RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000496183.5

RBM39-241, Transcript of RNA binding motif protein 39, humanhuman

TSL 2

Gene RBM39, Length 632 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBM39-241ENST00000496183 TNFRSF1AP19438 455 aa6.58□□□□□ -1.36
RBM39-241ENST00000496183 HIBADHP31937 336 aaKnown RBP6.58□□□□□ -1.36
RBM39-241ENST00000496183 ADCYAP1R1P41586 468 aa6.58□□□□□ -1.36
RBM39-241ENST00000496183 FOXL1Q12952 345 aa6.58□□□□□ -1.36
RBM39-241ENST00000496183 TERF2Q15554 542 aa6.58□□□□□ -1.36
RBM39-241ENST00000496183 MFSD5Q6N075 450 aa6.58□□□□□ -1.36
RBM39-241ENST00000496183 MAMDC4Q6UXC1 1216 aa6.58□□□□□ -1.36
RBM39-241ENST00000496183 GPR135Q8IZ08 494 aa6.58□□□□□ -1.36
RBM39-241ENST00000496183 CHAC2Q8WUX2 184 aa6.58□□□□□ -1.36
RBM39-241ENST00000496183 SLC5A5Q92911 643 aa6.58□□□□□ -1.36
RBM39-241ENST00000496183 TMEM176AQ96HP8 235 aa6.58□□□□□ -1.36
RBM39-241ENST00000496183 RPL10LQ96L21 214 aaKnown RBP6.58□□□□□ -1.36
RBM39-241ENST00000496183 KRTAP17-1Q9BYP8 105 aa6.58□□□□□ -1.36
RBM39-241ENST00000496183 CAAP1Q9H8G2 361 aa6.58□□□□□ -1.36
RBM39-241ENST00000496183 EMC7Q9NPA0 242 aa6.58□□□□□ -1.36
RBM39-241ENST00000496183 GIT1Q9Y2X7 761 aa6.58□□□□□ -1.36
RBM39-241ENST00000496183 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP6.57□□□□□ -1.36
RBM39-241ENST00000496183 A0A087X0B3 334 aa6.57□□□□□ -1.36
RBM39-241ENST00000496183 C2orf78A6NCI8 922 aa6.57□□□□□ -1.36
RBM39-241ENST00000496183 MTSS1O43312 755 aa6.57□□□□□ -1.36
RBM39-241ENST00000496183 TGM5O43548 720 aa6.57□□□□□ -1.36
RBM39-241ENST00000496183 KDM1AO60341 852 aa6.57□□□□□ -1.36
RBM39-241ENST00000496183 KIR2DL3P43628 341 aa6.57□□□□□ -1.36
RBM39-241ENST00000496183 NPEPPSP55786 919 aa6.57□□□□□ -1.36
RBM39-241ENST00000496183 ZXDAP98168 799 aa6.57□□□□□ -1.36
RBM39-241ENST00000496183 CDSNQ15517 529 aa6.57□□□□□ -1.36
RBM39-241ENST00000496183 NRN1LQ496H8 165 aa6.57□□□□□ -1.36
RBM39-241ENST00000496183 LMBR1LQ6UX01 489 aa6.57□□□□□ -1.36
RBM39-241ENST00000496183 ZNF662Q6ZS27 426 aa6.57□□□□□ -1.36
RBM39-241ENST00000496183 SPRED1Q7Z699 444 aa6.57□□□□□ -1.36
RBM39-241ENST00000496183 GLB1L2Q8IW92 636 aa6.57□□□□□ -1.36
RBM39-241ENST00000496183 UNC5BQ8IZJ1 945 aa6.57□□□□□ -1.36
RBM39-241ENST00000496183 VPS11Q9H270 941 aa6.57□□□□□ -1.36
RBM39-241ENST00000496183 IL23AQ9NPF7 189 aa6.57□□□□□ -1.36
RBM39-241ENST00000496183 TLR9Q9NR96 1032 aa6.57□□□□□ -1.36
RBM39-241ENST00000496183 ZC3H11BA0A1B0GUI2 810 aaPredicted RBP6.56□□□□□ -1.36
RBM39-241ENST00000496183 BRINP1O60477 761 aa6.56□□□□□ -1.36
RBM39-241ENST00000496183 ACRV1P26436 265 aa6.56□□□□□ -1.36
RBM39-241ENST00000496183 GDF5P43026 501 aa6.56□□□□□ -1.36
RBM39-241ENST00000496183 SESN3P58005 492 aa6.56□□□□□ -1.36
RBM39-241ENST00000496183 CRHR2Q13324 411 aa6.56□□□□□ -1.36
RBM39-241ENST00000496183 BROXQ5VW32 411 aa6.56□□□□□ -1.36
RBM39-241ENST00000496183 RASSF3Q86WH2 238 aa6.56□□□□□ -1.36
RBM39-241ENST00000496183 GSPT2Q8IYD1 628 aaKnown RBP6.56□□□□□ -1.36
RBM39-241ENST00000496183 GAB3Q8WWW8 586 aa6.56□□□□□ -1.36
RBM39-241ENST00000496183 MIEF2Q96C03 454 aa6.56□□□□□ -1.36
RBM39-241ENST00000496183 PAWRQ96IZ0 340 aaKnown RBP6.56□□□□□ -1.36
RBM39-241ENST00000496183 NCDNQ9UBB6 729 aa6.56□□□□□ -1.36
RBM39-241ENST00000496183 SRRDQ9UH36 339 aa6.56□□□□□ -1.36
RBM39-241ENST00000496183 USP18Q9UMW8 372 aa6.56□□□□□ -1.36
RBM39-241ENST00000496183 NUMBLQ9Y6R0 609 aa6.56□□□□□ -1.36
RBM39-241ENST00000496183 NESP48681 1621 aa6.56□□□□□ -1.36
RBM39-241ENST00000496183 MROH2BQ7Z745 1585 aa6.56□□□□□ -1.36
RBM39-241ENST00000496183 FZD7O75084 574 aa6.55□□□□□ -1.36
RBM39-241ENST00000496183 MFAP3LO75121 409 aa6.55□□□□□ -1.36
RBM39-241ENST00000496183 IPO13O94829 963 aaKnown RBP6.55□□□□□ -1.36
RBM39-241ENST00000496183 TACR2P21452 398 aa6.55□□□□□ -1.36
RBM39-241ENST00000496183 STAT3P40763 770 aa6.55□□□□□ -1.36
RBM39-241ENST00000496183 FAPQ12884 760 aa6.55□□□□□ -1.36
RBM39-241ENST00000496183 USP39Q53GS9 565 aaKnown RBP6.55□□□□□ -1.36
RBM39-241ENST00000496183 GIMAP6Q6P9H5 292 aa6.55□□□□□ -1.36
RBM39-241ENST00000496183 FAM111BQ6SJ93 734 aa6.55□□□□□ -1.36
RBM39-241ENST00000496183 UNQ6494/PRO21346Q6UXR6 183 aa6.55□□□□□ -1.36
RBM39-241ENST00000496183 RNF207Q6ZRF8 634 aa6.55□□□□□ -1.36
RBM39-241ENST00000496183 GAREM2Q75VX8 874 aa6.55□□□□□ -1.36
RBM39-241ENST00000496183 CXorf67Q86X51 503 aaPredicted RBP6.55□□□□□ -1.36
RBM39-241ENST00000496183 ZNF808Q8N4W9 903 aaPredicted RBP6.55□□□□□ -1.36
RBM39-241ENST00000496183 ZNF496Q96IT1 587 aaPredicted RBP6.55□□□□□ -1.36
RBM39-241ENST00000496183 ZNF341Q9BYN7 854 aa6.55□□□□□ -1.36
RBM39-241ENST00000496183 CADPSQ9ULU8 1353 aa6.55□□□□□ -1.36
RBM39-241ENST00000496183 ELL2O00472 640 aaPredicted RBP6.54□□□□□ -1.36
RBM39-241ENST00000496183 PFKMP08237 780 aa6.54□□□□□ -1.36
RBM39-241ENST00000496183 C6P13671 934 aa6.54□□□□□ -1.36
RBM39-241ENST00000496183 HNRNPLP14866 589 aaKnown RBP eCLIP6.54□□□□□ -1.36
RBM39-241ENST00000496183 STRN3Q13033 797 aa6.54□□□□□ -1.36
RBM39-241ENST00000496183 HDGFL2Q7Z4V5 671 aaPredicted RBP6.54□□□□□ -1.36
RBM39-241ENST00000496183 THNSL2Q86YJ6 484 aa6.54□□□□□ -1.36
RBM39-241ENST00000496183 C1orf210Q8IVY1 113 aa6.54□□□□□ -1.36
RBM39-241ENST00000496183 CMTM4Q8IZR5 234 aa6.54□□□□□ -1.36
RBM39-241ENST00000496183 OR14C36Q8NHC7 312 aa6.54□□□□□ -1.36
RBM39-241ENST00000496183 ACAP3Q96P50 834 aa6.54□□□□□ -1.36
RBM39-241ENST00000496183 GPHA2Q96T91 129 aa6.54□□□□□ -1.36
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RBM39-241ENST00000496183 TMPRSS5Q9H3S3 457 aa6.54□□□□□ -1.36
RBM39-241ENST00000496183 PRKAB1Q9Y478 270 aa6.54□□□□□ -1.36
RBM39-241ENST00000496183 UBE2QL1A1L167 161 aa6.53□□□□□ -1.36
RBM39-241ENST00000496183 BPIP17213 487 aa6.53□□□□□ -1.36
RBM39-241ENST00000496183 CNGA1P29973 690 aa6.53□□□□□ -1.36
RBM39-241ENST00000496183 PPARAQ07869 468 aa6.53□□□□□ -1.36
RBM39-241ENST00000496183 CNGB1Q14028 1251 aaPredicted RBP6.53□□□□□ -1.36
RBM39-241ENST00000496183 FKBP15Q5T1M5 1219 aa6.53□□□□□ -1.36
RBM39-241ENST00000496183 Q6ZSN1 163 aa6.53□□□□□ -1.36
RBM39-241ENST00000496183 RNF180Q86T96 592 aa6.53□□□□□ -1.36
RBM39-241ENST00000496183 EPC1Q9H2F5 836 aa6.53□□□□□ -1.36
RBM39-241ENST00000496183 AGO3Q9H9G7 860 aaKnown RBP6.53□□□□□ -1.36
RBM39-241ENST00000496183 PARPBPQ9NWS1 579 aa6.53□□□□□ -1.36
RBM39-241ENST00000496183 MRC2Q9UBG0 1479 aa6.53□□□□□ -1.36
RBM39-241ENST00000496183 ALDH1A2O94788 518 aa6.52□□□□□ -1.37
RBM39-241ENST00000496183 AMHP03971 560 aa6.52□□□□□ -1.37
RBM39-241ENST00000496183 GAAP10253 952 aa6.52□□□□□ -1.37
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