RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000510195.1

SNF8-208, Transcript of SNF8, ESCRT-II complex subunit, human

TSL 2

Gene SNF8, Length 445 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SNF8-208	ENST00000510195	PCBP1	Q15365	356 aa	Known RBP eCLIP	29.77	■■■□□ 2.36
SNF8-208	ENST00000510195	TMEM184A	Q6ZMB5	413 aa		29.77	■■■□□ 2.36
SNF8-208	ENST00000510195	HSD17B14	Q9BPX1	270 aa		29.77	■■■□□ 2.36
SNF8-208	ENST00000510195	C11orf16	Q9NQ32	467 aa		29.77	■■■□□ 2.36
SNF8-208	ENST00000510195	AGPAT5	Q9NUQ2	364 aa		29.77	■■■□□ 2.36
SNF8-208	ENST00000510195	NEMF	O60524	1076 aa		29.76	■■■□□ 2.35
SNF8-208	ENST00000510195	JAK2	O60674	1132 aa		29.76	■■■□□ 2.35
SNF8-208	ENST00000510195	SEC24B	O95487	1268 aa		29.76	■■■□□ 2.35
SNF8-208	ENST00000510195	SRGAP2B	P0DMP2	458 aa		29.76	■■■□□ 2.35
SNF8-208	ENST00000510195	LAMTOR4	Q0VGL1	99 aa		29.76	■■■□□ 2.35
SNF8-208	ENST00000510195	CTTN	Q14247	550 aa	Known RBP	29.76	■■■□□ 2.35
SNF8-208	ENST00000510195	XKR9	Q5GH70	373 aa		29.76	■■■□□ 2.35
SNF8-208	ENST00000510195	TPH2	Q8IWU9	490 aa		29.76	■■■□□ 2.35
SNF8-208	ENST00000510195	SLC39A11	Q8N1S5	342 aa		29.76	■■■□□ 2.35
SNF8-208	ENST00000510195	TMEM143	Q96AN5	459 aa		29.76	■■■□□ 2.35
SNF8-208	ENST00000510195	PGBD4	Q96DM1	585 aa		29.76	■■■□□ 2.35
SNF8-208	ENST00000510195	TCF25	Q9BQ70	676 aa		29.76	■■■□□ 2.35
SNF8-208	ENST00000510195	EIF2AK1	Q9BQI3	630 aa	Known RBP	29.76	■■■□□ 2.35
SNF8-208	ENST00000510195	TTC12	Q9H892	705 aa	Predicted RBP	29.76	■■■□□ 2.35
SNF8-208	ENST00000510195	LIMCH1	Q9UPQ0	1083 aa		29.76	■■■□□ 2.35
SNF8-208	ENST00000510195	ARIH1	Q9Y4X5	557 aa	Predicted RBP	29.76	■■■□□ 2.35
SNF8-208	ENST00000510195	PER2	O15055	1255 aa		29.75	■■■□□ 2.35
SNF8-208	ENST00000510195	DCX	O43602	365 aa		29.75	■■■□□ 2.35
SNF8-208	ENST00000510195	MXD4	Q14582	209 aa	Predicted RBP	29.75	■■■□□ 2.35
SNF8-208	ENST00000510195	EMC2	Q15006	297 aa		29.75	■■■□□ 2.35
SNF8-208	ENST00000510195	GLB1L	Q6UWU2	654 aa		29.75	■■■□□ 2.35
SNF8-208	ENST00000510195	ENTPD7	Q9NQZ7	604 aa		29.75	■■■□□ 2.35
SNF8-208	ENST00000510195	SRGAP2C	P0DJJ0	459 aa		29.74	■■■□□ 2.35
SNF8-208	ENST00000510195	CYP4A11	Q02928	519 aa		29.74	■■■□□ 2.35
SNF8-208	ENST00000510195	KCNC3	Q14003	757 aa		29.74	■■■□□ 2.35
SNF8-208	ENST00000510195	BMS1	Q14692	1282 aa	Known RBP	29.74	■■■□□ 2.35
SNF8-208	ENST00000510195	SAFB	Q15424	915 aa	Known RBP eCLIP	29.74	■■■□□ 2.35
SNF8-208	ENST00000510195	FERMT3	Q86UX7	667 aa		29.74	■■■□□ 2.35
SNF8-208	ENST00000510195	MTMR9	Q96QG7	549 aa		29.74	■■■□□ 2.35
SNF8-208	ENST00000510195	MTR	Q99707	1265 aa		29.74	■■■□□ 2.35
SNF8-208	ENST00000510195	LLPH	Q9BRT6	129 aa	Known RBP	29.74	■■■□□ 2.35
SNF8-208	ENST00000510195	ANKEF1	Q9NU02	776 aa		29.74	■■■□□ 2.35
SNF8-208	ENST00000510195	BARX2	Q9UMQ3	279 aa	Predicted RBP	29.74	■■■□□ 2.35
SNF8-208	ENST00000510195	PRR33	A8MZF0	331 aa		29.73	■■■□□ 2.35
SNF8-208	ENST00000510195	CENPB	P07199	599 aa	Predicted RBP	29.73	■■■□□ 2.35
SNF8-208	ENST00000510195	BCAR1	P56945	870 aa		29.73	■■■□□ 2.35
SNF8-208	ENST00000510195	POU5F1B	Q06416	359 aa		29.73	■■■□□ 2.35
SNF8-208	ENST00000510195	PLPP4	Q5VZY2	271 aa		29.73	■■■□□ 2.35
SNF8-208	ENST00000510195	TMC7	Q7Z402	723 aa		29.73	■■■□□ 2.35
SNF8-208	ENST00000510195	XRCC6	P12956	609 aa	Known RBP eCLIP	29.72	■■■□□ 2.35
SNF8-208	ENST00000510195	PBX3	P40426	434 aa		29.72	■■■□□ 2.35
SNF8-208	ENST00000510195	NOMO2	Q5JPE7	1267 aa		29.72	■■■□□ 2.35
SNF8-208	ENST00000510195	MRPL10	Q7Z7H8	261 aa	Known RBP	29.72	■■■□□ 2.35
SNF8-208	ENST00000510195	PCDHB2	Q9Y5E7	798 aa		29.72	■■■□□ 2.35
SNF8-208	ENST00000510195	ZBTB39	O15060	712 aa		29.71	■■■□□ 2.35
SNF8-208	ENST00000510195	OFD1	O75665	1012 aa		29.71	■■■□□ 2.35
SNF8-208	ENST00000510195	DGAT1	O75907	488 aa		29.71	■■■□□ 2.35
SNF8-208	ENST00000510195	TXK	P42681	527 aa		29.71	■■■□□ 2.35
SNF8-208	ENST00000510195	ST3GAL1	Q11201	340 aa		29.71	■■■□□ 2.35
SNF8-208	ENST00000510195	SMC1A	Q14683	1233 aa	Known RBP	29.71	■■■□□ 2.35
SNF8-208	ENST00000510195	MRPL43	Q8N983	215 aa	Known RBP	29.71	■■■□□ 2.35
SNF8-208	ENST00000510195	RNF149	Q8NC42	400 aa		29.71	■■■□□ 2.35
SNF8-208	ENST00000510195	TMEM169	Q96HH4	297 aa		29.71	■■■□□ 2.35
SNF8-208	ENST00000510195	MINDY3	Q9H8M7	445 aa		29.71	■■■□□ 2.35
SNF8-208	ENST00000510195	HCN4	Q9Y3Q4	1203 aa		29.71	■■■□□ 2.35
SNF8-208	ENST00000510195	CNTNAP2	Q9UHC6	1331 aa		29.71	■■■□□ 2.35
SNF8-208	ENST00000510195	AXL	P30530	894 aa		29.7	■■■□□ 2.35
SNF8-208	ENST00000510195	HOXA11	P31270	313 aa	Predicted RBP	29.7	■■■□□ 2.35
SNF8-208	ENST00000510195	ORC2	Q13416	577 aa	Predicted RBP	29.7	■■■□□ 2.35
SNF8-208	ENST00000510195	CNNM3	Q8NE01	707 aa		29.7	■■■□□ 2.35
SNF8-208	ENST00000510195	VN1R2	Q8NFZ6	395 aa		29.7	■■■□□ 2.35
SNF8-208	ENST00000510195	LPP	Q93052	612 aa		29.7	■■■□□ 2.35
SNF8-208	ENST00000510195	ZSCAN31	Q96LW9	406 aa	Predicted RBP	29.7	■■■□□ 2.35
SNF8-208	ENST00000510195	TBC1D13	Q9NVG8	400 aa		29.7	■■■□□ 2.35
SNF8-208	ENST00000510195	STK39	Q9UEW8	545 aa		29.7	■■■□□ 2.35
SNF8-208	ENST00000510195	USP15	Q9Y4E8	981 aa	Predicted RBP	29.7	■■■□□ 2.35
SNF8-208	ENST00000510195	ARID2	Q68CP9	1835 aa		29.69	■■■□□ 2.34
SNF8-208	ENST00000510195	HIDE1	A8MVS5	230 aa		29.69	■■■□□ 2.34
SNF8-208	ENST00000510195	HOXB8	P17481	243 aa	Predicted RBP	29.69	■■■□□ 2.34
SNF8-208	ENST00000510195	PTEN	P60484	403 aa		29.69	■■■□□ 2.34
SNF8-208	ENST00000510195	TFDP1	Q14186	410 aa		29.69	■■■□□ 2.34
SNF8-208	ENST00000510195	IFNLR1	Q8IU57	520 aa	Predicted RBP	29.69	■■■□□ 2.34
SNF8-208	ENST00000510195	XPNPEP1	Q9NQW7	623 aa		29.69	■■■□□ 2.34
SNF8-208	ENST00000510195	KANSL3	Q9P2N6	904 aa		29.69	■■■□□ 2.34
SNF8-208	ENST00000510195	RAPGEFL1	Q9UHV5	662 aa		29.69	■■■□□ 2.34
SNF8-208	ENST00000510195	FAM86C2P	A6NEL3	165 aa		29.68	■■■□□ 2.34
SNF8-208	ENST00000510195	ZC3H11A	O75152	810 aa	Known RBP eCLIP	29.68	■■■□□ 2.34
SNF8-208	ENST00000510195	HMGN5	P82970	282 aa	Known RBP	29.68	■■■□□ 2.34
SNF8-208	ENST00000510195	RNASEL	Q05823	741 aa	Known RBP	29.68	■■■□□ 2.34
SNF8-208	ENST00000510195	NCBP1	Q09161	790 aa	Known RBP	29.68	■■■□□ 2.34
SNF8-208	ENST00000510195	GIT2	Q14161	759 aa		29.68	■■■□□ 2.34
SNF8-208	ENST00000510195	HERC4	Q5GLZ8	1057 aa	Predicted RBP	29.68	■■■□□ 2.34
SNF8-208	ENST00000510195	URGCP	Q8TCY9	931 aa		29.68	■■■□□ 2.34
SNF8-208	ENST00000510195	SUSD6	Q92537	303 aa		29.68	■■■□□ 2.34
SNF8-208	ENST00000510195	CCDC51	Q96ER9	411 aa		29.68	■■■□□ 2.34
SNF8-208	ENST00000510195	C8orf76	Q96K31	380 aa		29.68	■■■□□ 2.34
SNF8-208	ENST00000510195	CCDC43	Q96MW1	224 aa	Known RBP	29.68	■■■□□ 2.34
SNF8-208	ENST00000510195	PHF7	Q9BWX1	381 aa	Predicted RBP	29.68	■■■□□ 2.34
SNF8-208	ENST00000510195	FOXP1	Q9H334	677 aa	Predicted RBP	29.68	■■■□□ 2.34
SNF8-208	ENST00000510195	NRDE2	Q9H7Z3	1164 aa		29.68	■■■□□ 2.34
SNF8-208	ENST00000510195	UBN1	Q9NPG3	1134 aa		29.68	■■■□□ 2.34
SNF8-208	ENST00000510195	BMP2K	Q9NSY1	1161 aa	Predicted RBP	29.68	■■■□□ 2.34
SNF8-208	ENST00000510195	IRAK3	Q9Y616	596 aa		29.68	■■■□□ 2.34
SNF8-208	ENST00000510195	TRIO	O75962	3097 aa		29.68	■■■□□ 2.34
SNF8-208	ENST00000510195	C2orf71	A6NGG8	1288 aa		29.67	■■■□□ 2.34

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