RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000494398.5

CERKL-213, Transcript of ceramide kinase like, humanhuman

TSL 2

Gene CERKL, Length 2,391 nt, Biotype retained intron.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CERKL-213ENST00000494398 SPP2Q13103 211 aa23.14■■□□□ 1.29
CERKL-213ENST00000494398 HLTFQ14527 1009 aaKnown RBP eCLIP23.14■■□□□ 1.29
CERKL-213ENST00000494398 PGM5Q15124 567 aa23.14■■□□□ 1.29
CERKL-213ENST00000494398 HSPBP1Q9NZL4 362 aa23.14■■□□□ 1.29
CERKL-213ENST00000494398 BCS1LQ9Y276 419 aa23.14■■□□□ 1.29
CERKL-213ENST00000494398 NCANO14594 1321 aa23.13■■□□□ 1.29
CERKL-213ENST00000494398 TMEM150BA6NC51 233 aa23.13■■□□□ 1.29
CERKL-213ENST00000494398 CCDC188H7C350 402 aa23.13■■□□□ 1.29
CERKL-213ENST00000494398 PPP3CAQ08209 521 aa23.13■■□□□ 1.29
CERKL-213ENST00000494398 KIF22Q14807 665 aa23.13■■□□□ 1.29
CERKL-213ENST00000494398 C12orf56Q8IXR9 622 aa23.13■■□□□ 1.29
CERKL-213ENST00000494398 IQCKQ8N0W5 287 aa23.13■■□□□ 1.29
CERKL-213ENST00000494398 RASGEF1CQ8N431 466 aa23.13■■□□□ 1.29
CERKL-213ENST00000494398 ISCUQ9H1K1 167 aa23.13■■□□□ 1.29
CERKL-213ENST00000494398 FAM170AA1A519 330 aa23.13■■□□□ 1.29
CERKL-213ENST00000494398 P4HA2O15460 535 aa23.13■■□□□ 1.29
CERKL-213ENST00000494398 PEX3P56589 373 aa23.13■■□□□ 1.29
CERKL-213ENST00000494398 GTF2BQ00403 316 aa23.13■■□□□ 1.29
CERKL-213ENST00000494398 TNFAIP1Q13829 316 aa23.13■■□□□ 1.29
CERKL-213ENST00000494398 MREGQ8N565 214 aa23.13■■□□□ 1.29
CERKL-213ENST00000494398 TMEM174Q8WUU8 243 aa23.13■■□□□ 1.29
CERKL-213ENST00000494398 DGCR8Q8WYQ5 773 aaKnown RBP eCLIP23.13■■□□□ 1.29
CERKL-213ENST00000494398 ARL8AQ96BM9 186 aa23.13■■□□□ 1.29
CERKL-213ENST00000494398 RMDN3Q96TC7 470 aa23.13■■□□□ 1.29
CERKL-213ENST00000494398 AGPAT1Q99943 283 aa23.13■■□□□ 1.29
CERKL-213ENST00000494398 DDX47Q9H0S4 455 aaKnown RBP23.13■■□□□ 1.29
CERKL-213ENST00000494398 MYH11P35749 1972 aa23.13■■□□□ 1.29
CERKL-213ENST00000494398 ANKRD62A6NC57 917 aa23.12■■□□□ 1.29
CERKL-213ENST00000494398 TULP1O00294 542 aaPredicted RBP23.12■■□□□ 1.29
CERKL-213ENST00000494398 CLSTN1O94985 981 aa23.12■■□□□ 1.29
CERKL-213ENST00000494398 C4orf19Q8IY42 314 aa23.12■■□□□ 1.29
CERKL-213ENST00000494398 THAP2Q9H0W7 228 aa23.12■■□□□ 1.29
CERKL-213ENST00000494398 GPRC5CQ9NQ84 441 aa23.12■■□□□ 1.29
CERKL-213ENST00000494398 TAS2R14Q9NYV8 317 aa23.12■■□□□ 1.29
CERKL-213ENST00000494398 PPP1R9AQ9ULJ8 1098 aa23.12■■□□□ 1.29
CERKL-213ENST00000494398 ASTN2O75129 1339 aaPredicted RBP23.12■■□□□ 1.29
CERKL-213ENST00000494398 BACH1O14867 736 aa23.12■■□□□ 1.29
CERKL-213ENST00000494398 SLC16A4O15374 487 aa23.12■■□□□ 1.29
CERKL-213ENST00000494398 KRT14P02533 472 aa23.12■■□□□ 1.29
CERKL-213ENST00000494398 PSMC5P62195 406 aa23.12■■□□□ 1.29
CERKL-213ENST00000494398 ERVK-9P63128 1117 aa23.12■■□□□ 1.29
CERKL-213ENST00000494398 CUL1Q13616 776 aa23.12■■□□□ 1.29
CERKL-213ENST00000494398 UGCGQ16739 394 aa23.12■■□□□ 1.29
CERKL-213ENST00000494398 SAMD3Q8N6K7 520 aa23.12■■□□□ 1.29
CERKL-213ENST00000494398 EIF1ADQ8N9N8 165 aaKnown RBP23.12■■□□□ 1.29
CERKL-213ENST00000494398 JDP2Q8WYK2 163 aa23.12■■□□□ 1.29
CERKL-213ENST00000494398 TEPSINQ96N21 525 aa23.12■■□□□ 1.29
CERKL-213ENST00000494398 IWS1Q96ST2 819 aa23.12■■□□□ 1.29
CERKL-213ENST00000494398 TIPINQ9BVW5 301 aa23.12■■□□□ 1.29
CERKL-213ENST00000494398 IGSF9BQ9UPX0 1349 aa23.11■■□□□ 1.29
CERKL-213ENST00000494398 ATP9AO75110 1047 aa23.11■■□□□ 1.29
CERKL-213ENST00000494398 ZBED4O75132 1171 aa23.11■■□□□ 1.29
CERKL-213ENST00000494398 PPATQ06203 517 aa23.11■■□□□ 1.29
CERKL-213ENST00000494398 TTMPQ5BVD1 217 aa23.11■■□□□ 1.29
CERKL-213ENST00000494398 FAM102BQ5T8I3 360 aa23.11■■□□□ 1.29
CERKL-213ENST00000494398 RNF207Q6ZRF8 634 aa23.11■■□□□ 1.29
CERKL-213ENST00000494398 PALB2Q86YC2 1186 aa23.11■■□□□ 1.29
CERKL-213ENST00000494398 VTI1AQ96AJ9 217 aa23.11■■□□□ 1.29
CERKL-213ENST00000494398 TRERF1Q96PN7 1200 aa23.11■■□□□ 1.29
CERKL-213ENST00000494398 RGPD3A6NKT7 1758 aaPredicted RBP23.11■■□□□ 1.29
CERKL-213ENST00000494398 RGPD4Q7Z3J3 1758 aa23.11■■□□□ 1.29
CERKL-213ENST00000494398 TESPA1A2RU30 521 aaPredicted RBP23.11■■□□□ 1.29
CERKL-213ENST00000494398 CTNND1O60716 968 aaKnown RBP23.11■■□□□ 1.29
CERKL-213ENST00000494398 ITGA4P13612 1032 aa23.11■■□□□ 1.29
CERKL-213ENST00000494398 VCAM1P19320 739 aa23.11■■□□□ 1.29
CERKL-213ENST00000494398 JAK3P52333 1124 aa23.11■■□□□ 1.29
CERKL-213ENST00000494398 MTMR2Q13614 643 aa23.11■■□□□ 1.29
CERKL-213ENST00000494398 XKR9Q5GH70 373 aa23.11■■□□□ 1.29
CERKL-213ENST00000494398 ARHGEF16Q5VV41 709 aa23.11■■□□□ 1.29
CERKL-213ENST00000494398 FOXR1Q6PIV2 292 aa23.11■■□□□ 1.29
CERKL-213ENST00000494398 NSMFQ6X4W1 530 aa23.11■■□□□ 1.29
CERKL-213ENST00000494398 ARHGEF19Q8IW93 802 aa23.11■■□□□ 1.29
CERKL-213ENST00000494398 ARHGEF26Q96DR7 871 aa23.11■■□□□ 1.29
CERKL-213ENST00000494398 ST6GALNAC4Q9H4F1 302 aa23.11■■□□□ 1.29
CERKL-213ENST00000494398 WDR64B1ANS9 1081 aa23.1■■□□□ 1.29
CERKL-213ENST00000494398 SHOX2O60902 331 aaPredicted RBP23.1■■□□□ 1.29
CERKL-213ENST00000494398 SNRPFP62306 86 aaKnown RBP23.1■■□□□ 1.29
CERKL-213ENST00000494398 PROCA1Q8NCQ7 364 aaPredicted RBP23.1■■□□□ 1.29
CERKL-213ENST00000494398 ZSWIM2Q8NEG5 633 aa23.1■■□□□ 1.29
CERKL-213ENST00000494398 PDCD2LQ9BRP1 358 aa23.1■■□□□ 1.29
CERKL-213ENST00000494398 TBC1D10BQ4KMP7 808 aaPredicted RBP23.09■■□□□ 1.29
CERKL-213ENST00000494398 EPC2Q52LR7 807 aa23.09■■□□□ 1.29
CERKL-213ENST00000494398 MAATS1Q7Z4T9 603 aa23.09■■□□□ 1.29
CERKL-213ENST00000494398 CCDC26Q8TAB7 109 aa23.09■■□□□ 1.29
CERKL-213ENST00000494398 SLC20A1Q8WUM9 679 aa23.09■■□□□ 1.29
CERKL-213ENST00000494398 CAPS2Q9BXY5 557 aa23.09■■□□□ 1.29
CERKL-213ENST00000494398 RPAP3Q9H6T3 665 aaPredicted RBP23.09■■□□□ 1.29
CERKL-213ENST00000494398 PXMP2Q9NR77 195 aa23.09■■□□□ 1.29
CERKL-213ENST00000494398 AMACRQ9UHK6 382 aa23.09■■□□□ 1.29
CERKL-213ENST00000494398 LOXHD1Q8IVV2 1947 aa23.09■■□□□ 1.29
CERKL-213ENST00000494398 ZNF233A6NK53 670 aa23.09■■□□□ 1.29
CERKL-213ENST00000494398 FGGP02679 453 aa23.09■■□□□ 1.29
CERKL-213ENST00000494398 SFNP31947 248 aa23.09■■□□□ 1.29
CERKL-213ENST00000494398 USP8P40818 1118 aa23.09■■□□□ 1.29
CERKL-213ENST00000494398 C1orf220Q5T0J3 134 aa23.09■■□□□ 1.29
CERKL-213ENST00000494398 PLA2G4FQ68DD2 849 aa23.09■■□□□ 1.29
CERKL-213ENST00000494398 SLC17A8Q8NDX2 589 aa23.09■■□□□ 1.29
CERKL-213ENST00000494398 DIS3Q9Y2L1 958 aaKnown RBP23.09■■□□□ 1.29
CERKL-213ENST00000494398 CCDC169A6NNP5 214 aa23.08■■□□□ 1.29
CERKL-213ENST00000494398 MAPK13O15264 365 aa23.08■■□□□ 1.29
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