RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000512069.6

PDE4D-220, Transcript of phosphodiesterase 4D, humanhuman

TSL 2

Gene PDE4D, Length 536 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4D-220ENST00000512069 FAPQ12884 760 aa6.39□□□□□ -1.39
PDE4D-220ENST00000512069 GAGE13Q4V321 117 aa6.39□□□□□ -1.39
PDE4D-220ENST00000512069 CCDC178Q5BJE1 867 aa6.39□□□□□ -1.39
PDE4D-220ENST00000512069 SPRED1Q7Z699 444 aa6.39□□□□□ -1.39
PDE4D-220ENST00000512069 GPR135Q8IZ08 494 aa6.39□□□□□ -1.39
PDE4D-220ENST00000512069 FUKQ8N0W3 1084 aa6.39□□□□□ -1.39
PDE4D-220ENST00000512069 CDYL2Q8N8U2 506 aa6.39□□□□□ -1.39
PDE4D-220ENST00000512069 SH3RF3Q8TEJ3 882 aaPredicted RBP6.39□□□□□ -1.39
PDE4D-220ENST00000512069 PLA2G12BQ9BX93 195 aa6.39□□□□□ -1.39
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PDE4D-220ENST00000512069 FANCD2Q9BXW9 1451 aa6.39□□□□□ -1.39
PDE4D-220ENST00000512069 C1QTNF3-AMACRE9PGA6 284 aa6.38□□□□□ -1.39
PDE4D-220ENST00000512069 KDM1AO60341 852 aa6.38□□□□□ -1.39
PDE4D-220ENST00000512069 ADAM8P78325 824 aa6.38□□□□□ -1.39
PDE4D-220ENST00000512069 STAT4Q14765 748 aa6.38□□□□□ -1.39
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PDE4D-220ENST00000512069 SLC41A1Q8IVJ1 513 aa6.38□□□□□ -1.39
PDE4D-220ENST00000512069 CLRN3Q8NCR9 226 aa6.38□□□□□ -1.39
PDE4D-220ENST00000512069 SHCBP1Q8NEM2 672 aa6.38□□□□□ -1.39
PDE4D-220ENST00000512069 GAB3Q8WWW8 586 aa6.38□□□□□ -1.39
PDE4D-220ENST00000512069 SPC25Q9HBM1 224 aa6.38□□□□□ -1.39
PDE4D-220ENST00000512069 PLA2G3Q9NZ20 509 aa6.38□□□□□ -1.39
PDE4D-220ENST00000512069 TSC22D4Q9Y3Q8 395 aa6.38□□□□□ -1.39
PDE4D-220ENST00000512069 TESMINQ9Y4I5 508 aa6.38□□□□□ -1.39
PDE4D-220ENST00000512069 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP6.38□□□□□ -1.39
PDE4D-220ENST00000512069 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP6.38□□□□□ -1.39
PDE4D-220ENST00000512069 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP6.37□□□□□ -1.39
PDE4D-220ENST00000512069 MATN3O15232 486 aa6.37□□□□□ -1.39
PDE4D-220ENST00000512069 JUNP05412 331 aaKnown RBP6.37□□□□□ -1.39
PDE4D-220ENST00000512069 VSIG10L2P0DP72 767 aa6.37□□□□□ -1.39
PDE4D-220ENST00000512069 HNRNPLP14866 589 aaKnown RBP eCLIP6.37□□□□□ -1.395e-8■■■■□ 21.3
PDE4D-220ENST00000512069 POU3F3P20264 500 aaPredicted RBP6.37□□□□□ -1.39
PDE4D-220ENST00000512069 COMTP21964 271 aa6.37□□□□□ -1.39
PDE4D-220ENST00000512069 CNGA1P29973 690 aa6.37□□□□□ -1.39
PDE4D-220ENST00000512069 KIR2DL3P43628 341 aa6.37□□□□□ -1.39
PDE4D-220ENST00000512069 BPIFB4P59827 614 aa6.37□□□□□ -1.39
PDE4D-220ENST00000512069 TCIRG1Q13488 830 aa6.37□□□□□ -1.39
PDE4D-220ENST00000512069 POLNQ7Z5Q5 900 aa6.37□□□□□ -1.39
PDE4D-220ENST00000512069 EDAQ92838 391 aa6.37□□□□□ -1.39
PDE4D-220ENST00000512069 CDK5RAP1Q96SZ6 601 aaKnown RBP6.37□□□□□ -1.39
PDE4D-220ENST00000512069 GPHA2Q96T91 129 aa6.37□□□□□ -1.39
PDE4D-220ENST00000512069 TOPORSQ9NS56 1045 aaPredicted RBP6.37□□□□□ -1.39
PDE4D-220ENST00000512069 PRSS50Q9UI38 385 aa6.37□□□□□ -1.39
PDE4D-220ENST00000512069 USP18Q9UMW8 372 aa6.37□□□□□ -1.39
PDE4D-220ENST00000512069 TCAF1Q9Y4C2 921 aa6.37□□□□□ -1.39
PDE4D-220ENST00000512069 PPP2R3BQ9Y5P8 575 aa6.37□□□□□ -1.39
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PDE4D-220ENST00000512069 DNAJC6O75061 913 aa6.36□□□□□ -1.39
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PDE4D-220ENST00000512069 GAAP10253 952 aa6.36□□□□□ -1.39
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PDE4D-220ENST00000512069 GRM7Q14831 915 aa6.36□□□□□ -1.39
PDE4D-220ENST00000512069 ACAP1Q15027 740 aa6.36□□□□□ -1.39
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PDE4D-220ENST00000512069 RNF219Q5W0B1 726 aaPredicted RBP6.36□□□□□ -1.39
PDE4D-220ENST00000512069 MAMDC4Q6UXC1 1216 aa6.36□□□□□ -1.39
PDE4D-220ENST00000512069 ADGRE4PQ86SQ3 457 aa6.36□□□□□ -1.39
PDE4D-220ENST00000512069 ANKRD53Q8N9V6 530 aa6.36□□□□□ -1.39
PDE4D-220ENST00000512069 WDR66Q8TBY9 1149 aa6.36□□□□□ -1.39
PDE4D-220ENST00000512069 RPL10LQ96L21 214 aaKnown RBP6.36□□□□□ -1.39
PDE4D-220ENST00000512069 ACAP3Q96P50 834 aa6.36□□□□□ -1.39
PDE4D-220ENST00000512069 OR14A2Q96R54 314 aa6.36□□□□□ -1.39
PDE4D-220ENST00000512069 C14orf93Q9H972 538 aaKnown RBP6.36□□□□□ -1.39
PDE4D-220ENST00000512069 SLTMQ9NWH9 1034 aaKnown RBP eCLIP6.36□□□□□ -1.39
PDE4D-220ENST00000512069 PHLDB1Q86UU1 1377 aa6.35□□□□□ -1.39
PDE4D-220ENST00000512069 GOLGA8BA8MQT2 603 aa6.35□□□□□ -1.39
PDE4D-220ENST00000512069 GPR39O43194 453 aa6.35□□□□□ -1.39
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PDE4D-220ENST00000512069 CD69Q07108 199 aa6.35□□□□□ -1.39
PDE4D-220ENST00000512069 SAFB2Q14151 953 aaKnown RBP eCLIP6.35□□□□□ -1.39
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PDE4D-220ENST00000512069 PITRM1Q5JRX3 1037 aa6.35□□□□□ -1.39
PDE4D-220ENST00000512069 RNF187Q5TA31 235 aaPredicted RBP6.35□□□□□ -1.39
PDE4D-220ENST00000512069 HDGFL2Q7Z4V5 671 aaPredicted RBP6.35□□□□□ -1.39
PDE4D-220ENST00000512069 UNC5BQ8IZJ1 945 aa6.35□□□□□ -1.39
PDE4D-220ENST00000512069 UIMC1Q96RL1 719 aa6.35□□□□□ -1.39
PDE4D-220ENST00000512069 MPHOSPH9Q99550 1183 aa6.35□□□□□ -1.39
PDE4D-220ENST00000512069 MUSKO15146 869 aa6.34□□□□□ -1.39
PDE4D-220ENST00000512069 TOX4O94842 621 aa6.34□□□□□ -1.39
PDE4D-220ENST00000512069 LY86O95711 162 aa6.34□□□□□ -1.39
PDE4D-220ENST00000512069 CLEC2LP0C7M8 214 aa6.34□□□□□ -1.39
PDE4D-220ENST00000512069 NRG3P56975 720 aa6.34□□□□□ -1.39
PDE4D-220ENST00000512069 UGT8Q16880 541 aa6.34□□□□□ -1.39
PDE4D-220ENST00000512069 SPDYAQ5MJ70 313 aa6.34□□□□□ -1.39
PDE4D-220ENST00000512069 IQSEC1Q6DN90 963 aa6.34□□□□□ -1.39
PDE4D-220ENST00000512069 CCDC62Q6P9F0 684 aa6.34□□□□□ -1.39
PDE4D-220ENST00000512069 LHFPL2Q6ZUX7 228 aa6.34□□□□□ -1.39
PDE4D-220ENST00000512069 GAREM2Q75VX8 874 aa6.34□□□□□ -1.39
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