RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000492417.5

TRA2B-215, Transcript of transformer 2 beta homolog, human

TSL 1 (best)

Gene TRA2B, Length 4,141 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TRA2B-215	ENST00000492417	IQCE	Q6IPM2	695 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TRA2B-215	ENST00000492417	DSTYK	Q6XUX3	929 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TRA2B-215	ENST00000492417	NECAB2	Q7Z6G3	386 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TRA2B-215	ENST00000492417	SAMD3	Q8N6K7	520 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TRA2B-215	ENST00000492417	CCDC155	Q8N6L0	562 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TRA2B-215	ENST00000492417	CNOT6L	Q96LI5	555 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
TRA2B-215	ENST00000492417	INPP4A	Q96PE3	977 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
TRA2B-215	ENST00000492417	MRPL4	Q9BYD3	311 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
TRA2B-215	ENST00000492417	MAGEF1	Q9HAY2	307 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TRA2B-215	ENST00000492417	ANKRD31	Q8N7Z5	1873 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TRA2B-215	ENST00000492417	RPTOR	Q8N122	1335 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TRA2B-215	ENST00000492417	RASSF10	A6NK89	507 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TRA2B-215	ENST00000492417	TMEM110-MUSTN1	A8MSY1	372 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TRA2B-215	ENST00000492417	CCNE2	O96020	404 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TRA2B-215	ENST00000492417	TRIM49	P0CI25	452 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TRA2B-215	ENST00000492417	TRIM49C	P0CI26	452 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TRA2B-215	ENST00000492417	CYP11B2	P19099	503 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TRA2B-215	ENST00000492417	CASQ1	P31415	396 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TRA2B-215	ENST00000492417	CIITA	P33076	1130 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TRA2B-215	ENST00000492417	PPP1R2	P41236	205 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TRA2B-215	ENST00000492417	RARRES1	P49788	294 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TRA2B-215	ENST00000492417	MAP3K10	Q02779	954 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TRA2B-215	ENST00000492417	MXD4	Q14582	209 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
TRA2B-215	ENST00000492417	OLFML2B	Q68BL8	750 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TRA2B-215	ENST00000492417	CCDC186	Q7Z3E2	898 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TRA2B-215	ENST00000492417	C7orf61	Q8IZ16	206 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TRA2B-215	ENST00000492417	PPM1E	Q8WY54	764 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TRA2B-215	ENST00000492417	SLC5A5	Q92911	643 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TRA2B-215	ENST00000492417	ANKRD36BP1	Q96IX9	119 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TRA2B-215	ENST00000492417	LSM14B	Q9BX40	385 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
TRA2B-215	ENST00000492417	NACA2	Q9H009	215 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TRA2B-215	ENST00000492417	LUC7L	Q9NQ29	371 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
TRA2B-215	ENST00000492417	CCDC88A	Q3V6T2	1871 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TRA2B-215	ENST00000492417	C2CD2L	O14523	706 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TRA2B-215	ENST00000492417	PSMD10	O75832	226 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TRA2B-215	ENST00000492417	NPTXR	O95502	500 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TRA2B-215	ENST00000492417	SMIM10L2A	P0DMW4	78 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TRA2B-215	ENST00000492417	SMIM10L2B	P0DMW5	78 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TRA2B-215	ENST00000492417	CAPN2	P17655	700 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TRA2B-215	ENST00000492417	PSMC2	P35998	433 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
TRA2B-215	ENST00000492417	MKRN4P	Q13434	485 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
TRA2B-215	ENST00000492417	BFSP2	Q13515	415 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TRA2B-215	ENST00000492417	MOXD1	Q6UVY6	613 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TRA2B-215	ENST00000492417	CCDC91	Q7Z6B0	441 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TRA2B-215	ENST00000492417	IGSF22	Q8N9C0	903 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TRA2B-215	ENST00000492417	GOLGA5	Q8TBA6	731 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TRA2B-215	ENST00000492417	RABGGTA	Q92696	567 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TRA2B-215	ENST00000492417	KIF12	Q96FN5	646 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TRA2B-215	ENST00000492417	C2orf40	Q9H1Z8	148 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TRA2B-215	ENST00000492417	TOPORS	Q9NS56	1045 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
TRA2B-215	ENST00000492417	AGO2	Q9UKV8	859 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
TRA2B-215	ENST00000492417	LUC7L2	Q9Y383	392 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
TRA2B-215	ENST00000492417	BCOR	Q6W2J9	1755 aa		4.86	□□□□□ -1.63
TRA2B-215	ENST00000492417	DUOX1	Q9NRD9	1551 aa		4.86	□□□□□ -1.63
TRA2B-215	ENST00000492417	TREH	O43280	583 aa		4.86	□□□□□ -1.63
TRA2B-215	ENST00000492417	KIF5C	O60282	957 aa		4.86	□□□□□ -1.63
TRA2B-215	ENST00000492417	DUSP11	O75319	330 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
TRA2B-215	ENST00000492417	SLU7	O95391	586 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
TRA2B-215	ENST00000492417	CAVIN2	O95810	425 aa		4.86	□□□□□ -1.63
TRA2B-215	ENST00000492417	SNAI1	O95863	264 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
TRA2B-215	ENST00000492417	BCR	P11274	1271 aa		4.86	□□□□□ -1.63
TRA2B-215	ENST00000492417	CCNE1	P24864	410 aa		4.86	□□□□□ -1.63
TRA2B-215	ENST00000492417	TM4SF4	P48230	202 aa		4.86	□□□□□ -1.63
TRA2B-215	ENST00000492417	GSDMD	P57764	484 aa		4.86	□□□□□ -1.63
TRA2B-215	ENST00000492417	TNNC1	P63316	161 aa		4.86	□□□□□ -1.63
TRA2B-215	ENST00000492417	SP2	Q02086	613 aa		4.86	□□□□□ -1.63
TRA2B-215	ENST00000492417	BFSP1	Q12934	665 aa		4.86	□□□□□ -1.63
TRA2B-215	ENST00000492417	GRB14	Q14449	540 aa		4.86	□□□□□ -1.63
TRA2B-215	ENST00000492417	SMC1A	Q14683	1233 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
TRA2B-215	ENST00000492417	ZNF484	Q5JVG2	852 aa		4.86	□□□□□ -1.63
TRA2B-215	ENST00000492417	ZNF354C	Q86Y25	554 aa		4.86	□□□□□ -1.63
TRA2B-215	ENST00000492417	XXYLT1	Q8NBI6	393 aa		4.86	□□□□□ -1.63
TRA2B-215	ENST00000492417	HASPIN	Q8TF76	798 aa		4.86	□□□□□ -1.63
TRA2B-215	ENST00000492417	U2AF1L4	Q8WU68	220 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
TRA2B-215	ENST00000492417	SENP7	Q9BQF6	1050 aa		4.86	□□□□□ -1.63
TRA2B-215	ENST00000492417	POLR3C	Q9BUI4	534 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
TRA2B-215	ENST00000492417	MTIF3	Q9H2K0	278 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
TRA2B-215	ENST00000492417	ANKEF1	Q9NU02	776 aa		4.86	□□□□□ -1.63
TRA2B-215	ENST00000492417	TRMT13	Q9NUP7	481 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
TRA2B-215	ENST00000492417	MORF4L1	Q9UBU8	362 aa		4.86	□□□□□ -1.63
TRA2B-215	ENST00000492417	NR2E3	Q9Y5X4	410 aa		4.86	□□□□□ -1.63
TRA2B-215	ENST00000492417	MYH1	P12882	1939 aa		4.86	□□□□□ -1.63
TRA2B-215	ENST00000492417	COL11A2	P13942	1736 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
TRA2B-215	ENST00000492417	GOLGA6L10	A0A0M3HER8	536 aa		4.86	□□□□□ -1.63
TRA2B-215	ENST00000492417	XPOT	O43592	962 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
TRA2B-215	ENST00000492417	NR3C1	P04150	777 aa		4.86	□□□□□ -1.63
TRA2B-215	ENST00000492417	MMP3	P08254	477 aa		4.86	□□□□□ -1.63
TRA2B-215	ENST00000492417	CYP3A4	P08684	503 aa		4.86	□□□□□ -1.63
TRA2B-215	ENST00000492417	PLS3	P13797	630 aa		4.86	□□□□□ -1.63
TRA2B-215	ENST00000492417	MCM3	P25205	808 aa		4.86	□□□□□ -1.63
TRA2B-215	ENST00000492417	OR1G1	P47890	313 aa		4.86	□□□□□ -1.63
TRA2B-215	ENST00000492417	RNASE9	P60153	205 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
TRA2B-215	ENST00000492417	MDM2	Q00987	491 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
TRA2B-215	ENST00000492417	GABPB1	Q06547	395 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
TRA2B-215	ENST00000492417	KNOP1	Q1ED39	458 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
TRA2B-215	ENST00000492417	ATF7IP2	Q5U623	682 aa		4.86	□□□□□ -1.63
TRA2B-215	ENST00000492417	RRAGA	Q7L523	313 aa		4.86	□□□□□ -1.63
TRA2B-215	ENST00000492417	OTOP2	Q7RTS6	562 aa		4.86	□□□□□ -1.63
TRA2B-215	ENST00000492417	C4orf19	Q8IY42	314 aa		4.86	□□□□□ -1.63
TRA2B-215	ENST00000492417	SYT2	Q8N9I0	419 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63

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