RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000497425.1

TTC21B-208, Transcript of tetratricopeptide repeat domain 21B, human

TSL 3

Gene TTC21B, Length 617 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TTC21B-208	ENST00000497425	PF4V1	P10720	104 aa		4.95	□□□□□ -1.62
TTC21B-208	ENST00000497425	OSM	P13725	252 aa		4.95	□□□□□ -1.62
TTC21B-208	ENST00000497425	TCIRG1	Q13488	830 aa		4.95	□□□□□ -1.62
TTC21B-208	ENST00000497425	KANSL1	Q7Z3B3	1105 aa		4.95	□□□□□ -1.62
TTC21B-208	ENST00000497425	TPH2	Q8IWU9	490 aa		4.95	□□□□□ -1.62
TTC21B-208	ENST00000497425	KY	Q8NBH2	561 aa		4.95	□□□□□ -1.62
TTC21B-208	ENST00000497425	LCOR	Q96JN0	433 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
TTC21B-208	ENST00000497425	TEKT5	Q96M29	485 aa		4.95	□□□□□ -1.62
TTC21B-208	ENST00000497425	ZSWIM3	Q96MP5	696 aa		4.95	□□□□□ -1.62
TTC21B-208	ENST00000497425	CAMKK2	Q96RR4	588 aa		4.95	□□□□□ -1.62
TTC21B-208	ENST00000497425	TMEM209	Q96SK2	561 aa		4.95	□□□□□ -1.62
TTC21B-208	ENST00000497425	GORASP1	Q9BQQ3	440 aa		4.95	□□□□□ -1.62
TTC21B-208	ENST00000497425	TACO1	Q9BSH4	297 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
TTC21B-208	ENST00000497425	C11orf84	Q9BUA3	381 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
TTC21B-208	ENST00000497425	KCTD10	Q9H3F6	313 aa		4.95	□□□□□ -1.62
TTC21B-208	ENST00000497425	DEF6	Q9H4E7	631 aa		4.95	□□□□□ -1.62
TTC21B-208	ENST00000497425	DLL4	Q9NR61	685 aa		4.95	□□□□□ -1.62
TTC21B-208	ENST00000497425	DPP7	Q9UHL4	492 aa		4.95	□□□□□ -1.62
TTC21B-208	ENST00000497425	TMPRSS11E	Q9UL52	423 aa		4.95	□□□□□ -1.62
TTC21B-208	ENST00000497425	USP18	Q9UMW8	372 aa		4.95	□□□□□ -1.62
TTC21B-208	ENST00000497425	ANKRD6	Q9Y2G4	727 aa		4.95	□□□□□ -1.62
TTC21B-208	ENST00000497425	GPR45	Q9Y5Y3	372 aa		4.95	□□□□□ -1.62
TTC21B-208	ENST00000497425	HS3ST3A1	Q9Y663	406 aa		4.95	□□□□□ -1.62
TTC21B-208	ENST00000497425	C9orf118	A6NHY6	69 aa		4.94	□□□□□ -1.62
TTC21B-208	ENST00000497425	PRPF3	O43395	683 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
TTC21B-208	ENST00000497425	RFPL1	O75677	317 aa		4.94	□□□□□ -1.62
TTC21B-208	ENST00000497425	IL33	O95760	270 aa		4.94	□□□□□ -1.62
TTC21B-208	ENST00000497425	IL18BP	O95998	194 aa		4.94	□□□□□ -1.62
TTC21B-208	ENST00000497425	ATF3	P18847	181 aa		4.94	□□□□□ -1.62
TTC21B-208	ENST00000497425	AGXT	P21549	392 aa		4.94	□□□□□ -1.62
TTC21B-208	ENST00000497425	APEX1	P27695	318 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
TTC21B-208	ENST00000497425	LGALS4	P56470	323 aa		4.94	□□□□□ -1.62
TTC21B-208	ENST00000497425	KRT85	P78386	507 aa		4.94	□□□□□ -1.62
TTC21B-208	ENST00000497425	CDK17	Q00537	523 aa		4.94	□□□□□ -1.62
TTC21B-208	ENST00000497425	TRIM25	Q14258	630 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
TTC21B-208	ENST00000497425	ICAM4	Q14773	271 aa		4.94	□□□□□ -1.62
TTC21B-208	ENST00000497425	MLC1	Q15049	377 aa		4.94	□□□□□ -1.62
TTC21B-208	ENST00000497425	FAM102B	Q5T8I3	360 aa		4.94	□□□□□ -1.62
TTC21B-208	ENST00000497425	KCNK18	Q7Z418	384 aa		4.94	□□□□□ -1.62
TTC21B-208	ENST00000497425	CIR1	Q86X95	450 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
TTC21B-208	ENST00000497425	LYSMD2	Q8IV50	215 aa		4.94	□□□□□ -1.62
TTC21B-208	ENST00000497425	CMTR2	Q8IYT2	770 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
TTC21B-208	ENST00000497425	STPG3	Q8N7X2	389 aa		4.94	□□□□□ -1.62
TTC21B-208	ENST00000497425	PPM1N	Q8N819	430 aa		4.94	□□□□□ -1.62
TTC21B-208	ENST00000497425	TXNDC5	Q8NBS9	432 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
TTC21B-208	ENST00000497425	RPGR	Q92834	1020 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
TTC21B-208	ENST00000497425	HSPBAP1	Q96EW2	488 aa		4.94	□□□□□ -1.62
TTC21B-208	ENST00000497425	CCDC136	Q96JN2	1154 aa		4.94	□□□□□ -1.62
TTC21B-208	ENST00000497425	C8orf48	Q96LL4	319 aa		4.94	□□□□□ -1.62
TTC21B-208	ENST00000497425	BTBD2	Q9BX70	525 aa		4.94	□□□□□ -1.62
TTC21B-208	ENST00000497425	WNT8A	Q9H1J5	351 aa		4.94	□□□□□ -1.62
TTC21B-208	ENST00000497425	OR10A5	Q9H207	317 aa		4.94	□□□□□ -1.62
TTC21B-208	ENST00000497425	TCF7L1	Q9HCS4	588 aa		4.94	□□□□□ -1.62
TTC21B-208	ENST00000497425	ZFP69B	Q9UJL9	534 aa		4.94	□□□□□ -1.62
TTC21B-208	ENST00000497425	GIT1	Q9Y2X7	761 aa		4.94	□□□□□ -1.62
TTC21B-208	ENST00000497425	NUMBL	Q9Y6R0	609 aa		4.94	□□□□□ -1.62
TTC21B-208	ENST00000497425	MYPN	Q86TC9	1320 aa		4.94	□□□□□ -1.62
TTC21B-208	ENST00000497425	NPEPPSL1	A6NEC2	478 aa		4.93	□□□□□ -1.62
TTC21B-208	ENST00000497425	PFKM	P08237	780 aa		4.93	□□□□□ -1.62
TTC21B-208	ENST00000497425	MTNR1B	P49286	362 aa		4.93	□□□□□ -1.62
TTC21B-208	ENST00000497425	SELENOP	P49908	381 aa		4.93	□□□□□ -1.62
TTC21B-208	ENST00000497425	ITGA1	P56199	1179 aa		4.93	□□□□□ -1.62
TTC21B-208	ENST00000497425	BCAR1	P56945	870 aa		4.93	□□□□□ -1.62
TTC21B-208	ENST00000497425	TGFB2	P61812	414 aa		4.93	□□□□□ -1.62
TTC21B-208	ENST00000497425	CCT2	P78371	535 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
TTC21B-208	ENST00000497425	IL13RA1	P78552	427 aa		4.93	□□□□□ -1.62
TTC21B-208	ENST00000497425	MRPS9	P82933	396 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
TTC21B-208	ENST00000497425	CD83	Q01151	205 aa		4.93	□□□□□ -1.62
TTC21B-208	ENST00000497425	TMEM240	Q5SV17	173 aa		4.93	□□□□□ -1.62
TTC21B-208	ENST00000497425	MCTP2	Q6DN12	878 aa		4.93	□□□□□ -1.62
TTC21B-208	ENST00000497425	TCEAL8	Q8IYN2	117 aa		4.93	□□□□□ -1.62
TTC21B-208	ENST00000497425	TTC8	Q8TAM2	541 aa		4.93	□□□□□ -1.62
TTC21B-208	ENST00000497425	RAX2	Q96IS3	184 aa		4.93	□□□□□ -1.62
TTC21B-208	ENST00000497425	CLIC6	Q96NY7	704 aa		4.93	□□□□□ -1.62
TTC21B-208	ENST00000497425	MTG2	Q9H4K7	406 aa		4.93	□□□□□ -1.62
TTC21B-208	ENST00000497425	CD248	Q9HCU0	757 aa		4.93	□□□□□ -1.62
TTC21B-208	ENST00000497425	PPP4R1L	Q9P1A2	415 aa		4.93	□□□□□ -1.62
TTC21B-208	ENST00000497425	GABBR1	Q9UBS5	961 aa		4.93	□□□□□ -1.62
TTC21B-208	ENST00000497425	MAGEL2	Q9UJ55	1249 aa		4.93	□□□□□ -1.62
TTC21B-208	ENST00000497425	CROT	Q9UKG9	612 aa		4.93	□□□□□ -1.62
TTC21B-208	ENST00000497425	DENND2A	Q9ULE3	1009 aa		4.93	□□□□□ -1.62
TTC21B-208	ENST00000497425	ZBTB21	Q9ULJ3	1066 aa		4.93	□□□□□ -1.62
TTC21B-208	ENST00000497425	TCAF1	Q9Y4C2	921 aa		4.93	□□□□□ -1.62
TTC21B-208	ENST00000497425	MTHFD2	P13995	350 aa		4.92	□□□□□ -1.62
TTC21B-208	ENST00000497425	C5AR1	P21730	350 aa		4.92	□□□□□ -1.62
TTC21B-208	ENST00000497425	PURA	Q00577	322 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
TTC21B-208	ENST00000497425	PPARA	Q07869	468 aa		4.92	□□□□□ -1.62
TTC21B-208	ENST00000497425	NFATC3	Q12968	1075 aa		4.92	□□□□□ -1.62
TTC21B-208	ENST00000497425	KLF10	Q13118	480 aa		4.92	□□□□□ -1.62
TTC21B-208	ENST00000497425	ADAM9	Q13443	819 aa		4.92	□□□□□ -1.62
TTC21B-208	ENST00000497425	MUM1	Q2TAK8	710 aa		4.92	□□□□□ -1.62
TTC21B-208	ENST00000497425	DPP8	Q6V1X1	898 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
TTC21B-208	ENST00000497425	AUTS2	Q8WXX7	1259 aa		4.92	□□□□□ -1.62
TTC21B-208	ENST00000497425	LRGUK	Q96M69	825 aa		4.92	□□□□□ -1.62
TTC21B-208	ENST00000497425	NOL10	Q9BSC4	688 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
TTC21B-208	ENST00000497425	IFT122	Q9HBG6	1241 aa		4.92	□□□□□ -1.62
TTC21B-208	ENST00000497425	ZNF277	Q9NRM2	450 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
TTC21B-208	ENST00000497425	GEMIN8	Q9NWZ8	242 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
TTC21B-208	ENST00000497425	FTSJ1	Q9UET6	329 aa		4.92	□□□□□ -1.62
TTC21B-208	ENST00000497425	PRSS50	Q9UI38	385 aa		4.92	□□□□□ -1.62

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 17.9 ms