RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000495350.5

CBX1-205, Transcript of chromobox 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene CBX1, Length 550 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX1-205ENST00000495350 GLULP15104 373 aa6.96□□□□□ -1.3
CBX1-205ENST00000495350 FGFR4P22455 802 aa6.96□□□□□ -1.3
CBX1-205ENST00000495350 PHKA2P46019 1235 aa6.96□□□□□ -1.3
CBX1-205ENST00000495350 SLC11A1P49279 550 aa6.96□□□□□ -1.3
CBX1-205ENST00000495350 RAB27AP51159 221 aa6.96□□□□□ -1.3
CBX1-205ENST00000495350 NAPAP54920 295 aa6.96□□□□□ -1.3
CBX1-205ENST00000495350 STARD6P59095 220 aa6.96□□□□□ -1.3
CBX1-205ENST00000495350 CDC42EP1Q00587 391 aa6.96□□□□□ -1.3
CBX1-205ENST00000495350 PFKPQ01813 784 aa6.96□□□□□ -1.3
CBX1-205ENST00000495350 PRKCQQ04759 706 aa6.96□□□□□ -1.3
CBX1-205ENST00000495350 SNW1Q13573 536 aaKnown RBP6.96□□□□□ -1.3
CBX1-205ENST00000495350 HTR4Q13639 388 aa6.96□□□□□ -1.3
CBX1-205ENST00000495350 COL9A2Q14055 689 aaPredicted RBP6.96□□□□□ -1.3
CBX1-205ENST00000495350 PPP2R5DQ14738 602 aa6.96□□□□□ -1.3
CBX1-205ENST00000495350 MLF2Q15773 248 aaPredicted RBP6.96□□□□□ -1.3
CBX1-205ENST00000495350 LONRF3Q496Y0 759 aa6.96□□□□□ -1.3
CBX1-205ENST00000495350 PLA2G4DQ86XP0 818 aa6.96□□□□□ -1.3
CBX1-205ENST00000495350 LRRC71Q8N4P6 559 aa6.96□□□□□ -1.3
CBX1-205ENST00000495350 FEZF2Q8TBJ5 459 aa6.96□□□□□ -1.3
CBX1-205ENST00000495350 DDX1Q92499 740 aaKnown RBP6.96□□□□□ -1.3
CBX1-205ENST00000495350 LPPQ93052 612 aa6.96□□□□□ -1.3
CBX1-205ENST00000495350 PGBD4Q96DM1 585 aa6.96□□□□□ -1.3
CBX1-205ENST00000495350 ANO3Q9BYT9 981 aa6.96□□□□□ -1.3
CBX1-205ENST00000495350 RHOBTB2Q9BYZ6 727 aa6.96□□□□□ -1.3
CBX1-205ENST00000495350 INO80BQ9C086 356 aaPredicted RBP6.96□□□□□ -1.3
CBX1-205ENST00000495350 EPC1Q9H2F5 836 aa6.96□□□□□ -1.3
CBX1-205ENST00000495350 ADAMTS10Q9H324 1103 aa6.96□□□□□ -1.3
CBX1-205ENST00000495350 LY9Q9HBG7 655 aa6.96□□□□□ -1.3
CBX1-205ENST00000495350 CHST12Q9NRB3 414 aa6.96□□□□□ -1.3
CBX1-205ENST00000495350 KANSL3Q9P2N6 904 aa6.96□□□□□ -1.3
CBX1-205ENST00000495350 ANGPTL2Q9UKU9 493 aa6.96□□□□□ -1.3
CBX1-205ENST00000495350 PIN4Q9Y237 131 aaKnown RBP6.96□□□□□ -1.3
CBX1-205ENST00000495350 FAN1Q9Y2M0 1017 aa6.96□□□□□ -1.3
CBX1-205ENST00000495350 ZFP37Q9Y6Q3 630 aaPredicted RBP6.96□□□□□ -1.3
CBX1-205ENST00000495350 C2orf16Q68DN1 1984 aa6.95□□□□□ -1.3
CBX1-205ENST00000495350 CNOT1A5YKK6 2376 aaKnown RBP6.95□□□□□ -1.3
CBX1-205ENST00000495350 LOC105378220A0A1B0GUY1 285 aaPredicted RBP6.95□□□□□ -1.3
CBX1-205ENST00000495350 hCG_1642624A0A1W2PR95 340 aa6.95□□□□□ -1.3
CBX1-205ENST00000495350 FAM170BA6NMN3 283 aa6.95□□□□□ -1.3
CBX1-205ENST00000495350 IPO5O00410 1097 aaKnown RBP6.95□□□□□ -1.3
CBX1-205ENST00000495350 MEIS1O00470 390 aa6.95□□□□□ -1.3
CBX1-205ENST00000495350 SLC30A4O14863 429 aa6.95□□□□□ -1.3
CBX1-205ENST00000495350 TEX28O15482 410 aa6.95□□□□□ -1.3
CBX1-205ENST00000495350 LRRN2O75325 713 aa6.95□□□□□ -1.3
CBX1-205ENST00000495350 RFPL2O75678 378 aa6.95□□□□□ -1.3
CBX1-205ENST00000495350 PLEKHA8P1O95397 391 aa6.95□□□□□ -1.3
CBX1-205ENST00000495350 SOD2P04179 222 aa6.95□□□□□ -1.3
CBX1-205ENST00000495350 ALDH2P05091 517 aa6.95□□□□□ -1.3
CBX1-205ENST00000495350 CALM1P0DP23 149 aa6.95□□□□□ -1.3
CBX1-205ENST00000495350 CALM2P0DP24 149 aa6.95□□□□□ -1.3
CBX1-205ENST00000495350 CALM3P0DP25 149 aa6.95□□□□□ -1.3
CBX1-205ENST00000495350 MYBP10242 640 aa6.95□□□□□ -1.3
CBX1-205ENST00000495350 GLUD2P49448 558 aa6.95□□□□□ -1.3
CBX1-205ENST00000495350 DNM2P50570 870 aa6.95□□□□□ -1.3
CBX1-205ENST00000495350 GPC3P51654 580 aa6.95□□□□□ -1.3
CBX1-205ENST00000495350 ADCY7P51828 1080 aa6.95□□□□□ -1.3
CBX1-205ENST00000495350 NRLP54845 237 aa6.95□□□□□ -1.3
CBX1-205ENST00000495350 SETQ01105 290 aaPredicted RBP6.95□□□□□ -1.3
CBX1-205ENST00000495350 SPEM2Q0P670 501 aa6.95□□□□□ -1.3
CBX1-205ENST00000495350 AP3B2Q13367 1082 aa6.95□□□□□ -1.3
CBX1-205ENST00000495350 COL9A3Q14050 684 aaPredicted RBP6.95□□□□□ -1.3
CBX1-205ENST00000495350 ZBTB41Q5SVQ8 909 aa6.95□□□□□ -1.3
CBX1-205ENST00000495350 ZNF746Q6NUN9 644 aaPredicted RBP6.95□□□□□ -1.3
CBX1-205ENST00000495350 RSPO2Q6UXX9 243 aaPredicted RBP6.95□□□□□ -1.3
CBX1-205ENST00000495350 MTSS1LQ765P7 747 aa6.95□□□□□ -1.3
CBX1-205ENST00000495350 NIPA1Q7RTP0 329 aa6.95□□□□□ -1.3
CBX1-205ENST00000495350 TEX2Q8IWB9 1127 aa6.95□□□□□ -1.3
CBX1-205ENST00000495350 SMAP1Q8IYB5 467 aaPredicted RBP6.95□□□□□ -1.3
CBX1-205ENST00000495350 MAML2Q8IZL2 1156 aaPredicted RBP6.95□□□□□ -1.3
CBX1-205ENST00000495350 TMTC2Q8N394 836 aa6.95□□□□□ -1.3
CBX1-205ENST00000495350 CCDC82Q8N4S0 544 aa6.95□□□□□ -1.3
CBX1-205ENST00000495350 SRBD1Q8N5C6 995 aaKnown RBP6.95□□□□□ -1.3
CBX1-205ENST00000495350 ZBTB44Q8NCP5 570 aa6.95□□□□□ -1.3
CBX1-205ENST00000495350 BCL7CQ8WUZ0 217 aaPredicted RBP6.95□□□□□ -1.3
CBX1-205ENST00000495350 PGBD1Q96JS3 809 aa6.95□□□□□ -1.3
CBX1-205ENST00000495350 RPS6KC1Q96S38 1066 aa6.95□□□□□ -1.3
CBX1-205ENST00000495350 TMEM175Q9BSA9 504 aa6.95□□□□□ -1.3
CBX1-205ENST00000495350 ZNF577Q9BSK1 485 aa6.95□□□□□ -1.3
CBX1-205ENST00000495350 TRAIPQ9BWF2 469 aa6.95□□□□□ -1.3
CBX1-205ENST00000495350 FAM126AQ9BYI3 521 aaPredicted RBP6.95□□□□□ -1.3
CBX1-205ENST00000495350 OSBPL6Q9BZF3 934 aa6.95□□□□□ -1.3
CBX1-205ENST00000495350 GLT8D2Q9H1C3 349 aa6.95□□□□□ -1.3
CBX1-205ENST00000495350 PLEKHA4Q9H4M7 779 aa6.95□□□□□ -1.3
CBX1-205ENST00000495350 NRBP2Q9NSY0 501 aa6.95□□□□□ -1.3
CBX1-205ENST00000495350 TBC1D22BQ9NU19 505 aa6.95□□□□□ -1.3
CBX1-205ENST00000495350 FAM105AQ9NUU6 356 aa6.95□□□□□ -1.3
CBX1-205ENST00000495350 ZDHHC7Q9NXF8 308 aa6.95□□□□□ -1.3
CBX1-205ENST00000495350 GABBR1Q9UBS5 961 aa6.95□□□□□ -1.3
CBX1-205ENST00000495350 DNAJB4Q9UDY4 337 aa6.95□□□□□ -1.3
CBX1-205ENST00000495350 MRPS17Q9Y2R5 130 aaKnown RBP6.95□□□□□ -1.3
CBX1-205ENST00000495350 PRG3Q9Y2Y8 225 aaPredicted RBP6.95□□□□□ -1.3
CBX1-205ENST00000495350 MAFBQ9Y5Q3 323 aaPredicted RBP6.95□□□□□ -1.3
CBX1-205ENST00000495350 PKD1L2Q7Z442 2459 aa6.95□□□□□ -1.3
CBX1-205ENST00000495350 MIA3Q5JRA6 1907 aa6.95□□□□□ -1.3
CBX1-205ENST00000495350 WDR64B1ANS9 1081 aa6.94□□□□□ -1.3
CBX1-205ENST00000495350 E7EWF7 191 aa6.94□□□□□ -1.3
CBX1-205ENST00000495350 ANHXE9PGG2 379 aa6.94□□□□□ -1.3
CBX1-205ENST00000495350 FOXD2O60548 495 aaPredicted RBP6.94□□□□□ -1.3
CBX1-205ENST00000495350 LRP3O75074 770 aa6.94□□□□□ -1.3
CBX1-205ENST00000495350 NR1I2O75469 434 aa6.94□□□□□ -1.3
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 15.8 ms