RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000503258.5

PDE4D-210, Transcript of phosphodiesterase 4D, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PDE4D, Length 2,860 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4D-210ENST00000503258 RTEL1Q9NZ71 1219 aa8.72□□□□□ -1.01
PDE4D-210ENST00000503258 ARP10275 920 aa8.71□□□□□ -1.01
PDE4D-210ENST00000503258 PDXDC2PQ6P474 469 aa8.71□□□□□ -1.01
PDE4D-210ENST00000503258 GLB1LQ6UWU2 654 aa8.71□□□□□ -1.01
PDE4D-210ENST00000503258 DGLUCYQ7Z3D6 616 aa8.71□□□□□ -1.01
PDE4D-210ENST00000503258 CABP7Q86V35 215 aa8.71□□□□□ -1.01
PDE4D-210ENST00000503258 PPP1R13LQ8WUF5 828 aa8.71□□□□□ -1.01
PDE4D-210ENST00000503258 TCP11Q8WWU5 503 aa8.71□□□□□ -1.01
PDE4D-210ENST00000503258 E2F7Q96AV8 911 aa8.71□□□□□ -1.01
PDE4D-210ENST00000503258 TSPAN18Q96SJ8 248 aa8.71□□□□□ -1.01
PDE4D-210ENST00000503258 IPO5O00410 1097 aaKnown RBP8.71□□□□□ -1.02
PDE4D-210ENST00000503258 PRC1O43663 620 aa8.71□□□□□ -1.02
PDE4D-210ENST00000503258 XRCC6P12956 609 aaKnown RBP eCLIP8.71□□□□□ -1.02
PDE4D-210ENST00000503258 PPP2R5CQ13362 524 aa8.71□□□□□ -1.02
PDE4D-210ENST00000503258 LEMD2Q8NC56 503 aa8.71□□□□□ -1.02
PDE4D-210ENST00000503258 NETO1Q8TDF5 533 aa8.71□□□□□ -1.02
PDE4D-210ENST00000503258 NRDE2Q9H7Z3 1164 aa8.71□□□□□ -1.02
PDE4D-210ENST00000503258 TELO2Q9Y4R8 837 aa8.71□□□□□ -1.02
PDE4D-210ENST00000503258 CCDC163A0A0D9SF12 145 aa8.71□□□□□ -1.02
PDE4D-210ENST00000503258 MUTP22033 750 aa8.71□□□□□ -1.02
PDE4D-210ENST00000503258 DNM2P50570 870 aa8.71□□□□□ -1.02
PDE4D-210ENST00000503258 CLUL1Q15846 466 aa8.71□□□□□ -1.02
PDE4D-210ENST00000503258 PLA2G4DQ86XP0 818 aa8.71□□□□□ -1.02
PDE4D-210ENST00000503258 C1orf210Q8IVY1 113 aa8.71□□□□□ -1.02
PDE4D-210ENST00000503258 COLGALT2Q8IYK4 626 aa8.71□□□□□ -1.02
PDE4D-210ENST00000503258 RILPL2Q969X0 211 aa8.71□□□□□ -1.02
PDE4D-210ENST00000503258 ZNF707Q96C28 371 aaPredicted RBP8.71□□□□□ -1.02
PDE4D-210ENST00000503258 VN1R3Q9BXE9 311 aa8.71□□□□□ -1.02
PDE4D-210ENST00000503258 RNF26Q9BY78 433 aaPredicted RBP8.71□□□□□ -1.02
PDE4D-210ENST00000503258 PRKD2Q9BZL6 878 aa8.71□□□□□ -1.02
PDE4D-210ENST00000503258 KCNK12Q9HB15 430 aa8.71□□□□□ -1.02
PDE4D-210ENST00000503258 C6orf50Q9HD87 102 aa8.71□□□□□ -1.02
PDE4D-210ENST00000503258 TBC1D13Q9NVG8 400 aa8.71□□□□□ -1.02
PDE4D-210ENST00000503258 DBR1Q9UK59 544 aaKnown RBP8.71□□□□□ -1.02
PDE4D-210ENST00000503258 MTMR7Q9Y216 660 aa8.71□□□□□ -1.02
PDE4D-210ENST00000503258 ZMYND10O75800 440 aa8.7□□□□□ -1.02
PDE4D-210ENST00000503258 PSMD10O75832 226 aa8.7□□□□□ -1.02
PDE4D-210ENST00000503258 GCFC2P16383 781 aaKnown RBP8.7□□□□□ -1.02
PDE4D-210ENST00000503258 ELAVL2Q12926 359 aaKnown RBP8.7□□□□□ -1.02
PDE4D-210ENST00000503258 LAIR1Q6GTX8 287 aa8.7□□□□□ -1.02
PDE4D-210ENST00000503258 TMC7Q7Z402 723 aa8.7□□□□□ -1.02
PDE4D-210ENST00000503258 MAML2Q8IZL2 1156 aaPredicted RBP8.7□□□□□ -1.02
PDE4D-210ENST00000503258 CDHR5Q9HBB8 845 aa8.7□□□□□ -1.02
PDE4D-210ENST00000503258 MRPL17Q9NRX2 175 aaKnown RBP8.7□□□□□ -1.02
PDE4D-210ENST00000503258 FAM105AQ9NUU6 356 aa8.7□□□□□ -1.02
PDE4D-210ENST00000503258 FBXW11Q9UKB1 542 aa8.7□□□□□ -1.02
PDE4D-210ENST00000503258 SLC12A7Q9Y666 1083 aa8.7□□□□□ -1.02
PDE4D-210ENST00000503258 M0R2N6 131 aa8.7□□□□□ -1.02
PDE4D-210ENST00000503258 SLC30A4O14863 429 aa8.7□□□□□ -1.02
PDE4D-210ENST00000503258 NCAM2O15394 837 aa8.7□□□□□ -1.02
PDE4D-210ENST00000503258 GATMP50440 423 aa8.7□□□□□ -1.02
PDE4D-210ENST00000503258 ORC2Q13416 577 aaPredicted RBP8.7□□□□□ -1.02
PDE4D-210ENST00000503258 EFCAB12Q6NXP0 572 aa8.7□□□□□ -1.02
PDE4D-210ENST00000503258 SYNE3Q6ZMZ3 975 aa8.7□□□□□ -1.02
PDE4D-210ENST00000503258 HOMER1Q86YM7 354 aa8.7□□□□□ -1.02
PDE4D-210ENST00000503258 HACE1Q8IYU2 909 aa8.7□□□□□ -1.02
PDE4D-210ENST00000503258 VPS52Q8N1B4 723 aa8.7□□□□□ -1.02
PDE4D-210ENST00000503258 SLC44A3Q8N4M1 653 aa8.7□□□□□ -1.02
PDE4D-210ENST00000503258 UROC1Q96N76 676 aa8.7□□□□□ -1.02
PDE4D-210ENST00000503258 COLEC11Q9BWP8 271 aa8.7□□□□□ -1.02
PDE4D-210ENST00000503258 FAM49AQ9H0Q0 323 aaPredicted RBP8.7□□□□□ -1.02
PDE4D-210ENST00000503258 MFSD1Q9H3U5 465 aa8.7□□□□□ -1.02
PDE4D-210ENST00000503258 EVPLQ92817 2033 aa8.7□□□□□ -1.02
PDE4D-210ENST00000503258 ARHGEF37A1IGU5 675 aa8.69□□□□□ -1.02
PDE4D-210ENST00000503258 MAN2B1O00754 1011 aa8.69□□□□□ -1.02
PDE4D-210ENST00000503258 PLEKHA8P1O95397 391 aa8.69□□□□□ -1.02
PDE4D-210ENST00000503258 GSPT1P15170 499 aaKnown RBP8.69□□□□□ -1.02
PDE4D-210ENST00000503258 UBXN11Q5T124 520 aa8.69□□□□□ -1.02
PDE4D-210ENST00000503258 RNF20Q5VTR2 975 aa8.69□□□□□ -1.02
PDE4D-210ENST00000503258 APOA5Q6Q788 366 aa8.69□□□□□ -1.02
PDE4D-210ENST00000503258 SYNPOQ8N3V7 929 aa8.69□□□□□ -1.02
PDE4D-210ENST00000503258 CELF5Q8N6W0 485 aaKnown RBP8.69□□□□□ -1.02
PDE4D-210ENST00000503258 MICAL1Q8TDZ2 1067 aa8.69□□□□□ -1.02
PDE4D-210ENST00000503258 FAM20AQ96MK3 541 aa8.69□□□□□ -1.02
PDE4D-210ENST00000503258 TEKT3Q9BXF9 490 aa8.69□□□□□ -1.02
PDE4D-210ENST00000503258 DHX33Q9H6R0 707 aaKnown RBP8.69□□□□□ -1.02
PDE4D-210ENST00000503258 GDE1Q9NZC3 331 aa8.69□□□□□ -1.02
PDE4D-210ENST00000503258 HSFX1Q9UBD0 423 aa8.69□□□□□ -1.02
PDE4D-210ENST00000503258 ZMYM5Q9UJ78 669 aa8.69□□□□□ -1.02
PDE4D-210ENST00000503258 BACE2Q9Y5Z0 518 aa8.69□□□□□ -1.02
PDE4D-210ENST00000503258 KINO60870 393 aaKnown RBP8.69□□□□□ -1.02
PDE4D-210ENST00000503258 FGFR1P11362 822 aa8.69□□□□□ -1.02
PDE4D-210ENST00000503258 GLUD2P49448 558 aa8.69□□□□□ -1.02
PDE4D-210ENST00000503258 PPP2R5DQ14738 602 aa8.69□□□□□ -1.02
PDE4D-210ENST00000503258 PAN2Q504Q3 1202 aaKnown RBP8.69□□□□□ -1.02
PDE4D-210ENST00000503258 RARS2Q5T160 578 aaKnown RBP8.69□□□□□ -1.02
PDE4D-210ENST00000503258 SPOUT1Q5T280 376 aaKnown RBP8.69□□□□□ -1.02
PDE4D-210ENST00000503258 ZBTB33Q86T24 672 aa8.69□□□□□ -1.02
PDE4D-210ENST00000503258 C4orf19Q8IY42 314 aa8.69□□□□□ -1.02
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PDE4D-210ENST00000503258 RMDN1Q96DB5 314 aa8.69□□□□□ -1.02
PDE4D-210ENST00000503258 ZNF577Q9BSK1 485 aa8.69□□□□□ -1.02
PDE4D-210ENST00000503258 NT5C3AQ9H0P0 336 aa8.69□□□□□ -1.02
PDE4D-210ENST00000503258 ARHGEF3Q9NR81 526 aa8.69□□□□□ -1.02
PDE4D-210ENST00000503258 MARCH5Q9NX47 278 aa8.69□□□□□ -1.02
PDE4D-210ENST00000503258 OBP2AQ9NY56 170 aa8.69□□□□□ -1.02
PDE4D-210ENST00000503258 MRPS17Q9Y2R5 130 aaKnown RBP8.69□□□□□ -1.02
PDE4D-210ENST00000503258 RBM8AQ9Y5S9 174 aaKnown RBP8.69□□□□□ -1.02
PDE4D-210ENST00000503258 GREB1Q4ZG55 1949 aa8.69□□□□□ -1.02
PDE4D-210ENST00000503258 FAM86B1E9PN63 330 aa8.68□□□□□ -1.02
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