RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489475.5

HOXB3-210, Transcript of homeobox B3, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene HOXB3, Length 1,845 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB3-210ENST00000489475 EFCAB12Q6NXP0 572 aa29.35■■■□□ 2.29
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HOXB3-210ENST00000489475 AKR1B15C9JRZ8 316 aaPredicted RBP29.34■■■□□ 2.29
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HOXB3-210ENST00000489475 LAMTOR4Q0VGL1 99 aa29.34■■■□□ 2.29
HOXB3-210ENST00000489475 BICD1Q96G01 975 aa29.34■■■□□ 2.29
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HOXB3-210ENST00000489475 HOXD10P28358 340 aa29.34■■■□□ 2.29
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HOXB3-210ENST00000489475 TRPV1Q8NER1 839 aa29.34■■■□□ 2.29
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HOXB3-210ENST00000489475 GOLGA8DPQ0D2H9 430 aa29.32■■■□□ 2.28
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HOXB3-210ENST00000489475 TMEM134Q9H6X4 195 aa29.32■■■□□ 2.28
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HOXB3-210ENST00000489475 CD99L2Q8TCZ2 262 aa29.31■■■□□ 2.28
HOXB3-210ENST00000489475 CASP8AP2Q9UKL3 1982 aa29.31■■■□□ 2.28
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HOXB3-210ENST00000489475 CCZ1BP86790 482 aa29.31■■■□□ 2.28
HOXB3-210ENST00000489475 CCZ1P86791 482 aaPredicted RBP29.31■■■□□ 2.28
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HOXB3-210ENST00000489475 TCERG1LQ5VWI1 586 aa29.31■■■□□ 2.28
HOXB3-210ENST00000489475 CCDC112Q8NEF3 446 aa29.31■■■□□ 2.28
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HOXB3-210ENST00000489475 C2orf40Q9H1Z8 148 aa29.29■■■□□ 2.28
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HOXB3-210ENST00000489475 IRX5P78411 483 aaPredicted RBP29.28■■■□□ 2.28
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HOXB3-210ENST00000489475 PIGRP01833 764 aa29.27■■■□□ 2.28
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HOXB3-210ENST00000489475 CACNB2Q08289 660 aaPredicted RBP29.27■■■□□ 2.28
HOXB3-210ENST00000489475 MFSD10Q14728 455 aa29.27■■■□□ 2.28
HOXB3-210ENST00000489475 INTS8Q75QN2 995 aaKnown RBP29.27■■■□□ 2.28
HOXB3-210ENST00000489475 CCDC155Q8N6L0 562 aa29.27■■■□□ 2.28
HOXB3-210ENST00000489475 NLRP4Q96MN2 994 aa29.27■■■□□ 2.28
HOXB3-210ENST00000489475 GNRH1P01148 92 aa29.27■■■□□ 2.28
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