RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000492717.1

DCTN1-222, Transcript of dynactin subunit 1, human

TSL 2

Gene DCTN1, Length 371 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
DCTN1-222	ENST00000492717	XPO5	Q9HAV4	1204 aa	Known RBP eCLIP	6.54	□□□□□ -1.36
DCTN1-222	ENST00000492717	G3BP2	Q9UN86	482 aa	Known RBP	6.54	□□□□□ -1.36
DCTN1-222	ENST00000492717	SMC3	Q9UQE7	1217 aa		6.54	□□□□□ -1.36
DCTN1-222	ENST00000492717	HIF3A	Q9Y2N7	669 aa		6.54	□□□□□ -1.36
DCTN1-222	ENST00000492717	SLC45A1	Q9Y2W3	748 aa		6.54	□□□□□ -1.36
DCTN1-222	ENST00000492717	TMX2	Q9Y320	296 aa		6.54	□□□□□ -1.36
DCTN1-222	ENST00000492717	STARD13	Q9Y3M8	1113 aa		6.54	□□□□□ -1.36
DCTN1-222	ENST00000492717	AFG3L2	Q9Y4W6	797 aa		6.54	□□□□□ -1.36
DCTN1-222	ENST00000492717	PLXNA1	Q9UIW2	1896 aa		6.53	□□□□□ -1.36
DCTN1-222	ENST00000492717	TRAV20	A0A0B4J274	112 aa		6.53	□□□□□ -1.36
DCTN1-222	ENST00000492717	CCL15-CCL14	A0A0B4J2E2	113 aa		6.53	□□□□□ -1.36
DCTN1-222	ENST00000492717	LOC100289279	A0A1B0GTE1	492 aa		6.53	□□□□□ -1.36
DCTN1-222	ENST00000492717	CCDC196	A0A1B0GTZ2	297 aa		6.53	□□□□□ -1.36
DCTN1-222	ENST00000492717		M0R082	166 aa		6.53	□□□□□ -1.36
DCTN1-222	ENST00000492717	DHX16	O60231	1041 aa	Known RBP	6.53	□□□□□ -1.36
DCTN1-222	ENST00000492717	ADCY3	O60266	1144 aa		6.53	□□□□□ -1.36
DCTN1-222	ENST00000492717	TLR2	O60603	784 aa		6.53	□□□□□ -1.36
DCTN1-222	ENST00000492717	DTNB	O60941	627 aa		6.53	□□□□□ -1.36
DCTN1-222	ENST00000492717	CDKL5	O76039	1030 aa		6.53	□□□□□ -1.36
DCTN1-222	ENST00000492717	GDF11	O95390	407 aa		6.53	□□□□□ -1.36
DCTN1-222	ENST00000492717	PARN	O95453	639 aa	Known RBP	6.53	□□□□□ -1.36
DCTN1-222	ENST00000492717	ALB	P02768	609 aa		6.53	□□□□□ -1.36
DCTN1-222	ENST00000492717	ZSCAN22	P10073	491 aa	Predicted RBP	6.53	□□□□□ -1.36
DCTN1-222	ENST00000492717	EPX	P11678	715 aa		6.53	□□□□□ -1.36
DCTN1-222	ENST00000492717	EEF2	P13639	858 aa	Known RBP	6.53	□□□□□ -1.36
DCTN1-222	ENST00000492717	PDC	P20941	246 aa		6.53	□□□□□ -1.36
DCTN1-222	ENST00000492717	U2AF2	P26368	475 aa	Known RBP eCLIP	6.53	□□□□□ -1.36
DCTN1-222	ENST00000492717	PMS1	P54277	932 aa	Known RBP	6.53	□□□□□ -1.36
DCTN1-222	ENST00000492717	SP3	Q02447	781 aa		6.53	□□□□□ -1.36
DCTN1-222	ENST00000492717	ICA1	Q05084	483 aa		6.53	□□□□□ -1.36
DCTN1-222	ENST00000492717	PABPC4	Q13310	644 aa	Known RBP eCLIP	6.53	□□□□□ -1.36
DCTN1-222	ENST00000492717	GAS6	Q14393	721 aa		6.53	□□□□□ -1.36
DCTN1-222	ENST00000492717	CCL15	Q16663	113 aa		6.53	□□□□□ -1.36
DCTN1-222	ENST00000492717	TM4SF20	Q53R12	229 aa		6.53	□□□□□ -1.36
DCTN1-222	ENST00000492717	ASPRV1	Q53RT3	343 aa		6.53	□□□□□ -1.36
DCTN1-222	ENST00000492717	EXOSC6	Q5RKV6	272 aa	Known RBP	6.53	□□□□□ -1.36
DCTN1-222	ENST00000492717	HEATR6	Q6AI08	1181 aa	Known RBP	6.53	□□□□□ -1.36
DCTN1-222	ENST00000492717	FBXO46	Q6PJ61	603 aa	Predicted RBP	6.53	□□□□□ -1.36
DCTN1-222	ENST00000492717	C17orf99	Q6UX52	265 aa		6.53	□□□□□ -1.36
DCTN1-222	ENST00000492717	RAB11FIP4	Q86YS3	637 aa		6.53	□□□□□ -1.36
DCTN1-222	ENST00000492717	SCYL3	Q8IZE3	742 aa		6.53	□□□□□ -1.36
DCTN1-222	ENST00000492717	KCT2	Q8NC54	265 aa		6.53	□□□□□ -1.36
DCTN1-222	ENST00000492717	ZNF417	Q8TAU3	575 aa		6.53	□□□□□ -1.36
DCTN1-222	ENST00000492717	PHKB	Q93100	1093 aa		6.53	□□□□□ -1.36
DCTN1-222	ENST00000492717	PPP1R14A	Q96A00	147 aa		6.53	□□□□□ -1.36
DCTN1-222	ENST00000492717	ERO1A	Q96HE7	468 aa		6.53	□□□□□ -1.36
DCTN1-222	ENST00000492717	C12orf42	Q96LP6	360 aa		6.53	□□□□□ -1.36
DCTN1-222	ENST00000492717	CCDC74B	Q96LY2	380 aa		6.53	□□□□□ -1.36
DCTN1-222	ENST00000492717	AIFM3	Q96NN9	605 aa		6.53	□□□□□ -1.36
DCTN1-222	ENST00000492717	ZNF587	Q96SQ5	575 aa	Predicted RBP	6.53	□□□□□ -1.36
DCTN1-222	ENST00000492717	DHRS4	Q9BTZ2	278 aa		6.53	□□□□□ -1.36
DCTN1-222	ENST00000492717	WDR18	Q9BV38	432 aa		6.53	□□□□□ -1.36
DCTN1-222	ENST00000492717	KAT14	Q9H8E8	782 aa		6.53	□□□□□ -1.36
DCTN1-222	ENST00000492717	TOMM22	Q9NS69	142 aa		6.53	□□□□□ -1.36
DCTN1-222	ENST00000492717	MCM8	Q9UJA3	840 aa		6.53	□□□□□ -1.36
DCTN1-222	ENST00000492717	ATP8A1	Q9Y2Q0	1164 aa		6.53	□□□□□ -1.36
DCTN1-222	ENST00000492717	MORC2	Q9Y6X9	1032 aa	Predicted RBP	6.53	□□□□□ -1.36
DCTN1-222	ENST00000492717	ZNF236	Q9UL36	1845 aa		6.53	□□□□□ -1.36
DCTN1-222	ENST00000492717	MGAM	O43451	1857 aa		6.52	□□□□□ -1.37
DCTN1-222	ENST00000492717		A0A0G2JLL6	359 aa	Predicted RBP	6.52	□□□□□ -1.37
DCTN1-222	ENST00000492717	ESYT2	A0FGR8	921 aa		6.52	□□□□□ -1.37
DCTN1-222	ENST00000492717	BTBD19	C9JJ37	291 aa		6.52	□□□□□ -1.37
DCTN1-222	ENST00000492717	RGS13	O14921	159 aa		6.52	□□□□□ -1.37
DCTN1-222	ENST00000492717	PLD2	O14939	933 aa		6.52	□□□□□ -1.37
DCTN1-222	ENST00000492717	DEXI	O95424	95 aa		6.52	□□□□□ -1.37
DCTN1-222	ENST00000492717	NDUFB10	O96000	172 aa		6.52	□□□□□ -1.37
DCTN1-222	ENST00000492717	CTSB	P07858	339 aa		6.52	□□□□□ -1.37
DCTN1-222	ENST00000492717	ASNS	P08243	561 aa		6.52	□□□□□ -1.37
DCTN1-222	ENST00000492717	CPE	P16870	476 aa		6.52	□□□□□ -1.37
DCTN1-222	ENST00000492717	KIF5B	P33176	963 aa		6.52	□□□□□ -1.37
DCTN1-222	ENST00000492717	CD68	P34810	354 aa	Predicted RBP	6.52	□□□□□ -1.37
DCTN1-222	ENST00000492717	PRMT2	P55345	433 aa		6.52	□□□□□ -1.37
DCTN1-222	ENST00000492717	CRHR2	Q13324	411 aa		6.52	□□□□□ -1.37
DCTN1-222	ENST00000492717	ARHGEF6	Q15052	776 aa		6.52	□□□□□ -1.37
DCTN1-222	ENST00000492717	PFKFB3	Q16875	520 aa	Predicted RBP	6.52	□□□□□ -1.37
DCTN1-222	ENST00000492717	FNDC3B	Q53EP0	1204 aa	Known RBP	6.52	□□□□□ -1.37
DCTN1-222	ENST00000492717	PPM1J	Q5JR12	505 aa		6.52	□□□□□ -1.37
DCTN1-222	ENST00000492717	GPATCH4	Q5T3I0	446 aa	Known RBP	6.52	□□□□□ -1.37
DCTN1-222	ENST00000492717	WWC2	Q6AWC2	1192 aa		6.52	□□□□□ -1.37
DCTN1-222	ENST00000492717	NFXL1	Q6ZNB6	911 aa		6.52	□□□□□ -1.37
DCTN1-222	ENST00000492717	FASTKD5	Q7L8L6	764 aa	Known RBP	6.52	□□□□□ -1.37
DCTN1-222	ENST00000492717	PRRT2	Q7Z6L0	340 aa	Predicted RBP	6.52	□□□□□ -1.37
DCTN1-222	ENST00000492717	SCUBE1	Q8IWY4	988 aa		6.52	□□□□□ -1.37
DCTN1-222	ENST00000492717	FAM43A	Q8N2R8	423 aa		6.52	□□□□□ -1.37
DCTN1-222	ENST00000492717	DAGLB	Q8NCG7	672 aa		6.52	□□□□□ -1.37
DCTN1-222	ENST00000492717	ACER1	Q8TDN7	264 aa		6.52	□□□□□ -1.37
DCTN1-222	ENST00000492717	DCAF4	Q8WV16	495 aa		6.52	□□□□□ -1.37
DCTN1-222	ENST00000492717	SLC6A18	Q96N87	628 aa		6.52	□□□□□ -1.37
DCTN1-222	ENST00000492717	LZTS2	Q9BRK4	669 aa		6.52	□□□□□ -1.37
DCTN1-222	ENST00000492717	AARSD1	Q9BTE6	412 aa	Known RBP	6.52	□□□□□ -1.37
DCTN1-222	ENST00000492717	PHF20	Q9BVI0	1012 aa		6.52	□□□□□ -1.37
DCTN1-222	ENST00000492717	RUSC1	Q9BVN2	902 aa		6.52	□□□□□ -1.37
DCTN1-222	ENST00000492717	KIAA1683	Q9H0B3	1180 aa		6.52	□□□□□ -1.37
DCTN1-222	ENST00000492717	CSTF2T	Q9H0L4	616 aa	Known RBP eCLIP	6.52	□□□□□ -1.37
DCTN1-222	ENST00000492717	VCPKMT	Q9H867	229 aa		6.52	□□□□□ -1.37
DCTN1-222	ENST00000492717	FRMD4A	Q9P2Q2	1039 aa	Predicted RBP	6.52	□□□□□ -1.37
DCTN1-222	ENST00000492717	ORC3	Q9UBD5	711 aa	Predicted RBP	6.52	□□□□□ -1.37
DCTN1-222	ENST00000492717	SUCO	Q9UBS9	1254 aa	Known RBP	6.52	□□□□□ -1.37
DCTN1-222	ENST00000492717	STX8	Q9UNK0	236 aa		6.52	□□□□□ -1.37
DCTN1-222	ENST00000492717	PLXNB2	O15031	1838 aa		6.52	□□□□□ -1.37

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