RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000511412.1

ALYREF-203, Transcript of Aly/REF export factor, humanhuman

TSL 3

Gene ALYREF, Length 533 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALYREF-203ENST00000511412 OTUD6AQ7L8S5 288 aa27.57■■■□□ 2
ALYREF-203ENST00000511412 SLC39A11Q8N1S5 342 aa27.57■■■□□ 2
ALYREF-203ENST00000511412 VN1R2Q8NFZ6 395 aa27.57■■■□□ 2
ALYREF-203ENST00000511412 TMEM143Q96AN5 459 aa27.57■■■□□ 2
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ALYREF-203ENST00000511412 IFT122Q9HBG6 1241 aa27.57■■■□□ 2
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ALYREF-203ENST00000511412 NT5C1B-RDH14C9J2C7 533 aa27.52■■■□□ 2
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ALYREF-203ENST00000511412 TECP42680 631 aa27.52■■■□□ 2
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ALYREF-203ENST00000511412 RNF149Q8NC42 400 aa27.52■■■□□ 2
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ALYREF-203ENST00000511412 CNTNAP2Q9UHC6 1331 aa27.47■■□□□ 1.99
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ALYREF-203ENST00000511412 HOXB8P17481 243 aaPredicted RBP27.47■■□□□ 1.99
ALYREF-203ENST00000511412 HOXA11P31270 313 aaPredicted RBP27.47■■□□□ 1.99
ALYREF-203ENST00000511412 TFDP1Q14186 410 aa27.47■■□□□ 1.99
ALYREF-203ENST00000511412 CBX2Q14781 532 aaPredicted RBP27.47■■□□□ 1.99
ALYREF-203ENST00000511412 PCBP1Q15365 356 aaKnown RBP eCLIP27.47■■□□□ 1.99
ALYREF-203ENST00000511412 SAFBQ15424 915 aaKnown RBP eCLIP27.47■■□□□ 1.99
ALYREF-203ENST00000511412 SYCE2Q6PIF2 218 aa27.47■■□□□ 1.99
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