RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000498284.1

PTPRK-215, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type K, humanhuman

TSL 5

Gene PTPRK, Length 524 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRK-215ENST00000498284 RBM8AQ9Y5S9 174 aaKnown RBP5.98□□□□□ -1.45
PTPRK-215ENST00000498284 TNKSO95271 1327 aa5.98□□□□□ -1.45
PTPRK-215ENST00000498284 SHTN1A0MZ66 631 aa5.97□□□□□ -1.45
PTPRK-215ENST00000498284 KRTAP9-7A8MTY7 169 aa5.97□□□□□ -1.45
PTPRK-215ENST00000498284 GAAP10253 952 aa5.97□□□□□ -1.45
PTPRK-215ENST00000498284 RBP3P10745 1247 aa5.97□□□□□ -1.45
PTPRK-215ENST00000498284 MTNR1BP49286 362 aa5.97□□□□□ -1.45
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PTPRK-215ENST00000498284 LY86O95711 162 aa5.96□□□□□ -1.46
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PTPRK-215ENST00000498284 OSMP13725 252 aa5.96□□□□□ -1.46
PTPRK-215ENST00000498284 HSP90B1P14625 803 aaKnown RBP5.96□□□□□ -1.46
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PTPRK-215ENST00000498284 RAC3P60763 192 aa5.96□□□□□ -1.46
PTPRK-215ENST00000498284 ATP2C1P98194 919 aaPredicted RBP5.96□□□□□ -1.46
PTPRK-215ENST00000498284 PTPN21Q16825 1174 aa5.96□□□□□ -1.46
PTPRK-215ENST00000498284 UNC5BQ8IZJ1 945 aa5.96□□□□□ -1.46
PTPRK-215ENST00000498284 PLA2G15Q8NCC3 412 aa5.96□□□□□ -1.46
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PTPRK-215ENST00000498284 SLC7A6OSQ96CW6 309 aaPredicted RBP5.96□□□□□ -1.46
PTPRK-215ENST00000498284 TEPSINQ96N21 525 aa5.96□□□□□ -1.46
PTPRK-215ENST00000498284 SEC61A2Q9H9S3 476 aa5.96□□□□□ -1.46
PTPRK-215ENST00000498284 IFT122Q9HBG6 1241 aa5.96□□□□□ -1.46
PTPRK-215ENST00000498284 JADE2Q9NQC1 790 aa5.96□□□□□ -1.46
PTPRK-215ENST00000498284 ZNF277Q9NRM2 450 aaPredicted RBP5.96□□□□□ -1.46
PTPRK-215ENST00000498284 GPR45Q9Y5Y3 372 aa5.96□□□□□ -1.46
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PTPRK-215ENST00000498284 CCT2P78371 535 aaKnown RBP5.95□□□□□ -1.46
PTPRK-215ENST00000498284 TCIRG1Q13488 830 aa5.95□□□□□ -1.46
PTPRK-215ENST00000498284 PCBP2Q15366 365 aaKnown RBP eCLIP5.95□□□□□ -1.465e-10■■■■■ 52.4
PTPRK-215ENST00000498284 TTLL10Q6ZVT0 673 aa5.95□□□□□ -1.46
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PTPRK-215ENST00000498284 LMF1Q96S06 567 aa5.95□□□□□ -1.46
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PTPRK-215ENST00000498284 PUF60Q9UHX1 559 aaKnown RBP5.95□□□□□ -1.46
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PTPRK-215ENST00000498284 PLATP00750 562 aa5.94□□□□□ -1.46
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PTPRK-215ENST00000498284 TBC1D10BQ4KMP7 808 aaPredicted RBP5.94□□□□□ -1.46
PTPRK-215ENST00000498284 MBNL2Q5VZF2 373 aaKnown RBP5.94□□□□□ -1.46
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PTPRK-215ENST00000498284 PCDHGA9Q9Y5G4 932 aaKnown RBP5.94□□□□□ -1.46
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PTPRK-215ENST00000498284 PCDHGA3Q9Y5H0 932 aa5.94□□□□□ -1.46
PTPRK-215ENST00000498284 PCDHGA2Q9Y5H1 932 aa5.94□□□□□ -1.46
PTPRK-215ENST00000498284 MRFAP1Q9Y605 127 aa5.94□□□□□ -1.46
PTPRK-215ENST00000498284 NPEPPSL1A6NEC2 478 aa5.93□□□□□ -1.46
PTPRK-215ENST00000498284 XPOTO43592 962 aaKnown RBP5.93□□□□□ -1.46
PTPRK-215ENST00000498284 ALDH1L1O75891 902 aa5.93□□□□□ -1.46
PTPRK-215ENST00000498284 TOX4O94842 621 aa5.93□□□□□ -1.46
PTPRK-215ENST00000498284 VSIG10L2P0DP72 767 aa5.93□□□□□ -1.46
PTPRK-215ENST00000498284 CCND1P24385 295 aa5.93□□□□□ -1.46
PTPRK-215ENST00000498284 KRT85P78386 507 aa5.93□□□□□ -1.46
PTPRK-215ENST00000498284 ADRM1Q16186 407 aa5.93□□□□□ -1.46
PTPRK-215ENST00000498284 ANO4Q32M45 955 aa5.93□□□□□ -1.46
PTPRK-215ENST00000498284 PLEKHG6Q3KR16 790 aa5.93□□□□□ -1.46
PTPRK-215ENST00000498284 BTNL9Q6UXG8 535 aa5.93□□□□□ -1.46
PTPRK-215ENST00000498284 TAS1R1Q7RTX1 841 aa5.93□□□□□ -1.46
PTPRK-215ENST00000498284 PNMA8AQ86V59 439 aaPredicted RBP5.93□□□□□ -1.46
PTPRK-215ENST00000498284 ANKRD53Q8N9V6 530 aa5.93□□□□□ -1.46
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