RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000502676.1

PITX1-202, Transcript of paired like homeodomain 1, humanhuman

TSL 3

Gene PITX1, Length 666 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITX1-202ENST00000502676 FOXD4L5Q5VV16 416 aaPredicted RBP25.79■■□□□ 1.72
PITX1-202ENST00000502676 KCNK18Q7Z418 384 aa25.79■■□□□ 1.72
PITX1-202ENST00000502676 ZBTB8OSQ8IWT0 167 aa25.79■■□□□ 1.72
PITX1-202ENST00000502676 KCTD17Q8N5Z5 321 aa25.79■■□□□ 1.72
PITX1-202ENST00000502676 RASSF8Q8NHQ8 419 aa25.79■■□□□ 1.72
PITX1-202ENST00000502676 FOXD4L4Q8WXT5 416 aaPredicted RBP25.79■■□□□ 1.72
PITX1-202ENST00000502676 CALML4Q96GE6 196 aa25.79■■□□□ 1.72
PITX1-202ENST00000502676 TRAIPQ9BWF2 469 aa25.79■■□□□ 1.72
PITX1-202ENST00000502676 SSBP05455 408 aaKnown RBP eCLIP25.78■■□□□ 1.72
PITX1-202ENST00000502676 RB1P06400 928 aa25.78■■□□□ 1.72
PITX1-202ENST00000502676 POU3F3P20264 500 aaPredicted RBP25.78■■□□□ 1.72
PITX1-202ENST00000502676 RAB27AP51159 221 aa25.78■■□□□ 1.72
PITX1-202ENST00000502676 GRIN1Q05586 938 aa25.78■■□□□ 1.72
PITX1-202ENST00000502676 MBTD1Q05BQ5 628 aa25.78■■□□□ 1.72
PITX1-202ENST00000502676 PPP2R5AQ15172 486 aa25.78■■□□□ 1.72
PITX1-202ENST00000502676 KIFAP3Q92845 792 aa25.78■■□□□ 1.72
PITX1-202ENST00000502676 IFT74Q96LB3 600 aa25.78■■□□□ 1.72
PITX1-202ENST00000502676 TMEM117Q9H0C3 514 aa25.78■■□□□ 1.72
PITX1-202ENST00000502676 POLD4Q9HCU8 107 aa25.78■■□□□ 1.72
PITX1-202ENST00000502676 FAM105AQ9NUU6 356 aa25.78■■□□□ 1.72
PITX1-202ENST00000502676 H3BNC9 293 aa25.77■■□□□ 1.72
PITX1-202ENST00000502676 SLC26A4O43511 780 aa25.77■■□□□ 1.72
PITX1-202ENST00000502676 TSPAN1O60635 241 aa25.77■■□□□ 1.72
PITX1-202ENST00000502676 LINC00271P0C7V0 271 aa25.77■■□□□ 1.72
PITX1-202ENST00000502676 AXLP30530 894 aa25.77■■□□□ 1.72
PITX1-202ENST00000502676 ZNF598Q86UK7 904 aaKnown RBP25.77■■□□□ 1.72
PITX1-202ENST00000502676 USP28Q96RU2 1077 aa25.77■■□□□ 1.72
PITX1-202ENST00000502676 C11orf84Q9BUA3 381 aaPredicted RBP25.77■■□□□ 1.72
PITX1-202ENST00000502676 C2orf40Q9H1Z8 148 aa25.77■■□□□ 1.72
PITX1-202ENST00000502676 LMCD1Q9NZU5 365 aa25.77■■□□□ 1.72
PITX1-202ENST00000502676 COL4A4P53420 1690 aaPredicted RBP25.77■■□□□ 1.72
PITX1-202ENST00000502676 C5orf67F2Z3F1 127 aa25.76■■□□□ 1.71
PITX1-202ENST00000502676 ATF7P17544 494 aaPredicted RBP25.76■■□□□ 1.71
PITX1-202ENST00000502676 HOXA11P31270 313 aaPredicted RBP25.76■■□□□ 1.71
PITX1-202ENST00000502676 NAMPTP43490 491 aa25.76■■□□□ 1.71
PITX1-202ENST00000502676 LONRF3Q496Y0 759 aa25.76■■□□□ 1.71
PITX1-202ENST00000502676 TMEM119Q4V9L6 283 aa25.76■■□□□ 1.71
PITX1-202ENST00000502676 RINT1Q6NUQ1 792 aa25.76■■□□□ 1.71
PITX1-202ENST00000502676 NOTUMQ6P988 496 aa25.76■■□□□ 1.71
PITX1-202ENST00000502676 DEPTORQ8TB45 409 aa25.76■■□□□ 1.71
PITX1-202ENST00000502676 BSNDQ8WZ55 320 aa25.76■■□□□ 1.71
PITX1-202ENST00000502676 CPB2Q96IY4 423 aa25.76■■□□□ 1.71
PITX1-202ENST00000502676 CASD1Q96PB1 797 aa25.76■■□□□ 1.71
PITX1-202ENST00000502676 RUSC1Q9BVN2 902 aa25.76■■□□□ 1.71
PITX1-202ENST00000502676 RNF19AQ9NV58 838 aa25.76■■□□□ 1.71
PITX1-202ENST00000502676 EYSQ5T1H1 3165 aa25.76■■□□□ 1.71
PITX1-202ENST00000502676 TRANK1O15050 2925 aa25.75■■□□□ 1.71
PITX1-202ENST00000502676 NLRC5Q86WI3 1866 aa25.75■■□□□ 1.71
PITX1-202ENST00000502676 ZSCAN22P10073 491 aaPredicted RBP25.75■■□□□ 1.71
PITX1-202ENST00000502676 PTPROQ16827 1216 aa25.75■■□□□ 1.71
PITX1-202ENST00000502676 HELQQ8TDG4 1101 aa25.75■■□□□ 1.71
PITX1-202ENST00000502676 PGBD4Q96DM1 585 aa25.75■■□□□ 1.71
PITX1-202ENST00000502676 ZNF396Q96N95 335 aaPredicted RBP25.75■■□□□ 1.71
PITX1-202ENST00000502676 PLVAPQ9BX97 442 aa25.75■■□□□ 1.71
PITX1-202ENST00000502676 CSRNP2Q9H175 543 aa25.75■■□□□ 1.71
PITX1-202ENST00000502676 AAASQ9NRG9 546 aa25.75■■□□□ 1.71
PITX1-202ENST00000502676 TYW1Q9NV66 732 aaKnown RBP25.75■■□□□ 1.71
PITX1-202ENST00000502676 FBXO2Q9UK22 296 aaPredicted RBP25.75■■□□□ 1.71
PITX1-202ENST00000502676 PCDHB2Q9Y5E7 798 aa25.75■■□□□ 1.71
PITX1-202ENST00000502676 SRPRBQ9Y5M8 271 aaKnown RBP25.75■■□□□ 1.71
PITX1-202ENST00000502676 RALGAPA2Q2PPJ7 1873 aa25.74■■□□□ 1.71
PITX1-202ENST00000502676 ZNF623O75123 536 aa25.74■■□□□ 1.71
PITX1-202ENST00000502676 HIP1RO75146 1068 aa25.74■■□□□ 1.71
PITX1-202ENST00000502676 PLA2G4BP0C869 781 aa25.74■■□□□ 1.71
PITX1-202ENST00000502676 SLC39A14Q15043 492 aa25.74■■□□□ 1.71
PITX1-202ENST00000502676 KARSQ15046 597 aaKnown RBP25.74■■□□□ 1.71
PITX1-202ENST00000502676 AMHR2Q16671 573 aa25.74■■□□□ 1.71
PITX1-202ENST00000502676 CLLU1OSQ5K130 101 aa25.74■■□□□ 1.71
PITX1-202ENST00000502676 CDCA2Q69YH5 1023 aaPredicted RBP25.74■■□□□ 1.71
PITX1-202ENST00000502676 C1orf186Q6ZWK4 172 aa25.74■■□□□ 1.71
PITX1-202ENST00000502676 SYT2Q8N9I0 419 aaPredicted RBP25.74■■□□□ 1.71
PITX1-202ENST00000502676 SLC17A8Q8NDX2 589 aa25.74■■□□□ 1.71
PITX1-202ENST00000502676 LPPQ93052 612 aa25.74■■□□□ 1.71
PITX1-202ENST00000502676 CCDC51Q96ER9 411 aa25.74■■□□□ 1.71
PITX1-202ENST00000502676 DRC1Q96MC2 740 aa25.74■■□□□ 1.71
PITX1-202ENST00000502676 PRMT7Q9NVM4 692 aaPredicted RBP25.74■■□□□ 1.71
PITX1-202ENST00000502676 F13A1P00488 732 aa25.73■■□□□ 1.71
PITX1-202ENST00000502676 ARF4P18085 180 aaPredicted RBP25.73■■□□□ 1.71
PITX1-202ENST00000502676 LIG1P18858 919 aa25.73■■□□□ 1.71
PITX1-202ENST00000502676 STK38Q15208 465 aa25.73■■□□□ 1.71
PITX1-202ENST00000502676 TMEM132AQ24JP5 1023 aa25.73■■□□□ 1.71
PITX1-202ENST00000502676 SPECC1Q5M775 1068 aa25.73■■□□□ 1.71
PITX1-202ENST00000502676 UBXN11Q5T124 520 aa25.73■■□□□ 1.71
PITX1-202ENST00000502676 LRRC43Q8N309 656 aa25.73■■□□□ 1.71
PITX1-202ENST00000502676 TIPINQ9BVW5 301 aa25.73■■□□□ 1.71
PITX1-202ENST00000502676 HCSTQ9UBK5 93 aa25.73■■□□□ 1.71
PITX1-202ENST00000502676 PCDHB12Q9Y5F1 795 aa25.73■■□□□ 1.71
PITX1-202ENST00000502676 FNDC1Q4ZHG4 1894 aaPredicted RBP25.72■■□□□ 1.71
PITX1-202ENST00000502676 B4GALT5O43286 388 aa25.72■■□□□ 1.71
PITX1-202ENST00000502676 PLCG1P19174 1290 aa25.72■■□□□ 1.71
PITX1-202ENST00000502676 NASPP49321 788 aaPredicted RBP25.72■■□□□ 1.71
PITX1-202ENST00000502676 RAD51AP2Q09MP3 1159 aa25.72■■□□□ 1.71
PITX1-202ENST00000502676 SKIV2LQ15477 1246 aaKnown RBP25.72■■□□□ 1.71
PITX1-202ENST00000502676 MAPK6Q16659 721 aa25.72■■□□□ 1.71
PITX1-202ENST00000502676 NAALADL2Q58DX5 795 aa25.72■■□□□ 1.71
PITX1-202ENST00000502676 GLB1LQ6UWU2 654 aa25.72■■□□□ 1.71
PITX1-202ENST00000502676 P2RX5Q93086 422 aa25.72■■□□□ 1.71
PITX1-202ENST00000502676 MRPL38Q96DV4 380 aaKnown RBP25.72■■□□□ 1.71
PITX1-202ENST00000502676 EPSTI1Q96J88 318 aa25.72■■□□□ 1.71
PITX1-202ENST00000502676 PRIMPOLQ96LW4 560 aa25.72■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.6 ms