RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489160.1

CCL20-204, Transcript of C-C motif chemokine ligand 20, humanhuman

TSL 3

Gene CCL20, Length 673 nt, Biotype retained intron.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL20-204ENST00000489160 OSBPL6Q9BZF3 934 aa6.53□□□□□ -1.36
CCL20-204ENST00000489160 KATNBL1Q9H079 304 aa6.53□□□□□ -1.36
CCL20-204ENST00000489160 MAGEL2Q9UJ55 1249 aa6.53□□□□□ -1.36
CCL20-204ENST00000489160 VWA7Q9Y334 891 aa6.53□□□□□ -1.36
CCL20-204ENST00000489160 NDUFS2O75306 463 aa6.52□□□□□ -1.37
CCL20-204ENST00000489160 IL33O95760 270 aa6.52□□□□□ -1.37
CCL20-204ENST00000489160 CYP1A1P04798 512 aaPredicted RBP6.52□□□□□ -1.37
CCL20-204ENST00000489160 U2AF1L5P0DN76 240 aaPredicted RBP6.52□□□□□ -1.37
CCL20-204ENST00000489160 ZSCAN22P10073 491 aaPredicted RBP6.52□□□□□ -1.37
CCL20-204ENST00000489160 C5AR1P21730 350 aa6.52□□□□□ -1.37
CCL20-204ENST00000489160 ADKP55263 362 aaKnown RBP6.52□□□□□ -1.37
CCL20-204ENST00000489160 SESN2P58004 480 aaPredicted RBP6.52□□□□□ -1.37
CCL20-204ENST00000489160 U2AF1Q01081 240 aaKnown RBP eCLIP6.52□□□□□ -1.37
CCL20-204ENST00000489160 FAM26FQ5R3K3 315 aa6.52□□□□□ -1.37
CCL20-204ENST00000489160 FAM102BQ5T8I3 360 aa6.52□□□□□ -1.37
CCL20-204ENST00000489160 TRIM68Q6AZZ1 485 aa6.52□□□□□ -1.37
CCL20-204ENST00000489160 NXNQ6DKJ4 435 aa6.52□□□□□ -1.37
CCL20-204ENST00000489160 LMBR1LQ6UX01 489 aa6.52□□□□□ -1.37
CCL20-204ENST00000489160 TCEAL8Q8IYN2 117 aa6.52□□□□□ -1.37
CCL20-204ENST00000489160 MYO1HQ8N1T3 1032 aa6.52□□□□□ -1.37
CCL20-204ENST00000489160 LINC01356Q8N9X3 169 aa6.52□□□□□ -1.37
CCL20-204ENST00000489160 NKD2Q969F2 451 aaPredicted RBP6.52□□□□□ -1.37
CCL20-204ENST00000489160 AJUBAQ96IF1 538 aa6.52□□□□□ -1.37
CCL20-204ENST00000489160 SPATA25Q9BR10 227 aa6.52□□□□□ -1.37
CCL20-204ENST00000489160 FDXACB1Q9BRP7 624 aaPredicted RBP6.52□□□□□ -1.37
CCL20-204ENST00000489160 BARX1Q9HBU1 254 aaPredicted RBP6.52□□□□□ -1.37
CCL20-204ENST00000489160 DNAI1Q9UI46 699 aa6.52□□□□□ -1.37
CCL20-204ENST00000489160 ZBTB21Q9ULJ3 1066 aa6.52□□□□□ -1.37
CCL20-204ENST00000489160 C9orf118A6NHY6 69 aa6.51□□□□□ -1.37
CCL20-204ENST00000489160 FSBPO95073 299 aa6.51□□□□□ -1.37
CCL20-204ENST00000489160 ZRANB2O95218 330 aaKnown RBP eCLIP6.51□□□□□ -1.37
CCL20-204ENST00000489160 STAT5BP51692 787 aa6.51□□□□□ -1.37
CCL20-204ENST00000489160 CCT2P78371 535 aaKnown RBP6.51□□□□□ -1.37
CCL20-204ENST00000489160 MALLQ13021 153 aa6.51□□□□□ -1.37
CCL20-204ENST00000489160 FZD5Q13467 585 aa6.51□□□□□ -1.37
CCL20-204ENST00000489160 ADRM1Q16186 407 aa6.51□□□□□ -1.37
CCL20-204ENST00000489160 CXorf57Q6NSI4 855 aaKnown RBP6.51□□□□□ -1.37
CCL20-204ENST00000489160 KLHDC10Q6PID8 442 aa6.51□□□□□ -1.37
CCL20-204ENST00000489160 BTNL9Q6UXG8 535 aa6.51□□□□□ -1.37
CCL20-204ENST00000489160 WDR75Q8IWA0 830 aaKnown RBP6.51□□□□□ -1.37
CCL20-204ENST00000489160 RTKN2Q8IZC4 609 aa6.51□□□□□ -1.37
CCL20-204ENST00000489160 TXNDC5Q8NBS9 432 aaKnown RBP6.51□□□□□ -1.37
CCL20-204ENST00000489160 GFM2Q969S9 779 aaKnown RBP6.51□□□□□ -1.37
CCL20-204ENST00000489160 CARD11Q9BXL7 1154 aa6.51□□□□□ -1.37
CCL20-204ENST00000489160 CSRNP2Q9H175 543 aa6.51□□□□□ -1.37
CCL20-204ENST00000489160 TUBD1Q9UJT1 453 aa6.51□□□□□ -1.37
CCL20-204ENST00000489160 A0A1B0GTL3 188 aa6.5□□□□□ -1.37
CCL20-204ENST00000489160 CYP2C19P33261 490 aa6.5□□□□□ -1.37
CCL20-204ENST00000489160 MEOX1P50221 254 aa6.5□□□□□ -1.37
CCL20-204ENST00000489160 SLC16A1P53985 500 aa6.5□□□□□ -1.37
CCL20-204ENST00000489160 MGAT5Q09328 741 aa6.5□□□□□ -1.37
CCL20-204ENST00000489160 MUM1L1Q5H9M0 696 aa6.5□□□□□ -1.37
CCL20-204ENST00000489160 LCE1DQ5T752 114 aa6.5□□□□□ -1.37
CCL20-204ENST00000489160 MCTP2Q6DN12 878 aa6.5□□□□□ -1.37
CCL20-204ENST00000489160 ADGRG2Q8IZP9 1017 aa6.5□□□□□ -1.37
CCL20-204ENST00000489160 MIER2Q8N344 545 aa6.5□□□□□ -1.37
CCL20-204ENST00000489160 KLHL36Q8N4N3 616 aa6.5□□□□□ -1.37
CCL20-204ENST00000489160 PPM1NQ8N819 430 aa6.5□□□□□ -1.37
CCL20-204ENST00000489160 GLB1L3Q8NCI6 653 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
CCL20-204ENST00000489160 ADAMTS17Q8TE56 1095 aa6.5□□□□□ -1.37
CCL20-204ENST00000489160 RELTQ969Z4 430 aa6.5□□□□□ -1.37
CCL20-204ENST00000489160 CCDC136Q96JN2 1154 aa6.5□□□□□ -1.37
CCL20-204ENST00000489160 C8orf48Q96LL4 319 aa6.5□□□□□ -1.37
CCL20-204ENST00000489160 ADAM29Q9UKF5 820 aa6.5□□□□□ -1.37
CCL20-204ENST00000489160 NOB1Q9ULX3 412 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
CCL20-204ENST00000489160 ARID1BQ8NFD5 2236 aaPredicted RBP6.49□□□□□ -1.37
CCL20-204ENST00000489160 DAPK3O43293 454 aa6.49□□□□□ -1.37
CCL20-204ENST00000489160 LY86O95711 162 aa6.49□□□□□ -1.37
CCL20-204ENST00000489160 HNRNPLP14866 589 aaKnown RBP eCLIP6.49□□□□□ -1.37
CCL20-204ENST00000489160 AKAP5P24588 427 aa6.49□□□□□ -1.37
CCL20-204ENST00000489160 CSF2RBP32927 897 aa6.49□□□□□ -1.37
CCL20-204ENST00000489160 MEF2AQ02078 507 aaPredicted RBP6.49□□□□□ -1.37
CCL20-204ENST00000489160 KIF23Q02241 960 aaPredicted RBP6.49□□□□□ -1.37
CCL20-204ENST00000489160 CD69Q07108 199 aa6.49□□□□□ -1.37
CCL20-204ENST00000489160 USP10Q14694 798 aaKnown RBP6.49□□□□□ -1.37
CCL20-204ENST00000489160 ZNF827Q17R98 1081 aa6.49□□□□□ -1.37
CCL20-204ENST00000489160 GJC2Q5T442 439 aaPredicted RBP6.49□□□□□ -1.37
CCL20-204ENST00000489160 TPH2Q8IWU9 490 aa6.49□□□□□ -1.37
CCL20-204ENST00000489160 UNC5BQ8IZJ1 945 aa6.49□□□□□ -1.37
CCL20-204ENST00000489160 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP6.49□□□□□ -1.37
CCL20-204ENST00000489160 MAGEB6Q8N7X4 407 aa6.49□□□□□ -1.37
CCL20-204ENST00000489160 LCORQ96JN0 433 aaPredicted RBP6.49□□□□□ -1.37
CCL20-204ENST00000489160 GREM2Q9H772 168 aa6.49□□□□□ -1.37
CCL20-204ENST00000489160 GEMIN8Q9NWZ8 242 aaKnown RBP6.49□□□□□ -1.37
CCL20-204ENST00000489160 SAP30BPQ9UHR5 308 aaKnown RBP6.49□□□□□ -1.37
CCL20-204ENST00000489160 SCOCQ9UIL1 159 aa6.49□□□□□ -1.37
CCL20-204ENST00000489160 A0A1W2PR48 441 aa6.48□□□□□ -1.37
CCL20-204ENST00000489160 GOLGA6CA6NDK9 693 aa6.48□□□□□ -1.37
CCL20-204ENST00000489160 GOLGA6BA6NDN3 693 aa6.48□□□□□ -1.37
CCL20-204ENST00000489160 GOLGA6DP0CG33 693 aa6.48□□□□□ -1.37
CCL20-204ENST00000489160 MCAMP43121 646 aa6.48□□□□□ -1.37
CCL20-204ENST00000489160 MRE11P49959 708 aa6.48□□□□□ -1.37
CCL20-204ENST00000489160 GTF2H3Q13889 308 aa6.48□□□□□ -1.37
CCL20-204ENST00000489160 MLC1Q15049 377 aa6.48□□□□□ -1.37
CCL20-204ENST00000489160 PCOLCEQ15113 449 aa6.48□□□□□ -1.37
CCL20-204ENST00000489160 VMACQ2NL98 169 aa6.48□□□□□ -1.37
CCL20-204ENST00000489160 RRP12Q5JTH9 1297 aaKnown RBP6.48□□□□□ -1.37
CCL20-204ENST00000489160 FAM180AQ6UWF9 173 aa6.48□□□□□ -1.37
CCL20-204ENST00000489160 LCNL1Q6ZST4 164 aa6.48□□□□□ -1.37
CCL20-204ENST00000489160 LARP4Q71RC2 724 aaKnown RBP eCLIP6.48□□□□□ -1.37
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