RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000497511.5

SKAP2-209, Transcript of src kinase associated phosphoprotein 2, human

TSL 4

Gene SKAP2, Length 585 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SKAP2-209	ENST00000497511	LLGL2	Q6P1M3	1020 aa		12.39	□□□□□ -0.43
SKAP2-209	ENST00000497511	CYB5R4	Q7L1T6	521 aa		12.39	□□□□□ -0.43
SKAP2-209	ENST00000497511	RTN4RL1	Q86UN2	441 aa	Predicted RBP	12.39	□□□□□ -0.43
SKAP2-209	ENST00000497511	SIX5	Q8N196	739 aa		12.39	□□□□□ -0.43
SKAP2-209	ENST00000497511	RRP36	Q96EU6	259 aa	Known RBP	12.39	□□□□□ -0.43
SKAP2-209	ENST00000497511	ENTPD7	Q9NQZ7	604 aa		12.39	□□□□□ -0.43
SKAP2-209	ENST00000497511	TMEM260	Q9NX78	707 aa		12.39	□□□□□ -0.43
SKAP2-209	ENST00000497511	PUF60	Q9UHX1	559 aa	Known RBP	12.39	□□□□□ -0.43
SKAP2-209	ENST00000497511	NR2E1	Q9Y466	385 aa		12.39	□□□□□ -0.43
SKAP2-209	ENST00000497511	SQOR	Q9Y6N5	450 aa		12.39	□□□□□ -0.43
SKAP2-209	ENST00000497511	GSTTP1	A0A1W2PQM5	241 aa		12.38	□□□□□ -0.43
SKAP2-209	ENST00000497511		M0R2N6	131 aa		12.38	□□□□□ -0.43
SKAP2-209	ENST00000497511	ATP9A	O75110	1047 aa		12.38	□□□□□ -0.43
SKAP2-209	ENST00000497511	FGF18	O76093	207 aa		12.38	□□□□□ -0.43
SKAP2-209	ENST00000497511	KCNA2	P16389	499 aa		12.38	□□□□□ -0.43
SKAP2-209	ENST00000497511	SARS	P49591	514 aa	Known RBP	12.38	□□□□□ -0.43
SKAP2-209	ENST00000497511	KRT76	Q01546	638 aa		12.38	□□□□□ -0.43
SKAP2-209	ENST00000497511	HDAC1	Q13547	482 aa	Predicted RBP	12.38	□□□□□ -0.43
SKAP2-209	ENST00000497511	TMEM266	Q2M3C6	531 aa		12.38	□□□□□ -0.43
SKAP2-209	ENST00000497511	SLC35G1	Q2M3R5	365 aa		12.38	□□□□□ -0.43
SKAP2-209	ENST00000497511	MARCH8	Q5T0T0	291 aa		12.38	□□□□□ -0.43
SKAP2-209	ENST00000497511	PDE12	Q6L8Q7	609 aa	Known RBP	12.38	□□□□□ -0.43
SKAP2-209	ENST00000497511	CTCFL	Q8NI51	663 aa	Predicted RBP	12.38	□□□□□ -0.43
SKAP2-209	ENST00000497511	C1orf216	Q8TAB5	229 aa		12.38	□□□□□ -0.43
SKAP2-209	ENST00000497511	SUSD6	Q92537	303 aa		12.38	□□□□□ -0.43
SKAP2-209	ENST00000497511	RIPOR3	Q96MK2	946 aa		12.38	□□□□□ -0.43
SKAP2-209	ENST00000497511	CELF4	Q9BZC1	486 aa	Known RBP	12.38	□□□□□ -0.43
SKAP2-209	ENST00000497511	VRTN	Q9H8Y1	702 aa		12.38	□□□□□ -0.43
SKAP2-209	ENST00000497511	IGSF9B	Q9UPX0	1349 aa		12.37	□□□□□ -0.43
SKAP2-209	ENST00000497511	TRIO	O75962	3097 aa		12.37	□□□□□ -0.43
SKAP2-209	ENST00000497511	PTPRZ1	P23471	2315 aa	Predicted RBP	12.37	□□□□□ -0.43
SKAP2-209	ENST00000497511	SPDYE3	A6NKU9	549 aa		12.37	□□□□□ -0.43
SKAP2-209	ENST00000497511	RPS6KA5	O75582	802 aa		12.37	□□□□□ -0.43
SKAP2-209	ENST00000497511	PDGFB	P01127	241 aa	Predicted RBP	12.37	□□□□□ -0.43
SKAP2-209	ENST00000497511	CA8	P35219	290 aa		12.37	□□□□□ -0.43
SKAP2-209	ENST00000497511	ERVFC1	P60507	584 aa		12.37	□□□□□ -0.43
SKAP2-209	ENST00000497511	APOBR	Q0VD83	1088 aa		12.37	□□□□□ -0.43
SKAP2-209	ENST00000497511	MTMR3	Q13615	1198 aa		12.37	□□□□□ -0.43
SKAP2-209	ENST00000497511	ODR4	Q5SWX8	454 aa		12.37	□□□□□ -0.43
SKAP2-209	ENST00000497511	ANKRD54	Q6NXT1	300 aa		12.37	□□□□□ -0.43
SKAP2-209	ENST00000497511	PGBD3	Q8N328	593 aa		12.37	□□□□□ -0.43
SKAP2-209	ENST00000497511	KREMEN2	Q8NCW0	462 aa		12.37	□□□□□ -0.43
SKAP2-209	ENST00000497511	VN1R2	Q8NFZ6	395 aa		12.37	□□□□□ -0.43
SKAP2-209	ENST00000497511	ATP8B4	Q8TF62	1192 aa		12.37	□□□□□ -0.43
SKAP2-209	ENST00000497511	TRAPPC12	Q8WVT3	735 aa		12.37	□□□□□ -0.43
SKAP2-209	ENST00000497511	TCF25	Q9BQ70	676 aa		12.37	□□□□□ -0.43
SKAP2-209	ENST00000497511	MFSD1	Q9H3U5	465 aa		12.37	□□□□□ -0.43
SKAP2-209	ENST00000497511	JPH1	Q9HDC5	661 aa	Predicted RBP	12.37	□□□□□ -0.43
SKAP2-209	ENST00000497511	SCHIP1	Q9P0W5	487 aa	Predicted RBP	12.37	□□□□□ -0.43
SKAP2-209	ENST00000497511	CACNA1H	O95180	2353 aa		12.37	□□□□□ -0.43
SKAP2-209	ENST00000497511	LAG3	P18627	525 aa		12.36	□□□□□ -0.43
SKAP2-209	ENST00000497511	KIF5B	P33176	963 aa		12.36	□□□□□ -0.43
SKAP2-209	ENST00000497511	LBR	Q14739	615 aa	Known RBP	12.36	□□□□□ -0.43
SKAP2-209	ENST00000497511	CES5A	Q6NT32	575 aa		12.36	□□□□□ -0.43
SKAP2-209	ENST00000497511	ASCL5	Q7RTU5	278 aa		12.36	□□□□□ -0.43
SKAP2-209	ENST00000497511	GPR161	Q8N6U8	529 aa	Known RBP	12.36	□□□□□ -0.43
SKAP2-209	ENST00000497511	COLGALT1	Q8NBJ5	622 aa		12.36	□□□□□ -0.43
SKAP2-209	ENST00000497511	ADAM2	Q99965	735 aa		12.36	□□□□□ -0.43
SKAP2-209	ENST00000497511	SDF4	Q9BRK5	362 aa		12.36	□□□□□ -0.43
SKAP2-209	ENST00000497511	PSTPIP2	Q9H939	334 aa		12.36	□□□□□ -0.43
SKAP2-209	ENST00000497511	ATP6V0A4	Q9HBG4	840 aa		12.36	□□□□□ -0.43
SKAP2-209	ENST00000497511	C1orf112	Q9NSG2	853 aa		12.36	□□□□□ -0.43
SKAP2-209	ENST00000497511	CUEDC1	Q9NWM3	386 aa	Predicted RBP	12.36	□□□□□ -0.43
SKAP2-209	ENST00000497511	SORCS3	Q9UPU3	1222 aa		12.36	□□□□□ -0.43
SKAP2-209	ENST00000497511	KIAA1024	Q9UPX6	916 aa		12.36	□□□□□ -0.43
SKAP2-209	ENST00000497511	PCDHA2	Q9Y5H9	948 aa		12.36	□□□□□ -0.43
SKAP2-209	ENST00000497511	TTC3	P53804	2025 aa		12.36	□□□□□ -0.43
SKAP2-209	ENST00000497511	USP34	Q70CQ2	3546 aa		12.36	□□□□□ -0.43
SKAP2-209	ENST00000497511	ATG2A	Q2TAZ0	1938 aa		12.35	□□□□□ -0.43
SKAP2-209	ENST00000497511	SMIM35	A0A1B0GVV1	85 aa		12.35	□□□□□ -0.43
SKAP2-209	ENST00000497511	MEIS2	O14770	477 aa		12.35	□□□□□ -0.43
SKAP2-209	ENST00000497511	HOXB8	P17481	243 aa	Predicted RBP	12.35	□□□□□ -0.43
SKAP2-209	ENST00000497511	ITGB5	P18084	799 aa		12.35	□□□□□ -0.43
SKAP2-209	ENST00000497511	PLA2G4A	P47712	749 aa		12.35	□□□□□ -0.43
SKAP2-209	ENST00000497511	STAT5B	P51692	787 aa		12.35	□□□□□ -0.43
SKAP2-209	ENST00000497511	TROAP	Q12815	778 aa		12.35	□□□□□ -0.43
SKAP2-209	ENST00000497511	PLCB4	Q15147	1175 aa		12.35	□□□□□ -0.43
SKAP2-209	ENST00000497511	DBN1	Q16643	649 aa		12.35	□□□□□ -0.43
SKAP2-209	ENST00000497511	FAM102B	Q5T8I3	360 aa		12.35	□□□□□ -0.43
SKAP2-209	ENST00000497511	SLC24A5	Q71RS6	500 aa		12.35	□□□□□ -0.43
SKAP2-209	ENST00000497511	TMC7	Q7Z402	723 aa		12.35	□□□□□ -0.43
SKAP2-209	ENST00000497511	UBALD2	Q8IYN6	164 aa		12.35	□□□□□ -0.43
SKAP2-209	ENST00000497511	NME8	Q8N427	588 aa		12.35	□□□□□ -0.43
SKAP2-209	ENST00000497511	TMEM87A	Q8NBN3	555 aa		12.35	□□□□□ -0.43
SKAP2-209	ENST00000497511	NCOA7	Q8NI08	942 aa		12.35	□□□□□ -0.43
SKAP2-209	ENST00000497511	ZNF837	Q96EG3	531 aa	Predicted RBP	12.35	□□□□□ -0.43
SKAP2-209	ENST00000497511	TMX1	Q9H3N1	280 aa		12.35	□□□□□ -0.43
SKAP2-209	ENST00000497511	TYW1	Q9NV66	732 aa	Known RBP	12.35	□□□□□ -0.43
SKAP2-209	ENST00000497511	SLC9A2	Q9UBY0	812 aa		12.35	□□□□□ -0.43
SKAP2-209	ENST00000497511	LAMA4	Q16363	1823 aa		12.34	□□□□□ -0.43
SKAP2-209	ENST00000497511	KAT6A	Q92794	2004 aa		12.34	□□□□□ -0.43
SKAP2-209	ENST00000497511	PRR23A	A6NEV1	266 aa		12.34	□□□□□ -0.43
SKAP2-209	ENST00000497511	PROB1	E7EW31	1015 aa		12.34	□□□□□ -0.43
SKAP2-209	ENST00000497511	GPR182	O15218	404 aa		12.34	□□□□□ -0.43
SKAP2-209	ENST00000497511	MAFG	O15525	162 aa		12.34	□□□□□ -0.43
SKAP2-209	ENST00000497511	FGFR1	P11362	822 aa		12.34	□□□□□ -0.43
SKAP2-209	ENST00000497511	KRT17	Q04695	432 aa		12.34	□□□□□ -0.43
SKAP2-209	ENST00000497511	MTHFD1L	Q6UB35	978 aa		12.34	□□□□□ -0.43
SKAP2-209	ENST00000497511	NFXL1	Q6ZNB6	911 aa		12.34	□□□□□ -0.43
SKAP2-209	ENST00000497511	CHD1L	Q86WJ1	897 aa		12.34	□□□□□ -0.43

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