RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000493152.6

SUCLA2-208, Transcript of succinate-CoA ligase ADP-forming beta subunit, human

TSL 3

Gene SUCLA2, Length 552 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SUCLA2-208	ENST00000493152	BHLHA9	Q7RTU4	235 aa		5.24	□□□□□ -1.57
SUCLA2-208	ENST00000493152	SLC43A3	Q8NBI5	491 aa		5.24	□□□□□ -1.57
SUCLA2-208	ENST00000493152	GML	Q99445	158 aa		5.24	□□□□□ -1.57
SUCLA2-208	ENST00000493152	TINF2	Q9BSI4	451 aa		5.24	□□□□□ -1.57
SUCLA2-208	ENST00000493152	ACSS2	Q9NR19	701 aa		5.24	□□□□□ -1.57
SUCLA2-208	ENST00000493152	PFDN2	Q9UHV9	154 aa		5.24	□□□□□ -1.57
SUCLA2-208	ENST00000493152	MRPS23	Q9Y3D9	190 aa	Known RBP	5.24	□□□□□ -1.57
SUCLA2-208	ENST00000493152	CENPVL1	A0A0U1RR11	272 aa		5.23	□□□□□ -1.57
SUCLA2-208	ENST00000493152	LOC101059915	A0A1B0GWI6	518 aa	Predicted RBP	5.23	□□□□□ -1.57
SUCLA2-208	ENST00000493152	UBA6	A0AVT1	1052 aa	Predicted RBP	5.23	□□□□□ -1.57
SUCLA2-208	ENST00000493152	UNCX	A6NJT0	531 aa		5.23	□□□□□ -1.57
SUCLA2-208	ENST00000493152	HOXA3	O43365	443 aa	Predicted RBP	5.23	□□□□□ -1.57
SUCLA2-208	ENST00000493152	DIAPH1	O60610	1272 aa	Known RBP	5.23	□□□□□ -1.57
SUCLA2-208	ENST00000493152	CLK3	P49761	638 aa	Known RBP	5.23	□□□□□ -1.57
SUCLA2-208	ENST00000493152	FSTL4	Q6MZW2	842 aa		5.23	□□□□□ -1.57
SUCLA2-208	ENST00000493152	FAM83A	Q86UY5	434 aa		5.23	□□□□□ -1.57
SUCLA2-208	ENST00000493152	CAVIN3	Q969G5	261 aa		5.23	□□□□□ -1.57
SUCLA2-208	ENST00000493152	COQ10A	Q96MF6	247 aa		5.23	□□□□□ -1.57
SUCLA2-208	ENST00000493152	DCLRE1C	Q96SD1	692 aa	Known RBP	5.23	□□□□□ -1.57
SUCLA2-208	ENST00000493152	OSBPL6	Q9BZF3	934 aa		5.23	□□□□□ -1.57
SUCLA2-208	ENST00000493152	CCDC113	Q9H0I3	377 aa		5.23	□□□□□ -1.57
SUCLA2-208	ENST00000493152	RSAD1	Q9HA92	442 aa		5.23	□□□□□ -1.57
SUCLA2-208	ENST00000493152	DNAI1	Q9UI46	699 aa		5.23	□□□□□ -1.57
SUCLA2-208	ENST00000493152	HDAC5	Q9UQL6	1122 aa		5.23	□□□□□ -1.57
SUCLA2-208	ENST00000493152	GAGE12B	A1L429	117 aa		5.22	□□□□□ -1.57
SUCLA2-208	ENST00000493152	GAGE12H	A6NDE8	117 aa		5.22	□□□□□ -1.57
SUCLA2-208	ENST00000493152	TMEM200C	A6NKL6	621 aa		5.22	□□□□□ -1.57
SUCLA2-208	ENST00000493152	RNASET2	O00584	256 aa	Known RBP	5.22	□□□□□ -1.57
SUCLA2-208	ENST00000493152	FSBP	O95073	299 aa		5.22	□□□□□ -1.57
SUCLA2-208	ENST00000493152	CYP17A1	P05093	508 aa		5.22	□□□□□ -1.57
SUCLA2-208	ENST00000493152	TMEM177	Q53S58	311 aa		5.22	□□□□□ -1.57
SUCLA2-208	ENST00000493152	PAPD7	Q5XG87	772 aa	Known RBP	5.22	□□□□□ -1.57
SUCLA2-208	ENST00000493152	CXorf67	Q86X51	503 aa	Predicted RBP	5.22	□□□□□ -1.57
SUCLA2-208	ENST00000493152	ARHGEF19	Q8IW93	802 aa		5.22	□□□□□ -1.57
SUCLA2-208	ENST00000493152	CKAP2L	Q8IYA6	745 aa		5.22	□□□□□ -1.57
SUCLA2-208	ENST00000493152	EXOC2	Q96KP1	924 aa		5.22	□□□□□ -1.57
SUCLA2-208	ENST00000493152	UIMC1	Q96RL1	719 aa		5.22	□□□□□ -1.57
SUCLA2-208	ENST00000493152	TUBGCP5	Q96RT8	1024 aa		5.22	□□□□□ -1.57
SUCLA2-208	ENST00000493152	WDR11	Q9BZH6	1224 aa		5.22	□□□□□ -1.57
SUCLA2-208	ENST00000493152	SLC52A2	Q9HAB3	445 aa		5.22	□□□□□ -1.57
SUCLA2-208	ENST00000493152	MSRB2	Q9Y3D2	182 aa		5.22	□□□□□ -1.57
SUCLA2-208	ENST00000493152	FAM153B	P0C7A2	387 aa		5.21	□□□□□ -1.58
SUCLA2-208	ENST00000493152	HKR1	P10072	659 aa		5.21	□□□□□ -1.58
SUCLA2-208	ENST00000493152	ZBTB48	P10074	688 aa	Predicted RBP	5.21	□□□□□ -1.58
SUCLA2-208	ENST00000493152	KIF11	P52732	1056 aa		5.21	□□□□□ -1.58
SUCLA2-208	ENST00000493152	BLOC1S1	P78537	153 aa		5.21	□□□□□ -1.58
SUCLA2-208	ENST00000493152	ZNF362	Q5T0B9	420 aa	Predicted RBP	5.21	□□□□□ -1.58
SUCLA2-208	ENST00000493152	PRAMEF9	Q5VWM5	478 aa		5.21	□□□□□ -1.58
SUCLA2-208	ENST00000493152	CCDC62	Q6P9F0	684 aa		5.21	□□□□□ -1.58
SUCLA2-208	ENST00000493152	GSTCD	Q8NEC7	633 aa		5.21	□□□□□ -1.58
SUCLA2-208	ENST00000493152	NDC1	Q9BTX1	674 aa		5.21	□□□□□ -1.58
SUCLA2-208	ENST00000493152	R3HDML	Q9H3Y0	253 aa		5.21	□□□□□ -1.58
SUCLA2-208	ENST00000493152	CLCA2	Q9UQC9	943 aa		5.21	□□□□□ -1.58
SUCLA2-208	ENST00000493152	AHRR	A9YTQ3	701 aa		5.2	□□□□□ -1.58
SUCLA2-208	ENST00000493152	DNAJC6	O75061	913 aa		5.2	□□□□□ -1.58
SUCLA2-208	ENST00000493152	C1R	P00736	705 aa		5.2	□□□□□ -1.58
SUCLA2-208	ENST00000493152	HNRNPL	P14866	589 aa	Known RBP eCLIP	5.2	□□□□□ -1.58
SUCLA2-208	ENST00000493152	VPS72	Q15906	364 aa		5.2	□□□□□ -1.58
SUCLA2-208	ENST00000493152	DDB1	Q16531	1140 aa		5.2	□□□□□ -1.58
SUCLA2-208	ENST00000493152	PRR16	Q569H4	304 aa		5.2	□□□□□ -1.58
SUCLA2-208	ENST00000493152	TIGD7	Q6NT04	549 aa	Predicted RBP	5.2	□□□□□ -1.58
SUCLA2-208	ENST00000493152	MICALCL	Q6ZW33	695 aa		5.2	□□□□□ -1.58
SUCLA2-208	ENST00000493152	OTOP1	Q7RTM1	612 aa		5.2	□□□□□ -1.58
SUCLA2-208	ENST00000493152	CMTR2	Q8IYT2	770 aa	Known RBP	5.2	□□□□□ -1.58
SUCLA2-208	ENST00000493152	IGSF22	Q8N9C0	903 aa		5.2	□□□□□ -1.58
SUCLA2-208	ENST00000493152	SPATA5L1	Q9BVQ7	753 aa		5.2	□□□□□ -1.58
SUCLA2-208	ENST00000493152	PCIF1	Q9H4Z3	704 aa		5.2	□□□□□ -1.58
SUCLA2-208	ENST00000493152	TRPM5	Q9NZQ8	1165 aa		5.2	□□□□□ -1.58
SUCLA2-208	ENST00000493152	ANKFY1	Q9P2R3	1169 aa		5.2	□□□□□ -1.58
SUCLA2-208	ENST00000493152	KRT37	O76014	449 aa		5.19	□□□□□ -1.58
SUCLA2-208	ENST00000493152	STC2	O76061	302 aa		5.19	□□□□□ -1.58
SUCLA2-208	ENST00000493152	HLA-DOA	P06340	250 aa		5.19	□□□□□ -1.58
SUCLA2-208	ENST00000493152	TCF3	P15923	654 aa		5.19	□□□□□ -1.58
SUCLA2-208	ENST00000493152	CXCR5	P32302	372 aa		5.19	□□□□□ -1.58
SUCLA2-208	ENST00000493152	BMPR1A	P36894	532 aa		5.19	□□□□□ -1.58
SUCLA2-208	ENST00000493152	ADCY1	Q08828	1119 aa		5.19	□□□□□ -1.58
SUCLA2-208	ENST00000493152	GDF7	Q7Z4P5	450 aa		5.19	□□□□□ -1.58
SUCLA2-208	ENST00000493152	OR52N2	Q8NGI0	321 aa		5.19	□□□□□ -1.58
SUCLA2-208	ENST00000493152	OR5M3	Q8NGP4	307 aa		5.19	□□□□□ -1.58
SUCLA2-208	ENST00000493152	SLC9A6	Q92581	669 aa		5.19	□□□□□ -1.58
SUCLA2-208	ENST00000493152	HAPLN2	Q9GZV7	340 aa		5.19	□□□□□ -1.58
SUCLA2-208	ENST00000493152	ZNF768	Q9H5H4	540 aa	Known RBP	5.19	□□□□□ -1.58
SUCLA2-208	ENST00000493152	AKIP1	Q9NQ31	210 aa		5.19	□□□□□ -1.58
SUCLA2-208	ENST00000493152	SYBU	Q9NX95	663 aa		5.19	□□□□□ -1.58
SUCLA2-208	ENST00000493152	WDR3	Q9UNX4	943 aa	Known RBP eCLIP	5.19	□□□□□ -1.58
SUCLA2-208	ENST00000493152	DIRC3	C9JPN6	131 aa		5.18	□□□□□ -1.58
SUCLA2-208	ENST00000493152	PROB1	E7EW31	1015 aa		5.18	□□□□□ -1.58
SUCLA2-208	ENST00000493152	LPXN	O60711	386 aa		5.18	□□□□□ -1.58
SUCLA2-208	ENST00000493152	STK10	O94804	968 aa	Known RBP	5.18	□□□□□ -1.58
SUCLA2-208	ENST00000493152	ZFP36	P26651	326 aa	Known RBP	5.18	□□□□□ -1.58
SUCLA2-208	ENST00000493152	WNT3A	P56704	352 aa		5.18	□□□□□ -1.58
SUCLA2-208	ENST00000493152	ZNF174	Q15697	407 aa		5.18	□□□□□ -1.58
SUCLA2-208	ENST00000493152	TRIM61	Q5EBN2	209 aa		5.18	□□□□□ -1.58
SUCLA2-208	ENST00000493152	DDX53	Q86TM3	631 aa	Known RBP	5.18	□□□□□ -1.58
SUCLA2-208	ENST00000493152	PPP1R1B	Q9UD71	204 aa	Predicted RBP	5.18	□□□□□ -1.58
SUCLA2-208	ENST00000493152	TNPO3	Q9Y5L0	923 aa	Known RBP	5.18	□□□□□ -1.58
SUCLA2-208	ENST00000493152	EPN1	Q9Y6I3	576 aa	Predicted RBP	5.18	□□□□□ -1.58
SUCLA2-208	ENST00000493152		A0A0A6YYJ9	748 aa		5.17	□□□□□ -1.58
SUCLA2-208	ENST00000493152	CCDC163	A0A0D9SF12	145 aa		5.17	□□□□□ -1.58
SUCLA2-208	ENST00000493152	TCRBV16S1A1N1	A0A5B0	115 aa		5.17	□□□□□ -1.58

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 42.4 ms