RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000495022.5

TRDMT1-211, Transcript of tRNA aspartic acid methyltransferase 1, humanhuman

TSL 2

Gene TRDMT1, Length 1,374 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRDMT1-211ENST00000495022 ZC3H11AO75152 810 aaKnown RBP eCLIP25.26■■□□□ 1.63
TRDMT1-211ENST00000495022 P4HBP07237 508 aaKnown RBP25.26■■□□□ 1.63
TRDMT1-211ENST00000495022 KSR1Q8IVT5 923 aa25.26■■□□□ 1.63
TRDMT1-211ENST00000495022 SLKQ9H2G2 1235 aaPredicted RBP25.26■■□□□ 1.63
TRDMT1-211ENST00000495022 IFT122Q9HBG6 1241 aa25.26■■□□□ 1.63
TRDMT1-211ENST00000495022 COL4A3BPQ9Y5P4 624 aa25.26■■□□□ 1.63
TRDMT1-211ENST00000495022 HCFC2Q9Y5Z7 792 aa25.26■■□□□ 1.63
TRDMT1-211ENST00000495022 NT5C1B-RDH14C9J2C7 533 aa25.25■■□□□ 1.63
TRDMT1-211ENST00000495022 POLGP54098 1239 aaPredicted RBP25.25■■□□□ 1.63
TRDMT1-211ENST00000495022 SIGLEC14Q08ET2 396 aa25.25■■□□□ 1.63
TRDMT1-211ENST00000495022 NOMO2Q5JPE7 1267 aa25.25■■□□□ 1.63
TRDMT1-211ENST00000495022 LPPQ93052 612 aa25.25■■□□□ 1.63
TRDMT1-211ENST00000495022 PBXIP1Q96AQ6 731 aa25.25■■□□□ 1.63
TRDMT1-211ENST00000495022 DHX33Q9H6R0 707 aaKnown RBP25.25■■□□□ 1.63
TRDMT1-211ENST00000495022 AGPAT5Q9NUQ2 364 aa25.25■■□□□ 1.63
TRDMT1-211ENST00000495022 TBC1D13Q9NVG8 400 aa25.25■■□□□ 1.63
TRDMT1-211ENST00000495022 PFKFB2O60825 505 aa25.24■■□□□ 1.63
TRDMT1-211ENST00000495022 CLASP2O75122 1294 aaKnown RBP25.24■■□□□ 1.63
TRDMT1-211ENST00000495022 RFC5P40937 340 aa25.24■■□□□ 1.63
TRDMT1-211ENST00000495022 NPEPPSP55786 919 aa25.24■■□□□ 1.63
TRDMT1-211ENST00000495022 ITIH3Q06033 890 aa25.24■■□□□ 1.63
TRDMT1-211ENST00000495022 ALYREFQ86V81 257 aaKnown RBP25.24■■□□□ 1.63
TRDMT1-211ENST00000495022 VPS52Q8N1B4 723 aa25.24■■□□□ 1.63
TRDMT1-211ENST00000495022 NECTIN4Q96NY8 510 aa25.24■■□□□ 1.63
TRDMT1-211ENST00000495022 APOL5Q9BWW9 433 aa25.24■■□□□ 1.63
TRDMT1-211ENST00000495022 ZBP1Q9H171 429 aa25.24■■□□□ 1.63
TRDMT1-211ENST00000495022 IRAK3Q9Y616 596 aa25.24■■□□□ 1.63
TRDMT1-211ENST00000495022 TDRD15B5MCY1 1934 aaKnown RBP25.24■■□□□ 1.63
TRDMT1-211ENST00000495022 DENND4AQ7Z401 1863 aa25.23■■□□□ 1.63
TRDMT1-211ENST00000495022 GAS2O43903 313 aaKnown RBP25.23■■□□□ 1.63
TRDMT1-211ENST00000495022 CCNT1O60563 726 aaKnown RBP25.23■■□□□ 1.63
TRDMT1-211ENST00000495022 CXCL14O95715 111 aa25.23■■□□□ 1.63
TRDMT1-211ENST00000495022 GIT2Q14161 759 aa25.23■■□□□ 1.63
TRDMT1-211ENST00000495022 PTPN21Q16825 1174 aa25.23■■□□□ 1.63
TRDMT1-211ENST00000495022 CES5AQ6NT32 575 aa25.23■■□□□ 1.63
TRDMT1-211ENST00000495022 PIK3AP1Q6ZUJ8 805 aa25.23■■□□□ 1.63
TRDMT1-211ENST00000495022 SRGAP1Q7Z6B7 1085 aa25.23■■□□□ 1.63
TRDMT1-211ENST00000495022 DDX53Q86TM3 631 aaKnown RBP25.23■■□□□ 1.63
TRDMT1-211ENST00000495022 C4orf19Q8IY42 314 aa25.23■■□□□ 1.63
TRDMT1-211ENST00000495022 PSPC1Q8WXF1 523 aaKnown RBP25.23■■□□□ 1.63
TRDMT1-211ENST00000495022 HAS1Q92839 578 aa25.23■■□□□ 1.63
TRDMT1-211ENST00000495022 PGBD4Q96DM1 585 aa25.23■■□□□ 1.63
TRDMT1-211ENST00000495022 IGSF21Q96ID5 467 aa25.23■■□□□ 1.63
TRDMT1-211ENST00000495022 CEP170P1Q96L14 293 aa25.23■■□□□ 1.63
TRDMT1-211ENST00000495022 ADAM7Q9H2U9 754 aa25.23■■□□□ 1.63
TRDMT1-211ENST00000495022 NRDE2Q9H7Z3 1164 aa25.23■■□□□ 1.63
TRDMT1-211ENST00000495022 WRAP73Q9P2S5 460 aaPredicted RBP25.23■■□□□ 1.63
TRDMT1-211ENST00000495022 NR2E1Q9Y466 385 aa25.23■■□□□ 1.63
TRDMT1-211ENST00000495022 OFD1O75665 1012 aa25.22■■□□□ 1.63
TRDMT1-211ENST00000495022 EPHA7Q15375 998 aa25.22■■□□□ 1.63
TRDMT1-211ENST00000495022 TMEM173Q86WV6 379 aaPredicted RBP25.22■■□□□ 1.63
TRDMT1-211ENST00000495022 SUGP1Q8IWZ8 645 aaKnown RBP25.22■■□□□ 1.63
TRDMT1-211ENST00000495022 ZNF579Q8NAF0 562 aaKnown RBP25.22■■□□□ 1.63
TRDMT1-211ENST00000495022 PRPF31Q8WWY3 499 aaKnown RBP25.22■■□□□ 1.63
TRDMT1-211ENST00000495022 LXNQ9BS40 222 aa25.22■■□□□ 1.63
TRDMT1-211ENST00000495022 TPCN1Q9ULQ1 816 aa25.22■■□□□ 1.63
TRDMT1-211ENST00000495022 INPP5FQ9Y2H2 1132 aa25.22■■□□□ 1.63
TRDMT1-211ENST00000495022 PCDHB2Q9Y5E7 798 aa25.22■■□□□ 1.63
TRDMT1-211ENST00000495022 ZC3H11BA0A1B0GUI2 810 aaPredicted RBP25.21■■□□□ 1.63
TRDMT1-211ENST00000495022 MEIS3P2A8K0S8 358 aa25.21■■□□□ 1.63
TRDMT1-211ENST00000495022 GALTP07902 379 aa25.21■■□□□ 1.63
TRDMT1-211ENST00000495022 CTSAP10619 480 aa25.21■■□□□ 1.63
TRDMT1-211ENST00000495022 CA8P35219 290 aa25.21■■□□□ 1.63
TRDMT1-211ENST00000495022 RNASELQ05823 741 aaKnown RBP25.21■■□□□ 1.63
TRDMT1-211ENST00000495022 LONRF3Q496Y0 759 aa25.21■■□□□ 1.63
TRDMT1-211ENST00000495022 SLFN12Q8IYM2 578 aa25.21■■□□□ 1.63
TRDMT1-211ENST00000495022 OXER1Q8TDS5 423 aa25.21■■□□□ 1.63
TRDMT1-211ENST00000495022 PRRX2Q99811 253 aa25.21■■□□□ 1.63
TRDMT1-211ENST00000495022 DZANK1Q9NVP4 752 aa25.21■■□□□ 1.63
TRDMT1-211ENST00000495022 YWHABP31946 246 aaKnown RBP25.2■■□□□ 1.63
TRDMT1-211ENST00000495022 MRE11P49959 708 aa25.2■■□□□ 1.63
TRDMT1-211ENST00000495022 OTUD6AQ7L8S5 288 aa25.2■■□□□ 1.63
TRDMT1-211ENST00000495022 MRPL10Q7Z7H8 261 aaKnown RBP25.2■■□□□ 1.63
TRDMT1-211ENST00000495022 POTEDQ86YR6 584 aa25.2■■□□□ 1.63
TRDMT1-211ENST00000495022 FBXL6Q8N531 539 aa25.2■■□□□ 1.63
TRDMT1-211ENST00000495022 URGCPQ8TCY9 931 aa25.2■■□□□ 1.63
TRDMT1-211ENST00000495022 TCP11Q8WWU5 503 aa25.2■■□□□ 1.63
TRDMT1-211ENST00000495022 WASF1Q92558 559 aa25.2■■□□□ 1.63
TRDMT1-211ENST00000495022 TMEM143Q96AN5 459 aa25.2■■□□□ 1.63
TRDMT1-211ENST00000495022 GJB4Q9NTQ9 266 aa25.2■■□□□ 1.63
TRDMT1-211ENST00000495022 STK39Q9UEW8 545 aa25.2■■□□□ 1.63
TRDMT1-211ENST00000495022 C2orf16Q68DN1 1984 aa25.2■■□□□ 1.62
TRDMT1-211ENST00000495022 ASAP2O43150 1006 aa25.19■■□□□ 1.62
TRDMT1-211ENST00000495022 MARCH6O60337 910 aa25.19■■□□□ 1.62
TRDMT1-211ENST00000495022 MTHFRP42898 656 aa25.19■■□□□ 1.62
TRDMT1-211ENST00000495022 ANAPC15P60006 121 aa25.19■■□□□ 1.62
TRDMT1-211ENST00000495022 SPIRE1Q08AE8 756 aa25.19■■□□□ 1.62
TRDMT1-211ENST00000495022 LAMTOR4Q0VGL1 99 aa25.19■■□□□ 1.62
TRDMT1-211ENST00000495022 ANKRD1Q15327 319 aa25.19■■□□□ 1.62
TRDMT1-211ENST00000495022 TMEM87AQ8NBN3 555 aa25.19■■□□□ 1.62
TRDMT1-211ENST00000495022 ASIC4Q96FT7 647 aa25.19■■□□□ 1.62
TRDMT1-211ENST00000495022 POMKQ9H5K3 350 aa25.19■■□□□ 1.62
TRDMT1-211ENST00000495022 ZSWIM4Q9H7M6 989 aa25.19■■□□□ 1.62
TRDMT1-211ENST00000495022 ORC3Q9UBD5 711 aaPredicted RBP25.19■■□□□ 1.62
TRDMT1-211ENST00000495022 CNTNAP2Q9UHC6 1331 aa25.19■■□□□ 1.62
TRDMT1-211ENST00000495022 USP34Q70CQ2 3546 aa25.18■■□□□ 1.62
TRDMT1-211ENST00000495022 BAG4O95429 457 aaKnown RBP25.18■■□□□ 1.62
TRDMT1-211ENST00000495022 CTDNEP1O95476 244 aa25.18■■□□□ 1.62
TRDMT1-211ENST00000495022 SRGAP2CP0DJJ0 459 aa25.18■■□□□ 1.62
TRDMT1-211ENST00000495022 HOXA11P31270 313 aaPredicted RBP25.18■■□□□ 1.62
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