RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000491139.5

NELFE-210, Transcript of negative elongation factor complex member E, humanhuman

TSL 3

Gene NELFE, Length 582 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NELFE-210ENST00000491139 DUSP12Q9UNI6 340 aa23.45■■□□□ 1.34
NELFE-210ENST00000491139 PIN4Q9Y237 131 aaKnown RBP23.45■■□□□ 1.34
NELFE-210ENST00000491139 A0A087WZ62 844 aa23.44■■□□□ 1.34
NELFE-210ENST00000491139 MSH4O15457 936 aa23.44■■□□□ 1.34
NELFE-210ENST00000491139 KLRC2P26717 231 aa23.44■■□□□ 1.34
NELFE-210ENST00000491139 ANGPT1Q15389 498 aa23.44■■□□□ 1.34
NELFE-210ENST00000491139 BICD2Q8TD16 824 aa23.44■■□□□ 1.34
NELFE-210ENST00000491139 FDXACB1Q9BRP7 624 aaPredicted RBP23.44■■□□□ 1.34
NELFE-210ENST00000491139 GBP3Q9H0R5 595 aa23.44■■□□□ 1.34
NELFE-210ENST00000491139 FAM105AQ9NUU6 356 aa23.44■■□□□ 1.34
NELFE-210ENST00000491139 STK39Q9UEW8 545 aa23.44■■□□□ 1.34
NELFE-210ENST00000491139 DENND4AQ7Z401 1863 aa23.44■■□□□ 1.34
NELFE-210ENST00000491139 DCHS1Q96JQ0 3298 aa23.44■■□□□ 1.34
NELFE-210ENST00000491139 ZNF623O75123 536 aa23.43■■□□□ 1.34
NELFE-210ENST00000491139 OFD1O75665 1012 aa23.43■■□□□ 1.34
NELFE-210ENST00000491139 SLC11A1P49279 550 aa23.43■■□□□ 1.34
NELFE-210ENST00000491139 RAB27AP51159 221 aa23.43■■□□□ 1.34
NELFE-210ENST00000491139 FGD1P98174 961 aa23.43■■□□□ 1.34
NELFE-210ENST00000491139 MTERF2Q49AM1 385 aa23.43■■□□□ 1.34
NELFE-210ENST00000491139 SIX5Q8N196 739 aa23.43■■□□□ 1.34
NELFE-210ENST00000491139 DTWD2Q8NBA8 298 aa23.43■■□□□ 1.34
NELFE-210ENST00000491139 CCDC136Q96JN2 1154 aa23.43■■□□□ 1.34
NELFE-210ENST00000491139 KLHL5Q96PQ7 755 aa23.43■■□□□ 1.34
NELFE-210ENST00000491139 VN1R3Q9BXE9 311 aa23.43■■□□□ 1.34
NELFE-210ENST00000491139 TEKT3Q9BXF9 490 aa23.43■■□□□ 1.34
NELFE-210ENST00000491139 NIFKQ9BYG3 293 aaKnown RBP23.43■■□□□ 1.34
NELFE-210ENST00000491139 DNAJB4Q9UDY4 337 aa23.43■■□□□ 1.34
NELFE-210ENST00000491139 SEPT9Q9UHD8 586 aaPredicted RBP23.43■■□□□ 1.34
NELFE-210ENST00000491139 MEIS3P2A8K0S8 358 aa23.42■■□□□ 1.34
NELFE-210ENST00000491139 CLCN4P51793 760 aa23.42■■□□□ 1.34
NELFE-210ENST00000491139 LETM2Q2VYF4 491 aa23.42■■□□□ 1.34
NELFE-210ENST00000491139 ADCK5Q3MIX3 580 aa23.42■■□□□ 1.34
NELFE-210ENST00000491139 TSGA10IPQ3SY00 556 aa23.42■■□□□ 1.34
NELFE-210ENST00000491139 XKR3Q5GH77 459 aa23.42■■□□□ 1.34
NELFE-210ENST00000491139 LRCH2Q5VUJ6 765 aa23.42■■□□□ 1.34
NELFE-210ENST00000491139 C15orf39Q6ZRI6 1047 aa23.42■■□□□ 1.34
NELFE-210ENST00000491139 ZNF410Q86VK4 478 aa23.42■■□□□ 1.34
NELFE-210ENST00000491139 SLC5A5Q92911 643 aa23.42■■□□□ 1.34
NELFE-210ENST00000491139 PGBD4Q96DM1 585 aa23.42■■□□□ 1.34
NELFE-210ENST00000491139 UNC45AQ9H3U1 944 aa23.42■■□□□ 1.34
NELFE-210ENST00000491139 IGSF9Q9P2J2 1179 aa23.42■■□□□ 1.34
NELFE-210ENST00000491139 IGKV6-21A0A0C4DH24 114 aa23.41■■□□□ 1.34
NELFE-210ENST00000491139 PRPF3O43395 683 aaKnown RBP23.41■■□□□ 1.34
NELFE-210ENST00000491139 SSBP05455 408 aaKnown RBP eCLIP23.41■■□□□ 1.34
NELFE-210ENST00000491139 CNPP09543 421 aaKnown RBP23.41■■□□□ 1.34
NELFE-210ENST00000491139 KRT32Q14532 448 aa23.41■■□□□ 1.34
NELFE-210ENST00000491139 CATSPER4Q7RTX7 472 aa23.41■■□□□ 1.34
NELFE-210ENST00000491139 RHPN2Q8IUC4 686 aa23.41■■□□□ 1.34
NELFE-210ENST00000491139 RASEFQ8IZ41 740 aa23.41■■□□□ 1.34
NELFE-210ENST00000491139 RDM1Q8NG50 284 aa23.41■■□□□ 1.34
NELFE-210ENST00000491139 URGCPQ8TCY9 931 aa23.41■■□□□ 1.34
NELFE-210ENST00000491139 SUCLA2Q9P2R7 463 aaPredicted RBP23.41■■□□□ 1.34
NELFE-210ENST00000491139 STK25O00506 426 aa23.4■■□□□ 1.34
NELFE-210ENST00000491139 HMGB1P09429 215 aaKnown RBP23.4■■□□□ 1.34
NELFE-210ENST00000491139 USP11P51784 963 aa23.4■■□□□ 1.34
NELFE-210ENST00000491139 AKAP17AQ02040 695 aaKnown RBP23.4■■□□□ 1.34
NELFE-210ENST00000491139 MIER3Q7Z3K6 550 aa23.4■■□□□ 1.34
NELFE-210ENST00000491139 ZNF280BQ86YH2 543 aa23.4■■□□□ 1.34
NELFE-210ENST00000491139 CEP89Q96ST8 783 aa23.4■■□□□ 1.34
NELFE-210ENST00000491139 MRPL17Q9NRX2 175 aaKnown RBP23.4■■□□□ 1.34
NELFE-210ENST00000491139 TMEM150BA6NC51 233 aa23.39■■□□□ 1.33
NELFE-210ENST00000491139 B4GALT3O60512 393 aa23.39■■□□□ 1.33
NELFE-210ENST00000491139 ALDH2P05091 517 aa23.39■■□□□ 1.33
NELFE-210ENST00000491139 CCDC148Q8NFR7 591 aa23.39■■□□□ 1.33
NELFE-210ENST00000491139 KCNG4Q8TDN1 519 aa23.39■■□□□ 1.33
NELFE-210ENST00000491139 GJA10Q969M2 543 aa23.39■■□□□ 1.33
NELFE-210ENST00000491139 SH2D3AQ9BRG2 576 aa23.39■■□□□ 1.33
NELFE-210ENST00000491139 PCDHB2Q9Y5E7 798 aa23.39■■□□□ 1.33
NELFE-210ENST00000491139 C2orf16Q68DN1 1984 aa23.39■■□□□ 1.33
NELFE-210ENST00000491139 EDIL3O43854 480 aa23.38■■□□□ 1.33
NELFE-210ENST00000491139 LILRB3O75022 631 aa23.38■■□□□ 1.33
NELFE-210ENST00000491139 NONOQ15233 471 aaKnown RBP eCLIP23.38■■□□□ 1.33
NELFE-210ENST00000491139 NLRP4Q96MN2 994 aa23.38■■□□□ 1.33
NELFE-210ENST00000491139 FAM193BQ96PV7 902 aaPredicted RBP23.38■■□□□ 1.33
NELFE-210ENST00000491139 TMEM175Q9BSA9 504 aa23.38■■□□□ 1.33
NELFE-210ENST00000491139 SEMA4AQ9H3S1 761 aa23.38■■□□□ 1.33
NELFE-210ENST00000491139 KANSL3Q9P2N6 904 aa23.38■■□□□ 1.33
NELFE-210ENST00000491139 WNT16Q9UBV4 365 aa23.38■■□□□ 1.33
NELFE-210ENST00000491139 FAN1Q9Y2M0 1017 aa23.38■■□□□ 1.33
NELFE-210ENST00000491139 DDX11L8A8MPP1 907 aa23.37■■□□□ 1.33
NELFE-210ENST00000491139 NARSO43776 548 aaKnown RBP23.37■■□□□ 1.33
NELFE-210ENST00000491139 MAFO75444 373 aaPredicted RBP23.37■■□□□ 1.33
NELFE-210ENST00000491139 PSMD10O75832 226 aa23.37■■□□□ 1.33
NELFE-210ENST00000491139 DDHD2O94830 711 aa23.37■■□□□ 1.33
NELFE-210ENST00000491139 STBD1O95210 358 aa23.37■■□□□ 1.33
NELFE-210ENST00000491139 CFHP08603 1231 aa23.37■■□□□ 1.33
NELFE-210ENST00000491139 RFX1P22670 979 aa23.37■■□□□ 1.33
NELFE-210ENST00000491139 AGMOQ6ZNB7 445 aa23.37■■□□□ 1.33
NELFE-210ENST00000491139 KSR1Q8IVT5 923 aa23.37■■□□□ 1.33
NELFE-210ENST00000491139 CMASQ8NFW8 434 aaPredicted RBP23.37■■□□□ 1.33
NELFE-210ENST00000491139 PHKBQ93100 1093 aa23.37■■□□□ 1.33
NELFE-210ENST00000491139 GBP2P32456 591 aaPredicted RBP23.36■■□□□ 1.33
NELFE-210ENST00000491139 ELMSAN1Q6PJG2 1045 aa23.36■■□□□ 1.33
NELFE-210ENST00000491139 STAMQ92783 540 aa23.36■■□□□ 1.33
NELFE-210ENST00000491139 JPH2Q9BR39 696 aaPredicted RBP23.36■■□□□ 1.33
NELFE-210ENST00000491139 RSAD1Q9HA92 442 aa23.36■■□□□ 1.33
NELFE-210ENST00000491139 MAN1C1Q9NR34 630 aa23.36■■□□□ 1.33
NELFE-210ENST00000491139 AGPAT5Q9NUQ2 364 aa23.36■■□□□ 1.33
NELFE-210ENST00000491139 DPP7Q9UHL4 492 aa23.36■■□□□ 1.33
NELFE-210ENST00000491139 SSX2IPQ9Y2D8 614 aa23.36■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.2 ms