RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000509368.6

PDE4D-218, Transcript of phosphodiesterase 4D, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PDE4D, Length 2,809 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4D-218ENST00000509368 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP2.69□□□□□ -1.98
PDE4D-218ENST00000509368 TMEM82A0PJX8 343 aa2.69□□□□□ -1.98
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PDE4D-218ENST00000509368 MAN2B1O00754 1011 aa2.69□□□□□ -1.98
PDE4D-218ENST00000509368 EPB41L2O43491 1005 aaKnown RBP2.69□□□□□ -1.98
PDE4D-218ENST00000509368 FKTNO75072 461 aa2.69□□□□□ -1.98
PDE4D-218ENST00000509368 ESR1P03372 595 aa2.69□□□□□ -1.98
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PDE4D-218ENST00000509368 MARCH10Q8NA82 808 aaPredicted RBP2.69□□□□□ -1.98
PDE4D-218ENST00000509368 BHLHE22Q8NFJ8 381 aaPredicted RBP2.69□□□□□ -1.98
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PDE4D-218ENST00000509368 FCRL2Q96LA5 508 aaPredicted RBP2.69□□□□□ -1.98
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PDE4D-218ENST00000509368 C7orf72A4D263 438 aa2.69□□□□□ -1.98
PDE4D-218ENST00000509368 SGTAO43765 313 aa2.69□□□□□ -1.98
PDE4D-218ENST00000509368 NBNO60934 754 aa2.69□□□□□ -1.98
PDE4D-218ENST00000509368 H2AFYO75367 372 aaKnown RBP2.69□□□□□ -1.98
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PDE4D-218ENST00000509368 SYPP08247 313 aa2.69□□□□□ -1.98
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PDE4D-218ENST00000509368 KANSL1Q7Z3B3 1105 aa2.69□□□□□ -1.98
PDE4D-218ENST00000509368 SLC41A1Q8IVJ1 513 aa2.69□□□□□ -1.98
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PDE4D-218ENST00000509368 GRAMD1CQ8IYS0 662 aa2.69□□□□□ -1.98
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PDE4D-218ENST00000509368 F5H0A9 414 aaPredicted RBP2.68□□□□□ -1.98
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PDE4D-218ENST00000509368 TIGD5Q53EQ6 642 aa2.68□□□□□ -1.98
PDE4D-218ENST00000509368 TOR2AQ5JU69 321 aa2.68□□□□□ -1.98
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PDE4D-218ENST00000509368 ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 179 aa2.68□□□□□ -1.98
PDE4D-218ENST00000509368 A0A1W2PQ45 241 aaPredicted RBP2.68□□□□□ -1.98
PDE4D-218ENST00000509368 A0A1W2PQY0 241 aa2.68□□□□□ -1.98
PDE4D-218ENST00000509368 GOLGA6L3A6NEY3 463 aa2.68□□□□□ -1.98
PDE4D-218ENST00000509368 FAM171A2A8MVW0 826 aa2.68□□□□□ -1.98
PDE4D-218ENST00000509368 HNRNPDLO14979 420 aaKnown RBP2.68□□□□□ -1.98
PDE4D-218ENST00000509368 FOXP2O15409 715 aa2.68□□□□□ -1.98
PDE4D-218ENST00000509368 KIR2DL1P43626 348 aaPredicted RBP2.68□□□□□ -1.98
PDE4D-218ENST00000509368 KIR2DL2P43627 348 aaPredicted RBP2.68□□□□□ -1.98
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