00000515746	H2AFV	Q71UI9	128 aa		5.4	□□□□□ -1.54
ATXN3-212	ENST00000515746	ARMC9	Q7Z3E5	817 aa		5.4	□□□□□ -1.54
ATXN3-212	ENST00000515746	PIGW	Q7Z7B1	504 aa		5.4	□□□□□ -1.54
ATXN3-212	ENST00000515746	TEX11	Q8IYF3	940 aa		5.4	□□□□□ -1.54
ATXN3-212	ENST00000515746	FUK	Q8N0W3	1084 aa		5.4	□□□□□ -1.54
ATXN3-212	ENST00000515746	KDF1	Q8NAX2	398 aa	Predicted RBP	5.4	□□□□□ -1.54
ATXN3-212	ENST00000515746	LMBR1	Q8WVP7	490 aa		5.4	□□□□□ -1.54
ATXN3-212	ENST00000515746	ATXN2L	Q8WWM7	1075 aa	Known RBP	5.4	□□□□□ -1.54
ATXN3-212	ENST00000515746	CRYGN	Q8WXF5	182 aa		5.4	□□□□□ -1.54
ATXN3-212	ENST00000515746	CCT6B	Q92526	530 aa		5.4	□□□□□ -1.54
ATXN3-212	ENST00000515746	COA7	Q96BR5	231 aa		5.4	□□□□□ -1.54
ATXN3-212	ENST00000515746	ACSBG1	Q96GR2	724 aa		5.4	□□□□□ -1.54
ATXN3-212	ENST00000515746	SGSM3	Q96HU1	749 aa		5.4	□□□□□ -1.54
ATXN3-212	ENST00000515746	AGBL1	Q96MI9	1066 aa		5.4	□□□□□ -1.54
ATXN3-212	ENST00000515746	ZNF317	Q96PQ6	595 aa	Predicted RBP	5.4	□□□□□ -1.54
ATXN3-212	ENST00000515746	XPO6	Q96QU8	1125 aa	Known RBP	5.4	□□□□□ -1.54
ATXN3-212	ENST00000515746	NAP1L4	Q99733	375 aa	Known RBP	5.4	□□□□□ -1.54
ATXN3-212	ENST00000515746	HNRNPUL1	Q9BUJ2	856 aa	Known RBP eCLIP	5.4	□□□□□ -1.54
ATXN3-212	ENST00000515746	MXD3	Q9BW11	206 aa		5.4	□□□□□ -1.54
ATXN3-212	ENST00000515746	AP1M1	Q9BXS5	423 aa		5.4	□□□□□ -1.54
ATXN3-212	ENST00000515746	FAM129A	Q9BZQ8	928 aa		5.4	□□□□□ -1.54
ATXN3-212	ENST00000515746	UBA5	Q9GZZ9	404 aa		5.4	□□□□□ -1.54
ATXN3-212	ENST00000515746	DDX47	Q9H0S4	455 aa	Known RBP	5.4	□□□□□ -1.54
ATXN3-212	ENST00000515746	DHX36	Q9H2U1	1008 aa	Known RBP	5.4	□□□□□ -1.54
ATXN3-212	ENST00000515746	ADAM7	Q9H2U9	754 aa		5.4	□□□□□ -1.54
ATXN3-212	ENST00000515746	GOLPH3	Q9H4A6	298 aa		5.4	□□□□□ -1.54
ATXN3-212	ENST00000515746	CCDC134	Q9H6E4	229 aa		5.4	□□□□□ -1.54
ATXN3-212	ENST00000515746	CNOT10	Q9H9A5	744 aa	Known RBP	5.4	□□□□□ -1.54
ATXN3-212	ENST00000515746	KANSL2	Q9H9L4	492 aa		5.4	□□□□□ -1.54
ATXN3-212	ENST00000515746	VAT1L	Q9HCJ6	419 aa		5.4	□□□□□ -1.54
ATXN3-212	ENST00000515746	CD248	Q9HCU0	757 aa		5.4	□□□□□ -1.54
ATXN3-212	ENST00000515746	FAM114A2	Q9NRY5	505 aa		5.4	□□□□□ -1.54
ATXN3-212	ENST00000515746	MTMR4	Q9NYA4	1195 aa		5.4	□□□□□ -1.54
ATXN3-212	ENST00000515746	DONSON	Q9NYP3	566 aa		5.4	□□□□□ -1.54
ATXN3-212	ENST00000515746	NARF	Q9UHQ1	456 aa		5.4	□□□□□ -1.54
ATXN3-212	ENST00000515746	HDAC9	Q9UKV0	1011 aa		5.4	□□□□□ -1.54
ATXN3-212	ENST00000515746	TPX2	Q9ULW0	747 aa	Known RBP	5.4	□□□□□ -1.54
ATXN3-212	ENST00000515746	NOVA2	Q9UNW9	492 aa	Known RBP	5.4	□□□□□ -1.54
ATXN3-212	ENST00000515746	KIAA1024	Q9UPX6	916 aa		5.4	□□□□□ -1.54
ATXN3-212	ENST00000515746	THRAP3	Q9Y2W1	955 aa	Known RBP	5.4	□□□□□ -1.54
ATXN3-212	ENST00000515746	NR2E1	Q9Y466	385 aa		5.4	□□□□□ -1.54
ATXN3-212	ENST00000515746	NAV1	Q8NEY1	1877 aa		5.4	□□□□□ -1.55
ATXN3-212	ENST00000515746	MYH1	P12882	1939 aa		5.4	□□□□□ -1.55
ATXN3-212	ENST00000515746	ATAD5	Q96QE3	1844 aa		5.39	□□□□□ -1.55
ATXN3-212	ENST00000515746	GOLGA6L7	A0A1B0GV03	622 aa		5.39	□□□□□ -1.55
ATXN3-212	ENST00000515746	CCT8L1P	A6NM43	557 aa		5.39	□□□□□ -1.55
ATXN3-212	ENST00000515746	PHF20L1	A8MW92	1017 aa		5.39	□□□□□ -1.55
ATXN3-212	ENST00000515746	TMCO5B	A8MYB1	307 aa		5.39	□□□□□ -1.55
ATXN3-212	ENST00000515746	POTEC	B2RU33	542 aa		5.39	□□□□□ -1.55
ATXN3-212	ENST00000515746		E9PMD0	336 aa		5.39	□□□□□ -1.55
ATXN3-212	ENST00000515746	PDXK	O00764	312 aa		5.39	□□□□□ -1.55
ATXN3-212	ENST00000515746	ASAP2	O43150	1006 aa		5.39	□□□□□ -1.55
ATXN3-212	ENST00000515746	TTI1	O43156	1089 aa		5.39	□□□□□ -1.55
ATXN3-212	ENST00000515746	MGRN1	O60291	552 aa		5.39	□□□□□ -1.55
ATXN3-212	ENST00000515746	BUB1B	O60566	1050 aa	Predicted RBP	5.39	□□□□□ -1.55

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